Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4414
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4414, 427 aa
1>>>pF1KE4414 427 - 427 aa - 427 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0397+/-0.000877; mu= 14.3731+/- 0.052
mean_var=88.7961+/-17.809, 0's: 0 Z-trim(108.2): 55 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.136106
statistics sampled from 9992 (10044) to 9992 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 3.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12630.1 KCNN4 gene_id:3783|Hs108|chr19 ( 427) 2835 566.7 1.5e-161
CCDS30880.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 731) 1154 236.7 5.5e-62
CCDS4114.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 ( 579) 1131 232.2 1e-60
CCDS67611.1 KCNN1 gene_id:3780|Hs108|chr19 ( 543) 1120 230.0 4.4e-60
CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 426) 1080 222.1 8.4e-58
CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 746) 654 138.6 2e-32
CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 ( 231) 615 130.6 1.6e-30
>>CCDS12630.1 KCNN4 gene_id:3783|Hs108|chr19 (427 aa)
initn: 2835 init1: 2835 opt: 2835 Z-score: 3013.6 bits: 566.7 E(32554): 1.5e-161
Smith-Waterman score: 2835; 99.8% identity (100.0% similar) in 427 aa overlap (1-427:1-427)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGGDLVLGLGALRRRKRLLEQEKSLAGWALVLAGTGIGLMVLHAEMLWFGGCSWALYLFL
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CCDS12 MGGDLVLGLGALRRRKRLLEQEKSLAGWALVLAGTGIGLMVLHAEMLWFGGCSWALYLFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEVQLFMTDNGLRDWRVALTGRQAAQIVLELVVCGLHPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEVQLFMTDNGLRDWRVALTGRQAAQIVLELVVCGLHPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 PVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGFLGQGEALLSLAMLLRLYLVPRAVLLRSGVLLNASYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGFLGQGEALLSLAMLLRLYLVPRAVLLRSGVLLNASYR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHPGRLLLGLTLGLWLTTAWVLSVAERQAVNATGHLSDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHPGRLLLGLTLGLWLTTAWVLSVAERQAVNATGHLSDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGKIVCLCTGVMGVCCTALLVAVVARKLEFNKAEKHVHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGKIVCLCTGVMGVCCTALLVAVVARKLEFNKAEKHVHN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 FMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTRRKESHAARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTRRKESHAARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LREQVNSMVDISKMHMILYDLQQNLSSSHRALEKQIDTLAGKLDALTELLSTALGPRQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LREQVNSMVDISKMHMILYDLQQNLSSSHRALEKQIDTLAGKLDALTELLSTALGPRQLP
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EPNQQSK
::.::::
CCDS12 EPSQQSK
>>CCDS30880.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (731 aa)
initn: 1138 init1: 425 opt: 1154 Z-score: 1226.3 bits: 236.7 E(32554): 5.5e-62
Smith-Waterman score: 1154; 46.6% identity (75.8% similar) in 401 aa overlap (12-407:270-667)
10 20 30 40
pF1KE4 MGGDLVLGLGALRRRKRLLEQEKSLAGWALVLAGTGIGLMV
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CCDS30 THNHQHAGTTASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
240 250 260 270 280 290
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LHAEMLWFGGCSWALYLFLVKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEVQLFMTDNGLRDWRVALT
...:. : . ... . .:: ::.::..:: ::.:.:..:::::. ::: :::.:.:
CCDS30 IETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAMT
300 310 320 330 340 350
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 GRQAAQIVLELVVCGLHPAPVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGFLGQGEALLSLAMLLRLY
.. : ::..::..:: : . : .:. . . . .::. :.::::
CCDS30 YERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEA---DVDIILSIPMFLRLY
360 370 380 390 400 410
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 LVPRAVLLRSGVLLNASYRSIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHPGRLLLGLTLGLWLTTAW
:. :..::.: .. .:: :::::::.. : :: : :. :: .:: ....::. .::
CCDS30 LIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAW
420 430 440 450 460 470
230 240 250 260 270
pF1KE4 VLSVAER--QAVNATGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGKIVCLCTGVMGVCCTA
.. : :: . ..:... ..::: ::::.:::::.:: :. :: ::: ::.::. :::
CCDS30 TVRVCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTA
480 490 500 510 520 530
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 LLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTR--RKESHA-
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CCDS30 LVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETWLIYKHTKLLKKIDHAK
540 550 560 570 580 590
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILYDLQQNLSSSHRALEKQI
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CCDS30 VRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYDLITELNDRSEDLEKQI
600 610 620 630 640 650
400 410 420
pF1KE4 DTLAGKLDALTELLSTALGPRQLPEPNQQSK
.: .::. ::
CCDS30 GSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSVAVGTTHTPISDSPIGV
660 670 680 690 700 710
>>CCDS4114.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 (579 aa)
initn: 1110 init1: 417 opt: 1131 Z-score: 1203.4 bits: 232.2 E(32554): 1e-60
Smith-Waterman score: 1131; 46.0% identity (76.0% similar) in 400 aa overlap (12-406:121-517)
10 20 30 40
pF1KE4 MGGDLVLGLGALRRRKRLLEQEKSLAGWALVLAGTGIGLMV
: .:. :.:..: :. .::... :: .::
CCDS41 GGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LHAEMLWFGGCSWALYLFLVKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEVQLFMTDNGLRDWRVALT
...:. : . . .:: . .:: ::.::..:: ::...::.:.::::.::: :::.:.:
CCDS41 IETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMT
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 GRQAAQIVLELVVCGLHPAPVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGFLGQGEALLSLAMLLRLY
.. : ::..::..:: : : . : : .. . .::. :.::::
CCDS41 YERIFFICLEILVCAIHPIP--GNYTFTWTARLAFSYAP-STTTADVDIILSIPMFLRLY
220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 LVPRAVLLRSGVLLNASYRSIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHPGRLLLGLTLGLWLTTAW
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CCDS41 LIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAW
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270
pF1KE4 VLSVAER--QAVNATGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGKIVCLCTGVMGVCCTA
.. . :: . ..:... ..::: ::::.:::::.::.:. :: ::: ::.::. :::
CCDS41 TVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTA
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 LLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTR--RKESHA-
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CCDS41 LVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAK
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILYDLQQNLSSSHRALEKQI
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CCDS41 VRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRI
450 460 470 480 490 500
400 410 420
pF1KE4 DTLAGKLDALTELLSTALGPRQLPEPNQQSK
:: ::..:
CCDS41 VTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRS
510 520 530 540 550 560
>>CCDS67611.1 KCNN1 gene_id:3780|Hs108|chr19 (543 aa)
initn: 980 init1: 435 opt: 1120 Z-score: 1192.1 bits: 230.0 E(32554): 4.4e-60
Smith-Waterman score: 1122; 44.8% identity (73.0% similar) in 426 aa overlap (12-422:93-515)
10 20 30 40
pF1KE4 MGGDLVLGLGALRRRKRLLEQEKSLAGWALVLAGTGIGLMV
: .:. :.:..: :. .::... :: .::
CCDS67 PQDQDDDEDDEEDEAGRQRASGKPSNVGHRLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LHAEMLWFGGCSWALYLFLVKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEVQLFMTDNGLRDWRVALT
..:. : . .:: : .:: ::.:: .:: :.: .::.:.::::.::: :::.:.:
CCDS67 TETELSWGVYTKESLYSFALKCLISLSTAILLGLVVLYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMT
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 GRQAAQIVLELVVCGLHPAPVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGFLGQGEALLSLAMLLRLY
... : :::.::..::.: . : .:. . . ..:::. :.::::
CCDS67 CERVFLISLELAVCAIHPVPGHYRFTWTARLAFTYAPSVAEADV---DVLLSIPMFLRLY
190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 LVPRAVLLRSGVLLNASYRSIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHPGRLLLGLTLGLWLTTAW
:. :..::.: .. .:: :::::::.. : :: : :. :: .:: .... :. .::
CCDS67 LLGRVMLLHSKIFTDASSRSIGALNKITFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISSWIIAAW
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270
pF1KE4 VLSVAER--QAVNATGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGKIVCLCTGVMGVCCTA
.. : :: . ..:... ..::: ::::.:::::.:: :. :: ::: ::.::. :::
CCDS67 TVRVCERYHDKQEVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTA
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 LLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTR--RKESHA-
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CCDS67 LVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKHTRLVKKPDQAR
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ARRHQRKLLAAINA---FRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILYDLQQNLSSSHRALE
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CCDS67 VRKHQRKFLQAIHQAQKLRSVKIEQGKLNDQANTLTDLAKTQTVMYDLVSELHAQHEELE
420 430 440 450 460 470
400 410 420
pF1KE4 KQIDTLAGKLDALTE-------LLSTALGPRQLPEPNQQSK
.. :: ..:::: :.. :. : : :
CCDS67 ARLATLESRLDALGASLQALPGLIAQAIRPPPPPLPPRPGPGPQDQAARSSPCRWTPVAP
480 490 500 510 520 530
CCDS67 SDCG
540
>>CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (426 aa)
initn: 1095 init1: 425 opt: 1080 Z-score: 1151.2 bits: 222.1 E(32554): 8.4e-58
Smith-Waterman score: 1080; 48.3% identity (76.5% similar) in 358 aa overlap (55-407:8-362)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LAGWALVLAGTGIGLMVLHAEMLWFGGCSWALYLFLVKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEV
... . .:: ::.::..:: ::.:.:..::
CCDS10 MERPIKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREV
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 QLFMTDNGLRDWRVALTGRQAAQIVLELVVCGLHPAPVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGF
:::. ::: :::.:.: .. : ::..::..:: : . : .:. .
CCDS10 QLFVIDNGADDWRIAMTYERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEA-
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 LGQGEALLSLAMLLRLYLVPRAVLLRSGVLLNASYRSIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHP
. . .::. :.:::::. :..::.: .. .:: :::::::.. : :: : :. :
CCDS10 --DVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICP
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 GRLLLGLTLGLWLTTAWVLSVAER--QAVNATGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMW
: .:: ....::. .::.. : :: . ..:... ..::: ::::.:::::.:: :.
CCDS10 GTVLLVFSISLWIIAAWTVRVCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYC
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 GKIVCLCTGVMGVCCTALLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEA
:: ::: ::.::. ::::.:::::::::..:::::::::::: : ::..:..:: ::.:.
CCDS10 GKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRET
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370
pF1KE4 WMFYKHTR--RKESHA-ARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILY
:..::::. .: .:: .:.::::.: ::. .:.:....::: .:.:..::.:::. ..:
CCDS10 WLIYKHTKLLKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMY
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420
pF1KE4 DLQQNLSSSHRALEKQIDTLAGKLDALTELLSTALGPRQLPEPNQQSK
:: .:.. . ::::: .: .::. ::
CCDS10 DLITELNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVS
340 350 360 370 380 390
>>CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (746 aa)
initn: 1164 init1: 425 opt: 654 Z-score: 695.6 bits: 138.6 E(32554): 2e-32
Smith-Waterman score: 1117; 45.0% identity (72.4% similar) in 416 aa overlap (12-407:270-682)
10 20 30 40
pF1KE4 MGGDLVLGLGALRRRKRLLEQEKSLAGWALVLAGTGIGLMV
: .:. :.:..: :. .::... :: .::
CCDS72 THNHQHAGTTASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
240 250 260 270 280 290
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LHAEMLWFGGCSWALYLFLVKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEVQLFMTDNGLRDWRVALT
...:. : . ... . .:: ::.::..:: ::.:.:..:::::. ::: :::.:.:
CCDS72 IETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAMT
300 310 320 330 340 350
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 GRQAAQIVLELVVCGLHPAPVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGFLGQGEALLSLAMLLRLY
.. : ::..::..:: : . : .:. . . . .::. :.::::
CCDS72 YERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEA---DVDIILSIPMFLRLY
360 370 380 390 400 410
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 LVPRAVLLRSGVLLNASYRSIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHPGRLLLGLTLGLWLTTAW
:. :..::.: .. .:: :::::::.. : :: : :. :: .:: ....::. .::
CCDS72 LIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAW
420 430 440 450 460 470
230 240 250 260
pF1KE4 VLSVAERQAVNA-----------------TGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGK
.. : : : :... ..::: ::::.:::::.:: :. ::
CCDS72 TVRVCESPESPAQPSGSSLPAWYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGK
480 490 500 510 520 530
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 IVCLCTGVMGVCCTALLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWM
::: ::.::. ::::.:::::::::..:::::::::::: : ::..:..:: ::.:.:.
CCDS72 GVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETWL
540 550 560 570 580 590
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 FYKHTR--RKESHA-ARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILYDL
.::::. .: .:: .:.::::.: ::. .:.:....::: .:.:..::.:::. ..:::
CCDS72 IYKHTKLLKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYDL
600 610 620 630 640 650
390 400 410 420
pF1KE4 QQNLSSSHRALEKQIDTLAGKLDALTELLSTALGPRQLPEPNQQSK
.:.. . ::::: .: .::. ::
CCDS72 ITELNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSVA
660 670 680 690 700 710
>>CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 (231 aa)
initn: 666 init1: 417 opt: 615 Z-score: 661.7 bits: 130.6 E(32554): 1.6e-30
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220 230 240 250 260 270
pF1KE4 LTLGLWLTTAWVLSVAERQAVNATGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGKIVCLCT
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10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 GVMGVCCTALLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTR
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CCDS43 GIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTK
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380
pF1KE4 --RKESHA-ARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILYDLQQNLSS
.: .:: .:.::::.: ::. .:.:....::: .:.:..::..: . :.::. ..:.
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100 110 120 130 140 150
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CCDS43 RSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERS
160 170 180 190 200 210
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]