Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4210
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4210, 730 aa
1>>>pF1KE4210 730 - 730 aa - 730 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1763+/-0.000904; mu= 6.6117+/- 0.055
mean_var=140.2385+/-28.197, 0's: 0 Z-trim(111.3): 40 B-trim: 30 in 1/50
Lambda= 0.108303
statistics sampled from 12257 (12288) to 12257 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 4.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45573.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 730) 4863 771.6 0
CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 711) 4726 750.2 2.4e-216
CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 715) 4324 687.4 2e-197
CCDS53277.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 727) 2085 337.6 4.1e-92
CCDS218.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 663) 1990 322.7 1.1e-87
CCDS53276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 681) 1791 291.6 2.6e-78
CCDS81276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 748) 1782 290.2 7.5e-78
CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 ( 991) 755 129.8 2e-29
CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (1013) 755 129.8 2e-29
CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1782) 725 125.2 8.5e-28
CCDS61490.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1783) 725 125.2 8.5e-28
CCDS9807.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1804) 725 125.2 8.6e-28
CCDS41474.1 SIPA1L2 gene_id:57568|Hs108|chr1 (1722) 717 124.0 2e-27
CCDS33007.1 SIPA1L3 gene_id:23094|Hs108|chr19 (1781) 715 123.7 2.5e-27
CCDS8108.1 SIPA1 gene_id:6494|Hs108|chr11 (1042) 664 115.6 3.9e-25
>>CCDS45573.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 (730 aa)
initn: 4863 init1: 4863 opt: 4863 Z-score: 4113.0 bits: 771.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4863; 100.0% identity (100.0% similar) in 730 aa overlap (1-730:1-730)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MFGRKRSVSFGGFGWIDKTMLASLKVKKQELANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MFGRKRSVSFGGFGWIDKTMLASLKVKKQELANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EMLEKMQGIKLEEQKPGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EMLEKMQGIKLEEQKPGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 TTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHTGSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHTGSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 QEIKSETSSNPSSPEICPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEIKSETSSNPSSPEICPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDK
670 680 690 700 710 720
730
pF1KE4 LSHASSGAGH
::::::::::
CCDS45 LSHASSGAGH
730
>>CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 (711 aa)
initn: 4726 init1: 4726 opt: 4726 Z-score: 3997.5 bits: 750.2 E(32554): 2.4e-216
Smith-Waterman score: 4726; 100.0% identity (100.0% similar) in 711 aa overlap (20-730:1-711)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MFGRKRSVSFGGFGWIDKTMLASLKVKKQELANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLASLKVKKQELANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFF
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EMLEKMQGIKLEEQKPGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EMLEKMQGIKLEEQKPGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIV
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPP
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGP
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTK
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 TTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHTGSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHTGSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSS
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 QEIKSETSSNPSSPEICPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QEIKSETSSNPSSPEICPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDK
650 660 670 680 690 700
730
pF1KE4 LSHASSGAGH
::::::::::
CCDS82 LSHASSGAGH
710
>>CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 (715 aa)
initn: 4324 init1: 4324 opt: 4324 Z-score: 3658.0 bits: 687.4 E(32554): 2e-197
Smith-Waterman score: 4720; 97.9% identity (97.9% similar) in 730 aa overlap (1-730:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MFGRKRSVSFGGFGWIDKTMLASLKVKKQELANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MFGRKRSVSFGGFGWIDKTMLASLKVKKQELANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EMLEKMQGIKLEEQKPGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENV
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EMLEKMQ---------------DDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENV
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIV
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPP
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGP
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTK
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 TTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHTGSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHTGSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSS
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 QEIKSETSSNPSSPEICPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEIKSETSSNPSSPEICPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDK
650 660 670 680 690 700
730
pF1KE4 LSHASSGAGH
::::::::::
CCDS45 LSHASSGAGH
710
>>CCDS53277.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 (727 aa)
initn: 2058 init1: 1609 opt: 2085 Z-score: 1767.2 bits: 337.6 E(32554): 4.1e-92
Smith-Waterman score: 2276; 51.8% identity (74.2% similar) in 726 aa overlap (1-710:1-706)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MFGRKRSVSFGGFGWIDKTMLASLKVKKQELANS---SDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSS
: ::::: .::..: .::.. . .: ... :. . : : : : :..
CCDS53 MSGRKRSFTFGAYGGVDKSFTSRRSVWRSDGQNQHFPQALDLSRVNLVPSYTPSLYPKNT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 EFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWI
..:::.::::: ...::. : : :...:::::::. ::. . ::.: ..:::::::::
CCDS53 DLFEMIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 EDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGS
: :: . .:: : : ::.: ::::. :: ::.:::::.:.:.: .
CCDS53 E-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGL
.::.:..:.: . :.::..::.: .: :. ::.. :...:.: :.:: :.:.
CCDS53 ALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLL
:: ::::::::..::..::: ..:.::::::::: :: :::::..::::::: :::..:
CCDS53 RFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRH
:. . :::::::::::::::::::.:::: .::..:::::::::::.:.:::::::::::
CCDS53 GQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 IGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGP
:::::::..::.::::::::::::::::::.:::.: : . : ::::::::.::: :::
CCDS53 IGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 PLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQA
:::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..::::::.:::::::..:..::: :.:.
CCDS53 PLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 MLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISH
:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.::..: ..:: .. . : ::...
CCDS53 MMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAP
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 NSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSST
:. ...:.. .: ..:: ...:: : .. : :. . . . .: .
CCDS53 NNPDLAKAAGISLIV------PGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAG
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KE4 PKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTA
::::.:: ::: :::.::. ::::. :. . . : . .::::::.:: .:..
CCDS53 QKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVV
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: :... :.: : :. .: :.. :.:: : . : :.. : :::: ::
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710 720 730
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. ..:
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710 720
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::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : . ::.: ::
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::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
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:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
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.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
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:..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: :
CCDS21 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF
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.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
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: . : :.. : :::: :: . ..:
CCDS21 EDSVSTTSGGSSPGP---SRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
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pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
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CCDS53 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
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CCDS53 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
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:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
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.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
CCDS53 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
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CCDS53 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
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pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
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CCDS53 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
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CCDS53 MDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRFGRRGSAIGIGTVE
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CCDS53 ESLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSE
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.::. ::::. :. . . : . .::::::.:: .:.. : :... :.: :
CCDS53 NSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESV
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CCDS53 SSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
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CCDS81 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
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CCDS81 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKL
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pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
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CCDS81 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
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CCDS81 MDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRFGRRGSAIGIGTVE
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.:: ...:: : .. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.
CCDS81 SLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSEN
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CCDS81 SSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPGPSRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQ
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. :.:::::. . ::..::::... .:::::::: ::.. . ::..::::::::::.:
CCDS69 WTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGNDIVTI
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.::: :..: : :.:: :.: : . .:. . .. .:.... ..:.:: ::::::.:
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::: :::.:::.:: :.:.: .. ::. . :: :. .::..:
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CCDS69 RSFSDVLPESPKSARKKEEARQAEFVRIGQALKLKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWEPQ
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Smith-Waterman score: 755; 40.1% identity (69.0% similar) in 319 aa overlap (155-468:97-411)
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CCDS68 ENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSPFFLSVT
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. .. . :.:: : : . .: . . : :: .: .:. : ...:
CCDS68 LSDQNNQRVPQYRAILWRKTGTQKICLPYSPTKTL-SVKSILSAMNLDKFEKGPREIFHP
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CCDS68 EIQKDLLVLEEQEGSVNFKFGVLFAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDTITLKG
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pF1KE4 FKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAI
. :.:::::. . ::..::::... .:::::::: ::.. . ::..::::::::::.:
CCDS68 WTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGNDIVTI
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pF1KE4 IFQE--ENTP-FVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSP
.::: :..: : :.:: :.: : . .:. . .. .:.... ..:.:: ::::::.:
CCDS68 VFQEGEESSPAFKPSMIRSHFTHIFALVRYN---QQNDNYRLKIFSEESVPLFGPPLPTP
310 320 330 340 350 360
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::: :::.:::.:: :.:.: .. ::. . :: :. .::..:
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