Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4391
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4391, 414 aa
1>>>pF1KE4391 414 - 414 aa - 414 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6911+/-0.000437; mu= 14.7454+/- 0.027
mean_var=64.2964+/-13.255, 0's: 0 Z-trim(109.7): 146 B-trim: 1099 in 2/48
Lambda= 0.159949
statistics sampled from 17788 (17937) to 17788 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 7.400
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016876859 (OMIM: 107400,606963,613490) PREDICTE ( 418) 1018 244.1 5e-64
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NP_001121172 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1018 244.1 5e-64
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NP_001121175 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1018 244.1 5e-64
NP_001002235 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1018 244.1 5e-64
NP_000615 (OMIM: 601841) plasma serine protease in ( 406) 946 227.4 4.9e-59
XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 943 226.8 8.1e-59
XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 943 226.8 8.1e-59
NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo ( 435) 943 226.8 8.4e-59
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NP_001275962 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 ( 427) 832 201.1 4.2e-51
NP_001275961 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 1 ( 464) 832 201.2 4.6e-51
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XP_011535019 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 811 196.3 9.8e-50
XP_005262237 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 371) 776 188.2 2.9e-47
XP_006724746 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 425) 773 187.5 5.3e-47
XP_005267790 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 444) 765 185.7 2e-46
NP_057270 (OMIM: 605271) protein Z-dependent prote ( 444) 765 185.7 2e-46
NP_001094077 (OMIM: 605271) protein Z-dependent pr ( 444) 765 185.7 2e-46
XP_016876842 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 484) 765 185.7 2.1e-46
NP_006211 (OMIM: 107410) putative alpha-1-antitryp ( 421) 761 184.8 3.6e-46
NP_001271205 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform D [H ( 286) 674 164.6 2.8e-40
NP_001284628 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 632 155.0 2.9e-37
NP_001284629 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 632 155.0 2.9e-37
NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform ( 376) 632 155.0 2.9e-37
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XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 632 155.0 2.9e-37
NP_001258753 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 632 155.0 2.9e-37
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XP_016866429 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 380) 632 155.0 3e-37
NP_001182220 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 380) 632 155.0 3e-37
NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 390) 632 155.0 3e-37
NP_001258752 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 395) 632 155.0 3.1e-37
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NP_002631 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 629 154.3 4.7e-37
NP_942130 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 629 154.3 4.7e-37
XP_005249241 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 376) 624 153.1 1.1e-36
NP_004146 (OMIM: 601799) serpin B9 [Homo sapiens] ( 376) 624 153.1 1.1e-36
NP_000176 (OMIM: 142360,612356) heparin cofactor 2 ( 499) 599 147.4 7.5e-35
>>XP_016876859 (OMIM: 107400,606963,613490) PREDICTED: a (418 aa)
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