Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4233
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4233, 850 aa
1>>>pF1KE4233 850 - 850 aa - 850 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6053+/-0.00105; mu= 20.0789+/- 0.063
mean_var=92.7142+/-18.905, 0's: 0 Z-trim(105.4): 101 B-trim: 184 in 1/49
Lambda= 0.133199
statistics sampled from 8297 (8411) to 8297 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 2.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3117.1 RASA2 gene_id:5922|Hs108|chr3 ( 849) 5624 1091.9 0
CCDS32016.1 RASA3 gene_id:22821|Hs108|chr13 ( 834) 3522 687.9 1.9e-197
CCDS5725.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 ( 803) 829 170.4 1.1e-41
CCDS9165.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 804) 711 147.7 7.5e-35
CCDS73529.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 805) 674 140.6 1e-32
CCDS55889.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 806) 672 140.2 1.4e-32
CCDS59506.1 RASA4B gene_id:100271927|Hs108|chr7 ( 757) 611 128.5 4.4e-29
CCDS47674.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 ( 757) 608 127.9 6.5e-29
CCDS55888.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 776) 482 103.7 1.3e-21
CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9 (1065) 398 87.7 1.2e-16
CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9 (1132) 398 87.7 1.2e-16
CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1 (1139) 379 84.1 1.6e-15
CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5 ( 870) 377 83.6 1.7e-15
CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1 (1280) 379 84.1 1.7e-15
CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5 (1047) 377 83.6 1.9e-15
CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs108|chr6 (1343) 364 81.2 1.3e-14
CCDS11264.1 NF1 gene_id:4763|Hs108|chr17 (2818) 344 77.7 3.3e-13
CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs108|chr19 (1011) 328 74.2 1.3e-12
>>CCDS3117.1 RASA2 gene_id:5922|Hs108|chr3 (849 aa)
initn: 4271 init1: 4271 opt: 5624 Z-score: 5841.2 bits: 1091.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5624; 99.9% identity (99.9% similar) in 850 aa overlap (1-850:1-849)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAAAPAAAAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAAAAPAAAAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DCFCTINLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DCFCTINLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VAIKKEDLCNHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAIKKEDLCNHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKAC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 HGLPLINGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HGLPLINGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FQVEEEDIEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FQVEEEDIEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SKTDDLGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SKTDDLGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VLPLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VLPLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TLKPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TLKPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IFYSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IFYSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 SEPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGSKDAIYTIPVKNILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS31 SEPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPG-KDAIYTIPVKNILA
610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VEKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VEKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVY
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LNGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEAC
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 GTIAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GTIAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGS
780 790 800 810 820 830
850
pF1KE4 KENPIVGKAS
::::::::::
CCDS31 KENPIVGKAS
840
>>CCDS32016.1 RASA3 gene_id:22821|Hs108|chr13 (834 aa)
initn: 2923 init1: 1943 opt: 3522 Z-score: 3658.3 bits: 687.9 E(32554): 1.9e-197
Smith-Waterman score: 3522; 61.5% identity (87.0% similar) in 818 aa overlap (34-849:8-818)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 AAPAAAAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCF
.::.::.. :: ::::: : :: :::::.
CCDS32 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 CTINLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAI
::.:::::::.::..::::: ::..:.:: ::::.:..::::..:..:..:: ::::::
CCDS32 CTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KKEDLCNHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGL
.:::: .. ...:::.:: ::..:::::::::::.:.:.::..:.::..:...: :.::
CCDS32 QKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 PLINGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQV
:..::: :::::::.:.:: :.. ::::::.::.::::.:.::::::: ::..::.:.
CCDS32 PIVNGQ-CDPYATVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDF
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EEEDIEKLEIRIDLWNNGNL-VQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSK
::::..:::::.:::: .:: : ::::...:..::: .::..:::.:::::::.:: :
CCDS32 EEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLK
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TDDLGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDAVL
:::::::::. ::::.:. :.::.::. ::::: ::.:.:::::.::.:.::.:..:..
CCDS32 PDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTL
:::::.::. ..::: .:.: ..: ::: ::::::::::..:.:: ::..: :::.:::
CCDS32 PLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIF
:: ..:::.: : :::::.:::.:.:.::: :::: :::..:..:..:..::::::::::
CCDS32 KPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIF
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 YSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLIS
.:::. :..:: .:: :.:.:::::.:::::: :..::. :.: ::: : :: :::::::
CCDS32 FSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLIS
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 KTIQTLGSWGSLSKSKS-SFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGTS
::.:::: ::::::: ::::..: :...:.:. : :::.::: :::. .. ...
CCDS32 KTVQTLG---SLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVE
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 EPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAV
.:. :::: : :::::: :.: :::::::: ::..:.::::. :.. .:.::..:::::
CCDS32 QPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKSKGDQP-LYSIPIENILAV
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 EKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYL
::::: ::. :::::::. :. ::.::::::::..:::.: .::.:::.::. ::::.::
CCDS32 EKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 NGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEACG
.:.::::. .... ::.:::.:.::.::.::: :::::::::::.: . ::.::.::::
CCDS32 SGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACG
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 TIAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSK
. .::.::..: .::.:::.: :.::..:. . . :.. : .:.. . ...::::.
CCDS32 SKSVYDGPEQE--EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQ
760 770 780 790 800 810
850
pF1KE4 ENPIVGKAS
:.:: :.
CCDS32 EHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
820 830
>>CCDS5725.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 (803 aa)
initn: 936 init1: 207 opt: 829 Z-score: 861.7 bits: 170.4 E(32554): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 1190; 31.1% identity (61.0% similar) in 798 aa overlap (39-795:6-767)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 AAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCFCTINL
:: .: :.::: : : .: ...
CCDS57 MAKRSSLYIRIVEGKNL-PAKDITGSSDPYCIVKV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDL
:.: . :: .: :.: ::..::. ..: ::. ..:::.:...:.:: :::: . .. .
CCDS57 DNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVHLPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 CNH-SGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGLPLIN
.: .: : : :: . ::::..::.:. . .. .:. ..: :
CCDS57 ASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEIHLRLE----VWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEEED
. . ::.. : : .: .:.. ::. :..:: : ::. .:
CCDS57 NGTSDPFVRVRYKGRTR----ETSIVKKSCYPRWNETFEFEL--------------QEGA
160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 IEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSKTDDLG
.: : . . :. . .. :::.. . :. ::. .....:. ::: .. .. .::
CCDS57 MEALCV--EAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSKSRRHDEGNLG
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLL-------LKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDA
::.:.. .. :::: :: :: :: ...: : : .: ::. :.
CCDS57 SLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPG-QLIPLIEETTSTE-CRQ--DV
260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VLPLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKV
. :..:.: . : . .:.:. :...::.::.::::.. .. ..:..: .::.
CCDS57 ATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSMESFLKVAGMQYLHG
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460
pF1KE4 TLKPILDEICDSSKSCEIDPIKLK--------------EGDNVENNKENLRYYVDKLFNT
.: ::.... . .: :.:: :.. :.. .:.. ..:: .. :...
CCDS57 VLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHLGALLSA
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 IVKSSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFPNDPH--VQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFH
. .: .::.:. : .: . . .:::. : : . ::.::. ::::. :..::. ::
CCDS57 LSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIMSPKLFH
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 LRPHHPDAQTIRTLTLISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKK
:: .: ::.: ::: :..:..:.. :... : ::..: : .. ..: . .:
CCDS57 LRERHADARTSRTLLLLAKAVQNV---GNMDTPASRAKEAWM-EPLQPTVRQG-VAQLKD
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630
pF1KE4 FLDEISSTETKESSGTSEPVHL-----KEGEMY-KRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSREL
:. .. . : :. .. . : ::: .. .:..:. . ...::: .: ::.. :
CCDS57 FITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEAL
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 TYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKNMFQVIHTE---KPL--YVQANNCV-
.. : :.:: . : . :: :.::.::.::. ....:::.:. .: :.: . ::
CCDS57 SFAKTPSSKKSAL-IKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQCK-CVN
610 620 630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 EANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQID
: :.:...: .:: : . :. :::.:. . .: ::.. .. :: . : . :
CCDS57 ELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWND
660 670 680 690 700 710
760 770 780 790 800
pF1KE4 -IDEDRETERIYS-LFTLSLLKLQKMEEACGTI---AVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTT
.:.: :.. :: :. . . .. .: : .: .: : :.:
CCDS57 PLDHDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDL
720 730 740 750 760 770
810 820 830 840 850
pF1KE4 FKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKENPIVGKAS
CCDS57 REAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
780 790 800
>>CCDS9165.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 (804 aa)
initn: 819 init1: 191 opt: 711 Z-score: 739.2 bits: 147.7 E(32554): 7.5e-35
Smith-Waterman score: 1083; 28.1% identity (60.6% similar) in 840 aa overlap (39-839:6-800)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 AAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCFCTINL
:: .. :.. : : : .: ...
CCDS91 MAKSSSLNVRVVEGRAL-PAKDVSGSSDPYCLVKV
10 20 30
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...: .:: : . :. :::.:. . .: ::.. .. :: . : . : .:.:
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:.. :: :. . . .. .: : .: .: : :.:
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740 750
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:.: . :: .: :.: ::..::. ..: ::. ..:::.:...:.:: :::: . .. .
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. . ::.. : : .: .:.. ::. :..:: : ::. .:
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::.:.. .. :::: :: :: :: ...: : : .: ::. :.
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.: ::.... . .: :.:: :.. :.. .:.. ..:: .. :...
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. .: .::.:. : .: . . .:::. : : . ::.::. ::::. :..::. ::
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:: .: ::.: ::: :..:..:.. :... : ::..: : .. ..: . .:
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CCDS47 FITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEAL
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pF1KE4 TYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCV-EANEW
.. : :.:: :: : :.:
CCDS47 SFAKTPSSK-------------------------------------------CVNELNQW
610
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 IDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQID-IDED
...: .:: : . :. :::.:. . .: ::.. .. :: . : . : .:.:
CCDS47 LSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDPLDHD
620 630 640 650 660 670
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pF1KE4 RETERIYS-LFTLSLLKLQKMEEACGTI---AVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQ
:.. :: :. . . .. .: : .: .: : :.:
CCDS47 LEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDLREAHS
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pF1KE4 QIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKENPIVGKAS
CCDS47 SSPAGSPPSEPNCLLELQT
740 750
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CCDS55 DDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVHLPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAI
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CCDS55 --VLADLDRAHEEFQQQERGKAALGPLGP
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CCDS68 NPKGGKGPGP----MIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHI--TNHYLGLCAALEPILS--
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::
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850 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]