Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4403
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4403, 419 aa
1>>>pF1KE4403 419 - 419 aa - 419 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3232+/-0.000798; mu= 16.4137+/- 0.048
mean_var=59.8713+/-12.236, 0's: 0 Z-trim(106.8): 13 B-trim: 540 in 1/50
Lambda= 0.165754
statistics sampled from 9205 (9210) to 9205 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4053.1 CKMT2 gene_id:1160|Hs108|chr5 ( 419) 2838 687.1 8.2e-198
CCDS10097.1 CKMT1B gene_id:1159|Hs108|chr15 ( 417) 2285 554.9 5.2e-158
CCDS32217.1 CKMT1A gene_id:548596|Hs108|chr15 ( 417) 2285 554.9 5.2e-158
CCDS9981.1 CKB gene_id:1152|Hs108|chr14 ( 381) 1696 414.0 1.2e-115
CCDS12659.1 CKM gene_id:1158|Hs108|chr19 ( 381) 1662 405.9 3.4e-113
>>CCDS4053.1 CKMT2 gene_id:1160|Hs108|chr5 (419 aa)
initn: 2838 init1: 2838 opt: 2838 Z-score: 3664.9 bits: 687.1 E(32554): 8.2e-198
Smith-Waterman score: 2838; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASIFSKLLTGRNASLLFATMGTSVLTTGYLLNRQKVCAEVREQPRLFPPSADYPDLRKH
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CCDS40 MASIFSKLLTGRNASLLFATMGTSVLTTGYLLNRQKVCAEVREQPRLFPPSADYPDLRKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 NNCMAECLTPAIYAKLRNKVTPNGYTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEESYEVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 NNCMAECLTPAIYAKLRNKVTPNGYTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEESYEVFA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DLFDPVIKLRHNGYDPRVMKHTTDLDASKITQGQFDEHYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 DLFDPVIKLRHNGYDPRVMKHTTDLDASKITQGQFDEHYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPAC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TRAERREVENVAITALEGLKGDLAGRYYKLSEMTEQDQQRLIDDHFLFDKPVSPLLTCAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 TRAERREVENVAITALEGLKGDLAGRYYKLSEMTEQDQQRLIDDHFLFDKPVSPLLTCAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MARDWPDARGIWHNYDKTFLIWINEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MARDWPDARGIWHNYDKTFLIWINEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RGWEFMWNERLGYILTCPSNLGTGLRAGVHVRIPKLSKDPRFSKILENLRLQKRGTGGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RGWEFMWNERLGYILTCPSNLGTGLRAGVHVRIPKLSKDPRFSKILENLRLQKRGTGGVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE4 TAAVADVYDISNIDRIGRSEVELVQIVIDGVNYLVDCEKKLERGQDIKVPPPLPQFGKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 TAAVADVYDISNIDRIGRSEVELVQIVIDGVNYLVDCEKKLERGQDIKVPPPLPQFGKK
370 380 390 400 410
>>CCDS10097.1 CKMT1B gene_id:1159|Hs108|chr15 (417 aa)
initn: 2280 init1: 2213 opt: 2285 Z-score: 2950.2 bits: 554.9 E(32554): 5.2e-158
Smith-Waterman score: 2285; 80.1% identity (92.5% similar) in 413 aa overlap (1-413:1-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASIFSKLLTGRNASLLFATMGTSVLTTGYLLNRQKVCAEVREQPRLFPPSADYPDLRKH
::. ::.::..: . :.: :.. :..:.:: . : : . :. ::.::::.:::::::
CCDS10 MAGPFSRLLSARPGLRLLALAGAGSLAAGFLLRPEPVRA-ASERRRLYPPSAEYPDLRKH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 NNCMAECLTPAIYAKLRNKVTPNGYTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEESYEVFA
::::: ::::.::.: .:.::.:.:::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS10 NNCMASHLTPAVYARLCDKTTPTGWTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEETYEVFA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DLFDPVIKLRHNGYDPRVMKHTTDLDASKITQGQFDEHYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPAC
:::::::. ::::::::.:::::::::::: .: :::.::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLFDPVIQERHNGYDPRTMKHTTDLDASKIRSGYFDERYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPAC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TRAERREVENVAITALEGLKGDLAGRYYKLSEMTEQDQQRLIDDHFLFDKPVSPLLTCAG
::::::::: :.. :: :::::::::::.:::::: .::.::::::::::::::::: ::
CCDS10 TRAERREVERVVVDALSGLKGDLAGRYYRLSEMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLTAAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MARDWPDARGIWHNYDKTFLIWINEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQE
:::::::::::::: .:.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MARDWPDARGIWHNNEKSFLIWVNEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RGWEFMWNERLGYILTCPSNLGTGLRAGVHVRIPKLSKDPRFSKILENLRLQKRGTGGVD
::::::::::::::::::::::::::::::...: :::: :: :::::::::::::::::
CCDS10 RGWEFMWNERLGYILTCPSNLGTGLRAGVHIKLPLLSKDSRFPKILENLRLQKRGTGGVD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE4 TAAVADVYDISNIDRIGRSEVELVQIVIDGVNYLVDCEKKLERGQDIKVPPPLPQFGKK
:::.. :.::::.::.:.:::::::.::::::::.:::..:::::::..: :.
CCDS10 TAATGGVFDISNLDRLGKSEVELVQLVIDGVNYLIDCERRLERGQDIRIPTPVIHTKH
360 370 380 390 400 410
>>CCDS32217.1 CKMT1A gene_id:548596|Hs108|chr15 (417 aa)
initn: 2280 init1: 2213 opt: 2285 Z-score: 2950.2 bits: 554.9 E(32554): 5.2e-158
Smith-Waterman score: 2285; 80.1% identity (92.5% similar) in 413 aa overlap (1-413:1-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASIFSKLLTGRNASLLFATMGTSVLTTGYLLNRQKVCAEVREQPRLFPPSADYPDLRKH
::. ::.::..: . :.: :.. :..:.:: . : : . :. ::.::::.:::::::
CCDS32 MAGPFSRLLSARPGLRLLALAGAGSLAAGFLLRPEPVRA-ASERRRLYPPSAEYPDLRKH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 NNCMAECLTPAIYAKLRNKVTPNGYTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEESYEVFA
::::: ::::.::.: .:.::.:.:::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS32 NNCMASHLTPAVYARLCDKTTPTGWTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEETYEVFA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DLFDPVIKLRHNGYDPRVMKHTTDLDASKITQGQFDEHYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPAC
:::::::. ::::::::.:::::::::::: .: :::.::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLFDPVIQERHNGYDPRTMKHTTDLDASKIRSGYFDERYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPAC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TRAERREVENVAITALEGLKGDLAGRYYKLSEMTEQDQQRLIDDHFLFDKPVSPLLTCAG
::::::::: :.. :: :::::::::::.:::::: .::.::::::::::::::::: ::
CCDS32 TRAERREVERVVVDALSGLKGDLAGRYYRLSEMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLTAAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MARDWPDARGIWHNYDKTFLIWINEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQE
:::::::::::::: .:.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MARDWPDARGIWHNNEKSFLIWVNEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RGWEFMWNERLGYILTCPSNLGTGLRAGVHVRIPKLSKDPRFSKILENLRLQKRGTGGVD
::::::::::::::::::::::::::::::...: :::: :: :::::::::::::::::
CCDS32 RGWEFMWNERLGYILTCPSNLGTGLRAGVHIKLPLLSKDSRFPKILENLRLQKRGTGGVD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE4 TAAVADVYDISNIDRIGRSEVELVQIVIDGVNYLVDCEKKLERGQDIKVPPPLPQFGKK
:::.. :.::::.::.:.:::::::.::::::::.:::..:::::::..: :.
CCDS32 TAATGGVFDISNLDRLGKSEVELVQLVIDGVNYLIDCERRLERGQDIRIPTPVIHTKH
360 370 380 390 400 410
>>CCDS9981.1 CKB gene_id:1152|Hs108|chr14 (381 aa)
initn: 1665 init1: 1665 opt: 1696 Z-score: 2189.6 bits: 414.0 E(32554): 1.2e-115
Smith-Waterman score: 1696; 67.0% identity (85.0% similar) in 361 aa overlap (48-407:14-373)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 FATMGTSVLTTGYLLNRQKVCAEVREQPRLFPPSADYPDLRKHNNCMAECLTPAIYAKLR
:: ..::: ::: ::. ::: .::.::
CCDS99 MPFSNSHNALKLRFPAEDEFPDLSAHNNHMAKVLTPELYAELR
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 NKVTPNGYTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEESYEVFADLFDPVIKLRHNGYDPR
: ::.:.:::. :::::::::::.: ::: ::::::::::: :::::.:. ::.:: :
CCDS99 AKSTPSGFTLDDVIQTGVDNPGHPYIMTVGCVAGDEESYEVFKDLFDPIIEDRHGGYKPS
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 VMKHTTDLDASKITQGQ-FDEHYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPACTRAERREVENVAITAL
.: :::. ... :. .: .:::::::::::::::. ::: :.:.::: .:..:. ::
CCDS99 D-EHKTDLNPDNLQGGDDLDPNYVLSSRVRTGRSIRGFCLPPHCSRGERRAIEKLAVEAL
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 EGLKGDLAGRYYKLSEMTEQDQQRLIDDHFLFDKPVSPLLTCAGMARDWPDARGIWHNYD
.: :::::::: :. ::: .::.:::::::::::::::: .::::::::::::::: .
CCDS99 SSLDGDLAGRYYALKSMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDN
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 KTFLIWINEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQERGWEFMWNERLGYILT
::::.:.::::: :::::.::::::.:: ::: :: ..: :.. . .::::: .::::::
CCDS99 KTFLVWVNEEDHLRVISMQKGGNMKEVFTRFCTGLTQIETLFKSKDYEFMWNPHLGYILT
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 CPSNLGTGLRAGVHVRIPKLSKDPRFSKILENLRLQKRGTGGVDTAAVADVYDISNIDRI
::::::::::::::...:.:.: .::..:. ::::::::::::::::. :.:.:: ::.
CCDS99 CPSNLGTGLRAGVHIKLPNLGKHEKFSEVLKRLRLQKRGTGGVDTAAVGGVFDVSNADRL
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410
pF1KE4 GRSEVELVQIVIDGVNYLVDCEKKLERGQDIKVPPPLPQFGKK
: :::::::.:.:::. :.. :..::.:: :
CCDS99 GFSEVELVQMVVDGVKLLIEMEQRLEQGQAIDDLMPAQK
350 360 370 380
>>CCDS12659.1 CKM gene_id:1158|Hs108|chr19 (381 aa)
initn: 1662 init1: 1615 opt: 1662 Z-score: 2145.7 bits: 405.9 E(32554): 3.4e-113
Smith-Waterman score: 1662; 65.7% identity (85.9% similar) in 361 aa overlap (48-407:14-373)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 FATMGTSVLTTGYLLNRQKVCAEVREQPRLFPPSADYPDLRKHNNCMAECLTPAIYAKLR
. : .:::: :::: ::. :: .: :::
CCDS12 MPFGNTHNKFKLNYKPEEEYPDLSKHNNHMAKVLTLELYKKLR
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 NKVTPNGYTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEESYEVFADLFDPVIKLRHNGYDPR
.: ::.:.:.:. ::::::::::::: ::: ::::::::::: .::::.:. ::.:: :
CCDS12 DKETPSGFTVDDVIQTGVDNPGHPFIMTVGCVAGDEESYEVFKELFDPIISDRHGGYKP-
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 VMKHTTDLDASKITQGQ-FDEHYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPACTRAERREVENVAITAL
. :: :::. .. :. .: .:::::::::::::.: .::: :.:.::: ::.... ::
CCDS12 TDKHKTDLNHENLKGGDDLDPNYVLSSRVRTGRSIKGYTLPPHCSRGERRAVEKLSVEAL
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 EGLKGDLAGRYYKLSEMTEQDQQRLIDDHFLFDKPVSPLLTCAGMARDWPDARGIWHNYD
..: :.. :.:: :. :::..::.:::::::::::::::: .::::::::::::::: .
CCDS12 NSLTGEFKGKYYPLKSMTEKEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDN
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 KTFLIWINEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQERGWEFMWNERLGYILT
:.::.:.::::: ::::::::::::.::.::: ::...:..... : ::::..:::.::
CCDS12 KSFLVWVNEEDHLRVISMEKGGNMKEVFRRFCVGLQKIEEIFKKAGHPFMWNQHLGYVLT
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 CPSNLGTGLRAGVHVRIPKLSKDPRFSKILENLRLQKRGTGGVDTAAVADVYDISNIDRI
::::::::::.::::.. .::: :.: .:: ::::::::::::::::..:.:.:: ::.
CCDS12 CPSNLGTGLRGGVHVKLAHLSKHPKFEEILTRLRLQKRGTGGVDTAAVGSVFDVSNADRL
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410
pF1KE4 GRSEVELVQIVIDGVNYLVDCEKKLERGQDIKVPPPLPQFGKK
: :::: ::.:.:::. .:. :::::.::.:
CCDS12 GSSEVEQVQLVVDGVKLMVEMEKKLEKGQSIDDMIPAQK
350 360 370 380
419 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 01:21:08 2016 done: Sun Nov 6 01:21:09 2016
Total Scan time: 2.740 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]