Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4314
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4314, 323 aa
1>>>pF1KE4314 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6571+/-0.000876; mu= 13.6759+/- 0.052
mean_var=65.4913+/-13.516, 0's: 0 Z-trim(105.8): 29 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.158483
statistics sampled from 8571 (8598) to 8571 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 2171 505.2 2.8e-143
CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 2123 494.2 5.7e-140
CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1907 444.8 4.2e-125
CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1903 443.9 7.8e-125
CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 1807 422.0 3.2e-118
CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 1313 309.0 3.2e-84
CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 1188 280.4 1.2e-75
CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 1163 274.7 6.1e-74
CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1064 252.1 4.3e-67
CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1020 242.0 4.6e-64
CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 952 226.5 2.4e-59
CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 918 218.7 4.9e-57
CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 813 194.6 3.9e-50
CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 593 144.4 1.1e-34
CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 587 143.0 2.7e-34
CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 348 88.3 6e-18
CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 348 88.4 7e-18
>>CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 2171 init1: 2171 opt: 2171 Z-score: 2685.8 bits: 505.2 E(32554): 2.8e-143
Smith-Waterman score: 2171; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
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CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
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CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
:::::::::::::::::::::::
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 2123 init1: 2123 opt: 2123 Z-score: 2626.5 bits: 494.2 E(32554): 5.7e-140
Smith-Waterman score: 2123; 97.8% identity (99.4% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::.::::::
CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.: ::::::::
CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
:::::::::::::::::::::::
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1907 init1: 1907 opt: 1907 Z-score: 2359.5 bits: 444.8 E(32554): 4.2e-125
Smith-Waterman score: 1907; 87.0% identity (95.7% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
::::.::::::::::::::::::::: :::.:::::..::::::::.::::::.::::::
CCDS70 MDSKHQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
:::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::: :::. ::::::::::: :.
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
:.:::::. : :::::..:: ::::.:::::::::::::::::::::::.: ::::::::
CCDS70 SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
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CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::.
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
::..:.. : ::. ::::.::::
CCDS70 RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
310 320
>>CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1903 init1: 1903 opt: 1903 Z-score: 2354.6 bits: 443.9 E(32554): 7.8e-125
Smith-Waterman score: 1903; 86.7% identity (95.7% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
::::.::.:::::::::::::::::: :::.:::::..::::::::.::::::.::::::
CCDS73 MDSKHQCLKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
:::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::: :::. ::::::::::: :.
CCDS73 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
:.:::::. : :::::..:: ::::.:::::::::::::::::::::::.: ::::::::
CCDS73 SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.:.. ::::::::::::::
CCDS73 GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::.
CCDS73 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
::..:.. : ::. ::::.::::
CCDS73 RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
310 320
>>CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1807 init1: 1807 opt: 1807 Z-score: 2236.0 bits: 422.0 E(32554): 3.2e-118
Smith-Waterman score: 1807; 81.4% identity (94.4% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
:: ::: :.::::::::::::::::: :::...:.:..::::::::.:::::..::::::
CCDS70 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
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CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
..:::: .:::::::..:::::: ::::.::::::::::::::::::: : ::::::::
CCDS70 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNCRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::.:: :::::::::::::::.::::..:.. ::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::.::..::::
CCDS70 LCALAKKHKQTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
:: ::...:.. :.:::::::
CCDS70 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
310 320
>>CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 1302 init1: 1253 opt: 1313 Z-score: 1625.5 bits: 309.0 E(32554): 3.2e-84
Smith-Waterman score: 1313; 58.4% identity (85.2% similar) in 317 aa overlap (8-323:10-326)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYA-PAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNN
. :.::. .:..:.:::. : .::. .::.::..:..:::.:..:.:
CCDS58 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIH
:..:: ::: :::.:.:.:::::: .:::...: ::.:::.:::.:. :::::::::.:.
CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FPVSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMIL
:.. :::.:. :.::::: :. .::::::::: ::::::.::.::::::.: ::.::
CCDS58 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLE
::::::.::: :::::::::.: ::: ::...:::..::: ::. :. ::. .:: ::.
CCDS58 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAID
: .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::..: :.:.:.:: :::: :.
CCDS58 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE4 GLNRNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
.::.:::.. : .. :.::: :::
CCDS58 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
310 320
>>CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (297 aa)
initn: 1175 init1: 1175 opt: 1188 Z-score: 1471.7 bits: 280.4 E(32554): 1.2e-75
Smith-Waterman score: 1925; 92.0% identity (92.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SVK--------------------------AMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
220 230 240 250 260 270
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
:::::::::::::::::::::::
CCDS81 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
280 290
>>CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (290 aa)
initn: 1152 init1: 1103 opt: 1163 Z-score: 1441.0 bits: 274.7 E(32554): 6.1e-74
Smith-Waterman score: 1163; 59.2% identity (85.9% similar) in 277 aa overlap (8-283:10-286)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYA-PAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNN
. :.::. .:..:.:::. : .::. .::.::..:..:::.:..:.:
CCDS55 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIH
:..:: ::: :::.:.:.:::::: .:::...: ::.:::.:::.:. :::::::::.:.
CCDS55 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FPVSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMIL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]