Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4201
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4201, 707 aa
1>>>pF1KE4201 707 - 707 aa - 707 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7856+/-0.000332; mu= 8.8359+/- 0.021
mean_var=138.4973+/-27.750, 0's: 0 Z-trim(120.2): 77 B-trim: 803 in 1/54
Lambda= 0.108982
statistics sampled from 35115 (35194) to 35115 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.413), width: 16
Scan time: 12.810
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001306223 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-contain ( 813) 2798 451.6 5.7e-126
NP_057205 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-containing ( 815) 2795 451.1 7.9e-126
NP_001306224 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-contain ( 711) 2319 376.2 2.4e-103
XP_005273215 (OMIM: 613272) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 713) 2316 375.8 3.3e-103
NP_001269615 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain- ( 220) 280 55.4 2.8e-07
NP_001269614 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain- ( 225) 280 55.4 2.9e-07
XP_011528679 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 249) 280 55.4 3.1e-07
NP_078957 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain-con ( 297) 280 55.5 3.6e-07
XP_005261801 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 315) 280 55.5 3.8e-07
NP_001269613 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain- ( 321) 280 55.5 3.9e-07
XP_005261800 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 328) 280 55.5 3.9e-07
XP_005261799 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 352) 280 55.5 4.2e-07
XP_005261798 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 352) 280 55.5 4.2e-07
XP_011528676 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 370) 280 55.5 4.4e-07
XP_011522877 (OMIM: 613422) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 226) 268 53.5 1.1e-06
NP_056168 (OMIM: 613422) BTB/POZ domain-containing ( 263) 268 53.5 1.2e-06
NP_061865 (OMIM: 611285) BTB/POZ domain-containing ( 234) 248 50.4 9.7e-06
NP_001161433 (OMIM: 611725,611726) BTB/POZ domain- ( 288) 236 48.5 4.3e-05
NP_694578 (OMIM: 611725,611726) BTB/POZ domain-con ( 289) 236 48.5 4.3e-05
NP_076981 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-containing ( 234) 218 45.7 0.00025
NP_001123466 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-contain ( 283) 218 45.7 0.0003
XP_011525600 (OMIM: 615240) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 283) 218 45.7 0.0003
XP_011525599 (OMIM: 615240) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 283) 218 45.7 0.0003
NP_001123467 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-contain ( 283) 218 45.7 0.0003
XP_016882772 (OMIM: 615240) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 283) 218 45.7 0.0003
XP_016884999 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 405) 204 43.6 0.0019
NP_004970 (OMIM: 300281) potassium voltage-gated c ( 647) 204 43.7 0.0028
XP_011542212 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 647) 204 43.7 0.0028
NP_955751 (OMIM: 607947) potassium channel regulat ( 229) 195 42.0 0.0031
XP_016878594 (OMIM: 608947) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 175) 192 41.5 0.0034
NP_775876 (OMIM: 607947) potassium channel regulat ( 272) 195 42.1 0.0036
XP_011544085 (OMIM: 608947) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 347) 196 42.3 0.0039
XP_016878595 (OMIM: 608947) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 173) 189 41.0 0.0047
NP_001304328 (OMIM: 613421) BTB/POZ domain-contain ( 290) 192 41.6 0.0052
NP_114160 (OMIM: 613421) BTB/POZ domain-containing ( 313) 192 41.6 0.0055
NP_001304324 (OMIM: 613421) BTB/POZ domain-contain ( 314) 192 41.6 0.0056
NP_612453 (OMIM: 610521) BTB/POZ domain-containing ( 325) 192 41.6 0.0057
XP_016881197 (OMIM: 181270,613420) PREDICTED: BTB/ ( 257) 190 41.3 0.0058
NP_945342 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain-con ( 257) 190 41.3 0.0058
NP_001129677 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 257) 190 41.3 0.0058
NP_001245150 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 257) 190 41.3 0.0058
NP_001245151 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 265) 190 41.3 0.006
XP_011539729 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 369) 191 41.5 0.0071
XP_011539730 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 369) 191 41.5 0.0071
XP_006710695 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 375) 191 41.5 0.0072
XP_011539728 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 387) 191 41.5 0.0074
XP_016856734 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 407) 191 41.5 0.0077
XP_011539727 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 407) 191 41.5 0.0077
XP_006710694 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 510) 191 41.6 0.0094
NP_849194 (OMIM: 608947) BTB/POZ domain-containing ( 329) 187 40.9 0.01
>>NP_001306223 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-containing (813 aa)
initn: 2817 init1: 2101 opt: 2798 Z-score: 2382.6 bits: 451.6 E(85289): 5.7e-126
Smith-Waterman score: 2813; 66.1% identity (83.4% similar) in 655 aa overlap (18-657:17-659)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAAATAAEGVPSRGPPGEVIHLNVGGKRFSTSRQTLTWIPDSFFSSLLSGRISTLKDET
::...::::: ::::::::: ::::::::::::::::::.:::
NP_001 MAGGHCGSFPAAAAGSGEIVQLNVGGTRFSTSRQTLMWIPDSFFSSLLSGRISTLRDET
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GAIFIDRDPTVFAPILNFLRTKELDPRGVHGSSLLHEAQFYGLTPLVRRLQLREELDRSS
:::::::::..:::::::::::::: ::: . : :::.:::.::::::: : :::.:::
NP_001 GAIFIDRDPAAFAPILNFLRTKELDLRGVSINVLRHEAEFYGITPLVRRLLLCEELERSS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 CGNVLFNGYLPPPVFPVKRRNR--HSLVGPQQLGGRPAPVRRSNTMPPNLGNAGLLGRML
::.:::.:::::: .: .. : .: . . :.. . .: ..:.: :.. :.
NP_001 CGSVLFHGYLPPPGIPSRKINNTVRSADSRNGLNSTEGEARGNGTQPVLSGTGEETVRL-
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DEKTPPSPSGQPEEPGMVRLVCGHHNWIAVAYTQFLVCYRLKEASGWQLVFSSPRLDWPI
: : .: : .: ::::::..::..: ::::.::.:::: ::.:: ::: :
NP_001 ---------GFPVDPRKVLIVAGHHNWIVAAYAHFAVCYRIKESSGWQQVFTSPYLDWTI
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ERLALTARVHGGALGEHDKMVAAATGSEILLWALQAEGGGSEIGVFHLGVPVEALFFVGN
::.::.:.: :: :..:::::.:. : :.::..: :.::::::: :::::.::::.::
NP_001 ERVALNAKVVGGPHGDKDKMVAVASESSIILWSVQDGGSGSEIGVFSLGVPVDALFFIGN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QLIATSHTGRIGVWNAVTKHWQVQEVQPITSYDAAGSFLLLGCNNGSIYYVDVQKFPLRM
::.::::::..:::::::.:::::.: ::::::.::::::::::::::::.:.:::::::
NP_001 QLVATSHTGKVGVWNAVTQHWQVQDVVPITSYDTAGSFLLLGCNNGSIYYIDMQKFPLRM
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 KDNDLLVSELYRDPAEDGVTALSVYLTPKTSDSGNWIEIAYGTSSGGVRVIVQHPETVGS
:::::::.:::.::..:..:::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::::::
NP_001 KDNDLLVTELYHDPSNDAITALSVYLTPKTSVSGNWIEIAYGTSSGAVRVIVQHPETVGS
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GPQLFQTFTVHRSPVTKIMLSEKHLISVCADNNHVRTWSVTRFRGMISTQPGSTPLASFK
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_001 GPQLFQTFTVHRSPVTKIMLSEKHLVSVCADNNHVRTWTVTRFRGMISTQPGSTPLASFK
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 ILALESADGHGGCSAGNDIGPYGERDDQQVFIQKVVPSASQLFVRLSSTGQRVCSVRSVD
::.:: ...::. :.::::::.::::::::::::::: ...:::::::::.:.: ...::
NP_001 ILSLEETESHGSYSSGNDIGPFGERDDQQVFIQKVVPITNKLFVRLSSTGKRICEIQAVD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 GSPTTAFTVLECEGSRRLGSRPRRYLLTGQANGSLAMWDLTTAMDGLGQAP-AGGLTEQE
. ..::: ::::: :.::::::::.::..:::. ::::::::: .... :: ::.:
NP_001 CTTISSFTVRECEGSSRMGSRPRRYLFTGHTNGSIQMWDLTTAMDMVNKSEDKGGPTEEE
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KE4 LMEQLEHCELAPP---APS-APSWGCLPSPSPRISLTSL--------HSASSNTSLSGHR
:.. :..:.:. .:. .:. . . : : .:: : :.. :. .:
NP_001 LLKLLDQCDLSTSRCATPNISPATSVVQHSHLRESNSSLQLQHHDTTHEAATYGSMRPYR
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 GSPSPPQAEARRRGGGSFVERCQELVRSGPDLRRPPTPAPWPSSGLGTPLTPPKMKLNET
:: :.:::
NP_001 --ESPLLARARRTESFHSYRDFQTINLNRNVERAVPENGNLGPIQAEVKGATGECNISER
650 660 670 680 690 700
>>NP_057205 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-containing pro (815 aa)
initn: 2817 init1: 2101 opt: 2795 Z-score: 2380.0 bits: 451.1 E(85289): 7.9e-126
Smith-Waterman score: 2810; 65.9% identity (83.3% similar) in 657 aa overlap (18-657:17-661)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAAATAAEGVPSRGPPGEVIHLNVGGKRFSTSRQTLTWIPDSFFSSLLSGRISTLKDET
::...::::: ::::::::: ::::::::::::::::::.:::
NP_057 MAGGHCGSFPAAAAGSGEIVQLNVGGTRFSTSRQTLMWIPDSFFSSLLSGRISTLRDET
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GAIFIDRDPTVFAPILNFLRTKELDPRGVHGSSLLHEAQFYGLTPLVRRLQLREELDRSS
:::::::::..:::::::::::::: ::: . : :::.:::.::::::: : :::.:::
NP_057 GAIFIDRDPAAFAPILNFLRTKELDLRGVSINVLRHEAEFYGITPLVRRLLLCEELERSS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 CGNVLFNGYLPPPVFPVKRRNR--HSLVGPQQLGGRPAPVRRSNTMPPNLGNAGLLGRML
::.:::.:::::: .: .. : .: . . :.. . .: ..:.: :.. :.
NP_057 CGSVLFHGYLPPPGIPSRKINNTVRSADSRNGLNSTEGEARGNGTQPVLSGTGEETVRL-
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DEKTPPSPSGQPEEPGMVRLVCGHHNWIAVAYTQFLVCYRLKEASGWQLVFSSPRLDWPI
: : .: : .: ::::::..::..: ::::.::.:::: ::.:: ::: :
NP_057 ---------GFPVDPRKVLIVAGHHNWIVAAYAHFAVCYRIKESSGWQQVFTSPYLDWTI
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ERLALTARVHGGALGEHDKMVAAATGSEILLWALQAEGGGSEIGVFHLGVPVEALFFVGN
::.::.:.: :: :..:::::.:. : :.::..: :.::::::: :::::.::::.::
NP_057 ERVALNAKVVGGPHGDKDKMVAVASESSIILWSVQDGGSGSEIGVFSLGVPVDALFFIGN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QLIATSHTGRIGVWNAVTKHWQVQEVQPITSYDAAGSFLLLGCNNGSIYYVDVQKFPLRM
::.::::::..:::::::.:::::.: ::::::.::::::::::::::::.:.:::::::
NP_057 QLVATSHTGKVGVWNAVTQHWQVQDVVPITSYDTAGSFLLLGCNNGSIYYIDMQKFPLRM
290 300 310 320 330 340
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pF1KE4 KDNDLLVSELYRDPAEDGVTALSVYLTPKTSDSGNWIEIAYGTSSGGVRVIVQHPETVGS
:::::::.:::.::..:..:::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::::::
NP_057 KDNDLLVTELYHDPSNDAITALSVYLTPKTSVSGNWIEIAYGTSSGAVRVIVQHPETVGS
350 360 370 380 390 400
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pF1KE4 GPQLFQTFTVHRSPVTKIMLSEKHLISVCADNNHVRTWSVTRFRGMISTQPGSTPLASFK
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_057 GPQLFQTFTVHRSPVTKIMLSEKHLVSVCADNNHVRTWTVTRFRGMISTQPGSTPLASFK
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 ILALESADGHGGCSAGNDIGPYGERDDQQVFIQKVVPSASQLFVRLSSTGQRVCSVRSVD
::.:: ...::. :.::::::.::::::::::::::: ...:::::::::.:.: ...::
NP_057 ILSLEETESHGSYSSGNDIGPFGERDDQQVFIQKVVPITNKLFVRLSSTGKRICEIQAVD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 GSPTTAFTVLECEGSRRLGSRPRRYLLTGQANGSLAMWDLTTAMDGLGQAP---AGGLTE
. ..::: ::::: :.::::::::.::..:::. ::::::::: .... .:: ::
NP_057 CTTISSFTVRECEGSSRMGSRPRRYLFTGHTNGSIQMWDLTTAMDMVNKSEDKDVGGPTE
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KE4 QELMEQLEHCELAPP---APS-APSWGCLPSPSPRISLTSL--------HSASSNTSLSG
.::.. :..:.:. .:. .:. . . : : .:: : :.. :.
NP_057 EELLKLLDQCDLSTSRCATPNISPATSVVQHSHLRESNSSLQLQHHDTTHEAATYGSMRP
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 HRGSPSPPQAEARRRGGGSFVERCQELVRSGPDLRRPPTPAPWPSSGLGTPLTPPKMKLN
.: :: :.:::
NP_057 YR--ESPLLARARRTESFHSYRDFQTINLNRNVERAVPENGNLGPIQAEVKGATGECNIS
650 660 670 680 690 700
>>NP_001306224 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-containing (711 aa)
initn: 2338 init1: 2101 opt: 2319 Z-score: 1976.5 bits: 376.2 E(85289): 2.4e-103
Smith-Waterman score: 2334; 63.9% identity (81.5% similar) in 568 aa overlap (106-657:3-557)
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 LNFLRTKELDPRGVHGSSLLHEAQFYGLTPLVRRLQLREELDRSSCGNVLFNGYLPPPVF
::::: : :::.:::::.:::.:::::: .
NP_001 MFLVRRLLLCEELERSSCGSVLFHGYLPPPGI
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 PVKRRNR--HSLVGPQQLGGRPAPVRRSNTMPPNLGNAGLLGRMLDEKTPPSPSGQPEEP
: .. : .: . . :.. . .: ..:.: :.. :. : : .:
NP_001 PSRKINNTVRSADSRNGLNSTEGEARGNGTQPVLSGTGEETVRL----------GFPVDP
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 GMVRLVCGHHNWIAVAYTQFLVCYRLKEASGWQLVFSSPRLDWPIERLALTARVHGGALG
: .: ::::::..::..: ::::.::.:::: ::.:: ::: :::.::.:.: :: :
NP_001 RKVLIVAGHHNWIVAAYAHFAVCYRIKESSGWQQVFTSPYLDWTIERVALNAKVVGGPHG
90 100 110 120 130 140
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 EHDKMVAAATGSEILLWALQAEGGGSEIGVFHLGVPVEALFFVGNQLIATSHTGRIGVWN
..:::::.:. : :.::..: :.::::::: :::::.::::.::::.::::::..::::
NP_001 DKDKMVAVASESSIILWSVQDGGSGSEIGVFSLGVPVDALFFIGNQLVATSHTGKVGVWN
150 160 170 180 190 200
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 AVTKHWQVQEVQPITSYDAAGSFLLLGCNNGSIYYVDVQKFPLRMKDNDLLVSELYRDPA
:::.:::::.: ::::::.::::::::::::::::.:.::::::::::::::.:::.::.
NP_001 AVTQHWQVQDVVPITSYDTAGSFLLLGCNNGSIYYIDMQKFPLRMKDNDLLVTELYHDPS
210 220 230 240 250 260
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 EDGVTALSVYLTPKTSDSGNWIEIAYGTSSGGVRVIVQHPETVGSGPQLFQTFTVHRSPV
.:..:::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDAITALSVYLTPKTSVSGNWIEIAYGTSSGAVRVIVQHPETVGSGPQLFQTFTVHRSPV
270 280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 TKIMLSEKHLISVCADNNHVRTWSVTRFRGMISTQPGSTPLASFKILALESADGHGGCSA
::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ...::. :.
NP_001 TKIMLSEKHLVSVCADNNHVRTWTVTRFRGMISTQPGSTPLASFKILSLEETESHGSYSS
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 GNDIGPYGERDDQQVFIQKVVPSASQLFVRLSSTGQRVCSVRSVDGSPTTAFTVLECEGS
::::::.::::::::::::::: ...:::::::::.:.: ...:: . ..::: :::::
NP_001 GNDIGPFGERDDQQVFIQKVVPITNKLFVRLSSTGKRICEIQAVDCTTISSFTVRECEGS
390 400 410 420 430 440
560 570 580 590 600
pF1KE4 RRLGSRPRRYLLTGQANGSLAMWDLTTAMDGLGQAP-AGGLTEQELMEQLEHCEL-----
:.::::::::.::..:::. ::::::::: .... :: ::.::.. :..:.:
NP_001 SRMGSRPRRYLFTGHTNGSIQMWDLTTAMDMVNKSEDKGGPTEEELLKLLDQCDLSTSRC
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650
pF1KE4 APPAPSAPSWGCLPSPSPRISLTSL--------HSASSNTSLSGHRGSPSPPQAEARRRG
: : : :. . . : : .:: : :.. :. .: :: :.:::
NP_001 ATPNIS-PATSVVQHSHLRESNSSLQLQHHDTTHEAATYGSMRPYR--ESPLLARARRTE
510 520 530 540 550
660 670 680 690 700
pF1KE4 GGSFVERCQELVRSGPDLRRPPTPAPWPSSGLGTPLTPPKMKLNETSF
NP_001 SFHSYRDFQTINLNRNVERAVPENGNLGPIQAEVKGATGECNISERKSPGVEIKSLRELD
560 570 580 590 600 610
>>XP_005273215 (OMIM: 613272) PREDICTED: BTB/POZ domain- (713 aa)
initn: 2338 init1: 2101 opt: 2316 Z-score: 1973.9 bits: 375.8 E(85289): 3.3e-103
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80 90 100 110 120 130
pF1KE4 LNFLRTKELDPRGVHGSSLLHEAQFYGLTPLVRRLQLREELDRSSCGNVLFNGYLPPPVF
::::: : :::.:::::.:::.:::::: .
XP_005 MFLVRRLLLCEELERSSCGSVLFHGYLPPPGI
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 PVKRRNR--HSLVGPQQLGGRPAPVRRSNTMPPNLGNAGLLGRMLDEKTPPSPSGQPEEP
: .. : .: . . :.. . .: ..:.: :.. :. : : .:
XP_005 PSRKINNTVRSADSRNGLNSTEGEARGNGTQPVLSGTGEETVRL----------GFPVDP
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pF1KE4 GMVRLVCGHHNWIAVAYTQFLVCYRLKEASGWQLVFSSPRLDWPIERLALTARVHGGALG
: .: ::::::..::..: ::::.::.:::: ::.:: ::: :::.::.:.: :: :
XP_005 RKVLIVAGHHNWIVAAYAHFAVCYRIKESSGWQQVFTSPYLDWTIERVALNAKVVGGPHG
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pF1KE4 EHDKMVAAATGSEILLWALQAEGGGSEIGVFHLGVPVEALFFVGNQLIATSHTGRIGVWN
..:::::.:. : :.::..: :.::::::: :::::.::::.::::.::::::..::::
XP_005 DKDKMVAVASESSIILWSVQDGGSGSEIGVFSLGVPVDALFFIGNQLVATSHTGKVGVWN
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pF1KE4 AVTKHWQVQEVQPITSYDAAGSFLLLGCNNGSIYYVDVQKFPLRMKDNDLLVSELYRDPA
:::.:::::.: ::::::.::::::::::::::::.:.::::::::::::::.:::.::.
XP_005 AVTQHWQVQDVVPITSYDTAGSFLLLGCNNGSIYYIDMQKFPLRMKDNDLLVTELYHDPS
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pF1KE4 EDGVTALSVYLTPKTSDSGNWIEIAYGTSSGGVRVIVQHPETVGSGPQLFQTFTVHRSPV
.:..:::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NDAITALSVYLTPKTSVSGNWIEIAYGTSSGAVRVIVQHPETVGSGPQLFQTFTVHRSPV
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pF1KE4 TKIMLSEKHLISVCADNNHVRTWSVTRFRGMISTQPGSTPLASFKILALESADGHGGCSA
::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ...::. :.
XP_005 TKIMLSEKHLVSVCADNNHVRTWTVTRFRGMISTQPGSTPLASFKILSLEETESHGSYSS
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 GNDIGPYGERDDQQVFIQKVVPSASQLFVRLSSTGQRVCSVRSVDGSPTTAFTVLECEGS
::::::.::::::::::::::: ...:::::::::.:.: ...:: . ..::: :::::
XP_005 GNDIGPFGERDDQQVFIQKVVPITNKLFVRLSSTGKRICEIQAVDCTTISSFTVRECEGS
390 400 410 420 430 440
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pF1KE4 RRLGSRPRRYLLTGQANGSLAMWDLTTAMDGLGQAP---AGGLTEQELMEQLEHCEL---
:.::::::::.::..:::. ::::::::: .... .:: ::.::.. :..:.:
XP_005 SRMGSRPRRYLFTGHTNGSIQMWDLTTAMDMVNKSEDKDVGGPTEEELLKLLDQCDLSTS
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650
pF1KE4 --APPAPSAPSWGCLPSPSPRISLTSL--------HSASSNTSLSGHRGSPSPPQAEARR
: : : :. . . : : .:: : :.. :. .: :: :.:::
XP_005 RCATPNIS-PATSVVQHSHLRESNSSLQLQHHDTTHEAATYGSMRPYR--ESPLLARARR
510 520 530 540 550
660 670 680 690 700
pF1KE4 RGGGSFVERCQELVRSGPDLRRPPTPAPWPSSGLGTPLTPPKMKLNETSF
XP_005 TESFHSYRDFQTINLNRNVERAVPENGNLGPIQAEVKGATGECNISERKSPGVEIKSLRE
560 570 580 590 600 610
>>NP_001269615 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain-cont (220 aa)
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Smith-Waterman score: 280; 45.0% identity (68.3% similar) in 120 aa overlap (3-119:15-134)
10 20 30 40
pF1KE4 MAAAATAAEGVPSRGPPGEVIHLNVGGKRFSTSRQTLTWIPDSFFSSL
:: :. : . : :. ..::::: : :.:::: ::.: :
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10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LSGR-ISTLKDETGAIFIDRDPTVFAPILNFLRTKELD-PRGVHGSSLLHEAQFYGLTPL
.:. ... .::::: .:::::: :.::::::: .: . . ..:.::.::.. ::
NP_001 CQGEELQSDRDETGAYLIDRDPTYFGPILNFLRHGKLVLDKDMAEEGVLEEAEFYNIGPL
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110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VRRLQLR-EELDRSSCGNVLFNGYLPPPVFPVKRRNRHSLVGPQQLGGRPAPVRRSNTMP
.: .. : :: : .
NP_001 IRIIKDRMEEKDYTVTQVPPKHVYRVLQCQEEELTQMVSTMSDGWRFEQLVNIGSSYNYG
130 140 150 160 170 180
>>NP_001269614 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain-cont (225 aa)
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10 20 30 40
pF1KE4 MAAAATAAEGVPSRGPPGEVIHLNVGGKRFSTSRQTLTWIPDSFFSSL
:: :. : . : :. ..::::: : :.:::: ::.: :
NP_001 MQTPRPAMRMEAGEAAPPAGAGGRAAGGWGKWVRLNVGGTVFLTTRQTLCREQKSFLSRL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LSGR-ISTLKDETGAIFIDRDPTVFAPILNFLRTKELD-PRGVHGSSLLHEAQFYGLTPL
.:. ... .::::: .:::::: :.::::::: .: . . ..:.::.::.. ::
NP_001 CQGEELQSDRDETGAYLIDRDPTYFGPILNFLRHGKLVLDKDMAEEGVLEEAEFYNIGPL
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pF1KE4 VRRLQLR-EELDRSSCGNVLFNGYLPPPVFPVKRRNRHSLVGPQQLGGRPAPVRRSNTMP
.: .. : :: : .
NP_001 IRIIKDRMEEKDYTVTQVPPKHVYRVLQCQEEELTQMVSTMSDGWRFEQLVNIGSSYNYG
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10 20 30 40
pF1KE4 MAAAATAAEGVPSRGPPGEVIHLNVGGKRFSTSRQTLTWIPDSFFSSL
:: :. : . : :. ..::::: : :.:::: ::.: :
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 LSGR-ISTLKDETGAIFIDRDPTVFAPILNFLRTKELD-PRGVHGSSLLHEAQFYGLTPL
.:. ... .::::: .:::::: :.::::::: .: . . ..:.::.::.. ::
XP_011 CQGEELQSDRDETGAYLIDRDPTYFGPILNFLRHGKLVLDKDMAEEGVLEEAEFYNIGPL
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pF1KE4 VRRLQLR-EELDRSSCGNVLFNGYLPPPVFPVKRRNRHSLVGPQQLGGRPAPVRRSNTMP
.: .. : :: : .
XP_011 IRIIKDRMEEKDYTVTQVPPKHVYRVLQCQEEELTQMVSTMSDGWRFEQLVNIGSSYNYG
130 140 150 160 170 180
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10 20 30 40
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:: :. : . : :. ..::::: : :.:::: ::.: :
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.:. ... .::::: .:::::: :.::::::: .: . . ..:.::.::.. ::
NP_078 CQGEELQSDRDETGAYLIDRDPTYFGPILNFLRHGKLVLDKDMAEEGVLEEAEFYNIGPL
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.: .. : :: : .
NP_078 IRIIKDRMEEKDYTVTQVPPKHVYRVLQCQEEELTQMVSTMSDGWRFEQLVNIGSSYNYG
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:: :. : . : :. ..::::: : :.:::: ::.: :
XP_005 MQTPRPAMRMEAGEAAPPAGAGGRAAGGWGKWVRLNVGGTVFLTTRQTLCREQKSFLSRL
10 20 30 40 50 60
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.:. ... .::::: .:::::: :.::::::: .: . . ..:.::.::.. ::
XP_005 CQGEELQSDRDETGAYLIDRDPTYFGPILNFLRHGKLVLDKDMAEEGVLEEAEFYNIGPL
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.: .. : :: : .
XP_005 IRIIKDRMEEKDYTVTQVPPKHVYRVLQCQEEELTQMVSTMSDGWRFEQLVNIGSSYNYG
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>>NP_001269613 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain-cont (321 aa)
initn: 302 init1: 131 opt: 280 Z-score: 249.1 bits: 55.5 E(85289): 3.9e-07
Smith-Waterman score: 280; 45.0% identity (68.3% similar) in 120 aa overlap (3-119:15-134)
10 20 30 40
pF1KE4 MAAAATAAEGVPSRGPPGEVIHLNVGGKRFSTSRQTLTWIPDSFFSSL
:: :. : . : :. ..::::: : :.:::: ::.: :
NP_001 MQTPRPAMRMEAGEAAPPAGAGGRAAGGWGKWVRLNVGGTVFLTTRQTLCREQKSFLSRL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LSGR-ISTLKDETGAIFIDRDPTVFAPILNFLRTKELD-PRGVHGSSLLHEAQFYGLTPL
.:. ... .::::: .:::::: :.::::::: .: . . ..:.::.::.. ::
NP_001 CQGEELQSDRDETGAYLIDRDPTYFGPILNFLRHGKLVLDKDMAEEGVLEEAEFYNIGPL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VRRLQLR-EELDRSSCGNVLFNGYLPPPVFPVKRRNRHSLVGPQQLGGRPAPVRRSNTMP
.: .. : :: : .
NP_001 IRIIKDRMEEKDYTVTQVPPKHVYRVLQCQEEELTQMVSTMSDGWRFEQLVNIGSSYNYG
130 140 150 160 170 180
707 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 01:30:57 2016 done: Sun Nov 6 01:30:59 2016
Total Scan time: 12.810 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]