Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4213
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4213, 705 aa
1>>>pF1KE4213 705 - 705 aa - 705 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1276+/-0.000522; mu= 11.8499+/- 0.032
mean_var=152.4679+/-32.500, 0's: 0 Z-trim(113.0): 286 B-trim: 2367 in 3/50
Lambda= 0.103869
statistics sampled from 21871 (22201) to 21871 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 10.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_438112 (OMIM: 300204,300928) probable E3 ubiqui ( 705) 4782 729.5 1.1e-209
XP_016884728 (OMIM: 300204,300928) PREDICTED: prob ( 685) 4659 711.1 3.7e-204
NP_000372 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiquiti ( 667) 3624 556.0 1.8e-157
NP_001180206 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiqu ( 667) 3624 556.0 1.8e-157
XP_016885025 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 667) 3624 556.0 1.8e-157
NP_001092094 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiqu ( 667) 3624 556.0 1.8e-157
NP_150632 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiquiti ( 667) 3624 556.0 1.8e-157
XP_016885029 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 552) 3073 473.3 1.1e-132
NP_036348 (OMIM: 300204,300928) probable E3 ubiqui ( 735) 3016 464.9 5e-130
XP_005262119 (OMIM: 300204,300928) PREDICTED: prob ( 715) 2893 446.4 1.7e-124
XP_016885031 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 489) 2406 373.3 1.2e-102
NP_001180208 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiqu ( 489) 2406 373.3 1.2e-102
XP_016885027 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 629) 2310 359.0 3.2e-98
NP_150631 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiquiti ( 629) 2310 359.0 3.2e-98
XP_016885028 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 629) 2310 359.0 3.2e-98
XP_016885026 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 629) 2310 359.0 3.2e-98
XP_016885023 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 718) 2161 336.8 1.8e-91
XP_006724555 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 718) 2161 336.8 1.8e-91
XP_011543827 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 718) 2161 336.8 1.8e-91
XP_011543828 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 718) 2161 336.8 1.8e-91
XP_005274594 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 718) 2161 336.8 1.8e-91
XP_005274593 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 718) 2161 336.8 1.8e-91
XP_011543829 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 718) 2161 336.8 1.8e-91
XP_016885024 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 680) 2156 336.0 3e-91
XP_016885030 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 540) 1470 233.1 2.2e-60
NP_001180207 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiqu ( 540) 1470 233.1 2.2e-60
NP_001180210 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiqu ( 228) 1091 176.0 1.4e-43
NP_001180209 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiqu ( 451) 1091 176.2 2.4e-43
XP_016876437 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 688) 567 97.9 1.4e-19
XP_016876435 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 706) 567 97.9 1.5e-19
XP_016876436 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 692) 562 97.1 2.4e-19
XP_016876434 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 710) 562 97.1 2.5e-19
NP_055978 (OMIM: 606555) E3 ubiquitin-protein liga ( 710) 562 97.1 2.5e-19
XP_016865112 (OMIM: 609317) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 529) 558 96.4 3e-19
NP_001287688 (OMIM: 609317) E3 ubiquitin-protein l ( 716) 558 96.5 3.7e-19
NP_061170 (OMIM: 609317) E3 ubiquitin-protein liga ( 728) 558 96.5 3.8e-19
XP_016865111 (OMIM: 609317) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 733) 558 96.5 3.8e-19
XP_016865110 (OMIM: 609317) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 745) 558 96.6 3.8e-19
NP_001287681 (OMIM: 609317) E3 ubiquitin-protein l ( 573) 548 95.0 9e-19
XP_005267359 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 714) 546 94.7 1.3e-18
XP_016876433 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 732) 533 92.8 5.1e-18
XP_016876432 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 791) 527 91.9 1e-17
XP_011534691 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 802) 527 91.9 1e-17
NP_443210 (OMIM: 606555) E3 ubiquitin-protein liga ( 550) 523 91.2 1.2e-17
XP_005267358 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 777) 522 91.2 1.7e-17
XP_006720081 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 795) 522 91.2 1.7e-17
NP_001269307 (OMIM: 600986) tripartite motif-conta ( 633) 502 88.1 1.1e-16
NP_001287818 (OMIM: 610584) tripartite motif-conta ( 721) 496 87.3 2.4e-16
XP_016876439 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 593) 482 85.1 8.7e-16
XP_016876438 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 611) 482 85.1 8.9e-16
>>NP_438112 (OMIM: 300204,300928) probable E3 ubiquitin- (705 aa)
initn: 4782 init1: 4782 opt: 4782 Z-score: 3885.8 bits: 729.5 E(85289): 1.1e-209
Smith-Waterman score: 4782; 100.0% identity (100.0% similar) in 705 aa overlap (1-705:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE4 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_438 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
670 680 690 700
>>XP_016884728 (OMIM: 300204,300928) PREDICTED: probable (685 aa)
initn: 4659 init1: 4659 opt: 4659 Z-score: 3786.4 bits: 711.1 E(85289): 3.7e-204
Smith-Waterman score: 4659; 100.0% identity (100.0% similar) in 685 aa overlap (21-705:1-685)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700
pF1KE4 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
650 660 670 680
>>NP_000372 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiquitin-pr (667 aa)
initn: 3687 init1: 3624 opt: 3624 Z-score: 2948.3 bits: 556.0 E(85289): 1.8e-157
Smith-Waterman score: 3624; 76.2% identity (93.2% similar) in 665 aa overlap (21-685:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_000 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
:...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_000 HCATNESVESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::.. .: :.:.. ::::.::: .::::::.::::::::.::.::::::::::.::
NP_000 RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
:.::.::.:.::. ::.::.::::::::.:::::::::::::::::::::.:..:..:::
NP_000 LIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
:.:: :::::.:::.:::. .::::: ::.::::.. .:::: :::: :.::::::.:.:
NP_000 QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQII
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
..:::: :::.:::::::.:::.::.:::. ::.:::: :::::.:::::.::::.:::.
NP_000 GTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
:::::::::::.::.::.:..::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.::::
NP_000 MATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTIT
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
::: ::::::. :::::::::::::: .:: ::.:::::::::::::::::::::::.::
NP_000 VHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI
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:.::::::::::.::: .::::::::::::: .:.:::.:.:.: .:.:::: :::::::
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::.. : ::.:::.::::: ::::::...:::::::.:::::::.::::::..::.. ::
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:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
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:...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::.
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::::.. .: :.:.. ::::.::: .::::::.::::::::.::.::::::::::.::
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XP_016 FTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
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Smith-Waterman score: 3624; 76.2% identity (93.2% similar) in 665 aa overlap (21-685:1-665)
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:.:.:::::.::. .. :::.:.:.::::::. ..::: ::.::.::::.: :::::
NP_001 NNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPT
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::.::: : :..::: :: .: :.
NP_001 FTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
650 660
>>NP_150632 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiquitin-pr (667 aa)
initn: 3687 init1: 3624 opt: 3624 Z-score: 2948.3 bits: 556.0 E(85289): 1.8e-157
Smith-Waterman score: 3624; 76.2% identity (93.2% similar) in 665 aa overlap (21-685:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_150 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVS
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pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
:...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_150 HCATNESVESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET
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pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::.. .: :.:.. ::::.::: .::::::.::::::::.::.::::::::::.::
NP_150 RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
:.::.::.:.::. ::.::.::::::::.:::::::::::::::::::::.:..:..:::
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pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
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pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
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NP_150 VHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI
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pF1KE4 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
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NP_150 FMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
::.. : ::.:::.::::: ::::::...:::::::.:::::::.::::::..::.. ::
NP_150 RFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRC
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
:.:.:::::.::. .. :::.:.:.::::::. ..::: ::.::.::::.: :::::
NP_150 NNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPT
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700
pF1KE4 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
::.::: : :..::: :: .: :.
NP_150 FTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
650 660
>>XP_016885029 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTED: E (552 aa)
initn: 3073 init1: 3073 opt: 3073 Z-score: 2503.2 bits: 473.3 E(85289): 1.1e-132
Smith-Waterman score: 3073; 78.8% identity (94.6% similar) in 552 aa overlap (21-572:1-552)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
XP_016 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
:...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 HCATNESVESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::.. .: :.:.. ::::.::: .::::::.::::::::.::.::::::::::.::
XP_016 RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
:.::.::.:.::. ::.::.::::::::.:::::::::::::::::::::.:..:..:::
XP_016 LIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
:.:: :::::.:::.:::. .::::: ::.::::.. .:::: :::: :.::::::.:.:
XP_016 QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQII
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
..:::: :::.:::::::.:::.::.:::. ::.:::: :::::.:::::.::::.:::.
XP_016 GTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
:::::::::::.::.::.:..::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.::::
XP_016 MATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTIT
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
::: ::::::. :::::::::::::: .:: ::.:::::::::::::::::::::::.::
XP_016 VHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
:.::::::::::.::: .::::::::::::: .:.:::.:.:.: .:.:::: :::::::
XP_016 FMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
::.. : ::.:::.::::: ::::::...:::
XP_016 RFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW
530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
>>NP_036348 (OMIM: 300204,300928) probable E3 ubiquitin- (735 aa)
initn: 4768 init1: 2995 opt: 3016 Z-score: 2455.3 bits: 464.9 E(85289): 5e-130
Smith-Waterman score: 4712; 95.9% identity (95.9% similar) in 735 aa overlap (1-705:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFIS------------------------------L
::::::::::::::::::::::::::::: :
NP_036 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISKSWCSWGLWPEIRKCKEAVSCSRLAGAPRGL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 YNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 YNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDP
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 KMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 KMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 TWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 TWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDY
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 DNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 DNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNC
670 680 690 700 710 720
700
pF1KE4 RPQESPYVSGMKTCH
:::::::::::::::
NP_036 RPQESPYVSGMKTCH
730
>>XP_005262119 (OMIM: 300204,300928) PREDICTED: probable (715 aa)
initn: 4645 init1: 2872 opt: 2893 Z-score: 2355.9 bits: 446.4 E(85289): 1.7e-124
Smith-Waterman score: 4589; 95.8% identity (95.8% similar) in 715 aa overlap (21-705:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
350 360 370 380 390 400
430 440 450
pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFIS------------------------------L
::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_005 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISKSWCSWGLWPEIRKCKEAVSCSRLAGAPRGL
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 YNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDP
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 KMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSS
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 TWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDY
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 DNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNC
650 660 670 680 690 700
700
pF1KE4 RPQESPYVSGMKTCH
:::::::::::::::
XP_005 RPQESPYVSGMKTCH
710
705 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 18:15:56 2016 done: Mon Nov 7 18:15:58 2016
Total Scan time: 10.610 Total Display time: 0.200
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]