Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4203
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4203, 710 aa
1>>>pF1KE4203 710 - 710 aa - 710 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9018+/-0.000897; mu= -3.2420+/- 0.054
mean_var=323.0220+/-66.693, 0's: 0 Z-trim(116.9): 39 B-trim: 303 in 1/54
Lambda= 0.071361
statistics sampled from 17541 (17578) to 17541 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.807), E-opt: 0.2 (0.54), width: 16
Scan time: 4.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 710) 4755 503.2 5.6e-142
CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 716) 4733 500.9 2.7e-141
CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 859) 985 115.1 4.5e-25
CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 885) 985 115.1 4.6e-25
CCDS65172.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 902) 985 115.1 4.6e-25
CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 913) 985 115.1 4.7e-25
CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 914) 985 115.1 4.7e-25
CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6 ( 777) 719 87.7 7.2e-17
CCDS13811.1 RGL4 gene_id:266747|Hs108|chr22 ( 473) 616 76.9 7.7e-14
CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 768) 598 75.2 4e-13
CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 803) 598 75.2 4.2e-13
>>CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 (710 aa)
initn: 4755 init1: 4755 opt: 4755 Z-score: 2662.4 bits: 503.2 E(32554): 5.6e-142
Smith-Waterman score: 4755; 99.7% identity (99.9% similar) in 710 aa overlap (1-710:1-710)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRRQRSQRRSPAEGPGGSQAPSPIANTFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRRQRSQRRSPAEGPGGSQAPSPIANTFLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTFVPTACLLGFLLPPMPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTFVPTACLLGFLLPPMPPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 PPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQDFRDPPVHSDLGSVRTFLGWAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::
CCDS32 PPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQDFRDHPAHSDLGSVRTFLGWAAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 PQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VTGCVLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VTGCVLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SWGAVSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SWGAVSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 PGDPSSPTSSVSPGSPPSSPRSRDAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSPRPFALPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PGDPSSPTSSVSPGSPPSSPRSRDAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSPRPFALPLG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 SPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE4 YQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS
670 680 690 700 710
>>CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 (716 aa)
initn: 3666 init1: 3666 opt: 4733 Z-score: 2650.2 bits: 500.9 E(32554): 2.7e-141
Smith-Waterman score: 4733; 98.9% identity (99.0% similar) in 716 aa overlap (1-710:1-716)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRRQRSQRRSPAEGPGGSQAPSPIANTFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRRQRSQRRSPAEGPGGSQAPSPIANTFLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTFVPTACLLGFLLPPMPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTFVPTACLLGFLLPPMPPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 PPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQDFRDPPVHSDLGSVRTFLGWAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::
CCDS54 PPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQDFRDHPAHSDLGSVRTFLGWAAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 PQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VTGCVLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VTGCVLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SWGAVSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SWGAVSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE4 PGDPSSPTSS------VSPGSPPSSPRSRDAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSPRP
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PGDPSSPTSSLCISPSVSPGSPPSSPRSRDAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSPRP
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 FALPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FALPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVP
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 QPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS
670 680 690 700 710
>>CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (859 aa)
initn: 1554 init1: 617 opt: 985 Z-score: 563.7 bits: 115.1 E(32554): 4.5e-25
Smith-Waterman score: 1320; 37.1% identity (57.9% similar) in 776 aa overlap (61-696:53-826)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 LRRQRSQRRSPAEGPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDP
:.: :::...:. ::.:: .:: . . .:
CCDS43 SISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDL
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140
pF1KE4 SFMPAFLATYRTFVPTACLLGFLLP------PMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLR-A
:.. :: :::.:. : .: .:. . : : . .: . . .:. :
CCDS43 SYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGC-ILPYSDEDGGPQDQLKNA
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190
pF1KE4 VVSVLGSWLQDHPQDFRDPPVHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EA
. :.::.::... .:: .:: : .. ... ::: ..:. :: .. . ::
CCDS43 ISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEA
150 160 170 180 190 200
200 210
pF1KE4 EREQ-------------------------------EEEP-----------------PQVW
: : : :: :..
CCDS43 EPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQ
210 220 230 240 250 260
220 230
pF1KE4 TGP-PRV--------------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLM
.: : : : .:: :.. : :.::
CCDS43 QAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLS
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PQGPQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQ
. :.:: : : ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:
CCDS43 EEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQ
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 FNTVTGCVLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYR
::.:..::. . :: . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:
CCDS43 FNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHR
390 400 410 420 430 440
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LKRSWGAVSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPP
::..: :::. . :.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..:
CCDS43 LKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPK
450 460 470 480 490 500
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 P-----GPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSY
: :::::::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..:
CCDS43 ETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNY
510 520 530 540 550 560
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 TLSPHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLARE
...: . : ..: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . :
CCDS43 SIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPS
570 580 590 600 610 620
540 550 560
pF1KE4 KSSSPSGS------------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD
: ::: : :: .. : : :: : :: ...
CCDS43 TELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQE
630 640 650 660 670 680
570 580 590 600 610
pF1KE4 -----APAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQ
. . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: ::
CCDS43 KKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQ
690 700 710 720 730 740
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 SSEARVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGD
.. .::::.: :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: :
CCDS43 VGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDD
750 760 770 780 790 800
680 690 700 710
pF1KE4 RVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS
: : ::.::::::::. .: ::.:.
CCDS43 RKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
810 820 830 840 850
>>CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (885 aa)
initn: 1566 init1: 617 opt: 985 Z-score: 563.5 bits: 115.1 E(32554): 4.6e-25
Smith-Waterman score: 1330; 37.7% identity (58.1% similar) in 769 aa overlap (61-696:91-852)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 LRRQRSQRRSPAEGPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDP
:.: :::...:. ::.:: .:: . . .:
CCDS65 SISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 SFMPAFLATYRTFVPTACLLGFLLPPMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGS
:.. :: :::.:. : .: .:. . : . : . :: :: :. :.::.
CCDS65 SYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGCILPYSDE--DGGPQDQL--KN--AISSILGT
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE4 WLQDHPQDFRDPPVHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EAEREQ---
::... .:: .:: : .. ... ::: ..:. :: .. . ::: :
CCDS65 WLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSP
180 190 200 210 220 230
210
pF1KE4 ----------------------------EEEP-----------------PQVWTGP-PRV
: :: :.. .: : :
CCDS65 VPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAV
240 250 260 270 280 290
220 230 240
pF1KE4 --------------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLMPQGPQLL
: .:: :.. : :.:: . :.::
CCDS65 GLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLL
300 310 320 330 340 350
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 DFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGC
: : ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::.:..:
CCDS65 VFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANC
360 370 380 390 400 410
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGA
:. . :: . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::..:
CCDS65 VITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWED
420 430 440 450 460 470
370 380 390 400 410
pF1KE4 VSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-----G
:::. . :.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..: :
CCDS65 VSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETGIIQG
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 PVPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPP
:::::::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..:...:
CCDS65 TVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQ
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 ILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSG
. : ..: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : : ::
CCDS65 FGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSG
600 610 620 630 640 650
540 550 560
pF1KE4 S------------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD-----AP
: : :: .. : : :: : :: ... .
CCDS65 SSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESA
660 670 680 690 700 710
570 580 590 600 610
pF1KE4 AGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSEARVI
. : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: .. .:
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620 630 640 650 660 670
pF1KE4 RVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPD
:::.: :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: :: : ::.
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160 170 180 190 200
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210
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CCDS65 RVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPE
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::::::::. .: ::.:.
CCDS65 NANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
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150 160 170 180 190
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360 370 380 390 400 410
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::..: :::. . :.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..:
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.. .::::.: :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: :
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CCDS65 RKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
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150 160 170 180 190
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CCDS69 RKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
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CCDS47 ---PLDPLVPMPPP------RSS--RRLRAGTLEALVRHLL-DTRTSGTDVSFMSAFLAT
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CCDS47 HRAFTSTPALLGLMADRLEALESHPTDELERTT----------EVAISVLSTWLASHPED
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CCDS47 F-GSEAKGQLDRLESFLLQTGYAA-GKGVGGGSADLIRNLRSRVD-------PQAPDLPK
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CCDS47 PLALPGDP--------------PADPTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGG
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CCDS47 EDNYSQSRELLVQEVKLQSPLEPHSKKAPRSGSRGGGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDEL
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CCDS47 ENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEV
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