Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4263
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4263, 1068 aa
1>>>pF1KE4263 1068 - 1068 aa - 1068 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4840+/-0.00116; mu= 14.6674+/- 0.069
mean_var=70.3836+/-14.327, 0's: 0 Z-trim(102.2): 57 B-trim: 42 in 1/49
Lambda= 0.152876
statistics sampled from 6795 (6844) to 6795 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 4.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9129.1 UBE3B gene_id:89910|Hs108|chr12 (1068) 7111 1578.3 0
CCDS58277.1 UBE3B gene_id:89910|Hs108|chr12 ( 244) 1405 319.9 4.4e-87
CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083) 952 220.0 2.3e-56
CCDS77499.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1216) 559 133.3 3.2e-30
CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX (4374) 567 135.1 3.3e-30
CCDS33354.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1572) 559 133.3 4.1e-30
CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 ( 900) 543 129.8 2.7e-29
CCDS69286.1 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1572) 545 130.2 3.5e-29
CCDS5469.2 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1606) 545 130.2 3.6e-29
CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1247) 543 129.8 3.8e-29
CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1303) 543 129.8 3.9e-29
CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1319) 543 129.8 4e-29
CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6 ( 909) 530 126.9 2e-28
CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 834) 513 123.1 2.5e-27
CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 854) 513 123.1 2.5e-27
CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 911) 513 123.1 2.7e-27
CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 947) 513 123.1 2.8e-27
CCDS45873.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 955) 513 123.1 2.8e-27
CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 967) 513 123.1 2.9e-27
CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 975) 513 123.1 2.9e-27
CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 752) 509 122.3 4.1e-27
CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 862) 509 122.3 4.7e-27
CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 903) 509 122.3 4.9e-27
CCDS34689.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 731) 501 120.5 1.4e-26
CCDS34690.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 757) 501 120.5 1.4e-26
CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17 ( 748) 499 120.0 1.9e-26
CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 431) 494 118.9 2.4e-26
CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 754) 494 118.9 4.1e-26
CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 870) 494 118.9 4.7e-26
CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8 ( 922) 491 118.3 7.9e-26
CCDS41971.1 AREL1 gene_id:9870|Hs108|chr14 ( 823) 490 118.1 8.2e-26
CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 776) 316 79.7 2.8e-14
CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 780) 316 79.7 2.8e-14
>>CCDS9129.1 UBE3B gene_id:89910|Hs108|chr12 (1068 aa)
initn: 7111 init1: 7111 opt: 7111 Z-score: 8466.9 bits: 1578.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7111; 99.9% identity (100.0% similar) in 1068 aa overlap (1-1068:1-1068)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFLCRSRLQRDIRREIDDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFLCRSRLQRDIRREIDDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 FKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCRSILSSMDAENEPKVWYVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 FKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCRSILSSMDAENEPKVWYVSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITLYLTMLVTFTDTSTWKILRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITLYLTMLVTFTDTSTWKILRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARPRPCLSKGTLTAAFSLALRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 KGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARPRPCLSKGTLTAAFSLALRPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 IAAQFSDNLIRPFLIHIMSVPALVTHLSTVTPERLTVLESHDMLRKFIIFLRDQDRCRDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 IAAQFSDNLIRPFLIHIMSVPALVTHLSTVTPERLTVLESHDMLRKFIIFLRDQDRCRDV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 CESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLTQTLCYCQKYVSQKKSNLTHWH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS91 CESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLTQTLCYCRKYVSQKKSNLTHWH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PVLGWFSQSVDYGLNESMHLITKQLQFLWGVPLIRIFFCDILSKKLLESQEPAHAQPASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PVLGWFSQSVDYGLNESMHLITKQLQFLWGVPLIRIFFCDILSKKLLESQEPAHAQPASP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 QNVLPVKSLLKRAFQKSASVRNILRPVGGKRVDSAEVQKVCNICVLYQTSLTTLTQIRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 QNVLPVKSLLKRAFQKSASVRNILRPVGGKRVDSAEVQKVCNICVLYQTSLTTLTQIRLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 ILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPHGGLKLFLECLNNDTEESKQLLAMLMLFCDCSRHLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPHGGLKLFLECLNNDTEESKQLLAMLMLFCDCSRHLI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 TILDDIEVYEEQISFKLEELVTISSFLNSFVFKMIWDGIVENAKGETLELFQSVHGWLMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 TILDDIEVYEEQISFKLEELVTISSFLNSFVFKMIWDGIVENAKGETLELFQSVHGWLMV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LYERDCRRRFTPEDHWLRKDLKPSVLFQELDRDRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LYERDCRRRFTPEDHWLRKDLKPSVLFQELDRDRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VTKEKEKLGLVETSSASPHVTHITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 VTKEKEKLGLVETSSASPHVTHITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 DEAGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSYIHENYLQLFEFVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 DEAGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSYIHENYLQLFEFVGK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 MLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 TDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 TDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 SGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KE4 IRKREPGGRLPTSSTCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 IRKREPGGRLPTSSTCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS
1030 1040 1050 1060
>>CCDS58277.1 UBE3B gene_id:89910|Hs108|chr12 (244 aa)
initn: 1405 init1: 1405 opt: 1405 Z-score: 1676.9 bits: 319.9 E(32554): 4.4e-87
Smith-Waterman score: 1405; 100.0% identity (100.0% similar) in 210 aa overlap (1-210:1-210)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFLCRSRLQRDIRREIDDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFLCRSRLQRDIRREIDDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 FKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCRSILSSMDAENEPKVWYVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCRSILSSMDAENEPKVWYVSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITLYLTMLVTFTDTSTWKILRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITLYLTMLVTFTDTSTWKILRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARPRPCLSKGTLTAAFSLALRPV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQCCDGLFPDLVSYAPHNNPVRWSVGRSWYDW
190 200 210 220 230 240
>>CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083 aa)
initn: 1125 init1: 390 opt: 952 Z-score: 1125.4 bits: 220.0 E(32554): 2.3e-56
Smith-Waterman score: 1227; 29.0% identity (56.2% similar) in 1170 aa overlap (9-1068:25-1083)
10 20 30 40
pF1KE4 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFL
.: .. :... :..: ...: . :..::. .:..
CCDS34 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE4 CRSRLQRDIRREIDDFFKADDPESTKRSALCIFKIA---------RKLLFLFRIKEDNER
:.. : .:.: .: : .: .. : :: :.:::... .::..:
CCDS34 DRKQ-QYSIQR------SAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKR
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 FEKLCRSILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQD
. : ..... . ... .: :. :: :. ::: .. :: .:.. . .:
CCDS34 LIWLYQNLIK------HSSLFVKQLDGSERLTCLF--QIKRLMSLCCRLLQNCN----DD
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 SRLITLYLTMLVTFTDTSTW-KILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLT
: ..: . :: .:.. .:. .:. . . . .:. .. ..:.: : .:..
CCDS34 SLNVALPMRMLEVFSSENTYLPVLQDASYVVS-----VIEQILHYMIHNGYYRSLYLLIN
170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 RGLARPRPCLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVPALVTH-LSTVTPE
:: . .: : :: . .:...:. . : : . . . :. :
CCDS34 ----------SKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLENVLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTE
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 RLTVLESHDMLRKFIIFLRDQDRCRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDG
.. . :.. .::: .: .:. . .:.
CCDS34 EFLAAPFTDQIFHFII------------PALADAQTVFPYEPFLN---------------
270 280 290
340 350 360 370 380
pF1KE4 FVSLLTQTLCYCQKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV--DY--GLNESMHLI-TKQLQ-F
. :: .. : ..::. . : : .: .: .: .:.: :. . :: :
CCDS34 -ALLLIESRC-------SRKSGGAPW---LFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTF
300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LWGVPLIRIFF-C-DILSKKLLESQEPAHAQPASPQN-VLPVKSLLKRAFQK--SASVRN
: .:. : : : . ::.: .:.::.. : :. . .. ..: . . :
CCDS34 LSQLPVSPASASCHDSASDSEEESEEAD--KPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTN
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490
pF1KE4 ILRPVGGKRVDSAEV-QKVCNIC--VLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFI
: . . : :: . ..: .. : . . ..:: : .:.. .: .:: .:
CCDS34 TLLNLVWRDSASEEVFTTMASVCHTLMVQHRMM-VPKVRL--LYSLAFNARFLRHLWFLI
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540
pF1KE4 CELGPH---GGLKLFLECLNNDT----EESKQLLAMLMLFCDCSRH-LITILDD------
.. . :.. .:. .. . :.:.... ...:: . : ::.: :.
CCDS34 SSMSTRMITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDP
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KE4 IEVYEEQIS----FKLEELVTISSFLNSF---VFKMIWDGIVENAKGETLELFQSV----
::: .. : : ::::. .: : . ..:. . ... : . :::.
CCDS34 IEVVGQRQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTT
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KE4 ------------HGWLMV----------LYERDCRRRFTPEDHWL--RKDLKPSVL----
. :... : :: :: : : .::: ..:.: . .
CCDS34 SSEMQQCIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLY
590 600 610 620 630 640
630 640 650
pF1KE4 ---------FQELDR-------------------DRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFR
:... : ...: .: .: :.: ..:: .:.
CCDS34 VPASRHVWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQ
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 TMVTKEKEKLGLVETSSASPHVT--HITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVN
.. .:. :... .: . ..::::. . ::.:..: .. .: :::...:
CCDS34 RLIYADKQ-----EVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLN
710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 DLGVDEAGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSY--IHENYLQL
:.:::::: :.:.:::.:..: :.: ..::::. . :::.:.. . ... .
CCDS34 AHGLDEAGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTN-EGLLYPNPAAQMLVGDSFARH
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 FEFVGKMLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSEFYKNLTSIK
. :.:.:::::.::...:..:::.::::.::: .: .. .: ::: : :::: .:
CCDS34 YYFLGRMLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADV---DIHHLASLDPEVYKNLLFLK
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880 890
pF1KE4 RYDGDITDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKN
:. :. .:::... .. .:. :: ::: ::::. :.:.::::.: .:.. ::..
CCDS34 SYEDDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQ
880 890 900 910 920 930
900 910 920 930 940 950
pF1KE4 QTAALISGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVII
. :. .:. .... ::.:::. :.: :::: .. :.:::::. : : ::. ..: ::
CCDS34 HCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIK
940 950 960 970 980 990
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE4 WLWDILASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSV
.: .. . :: .:. .::::::::::::::: : : : :.. .: ::
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:. ::::.:::.::::::.. ...:: :: ::: .:::::
CCDS34 LE------------RLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGFELS
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. .:. . :.: :..:: :. . ..:. :. : . :: . ....: :: :
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:...: .: :.:: : : ::.. .:.:.::.. .:: ::: .::::..:: ::. :.
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:.: .: :: :.: . :. ..: .:.:::. : : ::: :.
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:: : ..: :: . :::: : :: : . :.: ::: :. ..
CCDS77 -------GSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTCFNRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETST
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: :
CCDS77 FGLE
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CCDS35 FVTGTSKVPLQGFAALEGMNGIQKFQIHRDDRSTD-------------------RLPSAH
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CCDS35 TCFNQLDLPAYESFEKLRHMLLLAIQECSEGFGLA
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CCDS33 ARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQIMGYSRKDLQ
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. .:. . :.: :..:: :. . ..:. :. : . :: . ....: :: :
CCDS33 AFVDNHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALL-----RILCDLSDLEYLDEE
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CCDS33 KWRIERGVVQQTESLVRGFYEVVDARLVSVFDARELELVIAG-TAEIDLSDWRNNTEYRG
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CCDS33 GYHDNHIVIRWFWAAVER-FNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLR-------------
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CCDS33 -------GSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTCFNRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETST
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pF1KE4 FELS
: :
CCDS33 FGLE
1570
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CCDS45 ----PNKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEF--D---GEKGLDYGGVAR
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CCDS45 EWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGK
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CCDS45 LLDGFFIRPFYKMML--HKPI---TLHDMESVDSEYYNSLRWI--LENDPTELDLRFIID
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CCDS45 EELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQD
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CCDS45 LIKIFDENELELLMCGLG-DVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMD--SEKR
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CCDS45 IRLLQFVTGTSRVPMNGFAEL--------------------YGSNGPQSFTVEQWGTPEK
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CCDS45 LPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
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CCDS69 RNKLYVTFVG-----EEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMS
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CCDS69 AFVENHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALL-----RLPCDLSDLEYLDEE
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CCDS69 FHQSLQWMK--DNNITDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMV
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CCDS69 KWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAG-TAEIDLNDWRNNTEYRG
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CCDS69 GYHDGHLVIRWFWAAVER-FNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIE--
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CCDS69 -------KWGKITS-------------LPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEET
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pF1KE4 TGFELS
. : :
CCDS69 STFGLE
1570
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CCDS54 ARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKELQ
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pF1KE4 KGVIRVKFVNDLGVDEAGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYP-SPTS
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CCDS54 RNKLYVTFVG-----EEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMS
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pF1KE4 YIHENYLQLFEFVGKMLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSE
. ::.:. :.: :..:: :. . ..:. :. : . :: . ....: :: :
CCDS54 AFVENHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALL-----RLPCDLSDLEYLDEE
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pF1KE4 FYKNLTSIKRYDGDITD-LGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMA
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CCDS54 FHQSLQWMK--DNNITDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMV
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CCDS54 KWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAG-TAEIDLNDWRNNTEYRG
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950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 GFHGSHRVIIWLWDILASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIR--CVEVS
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CCDS54 GYHDGHLVIRWFWAAVER-FNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIE--
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE4 DDQDTGDTLGSVLRGFFTIRKREPGGRLPTSSTCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMN
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CCDS54 -------KWGKITS-------------LPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEET
1570 1580 1590 1600
pF1KE4 TGFELS
. : :
CCDS54 STFGLE
>>CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1247 aa)
initn: 346 init1: 205 opt: 543 Z-score: 636.8 bits: 129.8 E(32554): 3.8e-29
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pF1KE4 DHWLRKDLKPSVLFQELDRDRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKEKEKLGLVET
.:. .: . .:: . :...
CCDS10 DGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDI------
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