Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4324
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4324, 326 aa
1>>>pF1KE4324 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0474+/-0.000845; mu= 14.3582+/- 0.051
mean_var=125.7233+/-25.296, 0's: 0 Z-trim(111.3): 154 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.114384
statistics sampled from 12099 (12264) to 12099 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 2.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 ( 326) 2279 386.9 1.2e-107
CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 ( 313) 1422 245.4 4.3e-65
CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 299) 955 168.4 6.6e-42
CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 288) 925 163.4 2e-40
CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 ( 461) 779 139.5 5e-33
CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 255) 728 130.8 1.1e-30
CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 279) 728 130.9 1.2e-30
CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358) 701 127.1 7.9e-29
CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1 ( 346) 685 123.9 1.9e-28
CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6 ( 673) 670 121.7 1.7e-27
CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 ( 493) 652 118.6 1.1e-26
CCDS83313.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 298) 641 116.5 2.6e-26
CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 497) 641 116.8 3.7e-26
CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 498) 641 116.8 3.8e-26
CCDS30943.1 TNN gene_id:63923|Hs108|chr1 (1299) 641 117.2 7.3e-26
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201) 644 117.9 7.4e-26
CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 ( 491) 604 110.6 2.6e-24
CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20 ( 503) 594 109.0 8.2e-24
CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 444) 587 107.8 1.7e-23
CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 495) 587 107.8 1.8e-23
CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 496) 587 107.8 1.8e-23
CCDS12224.1 ANGPTL6 gene_id:83854|Hs108|chr19 ( 470) 576 106.0 6.1e-23
CCDS12200.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 406) 539 99.8 3.8e-21
CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 ( 439) 538 99.7 4.5e-21
CCDS42493.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 368) 469 88.2 1.1e-17
CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8 ( 312) 456 86.0 4.2e-17
CCDS622.1 ANGPTL3 gene_id:27329|Hs108|chr1 ( 460) 442 83.9 2.7e-16
CCDS47153.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 437) 438 83.2 4.2e-16
CCDS3788.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 453) 438 83.2 4.3e-16
CCDS8312.1 ANGPTL5 gene_id:253935|Hs108|chr11 ( 388) 344 67.6 1.8e-11
>>CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 (326 aa)
initn: 2279 init1: 2279 opt: 2279 Z-score: 2046.1 bits: 386.9 E(32554): 1.2e-107
Smith-Waterman score: 2279; 100.0% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MELSGATMARGLAVLLVLFLHIKNLPAQAADTCPEVKVVGLEGSDKLTILRGCPGLPGAP
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CCDS69 MELSGATMARGLAVLLVLFLHIKNLPAQAADTCPEVKVVGLEGSDKLTILRGCPGLPGAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GPKGEAGVIGERGERGLPGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPRNCKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GPKGEAGVIGERGERGLPGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPRNCKD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LLDRGYFLSGWHTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LLDRGYFLSGWHTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SQLGEFWLGNDNIHALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEAEKYKLVLGAFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SQLGEFWLGNDNIHALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEAEKYKLVLGAFV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGPHESY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGPHESY
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 ANGINWSAAKGYKYSYKVSEMKVRPA
::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ANGINWSAAKGYKYSYKVSEMKVRPA
310 320
>>CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1420 init1: 1420 opt: 1422 Z-score: 1282.0 bits: 245.4 E(32554): 4.3e-65
Smith-Waterman score: 1719; 77.0% identity (86.8% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MELSGATMARGLAVLLVLFLHIKNLPAQAADTCPEVKVVGLEGSDKLTILRGCPGLPGAP
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CCDS69 MELDRAVGVLGAATLLLSFLGMA-WALQAADTCPEVKMVGLEGSDKLTILRGCPGLPGAP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GPKGEAGVIGERGERGLPGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPRNCKD
:::::::. :.::::: :: :::::: ::.: :: : : ::::.:::
CCDS69 GPKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEP------------QPCLTGPRTCKD
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LLDRGYFLSGWHTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFG
:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::
CCDS69 LLDRGHFLSGWHTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYKQGFG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SQLGEFWLGNDNIHALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEAEKYKLVLGAFV
:.::::::::::::::::::.::::::::::: :.:::::.:::::::::::.:::::::
CCDS69 SRLGEFWLGNDNIHALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEAEKYNLVLGAFV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGPHESY
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CCDS69 EGSAGDSLTFHNNQSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGRYLRGTHGSF
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE4 ANGINWSAAKGYKYSYKVSEMKVRPA
::::::...:::.:::::::::::::
CCDS69 ANGINWKSGKGYNYSYKVSEMKVRPA
290 300 310
>>CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 (299 aa)
initn: 1042 init1: 925 opt: 955 Z-score: 865.8 bits: 168.4 E(32554): 6.6e-42
Smith-Waterman score: 982; 47.0% identity (68.8% similar) in 317 aa overlap (12-324:4-299)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MELSGATMARGLAVLLVLFLHIKNLPA----QAADTCPEVKVVGLEGSDKLTILRGCPGL
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CCDS30 MDLLWILPSLWLLLLGGPACLKTQEHPSCPGPRE--LEAS-KVVLLPSCPGA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 PGAPGPKGEAGVIGERGERGLPGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPR
::.:: :: ::: :: :: : : :: : :: . : :::
CCDS30 PGSPGEKG---------------APGPQGPPGPPGKMGPKG---EPGDPVNLLRCQEGPR
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 NCKDLLDRGYFLSGWHTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYK
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CCDS30 NCRELLSQGATLSGWYHLCLPEGRALPVFCDMDTEGGGWLVFQRRQDGSVDFFRSWSSYR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 QGFGSQLGEFWLGNDNIHALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEAEKYKLVL
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CCDS30 AGFGNQESEFWLGNENLHQLTLQGNWELRVELEDFNGNRTFAHYATFRLLGEVDHYQLAL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GAFVGGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGP
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CCDS30 GKFSEGTAGDSLSLHSGRPFTTYDADHDSSNSNCAVIVHGAWWYASCYRSNLNGRYAVSE
220 230 240 250 260 270
300 310 320
pF1KE4 HESYANGINWSAAKGYKYSYKVSEMKVRPA
.. ::.:....: . :. .: .:
CCDS30 AAAHKYGIDWASGRGVGHPYRRVRMMLR
280 290
>>CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 (288 aa)
initn: 1251 init1: 823 opt: 925 Z-score: 839.2 bits: 163.4 E(32554): 2e-40
Smith-Waterman score: 937; 45.7% identity (67.2% similar) in 317 aa overlap (12-324:4-288)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MELSGATMARGLAVLLVLFLHIKNLPA----QAADTCPEVKVVGLEGSDKLTILRGCPGL
: .: :.: . . :: : .:: . ::.: :...: .:::
CCDS30 MDLLWILPSLWLLLLGGPACLKTQEHPSCPGPRE--LEAS-KVVLLPSCPGA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 PGAPGPKGEAGVIGERGERGLPGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPR
::.:: :: ::: :: :: : : :: :::
CCDS30 PGSPGEKG---------------APGPQGPPGPPGKMGPKG--------------EPGPR
50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 NCKDLLDRGYFLSGWHTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYK
::..::..: ::::. . ::. : : :.:::::.:::: :::::.::::::.:.:..:.
CCDS30 NCRELLSQGATLSGWYHLCLPEGRALPVFCDMDTEGGGWLVFQRRQDGSVDFFRSWSSYR
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 QGFGSQLGEFWLGNDNIHALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEAEKYKLVL
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CCDS30 AGFGNQESEFWLGNENLHQLTLQGNWELRVELEDFNGNRTFAHYATFRLLGEVDHYQLAL
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GAFVGGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGP
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CCDS30 GKFSEGTAGDSLSLHSGRPFTTYDADHDSSNSNCAVIVHGAWWYASCYRSNLNGRYAVSE
210 220 230 240 250 260
300 310 320
pF1KE4 HESYANGINWSAAKGYKYSYKVSEMKVRPA
.. ::.:....: . :. .: .:
CCDS30 AAAHKYGIDWASGRGVGHPYRRVRMMLR
270 280
>>CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 (461 aa)
initn: 734 init1: 365 opt: 779 Z-score: 706.5 bits: 139.5 E(32554): 5e-33
Smith-Waterman score: 779; 47.9% identity (68.2% similar) in 261 aa overlap (74-325:210-456)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 SDKLTILRGCPGLPGAPGPKGEAGVIGERGERGLPGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKG
.::: : : . :.: . :: .
CCDS69 GRLIQLLSESQGHMAHLVNSVSDILDALQRDRGL-GRPRN------KADLQRAPARGTR-
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150
pF1KE4 DAGQSQSCATG--PRNCKDLLDRGYFLSGWHTIYLPDCRP--LTVLCDMDTDGGGWTVFQ
..:::: ::.: :.: : .: .... : : . : ::: ::::::::::
CCDS69 ----PRGCATGSRPRDCLDVLLSGQQDDGVYSVF-PTHYPAGFQVYCDMRTDGGGWTVFQ
240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 RRMDGSVDFYRDWAAYKQGFGSQLGEFWLGNDNIHALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAK
:: ::::.:.: : ::..::: :: ::: :::::.:.. ::.::: :::.. .:.
CCDS69 RREDGSVNFFRGWDAYRDGFGRLTGEHWLGLKRIHALTTQAAYELHVDLEDFENGTAYAR
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 YKSFKVA-----DEAEKYKLVLGAFVGGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVSSSNCAEKF
: :: :. : . : :... . .:.::.:: :.. :.:::.:.: : .::: .
CCDS69 YGSFGVGLFSVDPEEDGYPLTVADY-SGTAGDSLLKHSGMRFTTKDRDSDHSENNCAAFY
350 360 370 380 390 400
280 290 300 310 320
pF1KE4 QGAWWYADCHASNLNGLYLMGPHESYANGINWSAAKGYKYSYKVSEMKVRPA
.::::: .::.::::: :: : : :::.:..::. :..:: : ::::.::
CCDS69 RGAWWYRNCHTSNLNGQYLRGAHASYADGVEWSSWTGWQYSLKFSEMKIRPVREDR
410 420 430 440 450 460
>>CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 (255 aa)
initn: 696 init1: 357 opt: 728 Z-score: 664.2 bits: 130.8 E(32554): 1.1e-30
Smith-Waterman score: 728; 47.9% identity (70.5% similar) in 234 aa overlap (100-326:24-255)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GERGERGLPGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPRNCKDLLDRGYFLS
: .::: . . : : .: :. .:: .
CCDS11 MKALLALPLLLLLSTPPCAPQVSGIRGDALE-RFCLQQPLDCDDIYAQGYQSD
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GWHTIYLPD--CRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFGSQLGEFW
: . :: :. :. :.::: :.:: :::::.:..:::.:.: : :: ::: ::.:
CCDS11 GVYLIY-PSGPSVPVPVFCDMTTEGGKWTVFQKRFNGSVSFFRGWNDYKLGFGRADGEYW
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LGNDNIHALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEA-----EKYKLVLGAFVGG
:: .:.: :: . . :::::: :::.: .::: .:... .: . : : ...: :
CCDS11 LGLQNMHLLTLKQKYELRVDLEDFENNTAYAKYADFSISPNAVSAEEDGYTLFVAGFEDG
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGPHESYAN
.::.::. :... ::: :.:.:. .::: .::.:. .:: .::::.:: : : ::::
CCDS11 GAGDSLSYHSGQKFSTFDRDQDLFVQNCAALSSGAFWFRSCHFANLNGFYLGGSHLSYAN
180 190 200 210 220 230
310 320
pF1KE4 GINWSAAKGYKYSYKVSEMKVRPA
::::. ::. :: : .:::.: :
CCDS11 GINWAQWKGFYYSLKRTEMKIRRA
240 250
>>CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 (279 aa)
initn: 696 init1: 357 opt: 728 Z-score: 663.7 bits: 130.9 E(32554): 1.2e-30
Smith-Waterman score: 728; 47.9% identity (70.5% similar) in 234 aa overlap (100-326:48-279)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GERGERGLPGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPRNCKDLLDRGYFLS
: .::: . . : : .: :. .:: .
CCDS56 KAQGVLLKLALLALPLLLLLSTPPCAPQVSGIRGDALE-RFCLQQPLDCDDIYAQGYQSD
20 30 40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GWHTIYLPD--CRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFGSQLGEFW
: . :: :. :. :.::: :.:: :::::.:..:::.:.: : :: ::: ::.:
CCDS56 GVYLIY-PSGPSVPVPVFCDMTTEGGKWTVFQKRFNGSVSFFRGWNDYKLGFGRADGEYW
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LGNDNIHALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEA-----EKYKLVLGAFVGG
:: .:.: :: . . :::::: :::.: .::: .:... .: . : : ...: :
CCDS56 LGLQNMHLLTLKQKYELRVDLEDFENNTAYAKYADFSISPNAVSAEEDGYTLFVAGFEDG
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGPHESYAN
.::.::. :... ::: :.:.:. .::: .::.:. .:: .::::.:: : : ::::
CCDS56 GAGDSLSYHSGQKFSTFDRDQDLFVQNCAALSSGAFWFRSCHFANLNGFYLGGSHLSYAN
200 210 220 230 240 250
310 320
pF1KE4 GINWSAAKGYKYSYKVSEMKVRPA
::::. ::. :: : .:::.: :
CCDS56 GINWAQWKGFYYSLKRTEMKIRRA
260 270
>>CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358 aa)
initn: 600 init1: 317 opt: 701 Z-score: 631.1 bits: 127.1 E(32554): 7.9e-29
Smith-Waterman score: 701; 49.3% identity (70.9% similar) in 213 aa overlap (115-325:1135-1342)
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 GPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPRNCKDLLDRGYFLSGWHTIYLPD--CRPL
:..: . : : ::: . :.: . :
CCDS13 YTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKL
1110 1120 1130 1140 1150 1160
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 TVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFGSQLGEFWLGNDNIHALTAQGSS
: ::: :::::: :::::..:..::.: :: :. :::. ::::: :::: .:.::
CCDS13 QVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRY
1170 1180 1190 1200 1210 1220
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 ELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEAEKYKLVLGAFVGGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQD
:::::. : . . ::.: :.: : . ::: .:.. .:.::.::. :.. :::.:.:
CCDS13 ELRVDMRDGQ-EAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY-NGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRD
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KE4 NDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGPHESYANGINWSAAKGYKYSYKVSEMK
:::. .::: ...::::: .:: .:::: : . : ..:::: ::...: :::
CCDS13 NDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRH---SQGINWYHWKGHEFSIPFVEMK
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE4 VRPA
.::
CCDS13 MRPYNHRLMAGRKRQSLQF
1340 1350
>>CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1 (346 aa)
initn: 310 init1: 310 opt: 685 Z-score: 624.2 bits: 123.9 E(32554): 1.9e-28
Smith-Waterman score: 685; 45.7% identity (74.0% similar) in 223 aa overlap (108-325:121-341)
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 PGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPRNCKDLLDRGYFLSGWHTIYLP
.:. : . .:..: ...: .:: . . :
CCDS12 MESRLTDAESKYSEMNNQIDIMQLQAAQTVTQTSADAIYDCSSLYQKNYRISGVYKLP-P
100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 D---CRP-LTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFGSQLGEFWLGNDNI
: : : :.:::.:.:::::..::: .: :.::::: ::::::: :.:::::..:
CCDS12 DDFLGSPELEVFCDMETSGGGWTIIQRRKSGLVSFYRDWKQYKQGFGSIRGDFWLGNEHI
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 HALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEAEKYKLVLGAFVGGSAGNSLTGHNN
: :. : ..:::.. :.::: ..:.:. : ...: ..:.: :: ..:. ....: :::
CCDS12 HRLSRQ-PTRLRVEMEDWEGNLRYAEYSHFVLGNELNSYRLFLGNYTGNVGNDALQYHNN
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NFFSTKDQDNDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYL-MGPHESYANGINWSAAKGY
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CCDS12 TAFSTKDKDNDNCLDKCAQLRKGGYWYNCCTDSNLNGVYYRLGEHNKHLDGITWYGWHGS
270 280 290 300 310 320
320
pF1KE4 KYSYKVSEMKVRPA
:: : :::.::
CCDS12 TYSLKRVEMKIRPEDFKP
330 340
>>CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6 (673 aa)
initn: 668 init1: 350 opt: 670 Z-score: 607.2 bits: 121.7 E(32554): 1.7e-27
Smith-Waterman score: 673; 42.0% identity (66.2% similar) in 269 aa overlap (70-325:401-663)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 GLEGSDKLTILRGCPGLPGAPGPKGEAGVIGERGERGLPGAPGKAGPVG--PKGDRGEK-
:. : :::. . .: :. . . .
CCDS47 KEVTPRTALLTWTEPPVRPAGYLLSFHTPGGQNQEILLPGGITSHQLLGLFPSTSYNARL
380 390 400 410 420 430
100 110 120 130 140
pF1KE4 -GMRGEKGDAGQSQSCATG------PRNCKDLLDRGYFLSGWHTIYLPDCR--PLTVLCD
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CCDS47 QAMWGQSLLPPVSTSFTTGGLRIPFPRDCGEEMQNGAGASRTSTIFLNGNRERPLNVFCD
440 450 460 470 480 490
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 MDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFGSQLGEFWLGNDNIHALTAQGSSELRVD
:.:::::: ::::::::..::.::: : .:::. :::::::. .:.:: :. .:::
CCDS47 METDGGGWLVFQRRMDGQTDFWRDWEDYAHGFGNISGEFWLGNEALHSLTQAGDYSMRVD
500 510 520 530 540 550
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 LVDFEGNHQ-FAKYKSFKVADEAEKYKLVLGAFVGGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVS
: :.. ::.: ::.: . :: :.: : .. :.::.:.. :... ::..:.: .
CCDS47 LR--AGDEAVFAQYDSFHVDSAAEYYRLHLEGY-HGTAGDSMSYHSGSVFSARDRDPNSL
560 570 580 590 600
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CCDS47 LISCAVSYRGAWWYRNCHYANLNGLY--GSTVDH-QGVSWYHWKGFEFSVPFTEMKLRPR
610 620 630 640 650 660
CCDS47 NFRSPAGGG
670
326 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 17:26:47 2016 done: Mon Nov 7 17:26:47 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]