Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4216
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4216, 748 aa
1>>>pF1KE4216 748 - 748 aa - 748 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3638+/-0.0012; mu= 5.9182+/- 0.072
mean_var=172.4007+/-35.026, 0's: 0 Z-trim(107.7): 158 B-trim: 226 in 1/49
Lambda= 0.097680
statistics sampled from 9556 (9718) to 9556 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 3.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 748) 4997 717.2 2.3e-206
CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 653) 4306 619.8 4.2e-177
CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 655) 4067 586.1 5.7e-167
CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 698) 1590 237.1 7.3e-62
CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 704) 1590 237.1 7.3e-62
CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 608) 1298 195.9 1.6e-49
CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 639) 1241 187.9 4.3e-47
CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 646) 1241 187.9 4.3e-47
CCDS46312.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 638) 1239 187.6 5.2e-47
CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 714) 1109 169.3 1.9e-41
CCDS54363.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 606) 848 132.5 1.9e-30
CCDS82077.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 812) 403 69.9 1.9e-11
CCDS82076.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 774) 401 69.6 2.2e-11
CCDS45616.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 818) 401 69.6 2.3e-11
CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1075) 399 69.4 3.5e-11
CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1099) 399 69.4 3.5e-11
CCDS32408.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 803) 394 68.6 4.4e-11
CCDS32409.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 881) 394 68.6 4.8e-11
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 548) 386 67.4 7.1e-11
>>CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 (748 aa)
initn: 4997 init1: 4997 opt: 4997 Z-score: 3818.5 bits: 717.2 E(32554): 2.3e-206
Smith-Waterman score: 4997; 100.0% identity (100.0% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEENNDSTENPQQGQGRQNAIKCGWLRKQGGFVKTWHTRWFVLKGDQLYYFKDEDETKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEENNDSTENPQQGQGRQNAIKCGWLRKQGGFVKTWHTRWFVLKGDQLYYFKDEDETKPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGGDRDRMTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGGDRDRMTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDAELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDAELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 KENNNTKDSPSRQCSWDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KENNNTKDSPSRQCSWDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 TVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGELGQHNRLSTYDNVHQQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGELGQHNRLSTYDNVHQQFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 MMNLDDKQSIDSATWSTSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGNFEDPVLDGPPQDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MMNLDDKQSIDSATWSTSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGNFEDPVLDGPPQDD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LSHPRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSSLKQEMTKQKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSHPRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSSLKQEMTKQKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 EYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQK
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KE4 EMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ
730 740
>>CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 (653 aa)
initn: 4306 init1: 4306 opt: 4306 Z-score: 3293.1 bits: 619.8 E(32554): 4.2e-177
Smith-Waterman score: 4306; 100.0% identity (100.0% similar) in 653 aa overlap (96-748:1-653)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGGDRDRMTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSIRRVIW
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSIRRVIW
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKE
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAG
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 VKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPL
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDAELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDAELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNN
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TKDSPSRQCSWDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TKDSPSRQCSWDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPA
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 FNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMG
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 ILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGELGQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGELGQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLD
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 DKQSIDSATWSTSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGNFEDPVLDGPPQDDLSHPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DKQSIDSATWSTSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGNFEDPVLDGPPQDDLSHPR
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 DYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESR
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 IKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQF
580 590 600 610 620 630
730 740
pF1KE4 FSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ
:::::::::::::::::::::::
CCDS43 FSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ
640 650
>>CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 (655 aa)
initn: 4061 init1: 4061 opt: 4067 Z-score: 3111.1 bits: 586.1 E(32554): 5.7e-167
Smith-Waterman score: 4067; 97.0% identity (97.8% similar) in 643 aa overlap (106-748:15-655)
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 NEENPGKFLFEVVPGGDRDRMTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQ
.::: . . :.: . : :::::
CCDS36 MPEDRNSGGCPAGALASTPFIPKTTYRRIKRCF--SFRKGIFGQ
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 KLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEK
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 PSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 PSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKS
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 LPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQ
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 QLMSVMISKHDCLFPKDAELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 QLMSVMISKHDCLFPKDAELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 WDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 WDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTN
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 GSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 GSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNP
350 360 370 380 390 400
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 TNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGELGQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGELGQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATW
410 420 430 440 450 460
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 STSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGNFEDPVLDGPPQDDLSHPRDYESKSDHRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 STSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGNFEDPVLDGPPQDDLSHPRDYESKSDHRS
470 480 490 500 510 520
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 VGGRSSRATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VGGRSSRATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLT
530 540 550 560 570 580
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 LETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVE
590 600 610 620 630 640
740
pF1KE4 PRRTERGNTIWIQ
:::::::::::::
CCDS36 PRRTERGNTIWIQ
650
>>CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (698 aa)
initn: 1677 init1: 1268 opt: 1590 Z-score: 1224.2 bits: 237.1 E(32554): 7.3e-62
Smith-Waterman score: 1960; 47.7% identity (69.6% similar) in 726 aa overlap (21-734:39-689)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEENNDSTENPQQGQGRQNAIKCGWLRKQGGFVKTWHTRWFVLKGDQLYY
.: :::.:: ...:.:. :::::.::::.:
CCDS72 ARRARSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQRWFVLRGDQLFY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE4 FKDEDETKPLGTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGG--DRDRMTANHESYLLMAS
.::.:: :: : : : :..:.: : . :.::: :::. ::: .:... :: :. :::::
CCDS72 YKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKVPANPEALLLMAS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 TQNDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGL
.: ::::::..::::::.:.:::::::.::.::..:..:: ::::.::::::::::.:::
CCDS72 SQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 KEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKY
::::::.:::::::..:::.::::::: :::.:::::::::::::::::::::.:.:.:
CCDS72 TEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNL
:::::::.::.:.: :. ::::::..:: .:::::.:::.::::::.::.:::::::::
CCDS72 EDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 ATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDA-ELQSKPQDGVSNNN
:::::::::::.::::.:::::: .::.::.:.: ::. :: . : ..:. :.
CCDS72 ATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSPRGGL----
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 EIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKN
::. : . : . :. . :.: .: . .:.: .
CCDS72 -------------------------QCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGP-GLPAHRTSSLDG
370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 SVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSL
.. . .::. : : : : . : .:.:: :. . . :. ::
CCDS72 AAVAV-LSRTAPT----------GPG--------SRCSPG-KKVQTLPSWKSSFRQPRSL
400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 KVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGEL--
::. : : .... :..: :: :: :: .:: ... .. .:
CCDS72 --SGSPKGGGS----SLEVPIISSG--GN--------WLMNGLSSLRGHRRASSGDRLKD
440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 -GQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWS-TSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQ
:. .:::::::: . .. :. : .:: .:: : :. . .:: :.: .
CCDS72 SGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIP---SVASMAWSGASSSESSVGGSLSSC----TACRAS
490 500 510 520 530
590 600 610 620 630
pF1KE4 DFFGGN--FEDPVLDGPPQDDLSH-PRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSS
: . . : .:. : . :. :.. . . .:. .: . : .: :
CCDS72 DSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARR
540 550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 SNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIE
:. ::..::. :. :. .:. ::: .: .:. . :. .: :..:::::.::. :.:
CCDS72 SE--ALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLE
600 610 620 630 640 650
700 710 720 730 740
pF1KE4 IKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ
::.::.:::.::::.::..::.:::.::::.: :::
CCDS72 IKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
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10 20 30 40 50
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.: :::.:: ...:.:. :::::.::::.:
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60 70 80 90 100
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.::.:: :: : : : :..:.: : . :.::: :::. ::: .:... :: :. :::::
CCDS58 YKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKVPANPEALLLMAS
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110 120 130 140 150 160
pF1KE4 TQNDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGL
.: ::::::..::::::.:.:::::::.::.::..:..:: ::::.::::::::::.:::
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170 180 190 200 210 220
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::::::.:::::::..:::.::::::: :::.:::::::::::::::::::::.:.:.:
CCDS58 TEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARY
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230 240 250 260 270 280
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:::::::.::.:.: :. ::::::..:: .:::::.:::.::::::.::.:::::::::
CCDS58 EDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNL
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:::::::::::.::::.:::::: .::.::.:.: ::. :: . : ..:. :.
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pF1KE4 EIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKN
::. : . : . :. . :.: .: . .:.: .
CCDS58 -------------------------QCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGP-GLPAHRTSSLDG
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.. . .::. : : : : . : .:.:: :. . . :. ::
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::. : : .... :..: :: :: :: .:: ... .. .:
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:. .:::::::: . .. :. : .:: .:: : :. . .:: :.: .
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pF1KE4 DFFGGN--FEDPVLDGPPQDDLSH-PRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSS
: . . : .:. : . :. :.. . . .:. .: . : .: :
CCDS58 DSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARR
550 560 570 580 590 600
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:. ::..::. :. :. .:. ::: .: .:. . :. .: :..:::::.::. :.:
CCDS58 SE--ALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLE
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pF1KE4 IKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ
::.::.:::.::::.::..::.:::.::::.: :::
CCDS58 IKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
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:::::.:.:::::::.::.::..:..:: ::::.::::::::::.::: ::::::.::::
CCDS58 RRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQA
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:::..:::.::::::: :::.:::::::::::::::::::::.:.:.::::::::.::.:
CCDS58 NLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTK
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.: :. ::::::..:: .:::::.:::.::::::.::.::::::::::::::::::::.
CCDS58 DEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQ
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::::.:::::: .::.::.:.: ::. :: . : ..:. :.
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::. : . : . :. . :.: .: . .:.: ... . .::. :
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: : : . : .:.:: :. . . :. :: ::. : :
CCDS58 T----------GPG--------SRCSPG-KKVQTLPSWKSSFRQPRSL--SGSPKGGGS-
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.... :..: :: :: :: .:: ... .. .: :. .:::::::
CCDS58 ---SLEVPIISSG--GN--------WLMNGLSSLRGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDN
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: . .. :. : .:: .:: : :. . .:: :.: .: . . :
CCDS58 VPAPGLVPGI---PSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSC----TACRASDSSARSSLHTDW
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pF1KE4 VLDGPPQDDLSH-PRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSS
.:. : . :. :.. . . .:. .: . : .: : :. ::..::.
CCDS58 ALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSE--ALQGLVTE
460 470 480 490 500 510
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pF1KE4 LKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKED
:. :. .:. ::: .: .:. . :. .: :..:::::.::. :.:::.::.:::.::
CCDS58 LRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSERARED
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pF1KE4 AEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ
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CCDS58 AERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
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.::::::.:::::.: :..: ::::: .::.:: .:..:..:: :. ::::. ..
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340 350 360 370 380 390
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.: :: :. : .: . : :: .:. : : ... .
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: : :.:: ....: . :: . :. : . .. . .. ..::: :
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: :. : ... .:..: .: :. .: : :..
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. .::: : : : . : . .:.:.: :.
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:: ... : : : : .. : . .::.: : .: ::
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:: :...:.. . :: :. :..:. :: :: .::.::..: . .... :..::
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..:.:: . .::..:: ::..::.:::: :..:...: ... : .:
CCDS54 EKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
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pF1KE4 Q
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CCDS33 WDFNLKVEAAKIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPL-----ERPIKMGWLKKQRSIVKNW
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CCDS33 QQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNR
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CCDS33 M--GQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGA-VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPIL
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pF1KE4 VEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYL
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CCDS33 VEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYL
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CCDS33 LNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDI
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.: :: :. : .: . : :: .:. : : ... .
CCDS33 PLSP--------PAQK------------NDPKKAPVARSSVGWDATED-LRISRTDSFSS
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pF1KE4 ALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTP
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CCDS33 MTSDSDTTSP--------TGQQP------SDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLP
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pF1KE4 NGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRD
: :. : ... .:..: .: :. .: : :..
CCDS33 N------RKCFL--TSAFQGANSS-----KMEIF-----------KNEFWSPSS------
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520 530 540 550 560 570
pF1KE4 NKQKEQAGELGQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWSTSSCEISLPENSNSCRS
. .::: : : : . : . .:.:.: :.
CCDS33 ---EAKAGE-G-HRRTMSQD-------LRQLSDSQ-----------------------RT
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:: ... : : : : .. : . .::.: : .: ::
CCDS33 ST------------YDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGD-----------TLASPNS
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CCDS33 ETGPGKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEEL
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CCDS33 EKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
600 610 620 630 640
pF1KE4 Q
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10 20 30
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CCDS58 K
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]