Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4364
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4364, 381 aa
1>>>pF1KE4364 381 - 381 aa - 381 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5815+/-0.000839; mu= 15.0066+/- 0.050
mean_var=63.2098+/-12.531, 0's: 0 Z-trim(105.7): 16 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.161318
statistics sampled from 8584 (8592) to 8584 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12659.1 CKM gene_id:1158|Hs108|chr19 ( 381) 2578 608.7 2.8e-174
CCDS9981.1 CKB gene_id:1152|Hs108|chr14 ( 381) 2159 511.2 6.3e-145
CCDS32217.1 CKMT1A gene_id:548596|Hs108|chr15 ( 417) 1679 399.5 2.9e-111
CCDS10097.1 CKMT1B gene_id:1159|Hs108|chr15 ( 417) 1679 399.5 2.9e-111
CCDS4053.1 CKMT2 gene_id:1160|Hs108|chr5 ( 419) 1655 393.9 1.4e-109
>>CCDS12659.1 CKM gene_id:1158|Hs108|chr19 (381 aa)
initn: 2578 init1: 2578 opt: 2578 Z-score: 3242.4 bits: 608.7 E(32554): 2.8e-174
Smith-Waterman score: 2578; 99.7% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPFGNTHNKFKLNYKPEEEYPDLSKHNNHMAKVLTLELYKKLRDKETPSGFTVDDVIQTG
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CCDS12 MPFGNTHNKFKLNYKPEEEYPDLSKHNNHMAKVLTLELYKKLRDKETPSGFTVDDVIQTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VDNPGHPFIMTVGCVAGDEESYEVFKELFDPIISDRHGGYKPTDKHKTDLNHENLKGGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VDNPGHPFIMTVGCVAGDEESYEVFKELFDPIISDRHGGYKPTDKHKTDLNHENLKGGDD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LDPNYVLSSRVRTGRSIKGYTLPPHCSRGERRAVEKLSVEALNSLTGEFKGKYYPLKSMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDPNYVLSSRVRTGRSIKGYTLPPHCSRGERRAVEKLSVEALNSLTGEFKGKYYPLKSMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EKEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDNKSLLVWVNEEDHLRVISM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS12 EKEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDNKSFLVWVNEEDHLRVISM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EKGGNMKEVFRRFCVGLQKIEEIFKKAGHPFMWNQHLGYVLTCPSNLGTGLRGGVHVKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKGGNMKEVFRRFCVGLQKIEEIFKKAGHPFMWNQHLGYVLTCPSNLGTGLRGGVHVKLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HLSKHPKFEEILTRLRLQKRGTGGVDTAAVGSVFDVSNADRLGSSEVEQVQLVVDGVKLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HLSKHPKFEEILTRLRLQKRGTGGVDTAAVGSVFDVSNADRLGSSEVEQVQLVVDGVKLM
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE4 VEMEKKLEKGQSIDDMIPAQK
:::::::::::::::::::::
CCDS12 VEMEKKLEKGQSIDDMIPAQK
370 380
>>CCDS9981.1 CKB gene_id:1152|Hs108|chr14 (381 aa)
initn: 2159 init1: 2159 opt: 2159 Z-score: 2715.4 bits: 511.2 E(32554): 6.3e-145
Smith-Waterman score: 2159; 80.3% identity (92.4% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPFGNTHNKFKLNYKPEEEYPDLSKHNNHMAKVLTLELYKKLRDKETPSGFTVDDVIQTG
:::.:.:: .:: . :.:.:::: :::::::::: ::: .:: : ::::::.:::::::
CCDS99 MPFSNSHNALKLRFPAEDEFPDLSAHNNHMAKVLTPELYAELRAKSTPSGFTLDDVIQTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VDNPGHPFIMTVGCVAGDEESYEVFKELFDPIISDRHGGYKPTDKHKTDLNHENLKGGDD
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CCDS99 VDNPGHPYIMTVGCVAGDEESYEVFKDLFDPIIEDRHGGYKPSDEHKTDLNPDNLQGGDD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LDPNYVLSSRVRTGRSIKGYTLPPHCSRGERRAVEKLSVEALNSLTGEFKGKYYPLKSMT
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CCDS99 LDPNYVLSSRVRTGRSIRGFCLPPHCSRGERRAIEKLAVEALSSLDGDLAGRYYALKSMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EKEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDNKSLLVWVNEEDHLRVISM
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::
CCDS99 EAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDNKTFLVWVNEEDHLRVISM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EKGGNMKEVFRRFCVGLQKIEEIFKKAGHPFMWNQHLGYVLTCPSNLGTGLRGGVHVKLA
.::::::::: :::.:: .:: .::. . :::: ::::.::::::::::::.:::.::
CCDS99 QKGGNMKEVFTRFCTGLTQIETLFKSKDYEFMWNPHLGYILTCPSNLGTGLRAGVHIKLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HLSKHPKFEEILTRLRLQKRGTGGVDTAAVGSVFDVSNADRLGSSEVEQVQLVVDGVKLM
.:.:: :: :.: ::::::::::::::::::.::::::::::: :::: ::.:::::::.
CCDS99 NLGKHEKFSEVLKRLRLQKRGTGGVDTAAVGGVFDVSNADRLGFSEVELVQMVVDGVKLL
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE4 VEMEKKLEKGQSIDDMIPAQK
.:::..::.::.:::..::::
CCDS99 IEMEQRLEQGQAIDDLMPAQK
370 380
>>CCDS32217.1 CKMT1A gene_id:548596|Hs108|chr15 (417 aa)
initn: 1676 init1: 1623 opt: 1679 Z-score: 2111.0 bits: 399.5 E(32554): 2.9e-111
Smith-Waterman score: 1679; 67.3% identity (85.9% similar) in 361 aa overlap (14-373:47-406)
10 20 30 40
pF1KE4 MPFGNTHNKFKLNYKPEEEYPDLSKHNNHMAKVLTLELYKKLR
: : ::::: :::: ::. :: .: .:
CCDS32 LLALAGAGSLAAGFLLRPEPVRAASERRRLYPPSAEYPDLRKHNNCMASHLTPAVYARLC
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 DKETPSGFTVDDVIQTGVDNPGHPFIMTVGCVAGDEESYEVFKELFDPIISDRHGGYKP-
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CCDS32 DKTTPTGWTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEETYEVFADLFDPVIQERHNGYDPR
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 TDKHKTDLNHENLKGGDDLDPNYVLSSRVRTGRSIKGYTLPPHCSRGERRAVEKLSVEAL
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CCDS32 TMKHTTDLDASKIRSGY-FDERYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPACTRAERREVERVVVDAL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 NSLTGEFKGKYYPLKSMTEKEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDN
..: :.. :.:: :. ::: :::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::..
CCDS32 SGLKGDLAGRYYRLSEMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLTAAGMARDWPDARGIWHNNE
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 KSLLVWVNEEDHLRVISMEKGGNMKEVFRRFCVGLQKIEEIFKKAGHPFMWNQHLGYVLT
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CCDS32 KSFLIWVNEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQERGWEFMWNERLGYILT
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 CPSNLGTGLRGGVHVKLAHLSKHPKFEEILTRLRLQKRGTGGVDTAAVGSVFDVSNADRL
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CCDS32 CPSNLGTGLRAGVHIKLPLLSKDSRFPKILENLRLQKRGTGGVDTAATGGVFDISNLDRL
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380
pF1KE4 GSSEVEQVQLVVDGVKLMVEMEKKLEKGQSIDDMIPAQK
:.:::: ::::.:::. ... :..::.::.:
CCDS32 GKSEVELVQLVIDGVNYLIDCERRLERGQDIRIPTPVIHTKH
380 390 400 410
>>CCDS10097.1 CKMT1B gene_id:1159|Hs108|chr15 (417 aa)
initn: 1676 init1: 1623 opt: 1679 Z-score: 2111.0 bits: 399.5 E(32554): 2.9e-111
Smith-Waterman score: 1679; 67.3% identity (85.9% similar) in 361 aa overlap (14-373:47-406)
10 20 30 40
pF1KE4 MPFGNTHNKFKLNYKPEEEYPDLSKHNNHMAKVLTLELYKKLR
: : ::::: :::: ::. :: .: .:
CCDS10 LLALAGAGSLAAGFLLRPEPVRAASERRRLYPPSAEYPDLRKHNNCMASHLTPAVYARLC
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 DKETPSGFTVDDVIQTGVDNPGHPFIMTVGCVAGDEESYEVFKELFDPIISDRHGGYKP-
:: ::.:.:.:. ::::::::::::: ::: ::::::.:::: .::::.:..::.:: :
CCDS10 DKTTPTGWTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEETYEVFADLFDPVIQERHNGYDPR
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 TDKHKTDLNHENLKGGDDLDPNYVLSSRVRTGRSIKGYTLPPHCSRGERRAVEKLSVEAL
: :: :::. ....: .: :::::::::::::.: .::: :.:.::: ::.. :.::
CCDS10 TMKHTTDLDASKIRSGY-FDERYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPACTRAERREVERVVVDAL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 NSLTGEFKGKYYPLKSMTEKEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDN
..: :.. :.:: :. ::: :::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::..
CCDS10 SGLKGDLAGRYYRLSEMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLTAAGMARDWPDARGIWHNNE
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 KSLLVWVNEEDHLRVISMEKGGNMKEVFRRFCVGLQKIEEIFKKAGHPFMWNQHLGYVLT
::.:.::::::: ::::::::::::.::.::: ::...:..... : ::::..:::.::
CCDS10 KSFLIWVNEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQERGWEFMWNERLGYILT
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 CPSNLGTGLRGGVHVKLAHLSKHPKFEEILTRLRLQKRGTGGVDTAAVGSVFDVSNADRL
::::::::::.:::.:: ::: .: .:: :::::::::::::::.:.:::.:: :::
CCDS10 CPSNLGTGLRAGVHIKLPLLSKDSRFPKILENLRLQKRGTGGVDTAATGGVFDISNLDRL
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380
pF1KE4 GSSEVEQVQLVVDGVKLMVEMEKKLEKGQSIDDMIPAQK
:.:::: ::::.:::. ... :..::.::.:
CCDS10 GKSEVELVQLVIDGVNYLIDCERRLERGQDIRIPTPVIHTKH
380 390 400 410
>>CCDS4053.1 CKMT2 gene_id:1160|Hs108|chr5 (419 aa)
initn: 1655 init1: 1608 opt: 1655 Z-score: 2080.8 bits: 393.9 E(32554): 1.4e-109
Smith-Waterman score: 1655; 65.4% identity (85.9% similar) in 361 aa overlap (14-373:48-407)
10 20 30 40
pF1KE4 MPFGNTHNKFKLNYKPEEEYPDLSKHNNHMAKVLTLELYKKLR
. : .:::: :::: ::. :: .: :::
CCDS40 FATMGTSVLTTGYLLNRQKVCAEVREQPRLFPPSADYPDLRKHNNCMAECLTPAIYAKLR
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 DKETPSGFTVDDVIQTGVDNPGHPFIMTVGCVAGDEESYEVFKELFDPIISDRHGGYKP-
.: ::.:.:.:. ::::::::::::: ::: ::::::::::: .::::.:. ::.:: :
CCDS40 NKVTPNGYTLDQCIQTGVDNPGHPFIKTVGMVAGDEESYEVFADLFDPVIKLRHNGYDPR
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 TDKHKTDLNHENLKGGDDLDPNYVLSSRVRTGRSIKGYTLPPHCSRGERRAVEKLSVEAL
. :: :::. .. :. .: .:::::::::::::.: .::: :.:.::: ::.... ::
CCDS40 VMKHTTDLDASKITQGQ-FDEHYVLSSRVRTGRSIRGLSLPPACTRAERREVENVAITAL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 NSLTGEFKGKYYPLKSMTEKEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDN
..: :.. :.:: :. :::..::.:::::::::::::::: .::::::::::::::: .
CCDS40 EGLKGDLAGRYYKLSEMTEQDQQRLIDDHFLFDKPVSPLLTCAGMARDWPDARGIWHNYD
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 KSLLVWVNEEDHLRVISMEKGGNMKEVFRRFCVGLQKIEEIFKKAGHPFMWNQHLGYVLT
:..:.:.::::: ::::::::::::.::.::: ::...:..... : ::::..:::.::
CCDS40 KTFLIWINEEDHTRVISMEKGGNMKRVFERFCRGLKEVERLIQERGWEFMWNERLGYILT
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 CPSNLGTGLRGGVHVKLAHLSKHPKFEEILTRLRLQKRGTGGVDTAAVGSVFDVSNADRL
::::::::::.::::.. .::: :.: .:: ::::::::::::::::..:.:.:: ::.
CCDS40 CPSNLGTGLRAGVHVRIPKLSKDPRFSKILENLRLQKRGTGGVDTAAVADVYDISNIDRI
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380
pF1KE4 GSSEVEQVQLVVDGVKLMVEMEKKLEKGQSIDDMIPAQK
: :::: ::.:.:::. .:. :::::.::.:
CCDS40 GRSEVELVQIVIDGVNYLVDCEKKLERGQDIKVPPPLPQFGKK
380 390 400 410
381 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 02:04:00 2016 done: Sun Nov 6 02:04:00 2016
Total Scan time: 2.710 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]