Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4370
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4370, 387 aa
1>>>pF1KE4370 387 - 387 aa - 387 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1342+/-0.000887; mu= 17.4876+/- 0.053
mean_var=66.9446+/-13.512, 0's: 0 Z-trim(105.9): 70 B-trim: 538 in 1/46
Lambda= 0.156753
statistics sampled from 8625 (8701) to 8625 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 2.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10936.1 HSD17B2 gene_id:3294|Hs108|chr16 ( 387) 2618 601.1 5.4e-172
CCDS10837.1 HSD11B2 gene_id:3291|Hs108|chr16 ( 405) 836 198.1 1.2e-50
CCDS3328.1 BDH1 gene_id:622|Hs108|chr3 ( 343) 594 143.4 3e-34
CCDS2231.1 DHRS9 gene_id:10170|Hs108|chr2 ( 319) 590 142.4 5.4e-34
CCDS74600.1 DHRS9 gene_id:10170|Hs108|chr2 ( 379) 590 142.5 6.2e-34
CCDS41797.1 RDH16 gene_id:8608|Hs108|chr12 ( 317) 562 136.1 4.3e-32
CCDS8926.1 SDR9C7 gene_id:121214|Hs108|chr12 ( 313) 560 135.6 5.8e-32
CCDS8925.1 HSD17B6 gene_id:8630|Hs108|chr12 ( 317) 559 135.4 6.9e-32
CCDS31829.1 RDH5 gene_id:5959|Hs108|chr12 ( 318) 519 126.4 3.6e-29
CCDS12736.1 HSD17B14 gene_id:51171|Hs108|chr19 ( 270) 275 71.1 1.3e-12
CCDS82092.1 DHRS7B gene_id:25979|Hs108|chr17 ( 310) 249 65.3 8.6e-11
CCDS11215.1 DHRS7B gene_id:25979|Hs108|chr17 ( 325) 249 65.3 8.9e-11
>>CCDS10936.1 HSD17B2 gene_id:3294|Hs108|chr16 (387 aa)
initn: 2618 init1: 2618 opt: 2618 Z-score: 3201.2 bits: 601.1 E(32554): 5.4e-172
Smith-Waterman score: 2618; 100.0% identity (100.0% similar) in 387 aa overlap (1-387:1-387)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTFFSDTAWICLAVPTVLCGTVFCKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLIL
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CCDS10 MSTFFSDTAWICLAVPTVLCGTVFCKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 FSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKAVLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKAVLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGELL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYLWICLAHYLPIGIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYLWICLAHYLPIGIYD
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE4 YFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT
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CCDS10 YFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT
370 380
>>CCDS10837.1 HSD11B2 gene_id:3291|Hs108|chr16 (405 aa)
initn: 784 init1: 784 opt: 836 Z-score: 1023.0 bits: 198.1 E(32554): 1.2e-50
Smith-Waterman score: 836; 39.4% identity (66.8% similar) in 373 aa overlap (6-378:8-377)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSTFFSDTAWICLAVPTVLCGTVFCKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGL
: ::. .:. ..: .. . . . : . .. ::.: .: .: : .:
CCDS10 MERWPWPSGGAWLLVAARALL--QLLRSDLRLGRPLLAALALLAALDWLCQRLLPPPAAL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ILFSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKAVLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENG
..... .. . :. . ::: .:::.:: : :.:. : :: .::::.: ::. :.
CCDS10 AVLAAAGWIALSRLARPQRLPVATRAVLITGCDSGFGKETAKKLDSMGFTVLATVLELNS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGE
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CCDS10 PGAIELRTCCSPRLRLLQMDLTKPGDISRVLEFTKAHTTSTGLWGLVNNAGHNEVVADAE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAA
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CCDS10 LSPVATFRSCMEVNFFGALELTKGLLPLLRSSRGRIVTVGSPAGDMPYPCLGAYGTSKAA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VTMFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQD
:... ... :: ::.::. :::: : :. . . .::: .. .: .:: :. . ::.:
CCDS10 VALLMDTFSCELLPWGVKVSIIQPGCFKTESVRNVGQWEKRKQLLLANLPQELLQAYGKD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 YILAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYLWICLAHYLPIGI
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CCDS10 YIEHLHGQFLHSLRLAMSDLTPVVDAITDALLAARPRRRYYPGQGLGLMYFIHYYLPEGL
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE4 YDYFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT
: . : .. .::::.
CCDS10 RRRFLQAFF-ISHCLPRALQPGQPGTTPPQDAAQDPNLSPGPSPAVAR
360 370 380 390 400
>>CCDS3328.1 BDH1 gene_id:622|Hs108|chr3 (343 aa)
initn: 469 init1: 246 opt: 594 Z-score: 728.3 bits: 143.4 E(32554): 3e-34
Smith-Waterman score: 594; 36.0% identity (62.7% similar) in 303 aa overlap (70-365:45-343)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 CLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKAVLVTGGDCGLGHALC
:: :. : :: .::::::: : :.: .:
CCDS33 GKTLSACDRENGARRPLLLGSTSFIPIGRRTYASAAE--PVGSKAVLVTGCDSGFGFSLA
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 KYLDELGFTVFAGVL--NENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAMLQ
:.: :: :::: : ... :..:: : :: ..:... . ... . : . :.
CCDS33 KHLHSKGFLVFAGCLMKDKGHDGVKELDSLNSDRLRTVQLNVCSSEEVEKVVEIVRSSLK
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 D--RGLWAVINNAGVLGFPTDGELLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRLV
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CCDS33 DPEKGMWGLVNNAGISTFG-EVEFTSLETYKQVAEVNLWGTVRMTKSFLPLIRRAKGRVV
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 NVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTS-D
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CCDS33 NISSMLGRMANPARSPYCITKFGVEAFSDCLRYEMYPLGVKVSVVEPGNFIAATSLYSPE
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 KWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSP
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CCDS33 SIQAIAKKMWEELPEVVRKDYGKKYFDEKIAKMETYCSSGSTDTSPVIDAVTHALTATTP
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380
pF1KE4 FAYYTPGKGAYLWICLA--HYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT
.. : : : :. . .:: .: :.. :
CCDS33 YTRYHP-MDYYWWLRMQIMTHLPGAISDMIYIR
320 330 340
>>CCDS2231.1 DHRS9 gene_id:10170|Hs108|chr2 (319 aa)
initn: 389 init1: 223 opt: 590 Z-score: 723.8 bits: 142.4 E(32554): 5.4e-34
Smith-Waterman score: 590; 34.3% identity (65.7% similar) in 315 aa overlap (55-362:3-305)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 CKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKA
:: : :. . : ...: . .. . .:
CCDS22 MLFWVLGLL-ILCGFLWTRKGKLKIEDITDKY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 VLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQ
...:: : :.:. . .:. :: :.:. :.:.: : :. : :: .. .:.: : .
CCDS22 IFITGCDSGFGNLAARTFDKKGFHVIAACLTESGSTA--LKAETSERLRTVLLDVTDPEN
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 IKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGELLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFL
.: . . : .. ..:::..:::::: : . . : . ::.. . ::.:: . :: ..:
CCDS22 VKRTAQWVKNQVGEKGLWGLINNAGVPGVLAPTDWLTLEDYREPIEVNLFGLISVTLNML
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 PLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLA----SYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVASI
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CCDS22 PLVKKAQGRVINVSSVGG-----RLAIVGGGYTPSKYAVEGFNDSLRRDMKAFGVHVSCI
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310
pF1KE4 QPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKD--ILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDF
.:: : ::.: : . .:: : ..: .....::. :: . . : .: .. :.
CCDS22 EPGLFKTNLA---DPVKVIEKKLAIWEQLSPDIKQQYGEGYIEKSLDKLKGNKSYVNMDL
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 SPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYL-WICLAHYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRAL
:::.. ..::. . : ..:. :: : . :: :.: .: .. :..
CCDS22 SPVVECMDHALTSLFPKTHYAAGKDAKIFWIPLSH-MPAALQDFLLLKQKAELANPKAV
270 280 290 300 310
380
pF1KE4 RMPNYKKKAT
>>CCDS74600.1 DHRS9 gene_id:10170|Hs108|chr2 (379 aa)
initn: 389 init1: 223 opt: 590 Z-score: 722.8 bits: 142.5 E(32554): 6.2e-34
Smith-Waterman score: 590; 34.3% identity (65.7% similar) in 315 aa overlap (55-362:63-365)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 CKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKA
:: : :. . : ...: . .. . .:
CCDS74 DPPQPAHWRHHLLVLYKKGVYLSHTGGKMLFWVLGLL-ILCGFLWTRKGKLKIEDITDKY
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 VLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQ
...:: : :.:. . .:. :: :.:. :.:.: : :. : :: .. .:.: : .
CCDS74 IFITGCDSGFGNLAARTFDKKGFHVIAACLTESGSTA--LKAETSERLRTVLLDVTDPEN
100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 IKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGELLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFL
.: . . : .. ..:::..:::::: : . . : . ::.. . ::.:: . :: ..:
CCDS74 VKRTAQWVKNQVGEKGLWGLINNAGVPGVLAPTDWLTLEDYREPIEVNLFGLISVTLNML
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 PLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLA----SYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVASI
::..:..::..::::.:: ::: .: :: :: :.. .: ... .:..:. :
CCDS74 PLVKKAQGRVINVSSVGG-----RLAIVGGGYTPSKYAVEGFNDSLRRDMKAFGVHVSCI
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310
pF1KE4 QPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKD--ILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDF
.:: : ::.: : . .:: : ..: .....::. :: . . : .: .. :.
CCDS74 EPGLFKTNLA---DPVKVIEKKLAIWEQLSPDIKQQYGEGYIEKSLDKLKGNKSYVNMDL
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 SPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYL-WICLAHYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRAL
:::.. ..::. . : ..:. :: : . :: :.: .: .. :..
CCDS74 SPVVECMDHALTSLFPKTHYAAGKDAKIFWIPLSH-MPAALQDFLLLKQKAELANPKAV
330 340 350 360 370
380
pF1KE4 RMPNYKKKAT
>>CCDS41797.1 RDH16 gene_id:8608|Hs108|chr12 (317 aa)
initn: 442 init1: 272 opt: 562 Z-score: 689.7 bits: 136.1 E(32554): 4.3e-32
Smith-Waterman score: 562; 34.9% identity (63.1% similar) in 312 aa overlap (50-360:3-303)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 CGTVFCKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLP
: :. : :: .:.. : : :
CCDS41 MWLYLAVFVGLY------YLLHWYRERQVLSH
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 VDQKAVLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDI
. .: :..:: : :.:. : . :: :. :.:. :.:.: ::.:: : :: .. .:.
CCDS41 LRDKYVFITGCDSGFGKLLARQLDARGLRVLAACLTEKG--AEQLRGQTSDRLETVTLDV
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 TKPVQIKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPT-DGELLLMTDYKQCMAVNFFGTVE
:: .. : . : ..:.:::...::::. ..:: .::: :. . ::..:...
CCDS41 TKTESVAAAAQWVKECVRDKGLWGLVNNAGI-SLPTAPNELLTKQDFVTILDVNLLGVID
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 VTKTFLPLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVA
:: ..:::.:...::.:::::. : . . ..: :: .: ::. .: ::: .:.:::
CCDS41 VTLSLLPLVRRARGRVVNVSSVMGRVSLFG-GGYCISKYGVEAFSDSLRRELSYFGVKVA
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 SIQPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDF
:.:: : : .. ..... : .: :. ::.: ::. .. .. ... ..:.
CCDS41 MIEPGYFKTAVT-SKERFLKSFLEIWDRSSPEVKEAYGEKFVADYKKSAEQMEQKCTQDL
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 SPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYLWICLAHYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRALR
: : ..::..: : . :. : : : :.: . :
CCDS41 SLVTNCMEHALIACHPRTRYSAGWDAKLLYLPMSYMPTFLVDAIMYWVSPSPAKAL
270 280 290 300 310
380
pF1KE4 MPNYKKKAT
>>CCDS8926.1 SDR9C7 gene_id:121214|Hs108|chr12 (313 aa)
initn: 366 init1: 252 opt: 560 Z-score: 687.3 bits: 135.6 E(32554): 5.8e-32
Smith-Waterman score: 560; 35.2% identity (67.1% similar) in 304 aa overlap (67-367:9-306)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 WMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLP-VDQKAVLVTGGDCGLG
.:: .... .:. ...: :..:: : :.:
CCDS89 MAALTDLSFMYRWFKNCNLVGNLSEKYVFITGCDSGFG
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 HALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAM
. : : : . :. :.:. ..:. :...:.: : ::.. .:.:: .:: : . :
CCDS89 NLLAKQLVDRGMQVLAACFTEE--GSQKLQRDTSYRLQTTLLDVTKSESIKAAAQWVRDK
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 LQDRGLWAVINNAGVLGFPTD-GELLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRL
. ..::::..::::: :.:. .: : :. . . ::. : .::: .::......::.
CCDS89 VGEQGLWALVNNAGV-GLPSGPNEWLTKDDFVKVINVNLVGLIEVTLHMLPMVKRARGRV
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 VNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTSD
::.:: :: . . ..: :: .: ::. .: :: .:.:: :.::.. : : : .
CCDS89 VNMSSSGGRVAVIG-GGYCVSKFGVEAFSDSIRRELYYFGVKVCIIEPGNYRTAILGKEN
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 KWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSP
...: . ..:: :....::.::. . : : ..: :. ...:::...::
CCDS89 LESRMRK-LWERLPQETRDSYGEDYFRIYTDKLKNIMQVAEPRVRDVINSMEHAIVSRSP
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380
pF1KE4 FAYYTPGKGA-YLWICLAHYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT
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CCDS89 RIRYNPGLDAKLLYIPLAK-LPTPVTDFILSRYLPRPADSV
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CCDS31 VSRCLEHALTARHPRTRYSPGWDAKLLWLP-ASYLPASLVDAVLTWVLPKPAQAVY
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CCDS12 DKDESGGRALEQEL---PGAVFILCDVT---QEDDVKTLVSETIRRFGRLDCVVNNAGHH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]