Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4341
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4341, 354 aa
1>>>pF1KE4341 354 - 354 aa - 354 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1196+/-0.000373; mu= 17.5251+/- 0.023
mean_var=68.4162+/-13.438, 0's: 0 Z-trim(112.3): 40 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.155058
statistics sampled from 21111 (21124) to 21111 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 6.230
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000931 (OMIM: 602720) serum paraoxonase/lactona ( 354) 2326 529.5 4.4e-150
NP_000296 (OMIM: 602447) serum paraoxonase/arylest ( 354) 1606 368.4 1.3e-101
NP_000437 (OMIM: 168820,612633) serum paraoxonase/ ( 355) 1495 343.6 4e-94
XP_016867846 (OMIM: 602447) PREDICTED: serum parao ( 284) 1297 299.2 7.3e-81
XP_005250510 (OMIM: 602447) PREDICTED: serum parao ( 286) 1296 299.0 8.5e-81
XP_016867847 (OMIM: 602447) PREDICTED: serum parao ( 268) 1242 286.9 3.5e-77
NP_001018171 (OMIM: 602447) serum paraoxonase/aryl ( 342) 1015 236.2 8.2e-62
>>NP_000931 (OMIM: 602720) serum paraoxonase/lactonase 3 (354 aa)
initn: 2326 init1: 2326 opt: 2326 Z-score: 2815.5 bits: 529.5 E(85289): 4.4e-150
Smith-Waterman score: 2326; 99.7% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGKLVALVLLGVGLSLVGEMFLAFRERVNASREVEPVEPENCHLIEELENGSEDIDILPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
NP_000 MGKLVALVLLGVGLSLVGEMFLAFRERVNASREVEPVEPENCHLIEELESGSEDIDILPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GLAFISSGLKYPGMPNFAPDEPGKIFLMDLNEQNPRAQALEISGGFDKELFNPHGISIFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GLAFISSGLKYPGMPNFAPDEPGKIFLMDLNEQNPRAQALEISGGFDKELFNPHGISIFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DKDNTVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQRSLVYLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DKDNTVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQRSLVYLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 RDHYFTNSLLSFFEMILDLRWTYVLFYSPREVKVVAKGFCSANGITVSADQKYVYVADVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RDHYFTNSLLSFFEMILDLRWTYVLFYSPREVKVVAKGFCSANGITVSADQKYVYVADVA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 AKNIHIMEKHDNWDLTQLKVIQLGTLVDNLTVDPATGDILAGCHPNPMKLLNYNPEDPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AKNIHIMEKHDNWDLTQLKVIQLGTLVDNLTVDPATGDILAGCHPNPMKLLNYNPEDPPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE4 SEVLRIQNVLSEKPRVSTVYANNGSVLQGTSVASVYHGKILIGTVFHKTLYCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SEVLRIQNVLSEKPRVSTVYANNGSVLQGTSVASVYHGKILIGTVFHKTLYCEL
310 320 330 340 350
>>NP_000296 (OMIM: 602447) serum paraoxonase/arylesteras (354 aa)
initn: 1606 init1: 1606 opt: 1606 Z-score: 1945.0 bits: 368.4 E(85289): 1.3e-101
Smith-Waterman score: 1606; 65.5% identity (89.5% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGKLVALVLLGVGLSLVGEMFLAFRERVNASREVEPVEPENCHLIEELENGSEDIDILPS
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NP_000 MGRLVAVGLLGIALALLGERLLALRNRLKASREVESVDLPHCHLIKGIEAGSEDIDILPN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GLAFISSGLKYPGMPNFAPDEPGKIFLMDLNEQNPRAQALEISGGFDKELFNPHGISIFI
::::.: :::.::. .::::.:: :..:::.:..:::. :.:: ::: ::::::: ::
NP_000 GLAFFSVGLKFPGLHSFAPDKPGGILMMDLKEEKPRARELRISRGFDLASFNPHGISTFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DKDNTVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQRSLVYLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYAT
:.:.::::.:::::..:.::::::::: . ::..:::.::::: :::::...:: .::::
NP_000 DNDDTVYLFVVNHPEFKNTVEIFKFEEAENSLLHLKTVKHELLPSVNDITAVGPAHFYAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 RDHYFTNSLLSFFEMILDLRWTYVLFYSPREVKVVAKGFCSANGITVSADQKYVYVADVA
::::.. .:...: :.:.:. :..::: ::::::.:: :::::..: :.::.::::.
NP_000 NDHYFSDPFLKYLETYLNLHWANVVYYSPNEVKVVAEGFDSANGINISPDDKYIYVADIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 AKNIHIMEKHDNWDLTQLKVIQLGTLVDNLTVDPATGDILAGCHPNPMKLLNYNPEDPPG
:..::..::: : .::::::..: ::::::..::..::: .::::: .::. :.:..::.
NP_000 AHEIHVLEKHTNMNLTQLKVLELDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHPNGQKLFVYDPNNPPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE4 SEVLRIQNVLSEKPRVSTVYANNGSVLQGTSVASVYHGKILIGTVFHKTLYCEL
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NP_000 SEVLRIQNILSEKPTVTTVYANNGSVLQGSSVASVYDGKLLIGTLYHRALYCEL
310 320 330 340 350
>>NP_000437 (OMIM: 168820,612633) serum paraoxonase/aryl (355 aa)
initn: 1486 init1: 1102 opt: 1495 Z-score: 1810.8 bits: 343.6 E(85289): 4e-94
Smith-Waterman score: 1495; 60.8% identity (85.6% similar) in 355 aa overlap (1-354:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGKLVALVLLGVGLSLVGEMFLAFRERVNASREVEPVEPENCHLIEELENGSEDIDILPS
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NP_000 MAKLIALTLLGMGLALFRNHQSSYQTRLNALREVQPVELPNCNLVKGIETGSEDLEILPN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 GLAFISSGLKYPGMPNFAPDEPGKIFLMDLNEQNPRAQALEISGG-FDKELFNPHGISIF
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NP_000 GLAFISSGLKYPGIKSFNPNSPGKILLMDLNEEDPTVLELGITGSKFDVSSFNPHGISTF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IDKDNTVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQRSLVYLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYA
:.::..:: ::::: :::::.:::.:...::..::::.:.:: ..::::..:::.::.
NP_000 TDEDNAMYLLVVNHPDAKSTVELFKFQEEEKSLLHLKTIRHKLLPNLNDIVAVGPEHFYG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 TRDHYFTNSLLSFFEMILDLRWTYVLFYSPREVKVVAKGFCSANGITVSADQKYVYVADV
: :::: . :. .:: : : :.::..::: ::.:::.:: ::::..: : ::::.:..
NP_000 TNDHYFLDPYLQSWEMYLGLAWSYVVYYSPSEVRVVAEGFDFANGINISPDGKYVYIAEL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 AAKNIHIMEKHDNWDLTQLKVIQLGTLVDNLTVDPATGDILAGCHPNPMKLLNYNPEDPP
:..::..::: :: :: :: ....:::::..::: :::. .::::: ::.. :. :.::
NP_000 LAHKIHVYEKHANWTLTPLKSLDFNTLVDNISVDPETGDLWVGCHPNGMKIFFYDSENPP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GSEVLRIQNVLSEKPRVSTVYANNGSVLQGTSVASVYHGKILIGTVFHKTLYCEL
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NP_000 ASEVLRIQNILTEEPKVTQVYAENGTVLQGSTVASVYKGKLLIGTVFHKALYCEL
310 320 330 340 350
>>XP_016867846 (OMIM: 602447) PREDICTED: serum paraoxona (284 aa)
initn: 1297 init1: 1297 opt: 1297 Z-score: 1572.8 bits: 299.2 E(85289): 7.3e-81
Smith-Waterman score: 1297; 66.3% identity (90.0% similar) in 279 aa overlap (76-354:6-284)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EELENGSEDIDILPSGLAFISSGLKYPGMPNFAPDEPGKIFLMDLNEQNPRAQALEISGG
.::::.:: :..:::.:..:::. :.:: :
XP_016 MRAAEHFAPDKPGGILMMDLKEEKPRARELRISRG
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 FDKELFNPHGISIFIDKDNTVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQRSLVYLKTIKHELLKS
:: ::::::: :::.:.::::.:::::..:.::::::::: . ::..:::.::::: :
XP_016 FDLASFNPHGISTFIDNDDTVYLFVVNHPEFKNTVEIFKFEEAENSLLHLKTVKHELLPS
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 VNDIVVLGPEQFYATRDHYFTNSLLSFFEMILDLRWTYVLFYSPREVKVVAKGFCSANGI
::::...:: .:::: ::::.. .:...: :.:.:. :..::: ::::::.:: :::::
XP_016 VNDITAVGPAHFYATNDHYFSDPFLKYLETYLNLHWANVVYYSPNEVKVVAEGFDSANGI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 TVSADQKYVYVADVAAKNIHIMEKHDNWDLTQLKVIQLGTLVDNLTVDPATGDILAGCHP
..: :.::.::::. :..::..::: : .::::::..: ::::::..::..::: .::::
XP_016 NISPDDKYIYVADILAHEIHVLEKHTNMNLTQLKVLELDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHP
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 NPMKLLNYNPEDPPGSEVLRIQNVLSEKPRVSTVYANNGSVLQGTSVASVYHGKILIGTV
: .::. :.:..::.::::::::.::::: :.::::::::::::.:::::: ::.::::.
XP_016 NGQKLFVYDPNNPPSSEVLRIQNILSEKPTVTTVYANNGSVLQGSSVASVYDGKLLIGTL
220 230 240 250 260 270
350
pF1KE4 FHKTLYCEL
.:..:::::
XP_016 YHRALYCEL
280
>>XP_005250510 (OMIM: 602447) PREDICTED: serum paraoxona (286 aa)
initn: 1296 init1: 1296 opt: 1296 Z-score: 1571.5 bits: 299.0 E(85289): 8.5e-81
Smith-Waterman score: 1296; 66.5% identity (89.9% similar) in 278 aa overlap (77-354:9-286)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 ELENGSEDIDILPSGLAFISSGLKYPGMPNFAPDEPGKIFLMDLNEQNPRAQALEISGGF
::::.:: :..:::.:..:::. :.:: ::
XP_005 MVWLFLVCFAPDKPGGILMMDLKEEKPRARELRISRGF
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 DKELFNPHGISIFIDKDNTVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQRSLVYLKTIKHELLKSV
: ::::::: :::.:.::::.:::::..:.::::::::: . ::..:::.::::: ::
XP_005 DLASFNPHGISTFIDNDDTVYLFVVNHPEFKNTVEIFKFEEAENSLLHLKTVKHELLPSV
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 NDIVVLGPEQFYATRDHYFTNSLLSFFEMILDLRWTYVLFYSPREVKVVAKGFCSANGIT
:::...:: .:::: ::::.. .:...: :.:.:. :..::: ::::::.:: :::::.
XP_005 NDITAVGPAHFYATNDHYFSDPFLKYLETYLNLHWANVVYYSPNEVKVVAEGFDSANGIN
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VSADQKYVYVADVAAKNIHIMEKHDNWDLTQLKVIQLGTLVDNLTVDPATGDILAGCHPN
.: :.::.::::. :..::..::: : .::::::..: ::::::..::..::: .:::::
XP_005 ISPDDKYIYVADILAHEIHVLEKHTNMNLTQLKVLELDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHPN
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 PMKLLNYNPEDPPGSEVLRIQNVLSEKPRVSTVYANNGSVLQGTSVASVYHGKILIGTVF
.::. :.:..::.::::::::.::::: :.::::::::::::.:::::: ::.::::..
XP_005 GQKLFVYDPNNPPSSEVLRIQNILSEKPTVTTVYANNGSVLQGSSVASVYDGKLLIGTLY
220 230 240 250 260 270
350
pF1KE4 HKTLYCEL
:..:::::
XP_005 HRALYCEL
280
>>XP_016867847 (OMIM: 602447) PREDICTED: serum paraoxona (268 aa)
initn: 1242 init1: 1242 opt: 1242 Z-score: 1506.6 bits: 286.9 E(85289): 3.5e-77
Smith-Waterman score: 1242; 66.4% identity (89.9% similar) in 268 aa overlap (87-354:1-268)
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ILPSGLAFISSGLKYPGMPNFAPDEPGKIFLMDLNEQNPRAQALEISGGFDKELFNPHGI
.:::.:..:::. :.:: ::: ::::::
XP_016 MMDLKEEKPRARELRISRGFDLASFNPHGI
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SIFIDKDNTVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQRSLVYLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQ
: :::.:.::::.:::::..:.::::::::: . ::..:::.::::: :::::...:: .
XP_016 STFIDNDDTVYLFVVNHPEFKNTVEIFKFEEAENSLLHLKTVKHELLPSVNDITAVGPAH
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 FYATRDHYFTNSLLSFFEMILDLRWTYVLFYSPREVKVVAKGFCSANGITVSADQKYVYV
:::: ::::.. .:...: :.:.:. :..::: ::::::.:: :::::..: :.::.::
XP_016 FYATNDHYFSDPFLKYLETYLNLHWANVVYYSPNEVKVVAEGFDSANGINISPDDKYIYV
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ADVAAKNIHIMEKHDNWDLTQLKVIQLGTLVDNLTVDPATGDILAGCHPNPMKLLNYNPE
::. :..::..::: : .::::::..: ::::::..::..::: .::::: .::. :.:.
XP_016 ADILAHEIHVLEKHTNMNLTQLKVLELDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHPNGQKLFVYDPN
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DPPGSEVLRIQNVLSEKPRVSTVYANNGSVLQGTSVASVYHGKILIGTVFHKTLYCEL
.::.::::::::.::::: :.::::::::::::.:::::: ::.::::..:..:::::
XP_016 NPPSSEVLRIQNILSEKPTVTTVYANNGSVLQGSSVASVYDGKLLIGTLYHRALYCEL
220 230 240 250 260
>>NP_001018171 (OMIM: 602447) serum paraoxonase/aryleste (342 aa)
initn: 1541 init1: 1013 opt: 1015 Z-score: 1230.7 bits: 236.2 E(85289): 8.2e-62
Smith-Waterman score: 1500; 62.7% identity (86.2% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGKLVALVLLGVGLSLVGEMFLAFRERVNASREVEPVEPENCHLIEELENGSEDIDILPS
::.:::. :::..:.:.:: .::.:.:..:::::: :. .::::. .: :::::::::.
NP_001 MGRLVAVGLLGIALALLGERLLALRNRLKASREVESVDLPHCHLIKGIEAGSEDIDILPN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GLAFISSGLKYPGMPNFAPDEPGKIFLMDLNEQNPRAQALEISGGFDKELFNPHGISIFI
::::.: :::.::. .::::.:: :..:::.:..:::. :.:: ::: ::::::: ::
NP_001 GLAFFSVGLKFPGLHSFAPDKPGGILMMDLKEEKPRARELRISRGFDLASFNPHGISTFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DKDNTVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQRSLVYLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYAT
:.. .:.::::::::: . ::..:::.::::: :::::...:: .::::
NP_001 DNE------------FKNTVEIFKFEEAENSLLHLKTVKHELLPSVNDITAVGPAHFYAT
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 RDHYFTNSLLSFFEMILDLRWTYVLFYSPREVKVVAKGFCSANGITVSADQKYVYVADVA
::::.. .:...: :.:.:. :..::: ::::::.:: :::::..: :.::.::::.
NP_001 NDHYFSDPFLKYLETYLNLHWANVVYYSPNEVKVVAEGFDSANGINISPDDKYIYVADIL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 AKNIHIMEKHDNWDLTQLKVIQLGTLVDNLTVDPATGDILAGCHPNPMKLLNYNPEDPPG
:..::..::: : .::::::..: ::::::..::..::: .::::: .::. :.:..::.
NP_001 AHEIHVLEKHTNMNLTQLKVLELDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHPNGQKLFVYDPNNPPS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE4 SEVLRIQNVLSEKPRVSTVYANNGSVLQGTSVASVYHGKILIGTVFHKTLYCEL
::::::::.::::: :.::::::::::::.:::::: ::.::::..:..:::::
NP_001 SEVLRIQNILSEKPTVTTVYANNGSVLQGSSVASVYDGKLLIGTLYHRALYCEL
290 300 310 320 330 340
354 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 17:37:34 2016 done: Mon Nov 7 17:37:35 2016
Total Scan time: 6.230 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]