Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4242
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4242, 904 aa
1>>>pF1KE4242 904 - 904 aa - 904 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2072+/-0.00127; mu= 16.1298+/- 0.075
mean_var=84.1007+/-16.633, 0's: 0 Z-trim(101.5): 80 B-trim: 49 in 2/48
Lambda= 0.139854
statistics sampled from 6461 (6541) to 6461 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 3.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43508.1 ECT2L gene_id:345930|Hs108|chr6 ( 904) 6033 1228.3 0
CCDS6068.1 FBXO16 gene_id:157574|Hs108|chr8 ( 292) 551 122.0 1.7e-27
CCDS59099.1 FBXO16 gene_id:157574|Hs108|chr8 ( 280) 456 102.8 9.4e-22
CCDS3220.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 883) 387 89.1 3.9e-17
CCDS58860.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 914) 387 89.1 4.1e-17
CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257) 339 79.5 4.4e-14
CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1273) 339 79.5 4.5e-14
CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237) 311 73.8 2.2e-12
CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1227) 304 72.4 5.8e-12
CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1271) 304 72.4 6e-12
CCDS30617.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1240) 291 69.8 3.6e-11
CCDS182.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1279) 291 69.8 3.7e-11
>>CCDS43508.1 ECT2L gene_id:345930|Hs108|chr6 (904 aa)
initn: 6033 init1: 6033 opt: 6033 Z-score: 6577.5 bits: 1228.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6033; 100.0% identity (100.0% similar) in 904 aa overlap (1-904:1-904)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MESFHTRFSAWTPFSNKSLNRQLFQERVALISHWFDLWTNKQRQEFLFAIFLRCTKSQLR
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CCDS43 MESFHTRFSAWTPFSNKSLNRQLFQERVALISHWFDLWTNKQRQEFLFAIFLRCTKSQLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 FVQDWFSERMQVAKVDFSTVLPRFISLYIFSFLSPKDLCAAAQVSWPWKFLTEQDCLWMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FVQDWFSERMQVAKVDFSTVLPRFISLYIFSFLSPKDLCAAAQVSWPWKFLTEQDCLWMP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KCVKFGWFLPYTPTDNEYGAWKRHYIACVSHLDWLTPREAAATYGTLNEPKTEDEELLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KCVKFGWFLPYTPTDNEYGAWKRHYIACVSHLDWLTPREAAATYGTLNEPKTEDEELLER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 QREKCLRKRIWEKIALRKKELFKVRPPWVSGTCCSSVLKPRCQPRLSQTVRERVGLHEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QREKCLRKRIWEKIALRKKELFKVRPPWVSGTCCSSVLKPRCQPRLSQTVRERVGLHEAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EKQLVLTSLETLPKRSNISGSHSYPLLSKKNWHGVHKNDDRSSYALRPHFMLISSRIPAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKQLVLTSLETLPKRSNISGSHSYPLLSKKNWHGVHKNDDRSSYALRPHFMLISSRIPAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 EMVMESVKAGVVSVVYEHSVTLESLLYLIEKALDGQKAQSIGIFSDGDSREINLLQGYKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EMVMESVKAGVVSVVYEHSVTLESLLYLIEKALDGQKAQSIGIFSDGDSREINLLQGYKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GVKNLLRPEVRDFWEKLGSYVATEEEGGHVDFFVPLGASEAGIEVLSQLSQLTGTFFTAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GVKNLLRPEVRDFWEKLGSYVATEEEGGHVDFFVPLGASEAGIEVLSQLSQLTGTFFTAP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TGIATGSYQHILSDWLGSQWGKAPSSIYFCESKLQTWSSFTDFLEETLKTVRKQLYPFFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TGIATGSYQHILSDWLGSQWGKAPSSIYFCESKLQTWSSFTDFLEETLKTVRKQLYPFFK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 ELQKSISGRMIGQFMFDTMGMTNILNNQDTAQALADGLMELSKEDSERNVVEDNSWDTKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELQKSISGRMIGQFMFDTMGMTNILNNQDTAQALADGLMELSKEDSERNVVEDNSWDTKS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 RLSKNDLNFEALINLERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRDVYVAPLKAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RLSKNDLNFEALINLERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRDVYVAPLKAAL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 SSNRAILSAANIQIIFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIVTKFGSQLNTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSNRAILSAANIQIIFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIVTKFGSQLNTY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 TNFFNNYPVILKTIEKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYPSRRFEEYLNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TNFFNNYPVILKTIEKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYPSRRFEEYLNLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 YAVRLHTPAEHVDRGDLTTAIDQIKKYKGYIDQMKQNITMKDHLSDIQRIIWGCPTLSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YAVRLHTPAEHVDRGDLTTAIDQIKKYKGYIDQMKQNITMKDHLSDIQRIIWGCPTLSEV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 NRYLIRVQDVAQLHCCDEEISFSLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSSRGTSHTPFERTSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NRYLIRVQDVAQLHCCDEEISFSLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSSRGTSHTPFERTSKT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 TYQFIASVALHRLLIENIPDSKYVKNAFILQGPKYKWICATEIEDDKFLWLSVLRNAIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TYQFIASVALHRLLIENIPDSKYVKNAFILQGPKYKWICATEIEDDKFLWLSVLRNAIKS
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 SMEK
::::
CCDS43 SMEK
>>CCDS6068.1 FBXO16 gene_id:157574|Hs108|chr8 (292 aa)
initn: 556 init1: 531 opt: 551 Z-score: 607.3 bits: 122.0 E(32554): 1.7e-27
Smith-Waterman score: 551; 39.3% identity (65.9% similar) in 214 aa overlap (5-210:16-221)
10 20 30 40
pF1KE4 MESFHTRFSAWTPFSNKSLNRQLFQERVALISHWFDLWTNKQRQEFLFA
.:..:.:::.... :: ..:.:: ::...::: ::..::...: .
CCDS60 MMAFAPPKNTDGPKMQTKMSTWTPLNHQLLNDRVFEERRALLGKWFDKWTDSQRRRILTG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 IFLRCTKSQLRFVQDWFSERMQVAKVDFSTVLPRFISLYIFSFLSPKDLCAAAQVSWPWK
.. ::. :: .: ..:.. . .::.: ::: .::::::::.:..:: ::: : ::
CCDS60 LLERCSLSQQKFCCRKLQEKIPAEALDFTTKLPRVLSLYIFSFLDPRSLCRCAQVCWHWK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 FLTEQDCLWMPKCVKFGWFLPYTPTDNEYGAWKRHYIACVSHLDWLTPRE--------AA
:.: : ::: ::..:.:.. ..:: : : ::.::: :..: :. :
CCDS60 NLAELDQLWMLKCLRFNWYINFSPTPFEQGIWKKHYIQMVKELHITKPKTPPKDGFVIAD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ATYGTLNEPKTEDEELLERQREKCLRKRIWEKIALRKKELFKVRPPWVSGTCCSSVLKPR
. : : :. .. : . . :::. .. :. ::: :
CCDS60 VQLVTSNSPEEKQSPLSAFRSSSSLRKK--------NNSGEKALPPWRSSDKHPTDIIRF
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 CQPRLSQTVRERVGLHEALEKQLVLTSLETLPKRSNISGSHSYPLLSKKNWHGVHKNDDR
CCDS60 NYLDNRDPMETVQQGRRKRNQMTPDFSRQSHDKKNKLQDRTRLRKAQSMMSRRNPFPLCP
240 250 260 270 280 290
>>CCDS59099.1 FBXO16 gene_id:157574|Hs108|chr8 (280 aa)
initn: 484 init1: 440 opt: 456 Z-score: 504.0 bits: 102.8 E(32554): 9.4e-22
Smith-Waterman score: 480; 37.9% identity (61.7% similar) in 214 aa overlap (5-210:16-209)
10 20 30 40
pF1KE4 MESFHTRFSAWTPFSNKSLNRQLFQERVALISHWFDLWTNKQRQEFLFA
.:..:.::: ::.::...: :: ::..::...: .
CCDS59 MMAFAPPKNTDGPKMQTKMSTWTP-----LNHQLLNDR-------FDKWTDSQRRRILTG
10 20 30 40
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 IFLRCTKSQLRFVQDWFSERMQVAKVDFSTVLPRFISLYIFSFLSPKDLCAAAQVSWPWK
.. ::. :: .: ..:.. . .::.: ::: .::::::::.:..:: ::: : ::
CCDS59 LLERCSLSQQKFCCRKLQEKIPAEALDFTTKLPRVLSLYIFSFLDPRSLCRCAQVCWHWK
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 FLTEQDCLWMPKCVKFGWFLPYTPTDNEYGAWKRHYIACVSHLDWLTPRE--------AA
:.: : ::: ::..:.:.. ..:: : : ::.::: :..: :. :
CCDS59 NLAELDQLWMLKCLRFNWYINFSPTPFEQGIWKKHYIQMVKELHITKPKTPPKDGFVIAD
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ATYGTLNEPKTEDEELLERQREKCLRKRIWEKIALRKKELFKVRPPWVSGTCCSSVLKPR
. : : :. .. : . . :::. .. :. ::: :
CCDS59 VQLVTSNSPEEKQSPLSAFRSSSSLRKK--------NNSGEKALPPWRSSDKHPTDIIRF
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 CQPRLSQTVRERVGLHEALEKQLVLTSLETLPKRSNISGSHSYPLLSKKNWHGVHKNDDR
CCDS59 NYLDNRDPMETVQQGRRKRNQMTPDFSRQSHDKKNKLQDRTRLRKAQSMMSRRNPFPLCP
230 240 250 260 270 280
>>CCDS3220.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 (883 aa)
initn: 390 init1: 187 opt: 387 Z-score: 421.0 bits: 89.1 E(32554): 3.9e-17
Smith-Waterman score: 387; 27.6% identity (58.6% similar) in 362 aa overlap (561-904:418-766)
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 VEDNSWDTKSRLSKNDLNFEALINLERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRD
:.:: : .:..:: :.: .::.:: . .
CCDS32 ISNTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVPSKQSA--RWQVAKELYQTESNYVNILATIIQ
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 VYVAPLKAALSSNRAILSAANIQIIFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIV
.. .::. . . ::. .:. :: .: .:.... .. :.:.: . .: .. .:.:
CCDS32 LFQVPLEEEGQRGGPILAPEEIKTIFGSIPDIFDVHTKIKDDLEDLIVNWDESKSIGDIF
450 460 470 480 490 500
660 670 680 690 700
pF1KE4 TKFGSQL-NTYTNFFNNYPVILKTIEKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYP
:....: .:: : : . . .:: ::... : :..::: .. :: :::. :
CCDS32 LKYSKDLVKTYPPFVNFFEMSKETIIKCEKQKPRFHAFLKINQAKPECGRQSLVELLIRP
510 520 530 540 550 560
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 SRRFEEYLNLLYAVRLHTPAEHVDRGDLTTAIDQIKKYKGYIDQMKQNITMKDHLSDIQR
.:. :: .. :: :. :.. : :: ..:. .:.. :.. . .. :.
CCDS32 VQRLPSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSLKEVMTHINEDKRKTEAQKQIFDVVY
570 580 590 600 610 620
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 IIWGCPT-LSEVNRYLI-RVQDVAQ-LHCCDEEISFSLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSS
. :::. : .: :. ::. .. : ::. :.. .:::::: : ..
CCDS32 EVDGCPANLLSSHRSLVQRVETISLGEHPCDRG--------EQV---TLFLFNDCLEIAR
630 640 650 660 670
830 840 850 860 870
pF1KE4 R-----GTSHTPFERTSK-TTYQFIASVALHRLL-IENIPDSKYVKNAFIL--QGP--KY
. :: ..: .: .. . : . : .. . .: ... .::: : . : .
CCDS32 KRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCHNAFALLVRPPTEQA
680 690 700 710 720 730
880 890 900
pF1KE4 KWICATEIEDD---KFLWLSVLRNAIKSSMEK
. . . .. .: : ::..: . ... :
CCDS32 NVLLSFQMTSDELPKENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPESFEVNTKDMDSTLSR
740 750 760 770 780 790
CCDS32 ASRAIKKTSKKVTRAFSFSKTPKRALRRALMTSHGSVEGRSPSSNDKHVMSRLSSTSSLA
800 810 820 830 840 850
>>CCDS58860.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 (914 aa)
initn: 390 init1: 187 opt: 387 Z-score: 420.8 bits: 89.1 E(32554): 4.1e-17
Smith-Waterman score: 387; 27.6% identity (58.6% similar) in 362 aa overlap (561-904:449-797)
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 VEDNSWDTKSRLSKNDLNFEALINLERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRD
:.:: : .:..:: :.: .::.:: . .
CCDS58 ISNTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVPSKQSA--RWQVAKELYQTESNYVNILATIIQ
420 430 440 450 460 470
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 VYVAPLKAALSSNRAILSAANIQIIFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIV
.. .::. . . ::. .:. :: .: .:.... .. :.:.: . .: .. .:.:
CCDS58 LFQVPLEEEGQRGGPILAPEEIKTIFGSIPDIFDVHTKIKDDLEDLIVNWDESKSIGDIF
480 490 500 510 520 530
660 670 680 690 700
pF1KE4 TKFGSQL-NTYTNFFNNYPVILKTIEKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYP
:....: .:: : : . . .:: ::... : :..::: .. :: :::. :
CCDS58 LKYSKDLVKTYPPFVNFFEMSKETIIKCEKQKPRFHAFLKINQAKPECGRQSLVELLIRP
540 550 560 570 580 590
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 SRRFEEYLNLLYAVRLHTPAEHVDRGDLTTAIDQIKKYKGYIDQMKQNITMKDHLSDIQR
.:. :: .. :: :. :.. : :: ..:. .:.. :.. . .. :.
CCDS58 VQRLPSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSLKEVMTHINEDKRKTEAQKQIFDVVY
600 610 620 630 640 650
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 IIWGCPT-LSEVNRYLI-RVQDVAQ-LHCCDEEISFSLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSS
. :::. : .: :. ::. .. : ::. :.. .:::::: : ..
CCDS58 EVDGCPANLLSSHRSLVQRVETISLGEHPCDRG--------EQV---TLFLFNDCLEIAR
660 670 680 690 700
830 840 850 860 870
pF1KE4 R-----GTSHTPFERTSK-TTYQFIASVALHRLL-IENIPDSKYVKNAFIL--QGP--KY
. :: ..: .: .. . : . : .. . .: ... .::: : . : .
CCDS58 KRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCHNAFALLVRPPTEQA
710 720 730 740 750 760
880 890 900
pF1KE4 KWICATEIEDD---KFLWLSVLRNAIKSSMEK
. . . .. .: : ::..: . ... :
CCDS58 NVLLSFQMTSDELPKENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPESFEVNTKDMDSTLSR
770 780 790 800 810 820
CCDS58 ASRAIKKTSKKVTRAFSFSKTPKRALRRALMTSHGSVEGRSPSSNDKHVMSRLSSTSSLA
830 840 850 860 870 880
>>CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257 aa)
initn: 199 init1: 119 opt: 339 Z-score: 366.3 bits: 79.5 E(32554): 4.4e-14
Smith-Waterman score: 342; 24.3% identity (59.3% similar) in 371 aa overlap (466-829:151-506)
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 LGSQWGKAPSSIYFCESKLQTWSSFTDFLEETLKTVRKQLYPFFKELQKSISGRMIGQFM
:: ::: ::: ... . : :. ..
CCDS45 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIE-RLKAE--
130 140 150 160 170
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 FDTMGMTNILNNQDTAQALADGLMELSKEDSERNVVEDNSWDTKSRLSKNDLNFEALI-N
.:..:.... :. . . :::. . .. . .. : . .....: .
CCDS45 -----ITSLLKDNERIQSTQT--VAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRR--KWKTIIQD
180 190 200 210 220
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 LERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRDVYVAPLKAALSSNRAILSAANIQI
: . :: .:: .:: .:..: .::: :.:. . .. ::. : ::.. .. ...
CCDS45 YIRSPHADSMRKRNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSS
230 240 250 260 270 280
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 IFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIVTKFGSQLNTYTNFFNNYPVILKTI
:: . :. :.. : ..:. :.. : :. .... . .:: : .: :. :. .
CCDS45 IFLNSETIMFLHQIFYQGLKARISSW-PTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQIL
290 300 310 320 330 340
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 EKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYPSRRFEEYLNLLYAVRLHTPAEHVDR
.:.. : .::... . .: .: :: .. .:. :. . ::: :::.:
CCDS45 AHCKQN-RDFDKLLKHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVER
350 360 370 380 390 400
740 750 760 770 780 790
pF1KE4 GDLTTAIDQIKKYKGYI-DQMKQNITMKDHLSDIQRIIWGCPTLSEVNRYLIRVQDVAQL
..: : ..... . . :..... ... .:. . :: :: : .... ..: .. :.
CCDS45 NSLDYAKSKLEELSRIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQV
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CCDS10 PMSEKGKITRGRLGSLSLKKE-GERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNGVISLIDCTL
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CCDS10 LEEPESTEEEAKGSGQDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDN
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:..
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CCDS13 MAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKN-SLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]