Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4286
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4286, 1631 aa
1>>>pF1KE4286 1631 - 1631 aa - 1631 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2740+/-0.00117; mu= 19.5132+/- 0.070
mean_var=95.6225+/-18.737, 0's: 0 Z-trim(102.5): 49 B-trim: 8 in 1/51
Lambda= 0.131158
statistics sampled from 6953 (6986) to 6953 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 6.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1144.1 IQGAP3 gene_id:128239|Hs108|chr1 (1631) 10553 2008.8 0
CCDS10362.1 IQGAP1 gene_id:8826|Hs108|chr15 (1657) 5923 1132.7 0
CCDS75262.1 IQGAP2 gene_id:10788|Hs108|chr5 (1525) 3728 717.3 9.4e-206
CCDS34188.1 IQGAP2 gene_id:10788|Hs108|chr5 (1575) 3728 717.3 9.7e-206
CCDS68898.1 IQGAP2 gene_id:10788|Hs108|chr5 (1071) 2828 546.9 1.3e-154
CCDS68897.1 IQGAP2 gene_id:10788|Hs108|chr5 (1071) 2828 546.9 1.3e-154
>>CCDS1144.1 IQGAP3 gene_id:128239|Hs108|chr1 (1631 aa)
initn: 10553 init1: 10553 opt: 10553 Z-score: 10786.4 bits: 2008.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10553; 99.8% identity (99.9% similar) in 1631 aa overlap (1-1631:1-1631)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MERRAAGPGWAAYERLTAEEMDEQRRQNVAYQYLCRLEEAKRWMEACLKEELPSPVELEE
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CCDS11 MERRAAGPGWAAYERLTAEEMDEQRRQNVAYQYLCRLEEAKRWMEACLKEELPSPVELEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SLRNGVLLAKLGHCFAPSVVPLKKIYDVEQLRYQATGLHFRHTDNINFWLSAIAHIGLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLRNGVLLAKLGHCFAPSVVPLKKIYDVEQLRYQATGLHFRHTDNINFWLSAIAHIGLPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TFFPETTDIYDKKNMPRVVYCIHALSLFLFRLGLAPQIHDLYGKVKFTAEELSNMASELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TFFPETTDIYDKKNMPRVVYCIHALSLFLFRLGLAPQIHDLYGKVKFTAEELSNMASELA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KYGLQLPAFSKIGGILANELSVDEAAVHAAVLAINEAVERGVVEDTLAALQNPSALLENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KYGLQLPAFSKIGGILANELSVDEAAVHAAVLAINEAVERGVVEDTLAALQNPSALLENL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 REPLAAVYQEMLAQAKMEKAANARNHDDRESQDIYDHYLTQAEIQGNINHVNAHGALEVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS11 REPLAAVYQEMLAQAKMEKAANARNHDDRESQDIYDHYLTQAEIQGNINHVNVHGALEVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DDALERQSPEALLKALQDPALALRGVRRDFADWYLEQLNSDREQKAQELGLVELLEKEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDALERQSPEALLKALQDPALALRGVRRDFADWYLEQLNSDREQKAQELGLVELLEKEEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QAGVAAANTKGDQEQAMLHAVQRINKAIRRGVAADTVKELMCPEAQLPPVYPVASSMYQL
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QAGVAAANTKGDQEQAMLHAVQRINKAIRRRVAADTVKELMCPEAQLPPVYPVASSMYQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ELAVLQQQQGELGQEELFVAVEMLSAVVLINRALEARDASGFWSSLVNPATGLAEVEGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ELAVLQQQQGELGQEELFVAVEMLSAVVLINRALEARDASGFWSSLVNPATGLAEVEGEN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 AQRYFDALLKLRQERGMGEDFLSWNDLQATVSQVNAQTQEETDRVLAVSLINEALDKGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AQRYFDALLKLRQERGMGEDFLSWNDLQATVSQVNAQTQEETDRVLAVSLINEALDKGSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 EKTLSALLLPAAGLDDVSLPVAPRYHLLLVAAKRQKAQVTGDPGAVLWLEEIRQGVVRAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKTLSALLLPAAGLDDVSLPVAPRYHLLLVAAKRQKAQVTGDPGAVLWLEEIRQGVVRAN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 QDTNTAQRMALGVAAINQAIKEGKAAQTERVLRNPAVALRGVVPDCANGYQRALESAMAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QDTNTAQRMALGVAAINQAIKEGKAAQTERVLRNPAVALRGVVPDCANGYQRALESAMAK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 KQCPADTAFWVQHDMKDGTAYYFHLQTFQGIWEQPPGCPLNTSHLTREEIQSAVTKVTAA
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KQRPADTAFWVQHDMKDGTAYYFHLQTFQGIWEQPPGCPLNTSHLTREEIQSAVTKVTAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 YDRQQLWKANVGFVIQLQARLRGFLVRQKFAEHSHFLRTWLPAVIKIQAHWRGYRQRKIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YDRQQLWKANVGFVIQLQARLRGFLVRQKFAEHSHFLRTWLPAVIKIQAHWRGYRQRKIY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 LEWLQYFKANLDAIIKIQAWARMWAARRQYLRRLHYFQKNVNSIVKIQAFFRARKAQDDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEWLQYFKANLDAIIKIQAWARMWAARRQYLRRLHYFQKNVNSIVKIQAFFRARKAQDDY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 RILVHAPHPPLSVVRRFAHLLNQSQQDFLAEAELLKLQEEVVRKIRSNQQLEQDLNIMDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RILVHAPHPPLSVVRRFAHLLNQSQQDFLAEAELLKLQEEVVRKIRSNQQLEQDLNIMDI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 KIGLLVKNRITLQEVVSHCKKLTKRNKEQLSDMMVLDKQKGLKSLSKEKRQKLEAYQHLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KIGLLVKNRITLQEVVSHCKKLTKRNKEQLSDMMVLDKQKGLKSLSKEKRQKLEAYQHLF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 YLLQTQPIYLAKLIFQMPQNKTTKFMEAVIFSLYNYASSRREAYLLLQLFKTALQEEIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YLLQTQPIYLAKLIFQMPQNKTTKFMEAVIFSLYNYASSRREAYLLLQLFKTALQEEIKS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 KVEQPQDVVTGNPTVVRLVVRFYRNGRGQSALQEILGKVIQDVLEDKVLSVHTDPVHLYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KVEQPQDVVTGNPTVVRLVVRFYRNGRGQSALQEILGKVIQDVLEDKVLSVHTDPVHLYK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE4 NWINQTEAQTGQRSHLPYDVTPEQALSHPEVQRRLDIALRNLLAMTDKFLLAITSSVDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NWINQTEAQTGQRSHLPYDVTPEQALSHPEVQRRLDIALRNLLAMTDKFLLAITSSVDQI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE4 PYGMRYVAKVLKATLAEKFPDATDSEVYKVVGNLLYYRFLNPAVVAPDAFDIVAMAAGGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PYGMRYVAKVLKATLAEKFPDATDSEVYKVVGNLLYYRFLNPAVVAPDAFDIVAMAAGGA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LAAPQRHALGAVAQLLQHAAAGKAFSGQSQHLRVLNDYLEETHLKFRKFIHRACQVPEPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAAPQRHALGAVAQLLQHAAAGKAFSGQSQHLRVLNDYLEETHLKFRKFIHRACQVPEPE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 ERFAVDEYSDMVAVAKPMVYITVGELVNTHRLLLEHQDCIAPDHQDPLHELLEDLGELPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERFAVDEYSDMVAVAKPMVYITVGELVNTHRLLLEHQDCIAPDHQDPLHELLEDLGELPT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 IPDLIGESIAADGHTDLSKLEVSLTLTNKFEGLEADADDSNTRSLLLSTKQLLADIIQFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPDLIGESIAADGHTDLSKLEVSLTLTNKFEGLEADADDSNTRSLLLSTKQLLADIIQFH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 PGDTLKEILSLSASREQEAAHKQLMSRRQACTAQTPEPLRRHRSLTAHSLLPLAEKQRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGDTLKEILSLSASREQEAAHKQLMSRRQACTAQTPEPLRRHRSLTAHSLLPLAEKQRRV
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 LRNLRRLEALGLVSARNGYQGLVDELAKDIRNQHRHRHRRKAELVKLQATLQGLSTKTTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRNLRRLEALGLVSARNGYQGLVDELAKDIRNQHRHRHRRKAELVKLQATLQGLSTKTTF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE4 YEEQGDYYSQYIRACLDHLAPDSKSSGKGKKQPSLHYTAAQLLEKGVLVEIEDLPASHFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YEEQGDYYSQYIRACLDHLAPDSKSSGKGKKQPSLHYTAAQLLEKGVLVEIEDLPASHFR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE4 NVIFDITPGDEAGKFEVNAKFLGVDMERFQLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFNKAKVNVNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NVIFDITPGDEAGKFEVNAKFLGVDMERFQLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFNKAKVNVNLL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630
pF1KE4 IFLLNKKFLRK
:::::::::::
CCDS11 IFLLNKKFLRK
1630
>>CCDS10362.1 IQGAP1 gene_id:8826|Hs108|chr15 (1657 aa)
initn: 4879 init1: 1813 opt: 5923 Z-score: 6051.5 bits: 1132.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6380; 59.4% identity (83.8% similar) in 1636 aa overlap (14-1631:24-1657)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MERRAAGPGWAAYERLTAEEMDEQRRQNVAYQYLCRLEEAKRWMEACLKE
::::::::::.:::::::.:::.:::::::::::: :
CCDS10 MSAADEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ELPSPVELEESLRNGVLLAKLGHCFAPSVVPLKKIYDVEQLRYQATGLHFRHTDNINFWL
.:: .::::.::::: :::::. :.:.:: :::::: :: ::.:::::::::::. ::
CCDS10 DLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SAIAHIGLPSTFFPETTDIYDKKNMPRVVYCIHALSLFLFRLGLAPQIHDLYGKVKFTAE
.:. .::::. :.::::::::.::::: .::::::::.::.:::::::.:::::: :: :
CCDS10 NAMDEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ELSNMASELAKYGLQLPAFSKIGGILANELSVDEAAVHAAVLAINEAVERGVVEDTLAAL
:..:: .:: :::.:.::::::::::::::::::::.::::.:::::..: . ::.:::
CCDS10 EINNMKTELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDRRIPADTFAAL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE4 QNPSALLENLREPLAAVYQEMLAQAKMEKAANARN---HDDRESQDIYDHYLTQAEIQGN
.::.:.: ::.::::..::..: :::..: .::.: ...:: .:.:.. :::::::::
CCDS10 KNPNAMLVNLEEPLASTYQDILYQAKQDKMTNAKNRTENSERE-RDVYEELLTQAEIQGN
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 INHVNAHGALEVVDDALERQSPEALLKALQDPALALRGVRRDFADWYLEQLNSDREQKAQ
::.::. .:: .: :::. . ::..:::.:::.:::.... .::::.:: ::..:: :
CCDS10 INKVNTFSALANIDLALEQGDALALFRALQSPALGLRGLQQQNSDWYLKQLLSDKQQKRQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ELGLVELLEKEEVQAGVAAANTKGDQEQAMLHAVQRINKAIRRGVAADTVKELMCPEAQL
: .. :.:::.:.:: :::. ..: : : :: :: ::..::: :: ::: :::::
CCDS10 S-GQTDPLQKEELQSGVDAANSAAQQYQRRLAAVALINAAIQKGVAEKTVLELMNPEAQL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 PPVYPVASSMYQLELAVLQQQQGE--LGQEELFVAVEMLSAVVLINRALEARDASGFWSS
: ::: :...:: :::.::.:. : : . :: :::::::.:.:::::::. :.. :..
CCDS10 PQVYPFAADLYQKELATLQRQSPEHNLTHPELSVAVEMLSSVALINRALESGDVNTVWKQ
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 LVNPATGLAEVEGENAQRYFDALLKLR-QERGMGEDFLSWNDLQATVSQVNAQTQEETDR
: . .:::...: :: :::.: :.::. : .. ...:..:::.:: :..:: .::: .:
CCDS10 LSSSVTGLTNIEEENCQRYLDELMKLKAQAHAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHER
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 VLAVSLINEALDKGSPEKTLSALLLPAAGLDDVSLPVAPRYHLLLVAAKRQKAQVTGDPG
.::..:::::::.:. .:::.:: .::: :. : :: .:. :. :::.::: : .
CCDS10 ILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDES
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 AVLWLEEIRQGVVRANQDTNTAQRMALGVAAINQAIKEGKAAQTERVLRNPAVALRGVVP
:::::.::. :. ..:.::. ::..:::. :::.:.. : ...: .::.: :.: ::.:
CCDS10 AVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGIFAINEAVESGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIP
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 DCANGYQRALESAMAKKQCPADT-AFWVQHDMKDGTAYYFHLQTFQGIWEQPPGCPLNTS
.:.. :. : : :: .:. . ::.: .: : :: .:.: .: :..::. :.
CCDS10 ECGETYHSDLAEAKKKKLAVGDNNSKWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFVQNSM
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 HLTREEIQSAVTKVTAAYDRQQLWKANVGFVIQLQARLRGFLVRQKFAEHSHFLRTWLPA
.:.::::::... :::::.:.::: :: :.. .:::: ::.::::.: . .::. .::
CCDS10 QLSREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 VIKIQAHWRGYRQRKIYLEWLQYFKANLDAIIKIQAWARMWAARRQYLRRLHYFQKNVNS
. ::..::::.:.: : . : :.... : ..:::. ::: ::..: ::.::. ..:.
CCDS10 ITCIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYLRSHKDEVVKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHIND
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE4 IVKIQAFFRARKAQDDYRILVHAPHPPLSVVRRFAHLLNQSQQDFLAEAELLKLQEEVVR
:.:::::.:: ::.:::. :..: ::. :::.:.:::.::.::: : .:.:..:::.
CCDS10 IIKIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMVVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVIT
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KE4 KIRSNQQLEQDLNIMDIKIGLLVKNRITLQEVVSHCKKLTKRNKEQLSDMMVLDKQKG-L
::::::::.:::.:::::::::::.::::.:::: :::::.:::::::::...:::: :
CCDS10 LIRSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGL
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 KSLSKEKRQKLEAYQHLFYLLQTQPIYLAKLIFQMPQNKTTKFMEAVIFSLYNYASSRRE
:.::::::.::::::::::::::.: :::::::::::::.::::..:::.::::::..::
CCDS10 KALSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQRE
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE4 AYLLLQLFKTALQEEIKSKVEQPQDVVTGNPTVVRLVVRFYRNGRGQSALQEILGKVIQD
::::.::::::::::::::.: :..:::::::...:: : :..:::.::..::. :...
CCDS10 EYLLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE4 VLEDKVLSVHTDPVHLYKNWINQTEAQTGQRSHLPYDVTPEQALSHPEVQRRLDIALRNL
...:: :...:::: .::.:.:: :.:::. :.:::::::::::.: ::. ::: ..::.
CCDS10 IMDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNM
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE4 LAMTDKFLLAITSSVDQIPYGMRYVAKVLKATLAEKFPDATDSEVYKVVGNLLYYRFLNP
:.::::: ::.::::.::::::..::::: .: :::::: ..:. :..:::::::..::
CCDS10 RAVTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNP
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE4 AVVAPDAFDIVAMAAGGALAAPQRHALGAVAQLLQHAAAGKAFSGQSQHLRVLNDYLEET
:.::::::::. ..::: :.. ::. ::..:..:::::..: : :.. :: ..:.:: ..
CCDS10 AIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE4 HLKFRKFIHRACQVPEPEERFAVDEYSDMVAVAKPMVYITVGELVNTHRLLLEHQDCIAP
. :::.:.. ::.::: ...: ::::::.:...::..::..::..::: :::.::: :::
CCDS10 YQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAP
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1310 1320 1330 1340 1350
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.:.::.::::.::::.::: .::::: . .. :.: ::::::::::. . .
CCDS10 EHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNLNDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAE
1320 1330 1340 1350 1360 1370
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..:..::.::.:..:.:.:.::.:: ::: :. :::: :.. :.:: :.::. .
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1380 1390 1400 1410 1420 1430
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.. .:. : : : ::.... .:..: :: :. .: :: :....:.:::::.:.:.:
CCDS10 KKSKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRYRQR
1440 1450 1460 1470 1480 1490
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1600 1610 1620 1630
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CCDS10 YQDLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK
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:: .:: :::.:.:.::::::::::::::::::.::::.:::::::.:..:.:...:.::
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CCDS34 LLKLFKTALEEEIKSKVDQVQDIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNTLRQLLAPVVKEIID
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CCDS34 DKSLIINTNPVEVYKAWVNQLETQTGEASKLPYDVTTEQALTYPEVKNKLEASIENLRRV
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... .:. . ::: .:.:.. :::: :: : ::..: :: ...:.:::::::. .:.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]