Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4319
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4319, 325 aa
1>>>pF1KE4319 325 - 325 aa - 325 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4755+/-0.000805; mu= 14.9305+/- 0.048
mean_var=65.4871+/-13.184, 0's: 0 Z-trim(107.1): 28 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.158488
statistics sampled from 9382 (9403) to 9382 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 2218 515.8 1.8e-146
CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1080 255.6 3.8e-68
CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1055 249.9 2e-66
CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 932 221.8 6.3e-58
CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 922 219.5 2.9e-57
CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 918 218.6 5.5e-57
CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 914 217.6 1e-56
CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 900 214.4 9.6e-56
CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 870 207.6 1.1e-53
CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 866 206.7 2.1e-53
CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 786 188.4 6.1e-48
CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 508 124.8 9.1e-29
CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 485 119.5 3.3e-27
CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 418 104.2 1.3e-22
CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 382 95.9 3.1e-20
CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 382 96.0 3.6e-20
CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 356 89.9 1.3e-18
>>CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 (325 aa)
initn: 2218 init1: 2218 opt: 2218 Z-score: 2742.9 bits: 515.8 E(32554): 1.8e-146
Smith-Waterman score: 2218; 100.0% identity (100.0% similar) in 325 aa overlap (1-325:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPEIGEAL
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CCDS52 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPEIGEAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPYAFER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 KEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPYAFER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSVASVRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSVASVRP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVVLALAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 AVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVVLALAEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNKNWRYIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 YGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNKNWRYIV
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 PMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY
:::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY
310 320
>>CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 1076 init1: 484 opt: 1080 Z-score: 1336.9 bits: 255.6 E(32554): 3.8e-68
Smith-Waterman score: 1087; 49.5% identity (75.7% similar) in 325 aa overlap (3-325:2-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPEIGEAL
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CCDS58 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWKSPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENEVGVAI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPYAFER
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CCDS58 QEKLRE-QVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTGFKP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 GDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSVASVR-
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CCDS58 GKEFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKPGLKY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 -PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVVLALA
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CCDS58 KPAVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPRIKAIA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 EKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNKNWRY
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CCDS58 AKHNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYNRNWR-
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE4 IVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY
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CCDS58 VCALLSC--------TSHKDYPFHEEF
300 310
>>CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 1097 init1: 486 opt: 1055 Z-score: 1306.0 bits: 249.9 E(32554): 2e-66
Smith-Waterman score: 1055; 51.5% identity (77.8% similar) in 297 aa overlap (3-297:2-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPEIGEAL
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CCDS58 MATFVELSTKAKMPIVGLGTWKSPLGKVKEAVKVAIDAGYRHIDCAYVYQNEHEVGEAI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPYAFER
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CCDS58 QEKIQE-KAVKREDLFIVSKLWPTFFERPLVRKAFEKTLKDLKLSYLDVYLIHWPQGFKS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 GDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSVASVR-
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CCDS58 GDDLFPKDDKGNAIGGKATFLDAWEAMEELVDEGLVKALGVSNFSHFQIEKLLNKPGLKY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 -PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVVLALA
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CCDS58 KPVTNQVECHPYLTQEKLIQYCHSKGITVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPKIKEIA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 EKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNKNWRY
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CCDS58 AKHKKTAAQVLIRFHIQRNVIVIPKSVTPARIVENIQVFDFKLSDEEMATILSFNRNWRA
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE4 IVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY
CCDS58 CNVLQSSHLEDYPFNAEY
300 310
>>CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 (344 aa)
initn: 963 init1: 471 opt: 932 Z-score: 1153.4 bits: 221.8 E(32554): 6.3e-58
Smith-Waterman score: 932; 49.5% identity (77.7% similar) in 273 aa overlap (27-297:54-325)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPEI
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CCDS47 VGPLTGLKSSLLKDTTSAGPLLRPYPASLLGKVKEAVKVAIDAEYRHIDCAYFYENQHEV
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GEALKEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPY
:::..: . ::: ::.::..::.: : . :. :..::: ::.: :::.::.:::
CCDS47 GEAIQEKIQE-KAVMREDLFIVSKVWPTFFERPLVRKAFEKTLKDLKLSYLDVYLIHWPQ
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 AFERGDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSVA
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CCDS47 GFKTGDDFFPKDDKGNMISGKGTFLDAWEAMEELVDEGLVKALGVSNFNHFQIERLLNKP
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SVR--PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVV
... :.. ::::::::.:..:: .:...:. ::::::::: :: : :..: :::.: .
CCDS47 GLKYKPVTNQVECHPYLTQEKLIQYCHSKGITVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPKI
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LALAEKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNK
.: :. .. ::.:.:...::.: ::::.::..:..::.:::: .: ::: . ..:.
CCDS47 KEIAAKHKKTTAQVLIRFHIQRNVTVIPKSMTPAHIVENIQVFDFKLSDEEMATILSFNR
270 280 290 300 310 320
300 310 320
pF1KE4 NWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY
:::
CCDS47 NWRAFDFKEFSHLEDFPFDAEY
330 340
>>CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 883 init1: 336 opt: 922 Z-score: 1141.5 bits: 219.5 E(32554): 2.9e-57
Smith-Waterman score: 922; 44.3% identity (72.8% similar) in 327 aa overlap (5-325:7-323)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWK-SEPGQVKA--AVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPE
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CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 IGEALKEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWP
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CCDS70 VGLAIRSKIADG-SVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFP
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 YAFERGDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSV
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CCDS70 VSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ASVR--PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSS-DRAWRDPDEPVLLEEP
... :. :::::::. : .:. :... . ..::: ::: .. : ::. :::::.:
CCDS70 PGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VVLALAEKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNAL
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CCDS70 VLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE4 NKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY
:.: :: ::.: :: : :::.: :
CCDS70 NRNVRY----LTLDIF-----AGPPNYPFSDEY
300 310 320
>>CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 907 init1: 332 opt: 918 Z-score: 1136.5 bits: 218.6 E(32554): 5.5e-57
Smith-Waterman score: 918; 44.0% identity (72.8% similar) in 327 aa overlap (5-325:7-323)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWK-SEPGQVKA--AVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPE
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CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 IGEALKEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWP
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CCDS70 VGLAIRSKIADG-SVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFP
70 80 90 100 110
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pF1KE4 YAFERGDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSV
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CCDS70 VSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ASVR--PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSS-DRAWRDPDEPVLLEEP
... :. :::::::. : .:. :... . ..::: ::: .. : ::. :::::.:
CCDS70 PGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VVLALAEKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNAL
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CCDS70 VLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE4 NKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY
:.: :: ::.: :: : :::.: :
CCDS70 NRNVRY----LTLDIF-----AGPPNYPFSDEY
300 310 320
>>CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 870 init1: 327 opt: 914 Z-score: 1131.5 bits: 217.6 E(32554): 1e-56
Smith-Waterman score: 914; 43.8% identity (72.8% similar) in 331 aa overlap (2-325:6-326)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTW---KSEP-GQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGN
:. . : :...:.:::::. :: : : ..:: :...:::::: : :: :
CCDS58 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 EPEIGEALKEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLM
: :.:::..: .. :: : ::..: .::: :.: :: :.:.:..:: :::.:.:::..
CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGK-VRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYII
70 80 90 100 110
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pF1KE4 HWPYAFERGDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDI
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CCDS58 EVPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELI
120 130 140 150 160 170
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pF1KE4 LSVASVR--PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSS-DRAWRDPDEPVLL
:. ... :. :::::::..: .:. :: . . .:::::::.: . : . . : ::
CCDS58 LNKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EEPVVLALAEKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQL
.. .. .:...:... :::.::...:: :. ::::.. :: .:...:::... ::::..
CCDS58 KDALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE4 NALNKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY
.::::: :.. .. : :: :::.: :
CCDS58 EALNKNVRFVELLMWRD---------HPEYPFHDEY
300 310 320
>>CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 869 init1: 340 opt: 900 Z-score: 1114.3 bits: 214.4 E(32554): 9.6e-56
Smith-Waterman score: 900; 42.0% identity (72.4% similar) in 326 aa overlap (6-325:8-323)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAV---KYALSVGYRHIDCAAIYGNEPE
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