Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4225
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4225, 794 aa
1>>>pF1KE4225 794 - 794 aa - 794 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5851+/-0.00139; mu= -4.6310+/- 0.081
mean_var=319.4345+/-69.605, 0's: 0 Z-trim(108.8): 136 B-trim: 660 in 1/50
Lambda= 0.071760
statistics sampled from 10369 (10481) to 10369 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16
Scan time: 3.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 5134 546.4 6.7e-155
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 2673 291.6 3.4e-78
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 2330 256.1 1.7e-67
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 2318 254.9 4e-67
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 872 105.3 5.6e-22
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 832 101.0 8.1e-21
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 602 77.4 1.6e-13
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290) 602 77.4 1.7e-13
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 602 77.4 1.7e-13
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 584 75.5 5.7e-13
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 523 69.0 3.4e-11
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 519 68.6 4.6e-11
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 519 68.6 4.7e-11
>>CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 (794 aa)
initn: 5134 init1: 5134 opt: 5134 Z-score: 2894.4 bits: 546.4 E(32554): 6.7e-155
Smith-Waterman score: 5134; 100.0% identity (100.0% similar) in 794 aa overlap (1-794:1-794)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASPTLSPDSSSQEALSAPTCSPTSDSENLSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MASPTLSPDSSSQEALSAPTCSPTSDSENLSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 KRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 MQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELKALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELKALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ARGGRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ARGGRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 EAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSESRRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSESRRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 RQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQYIRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFEDPLAFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQYIRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFEDPLAFDG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LSLARHLDEDSLPSSDEELLGVGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LSLARHLDEDSLPSSDEELLGVGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSD
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE4 ADELAAPYSQGLDN
::::::::::::::
CCDS12 ADELAAPYSQGLDN
790
>>CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 (805 aa)
initn: 2798 init1: 2639 opt: 2673 Z-score: 1517.4 bits: 291.6 E(32554): 3.4e-78
Smith-Waterman score: 5102; 98.6% identity (98.6% similar) in 805 aa overlap (1-794:1-805)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASPTLSPDSSSQEALSAPTCSPTSDSENLSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MASPTLSPDSSSQEALSAPTCSPTSDSENLSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE4 KRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEK-----------GQVTRAQEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS54 KRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESAALADRLIQGQVTRAQEA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 EENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 RETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELKALKVREGQAVASTRELKLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELKALKVREGQAVASTRELKLQL
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 QELSDTWQAHLARGGRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELETQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QELSDTWQAHLARGGRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELETQ
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 DHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSESRRKQAEAECKSKEEVMAVRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSESRRKQAEAECKSKEEVMAVRLR
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 EADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQYIRELKDQIEELKAEVRLLKGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQYIRELKDQIEELKAEVRLLKGP
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 PPFEDPLAFDGLSLARHLDEDSLPSSDEELLGVGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPFEDPLAFDGLSLARHLDEDSLPSSDEELLGVGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERP
730 740 750 760 770 780
770 780 790
pF1KE4 AKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
790 800
>>CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (810 aa)
initn: 2972 init1: 2207 opt: 2330 Z-score: 1325.4 bits: 256.1 E(32554): 1.7e-67
Smith-Waterman score: 3294; 68.7% identity (84.3% similar) in 758 aa overlap (1-749:49-760)
10 20
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
CCDS30 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL
::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS30 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP
::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
CCDS30 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
CCDS30 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 MYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQ
:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
CCDS30 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
CCDS30 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQEN
::::::::::: ..:::
CCDS30 LLKQRIETLEK-----------------------HKCSSN--------------------
440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 PRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELK
.:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.:::::
CCDS30 --YNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELI
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 ALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLR
:.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::
CCDS30 AVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLR
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 EAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSES
::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::.
CCDS30 EAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEA
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 RRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQY
.::::: :::.::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::
CCDS30 KRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQY
640 650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 IRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG-----
: :::::: ::. :.: ::: : :::. .. :: :..:. ::::...
CCDS30 IGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQE
700 710 720 730 740 750
750 760 770 780 790
pF1KE4 VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
.::: :.
CCDS30 TGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
760 770 780 790 800 810
>>CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (821 aa)
initn: 2952 init1: 2187 opt: 2318 Z-score: 1318.6 bits: 254.9 E(32554): 4e-67
Smith-Waterman score: 3323; 68.9% identity (85.5% similar) in 758 aa overlap (1-749:49-771)
10 20
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
CCDS76 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL
::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS76 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP
::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
CCDS76 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
CCDS76 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 MYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQ
:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
CCDS76 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
CCDS76 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQEN
::::::::::: ... :.. .....:::
CCDS76 LLKQRIETLEKESASLADR------------LIQHKCSSN--------------------
440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 PRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELK
.:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.:::::
CCDS76 --YNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELI
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 ALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLR
:.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::
CCDS76 AVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLR
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 EAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSES
::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::.
CCDS76 EAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEA
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 RRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQY
.::::: :::.::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::
CCDS76 KRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQY
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 IRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG-----
: :::::: ::. :.: ::: : :::. .. :: :..:. ::::...
CCDS76 IGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQE
710 720 730 740 750 760
750 760 770 780 790
pF1KE4 VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
.::: :.
CCDS76 TGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
770 780 790 800 810 820
>>CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069 aa)
initn: 873 init1: 621 opt: 872 Z-score: 508.0 bits: 105.3 E(32554): 5.6e-22
Smith-Waterman score: 900; 34.4% identity (65.2% similar) in 529 aa overlap (90-604:541-1046)
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHH
::.. ..:. . : :. :.:.:.:.
CCDS68 EDDEEEDNDEPLLSGSGDVSKECAEKILETWGELLSKWHLNLNVRPKQLSSLVRNGVPEA
520 530 540 550 560 570
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FRAIVWQLL--CSATDMPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQE
.:. ::::: : .: :. .: :. :: .. : ::: ::.: :..:: . ::.
CCDS68 LRGEVWQLLAGCHNNDHLVE-KYRILITKESPQDSAITRDINRTFPAHDYFKDTGGDGQD
580 590 600 610 620
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMA
:... ::::. :.:.:::::..:....::..::::.:: :.:..: .: :::::: ..
CCDS68 SLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFSVLVKIMFDYGLRELFKQNFE
630 640 650 660 670 680
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFM
.: .::.: ..:: .::: .:: . :... ::::.:::::: . ::: .. ...:...
CCDS68 DLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLYMVFHIIDLLL
690 700 710 720 730 740
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 YEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFDSCPD--KLVLKAYQVKY
::. ..: :.:.::.... .:. :.:: ..:. .:... : . ::. : ..:
CCDS68 CEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLTDFEGALKFFRVQLPKRYRSEENAKKLMELACNMKI
750 760 770 780 790 800
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVI
. ::.:. :::: .:. .. ... :.:.. ::: :.. ::. . :.: ..
CCDS68 SQKKLKKYEKEYHTMREQQAQQEDPIERFERENRRLQEANMRLEQENDDLAHE-----LV
810 820 830 840 850 860
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 KRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETL
..:. :.. ..: : ::.. ..: ... .:. .:: : : :.:
CCDS68 TSKIAL-RKDLDNAEE---KADALNKELLMTKQKLIDAEEEKRRLEEESAQ--LKEMCR-
870 880 890 900 910
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GALREMQDKVLDMEKRNSSL-PDENNV-AQLQEELKALKVREGQAVASTRELKLQLQELS
::. ::. . :.:::. : ... .::.:.: : : .:. :.. :...
CCDS68 ---REL-DKAESEIKKNSSIIGDYKQICSQLSERL------EKQQTANKVEIEKIRQKVD
920 930 940 950 960
540 550 560 570 580
pF1KE4 DTWQAH--LARGGRWKE-SPRKLVVGELQDE---LMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELE
: . . . . :: : : : :. : :: .. .::: . .:. .: .
CCDS68 DCERCREFFNKEGRVKGISSTKEVLDEDTDEEKETLKNQLREMELELAQTKLQLVEAECK
970 980 990 1000 1010 1020
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 TQDHIHR-NL-LNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSESRRKQAEAECKSKEEVMA
:: :. .: ::.:.: .
CCDS68 IQDLEHHLGLALNEVQAAKKTWFNRTLSSIKTATGVQGKETC
1030 1040 1050 1060
>>CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 (815 aa)
initn: 780 init1: 623 opt: 832 Z-score: 487.2 bits: 101.0 E(32554): 8.1e-21
Smith-Waterman score: 832; 38.2% identity (74.8% similar) in 317 aa overlap (73-385:495-811)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSH-LEEDTWILWGRIANEWEEWR
::.....:. : ::.. ..:.
CCDS13 DKEEPVTPTSGGGPMSPQDDEAEEESDNELSSGTGDVSKDCPEKILYSWGELLGKWHSNL
470 480 490 500 510 520
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 RRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATD-MPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIAR
. : :. :...:.:. .:: ::::: . : . . ..: :. .: :..: ::: :
CCDS13 GARPKGLSTLVKSGVPEALRAEVWQLLAGCHDNQAMLDRYRILITKDSAQESVITRDIHR
530 540 550 560 570 580
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 TYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFV
:.: :..:: . ::: :... ::::. :...:::::..:....::..::::.::::.:
CCDS13 TFPAHDYFKDTGGDGQESLYKICKAYSVYDEDIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFCVLV
590 600 610 620 630 640
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 RLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLF
..: .: ::.:.. .. .: .::.: ..:::::::..:: . .... ::::.::::::
CCDS13 KIMYDYGLRDLYRNNFEDLHCKFYQLERLMQEQLPDLHSHFSDLNLEAHMYASQWFLTLF
650 660 670 680 690 700
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFD
. ::: .. ...:... :::.:.:.:.::::.... .:.: :.:: ..:. .:...
CCDS13 TAKFPLCMVFHIIDLLLCEGLNIIFHVALALLKTSKEDLLQADFEGALKFFRVQLPKRYR
710 720 730 740 750 760
350 360 370 380 390
pF1KE4 SCPD--KLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETL
. . .:. .: ..: ::.:. :::: .:. ...... . : .
CCDS13 AEENARRLMEQACNIKVPTKKLKKYEKEYQTMRESQLQQEDPMDRYKFVYL
770 780 790 800 810
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 EKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVS
>>CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235 aa)
initn: 595 init1: 512 opt: 602 Z-score: 356.1 bits: 77.4 E(32554): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 652; 29.8% identity (64.0% similar) in 470 aa overlap (6-445:742-1204)
10 20
pF1KE4 MASPTLSPDSSSQEA------LSAPTCSPTSDSEN
::: : ..: ::. .: . :
CCDS66 RIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGED-DPEKIEER
720 730 740 750 760 770
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAK--LEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTW
. ::. : . ...: ::. ...... ...:: . : :. . ... ....
CCDS66 KKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQK-LEASRDELQSRKVKLDY--EEVGACQKEVL
780 790 800 810 820
90 100 110 120 130
pF1KE4 ILWGR-IANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVKNQ---
: : . . : . : : . . :...:.:. :. .::.: . : :.:
CCDS66 ITWDKKLLNCRAKIRCDMEDI-HTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD
830 840 850 860 870 880
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 --YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQ
:.::::. . .. : :..::.: : .:. : . :: :::..:::::.:.::::::
CCDS66 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ
890 900 910 920 930 940
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 GSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDL
: .:..:.::..: ::.:: .. :: . .:. ..:.: : . .::. .:.. ::
CCDS66 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL
950 960 970 980 990 1000
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA
.:.. . . :.::. :::::: . : : ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ...
CCDS66 YNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQET
1010 1020 1030 1040 1050 1060
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 ELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEME
.:. . .:.. .... ..: . : .:.. ..... . :... : :: ..... .:
CCDS66 LIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDIS-KQLHAYEVEYHVLQDELQE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
380 390 400 410 420
pF1KE4 -----EQIE-IKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQV--TRAQEAEENY--VIKRELAVVRQQ
:. : ...: :....: .: .. ::: :: :. : : : .. :: . ..
CCDS66 SSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKM-KSL
1130 1140 1150 1160 1170 1180
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV
. .. . :.:..::..
CCDS66 IRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
1190 1200 1210 1220 1230
>>CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290 aa)
initn: 595 init1: 512 opt: 602 Z-score: 355.8 bits: 77.4 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 652; 29.8% identity (64.0% similar) in 470 aa overlap (6-445:797-1259)
10 20
pF1KE4 MASPTLSPDSSSQEA------LSAPTCSPTSDSEN
::: : ..: ::. .: . :
CCDS66 RIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGED-DPEKIEER
770 780 790 800 810 820
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAK--LEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTW
. ::. : . ...: ::. ...... ...:: . : :. . ... ....
CCDS66 KKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQK-LEASRDELQSRKVKLDY--EEVGACQKEVL
830 840 850 860 870 880
90 100 110 120 130
pF1KE4 ILWGR-IANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVKNQ---
: : . . : . : : . . :...:.:. :. .::.: . : :.:
CCDS66 ITWDKKLLNCRAKIRCDMEDI-HTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD
890 900 910 920 930 940
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 --YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQ
:.::::. . .. : :..::.: : .:. : . :: :::..:::::.:.::::::
CCDS66 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ
950 960 970 980 990 1000
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 GSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDL
: .:..:.::..: ::.:: .. :: . .:. ..:.: : . .::. .:.. ::
CCDS66 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA
.:.. . . :.::. :::::: . : : ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ...
CCDS66 YNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQET
1070 1080 1090 1100 1110 1120
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 ELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEME
.:. . .:.. .... ..: . : .:.. ..... . :... : :: ..... .:
CCDS66 LIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDIS-KQLHAYEVEYHVLQDELQE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
380 390 400 410 420
pF1KE4 -----EQIE-IKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQV--TRAQEAEENY--VIKRELAVVRQQ
:. : ...: :....: .: .. ::: :: :. : : : .. :: . ..
CCDS66 SSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKM-KSL
1190 1200 1210 1220 1230
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV
. .. . :.:..::..
CCDS66 IRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
1240 1250 1260 1270 1280 1290
>>CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298 aa)
initn: 595 init1: 512 opt: 602 Z-score: 355.8 bits: 77.4 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 652; 29.8% identity (64.0% similar) in 470 aa overlap (6-445:805-1267)
10 20
pF1KE4 MASPTLSPDSSSQEA------LSAPTCSPTSDSEN
::: : ..: ::. .: . :
CCDS41 RIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGED-DPEKIEER
780 790 800 810 820 830
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAK--LEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTW
. ::. : . ...: ::. ...... ...:: . : :. . ... ....
CCDS41 KKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQK-LEASRDELQSRKVKLDY--EEVGACQKEVL
840 850 860 870 880 890
90 100 110 120 130
pF1KE4 ILWGR-IANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVKNQ---
: : . . : . : : . . :...:.:. :. .::.: . : :.:
CCDS41 ITWDKKLLNCRAKIRCDMEDI-HTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD
900 910 920 930 940
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 --YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQ
:.::::. . .. : :..::.: : .:. : . :: :::..:::::.:.::::::
CCDS41 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ
950 960 970 980 990 1000
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 GSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDL
: .:..:.::..: ::.:: .. :: . .:. ..:.: : . .::. .:.. ::
CCDS41 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA
.:.. . . :.::. :::::: . : : ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ...
CCDS41 YNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQET
1070 1080 1090 1100 1110 1120
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 ELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEME
.:. . .:.. .... ..: . : .:.. ..... . :... : :: ..... .:
CCDS41 LIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDIS-KQLHAYEVEYHVLQDELQE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
380 390 400 410 420
pF1KE4 -----EQIE-IKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQV--TRAQEAEENY--VIKRELAVVRQQ
:. : ...: :....: .: .. ::: :: :. : : : .. :: . ..
CCDS41 SSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKM-KSL
1190 1200 1210 1220 1230 1240
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV
. .. . :.:..::..
CCDS41 IRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
1250 1260 1270 1280 1290
>>CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168 aa)
initn: 523 init1: 523 opt: 584 Z-score: 346.4 bits: 75.5 E(32554): 5.7e-13
Smith-Waterman score: 626; 31.1% identity (66.7% similar) in 351 aa overlap (112-446:797-1145)
90 100 110 120 130
pF1KE4 LEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVK
. .:.:.: :. .:..: . : :
CCDS33 LKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSK
770 780 790 800 810 820
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NQ-----YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDRE
.: :.::::. . .. : :..::.: : .:..: . :: :.:..:::::.:.:
CCDS33 QQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQE
830 840 850 860 870 880
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 VGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQE
:::::: .:..:.::..: ::::: .. :: .. ::. ..:.: : . .::. .:..
CCDS33 VGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHD
890 900 910 920 930 940
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 QLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALL
:: .:.. . . :.::. ::::.: . ::: ..::::... .: :..:.:.:.::
CCDS33 YHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLL
950 960 970 980 990 1000
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 QVNQAELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMK
.. ..: . .: . .... ..:. .: . ..... :... : :: ...
CCDS33 GSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIA-KQLQAYEVEYHVLQ
1010 1020 1030 1040 1050 1060
380 390 400 410 420
pF1KE4 -----SKEMEEQIEIKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQ
:. . .. .. .: .:.. : :: .. ::. ::. .. . .:.. :. ...
CCDS33 EELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSS-ESK
1070 1080 1090 1100 1110 1120
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV
..: :. .:.. : :.
CCDS33 LKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
1130 1140 1150 1160
794 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 17:09:22 2016 done: Mon Nov 7 17:09:22 2016
Total Scan time: 3.900 Total Display time: 0.150
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]