FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4195, 704 aa
1>>>pF1KE4195 704 - 704 aa - 704 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0892+/-0.00102; mu= 7.0791+/- 0.062
mean_var=139.1436+/-28.250, 0's: 0 Z-trim(108.8): 44 B-trim: 102 in 1/50
Lambda= 0.108728
statistics sampled from 10394 (10426) to 10394 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16
Scan time: 3.790
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS63038.1 MARCH7 gene_id:64844|Hs108|chr2 ( 635) 3251 521.9 1.1e-147
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CCDS74122.1 MARCH10 gene_id:162333|Hs108|chr17 ( 799) 572 101.7 4.4e-21
>>CCDS2210.1 MARCH7 gene_id:64844|Hs108|chr2 (704 aa)
initn: 4579 init1: 4579 opt: 4579 Z-score: 3889.8 bits: 730.2 E(32554): 2.4e-210
Smith-Waterman score: 4579; 100.0% identity (100.0% similar) in 704 aa overlap (1-704:1-704)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MESKPSRIPRRISVQPSSSLSARMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MESKPSRIPRRISVQPSSSLSARMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PFQSAWYSESEITQGARSRSQNQQRDHDSKRPKLSCTNCTTSAGRNVGNGLNTLSDSSWR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HSQVPRSSSMVLGSFGTDLMRERRDLERRTDSSISNLMDYSHRSGDFTTSSYVQDRVPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 HSQVPRSSSMVLGSFGTDLMRERRDLERRTDSSISNLMDYSHRSGDFTTSSYVQDRVPSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SQGARPKENSMSTLQLNTSSTNHQLPSEHQTILSSRDSRNSLRSNFSSRESESSRSNTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SQGARPKENSMSTLQLNTSSTNHQLPSEHQTILSSRDSRNSLRSNFSSRESESSRSNTQP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GFSYSSSRDEAPIISNSERVVSSQRPFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GFSYSSSRDEAPIISNSERVVSSQRPFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QDSLNTRSLNSENSYVSPRILTASQSRSNVPSASEVPDNRASEASQGFRFLRRRWGLSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 QDSLNTRSLNSENSYVSPRILTASQSRSNVPSASEVPDNRASEASQGFRFLRRRWGLSSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SHNHSSESDSENFNQESEGRNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRIPTSDTSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SHNHSSESDSENFNQESEGRNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRIPTSDTSSR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SHIFRRESNEVVHLEAQNDPLGAAANRPQASAASSSATTGGSTSDSAQGGRNTGISGILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SHIFRRESNEVVHLEAQNDPLGAAANRPQASAASSSATTGGSTSDSAQGGRNTGISGILP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GSLFRFAVPPALGSNLTDNVMITVDIIPSGWNSADGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GSLFRFAVPPALGSNLTDNVMITVDIIPSGWNSADGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LEDSEEEEGDLCRICQMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQDCMKKWLQAKINSGSSLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LEDSEEEEGDLCRICQMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQDCMKKWLQAKINSGSSLEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 VTTCELCKEKLELNLEDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 VTTCELCKEKLELNLEDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE4 TNEPSTRVRFINLARTLQAHMEDLETSEDDSEEDGDHNRTFDIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 TNEPSTRVRFINLARTLQAHMEDLETSEDDSEEDGDHNRTFDIA
670 680 690 700
>>CCDS63039.1 MARCH7 gene_id:64844|Hs108|chr2 (666 aa)
initn: 4251 init1: 4251 opt: 4252 Z-score: 3612.9 bits: 678.9 E(32554): 6.4e-195
Smith-Waterman score: 4252; 99.4% identity (99.4% similar) in 659 aa overlap (46-704:8-666)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 PSSSLSARMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASASPFQSAWYSESEITQG
: : ::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MIGNYDHLMSLVTSTSASASASPFQSAWYSESEITQG
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 ARSRSQNQQRDHDSKRPKLSCTNCTTSAGRNVGNGLNTLSDSSWRHSQVPRSSSMVLGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ARSRSQNQQRDHDSKRPKLSCTNCTTSAGRNVGNGLNTLSDSSWRHSQVPRSSSMVLGSF
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 GTDLMRERRDLERRTDSSISNLMDYSHRSGDFTTSSYVQDRVPSYSQGARPKENSMSTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GTDLMRERRDLERRTDSSISNLMDYSHRSGDFTTSSYVQDRVPSYSQGARPKENSMSTLQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 LNTSSTNHQLPSEHQTILSSRDSRNSLRSNFSSRESESSRSNTQPGFSYSSSRDEAPIIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LNTSSTNHQLPSEHQTILSSRDSRNSLRSNFSSRESESSRSNTQPGFSYSSSRDEAPIIS
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NSERVVSSQRPFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSSQDSLNTRSLNSENSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NSERVVSSQRPFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSSQDSLNTRSLNSENSY
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 VSPRILTASQSRSNVPSASEVPDNRASEASQGFRFLRRRWGLSSLSHNHSSESDSENFNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VSPRILTASQSRSNVPSASEVPDNRASEASQGFRFLRRRWGLSSLSHNHSSESDSENFNQ
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 ESEGRNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRIPTSDTSSRSHIFRRESNEVVHLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ESEGRNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRIPTSDTSSRSHIFRRESNEVVHLE
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 AQNDPLGAAANRPQASAASSSATTGGSTSDSAQGGRNTGISGILPGSLFRFAVPPALGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AQNDPLGAAANRPQASAASSSATTGGSTSDSAQGGRNTGISGILPGSLFRFAVPPALGSN
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 LTDNVMITVDIIPSGWNSADGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLLLEDSEEEEGDLCRIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LTDNVMITVDIIPSGWNSADGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLLLEDSEEEEGDLCRIC
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 QMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQDCMKKWLQAKINSGSSLEAVTTCELCKEKLELNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQDCMKKWLQAKINSGSSLEAVTTCELCKEKLELNL
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 EDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGNTNEPSTRVRFINLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 EDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGNTNEPSTRVRFINLAR
580 590 600 610 620 630
680 690 700
pF1KE4 TLQAHMEDLETSEDDSEEDGDHNRTFDIA
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TLQAHMEDLETSEDDSEEDGDHNRTFDIA
640 650 660
>>CCDS63038.1 MARCH7 gene_id:64844|Hs108|chr2 (635 aa)
initn: 3968 init1: 3227 opt: 3251 Z-score: 2764.7 bits: 521.9 E(32554): 1.1e-147
Smith-Waterman score: 3860; 91.5% identity (91.6% similar) in 670 aa overlap (1-670:1-614)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MESKPSRIPRRISVQPSSSLSARMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MESKPSRIPRRISVQPSSSLSARMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PFQSAWYSESEITQGARSRSQNQQRDHDSKRPKLSCTNCTTSAGRNVGNGLNTLSDSSWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PFQSAWYSESEITQGARSRSQNQQRDHDSKRPKLSCTNCTTSAGRNVGNGLNTLSD----
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HSQVPRSSSMVLGSFGTDLMRERRDLERRTDSSISNLMDYSHRSGDFTTSSYVQDRVPSY
::::::::
CCDS63 ----------------------------------------------------VQDRVPSY
120
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SQGARPKENSMSTLQLNTSSTNHQLPSEHQTILSSRDSRNSLRSNFSSRESESSRSNTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SQGARPKENSMSTLQLNTSSTNHQLPSEHQTILSSRDSRNSLRSNFSSRESESSRSNTQP
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GFSYSSSRDEAPIISNSERVVSSQRPFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GFSYSSSRDEAPIISNSERVVSSQRPFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSS
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QDSLNTRSLNSENSYVSPRILTASQSRSNVPSASEVPDNRASEASQGFRFLRRRWGLSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QDSLNTRSLNSENSYVSPRILTASQSRSNVPSASEVPDNRASEASQGFRFLRRRWGLSSL
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SHNHSSESDSENFNQESEGRNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRIPTSDTSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SHNHSSESDSENFNQESEGRNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRIPTSDTSSR
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SHIFRRESNEVVHLEAQNDPLGAAANRPQASAASSSATTGGSTSDSAQGGRNTGISGILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SHIFRRESNEVVHLEAQNDPLGAAANRPQASAASSSATTGGSTSDSAQGGRNTGISGILP
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GSLFRFAVPPALGSNLTDNVMITVDIIPSGWNSADGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GSLFRFAVPPALGSNLTDNVMITVDIIPSGWNSADGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLL
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LEDSEEEEGDLCRICQMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQDCMKKWLQAKINSGSSLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LEDSEEEEGDLCRICQMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQDCMKKWLQAKINSGSSLEA
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 VTTCELCKEKLELNLEDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VTTCELCKEKLELNLEDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGN
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700
pF1KE4 TNEPSTRVRFINLARTLQAHMEDLETSEDDSEEDGDHNRTFDIA
:::::::::.
CCDS63 TNEPSTRVRLQRMIPKKTETITGHLILPNFI
610 620 630
>>CCDS11635.1 MARCH10 gene_id:162333|Hs108|chr17 (808 aa)
initn: 701 init1: 506 opt: 583 Z-score: 501.2 bits: 103.4 E(32554): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 645; 29.9% identity (57.0% similar) in 705 aa overlap (44-698:146-798)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 VQPSSSLSARMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASASPFQSAWYSESEIT
: .. : .: ::.. : .. : .. .
CCDS11 KAEKVDPSEPSPADQAPMVLLRKRKPNLRRFTVSPESHSPRASGDRSRQKQQWPAKVPVP
120 130 140 150 160 170
80 90 100 110 120
pF1KE4 QGARSRSQNQ--------QRDHDSKRPKL-SCTNCTTSAGRNVGNGLNTLSDSSWRH---
.:: . :.. .: .. .: . : : .: . .: . ..: :
CCDS11 RGADQVVQQEGLMCNTKLKRPNQERRNLVPSSQPMTENAPDRAKKGDPSAPSQSELHPAL
180 190 200 210 220 230
130 140 150 160
pF1KE4 SQV--PRSSSMVLGSFG------TDLMRERRDLERRTDSSISNLMDY-SHRSGDFT---T
::. ..: .::. :. : . :. : : .. .... :.: .: : :
CCDS11 SQAFQGKNSPQVLSEFSGPPLTPTTVGGPRKASFRFRDEDFYSILSLNSRRESDDTEEET
240 250 260 270 280 290
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 SS----YVQDRVP-SYSQGARPKENSMSTLQLNTSSTNHQLPSEHQTILSSR---DSRNS
.: .: : : : :. : . .. :: : ... : . .:. ::: :..:
CCDS11 QSEECLWVGVRSPCSPSHHKRSRFGGTSTPQ--AKNKNFEENAENCRGHSSRRSEPSHGS
300 310 320 330 340 350
230 240 250 260 270
pF1KE4 LR-SNF----SSRESESSRSNTQPGFSYSSSRDEAPIISNSERVVSSQRPFQESSDNEGR
:: :: . : : ..: . .::. : : ..:: ... :.. .. .: :
CCDS11 LRISNAMEPATERPSAGQRLSQDPGLPDRESATEKDR-GGSEN--AKKSPLSWDTKSEPR
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 RTTRRLLSRIASSMSS------TFFSRRSSQDSLNTRSLNSENSYVSPRILTASQSRSNV
. . . :. : : :. .: ::. : :: . ..: : .. ::.:
CCDS11 QEVGVNAENVWSDCISVEHRPGTHDSEGYWKDYLNS-SQNSLDYFISGRPISP---RSSV
420 430 440 450 460
340 350 360 370 380
pF1KE4 PSASEVPDNRASEASQGFRF-LRRRWGLSSLSHNHSSESDSENFNQESEGRNTGPWLSSS
:. . : :: ...: . ..:: : :::.:.... : .. ::
CCDS11 NSSYNPP---ASFMHSALRDDIPVDLSMSSTS-VHSSDSEGNS------GFHVCQPLSP-
470 480 490 500 510
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LRNRCTPLFSRRRREGRDESSRIPTSDTSSRSHIFRRESNEVVHLEAQNDPLGAAAN-RP
.::: ::. : .. . .:.. :.. :. . .. . :. :: . :
CCDS11 IRNR-TPFASA------ENHNYFPVN--SAHEFAVREAEDTTLTSQPQGAPLYTDLLLNP
520 530 540 550 560
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 QASAASSSATTGGSTSDSAQGGRNTGISGIL----PGSLFRFAVPPALGSNLTDNVMITV
:.. . ...... . ...: . .:: : : ..: . : : .::
CCDS11 QGNLSLVDSSSSSPSRMNSEG--HLHVSGSLQENTPFTFFAVSHFP----NQNDN-----
570 580 590 600 610
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 DIIPSGWNSADGKSDKTKSAPSR-DPERLQKIKESLLLEDSEEEEGDLCRICQMAAASSS
.. .:.: .:. ... . :::.:.:..:::: :::::: ::::::::.:..: :
CCDS11 ----GSRMAASGFTDEKETSKIKADPEKLKKLQESLLEEDSEEE-GDLCRICQIAGGSPS
620 630 640 650 660 670
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 NLLIEPCKCTGSLQYVHQDCMKKWLQAKINSGSSLEAVTTCELCKEKLELNLEDFDIHEL
: :.::: :.::::.:::.:.::::..::.::..: :: :::.::. : ..: ::.. :.
CCDS11 NPLLEPCGCVGSLQFVHQECLKKWLKVKITSGADLGAVKTCEMCKQGLLVDLGDFNMIEF
680 690 700 710 720 730
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 HRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGNTNEPSTRVRFINLARTLQAHMED
.. : . ::. :...::::::.:::: :: :...: ... : : :. .. .
CCDS11 YQKHQQSQAQNELMNSGLYLVLLLHLYEQRFAELMRLNHNQVERER-------LSRNYPQ
740 750 760 770 780
690 700
pF1KE4 LETSEDDSEEDGDHNRTFDIA
.: :... : :: :
CCDS11 PRTEENENSELGDGNEGSISQSQVV
790 800
>>CCDS74123.1 MARCH10 gene_id:162333|Hs108|chr17 (846 aa)
initn: 701 init1: 506 opt: 583 Z-score: 500.9 bits: 103.4 E(32554): 1.4e-21
Smith-Waterman score: 645; 29.9% identity (57.0% similar) in 705 aa overlap (44-698:184-836)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 VQPSSSLSARMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASASPFQSAWYSESEIT
: .. : .: ::.. : .. : .. .
CCDS74 KGPMSRSIPPCEADQAPMVLLRKRKPNLRRFTVSPESHSPRASGDRSRQKQQWPAKVPVP
160 170 180 190 200 210
80 90 100 110 120
pF1KE4 QGARSRSQNQ--------QRDHDSKRPKL-SCTNCTTSAGRNVGNGLNTLSDSSWRH---
.:: . :.. .: .. .: . : : .: . .: . ..: :
CCDS74 RGADQVVQQEGLMCNTKLKRPNQERRNLVPSSQPMTENAPDRAKKGDPSAPSQSELHPAL
220 230 240 250 260 270
130 140 150 160
pF1KE4 SQV--PRSSSMVLGSFG------TDLMRERRDLERRTDSSISNLMDY-SHRSGDFT---T
::. ..: .::. :. : . :. : : .. .... :.: .: : :
CCDS74 SQAFQGKNSPQVLSEFSGPPLTPTTVGGPRKASFRFRDEDFYSILSLNSRRESDDTEEET
280 290 300 310 320 330
170 180 190 200 210 220
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.: .: : : : :. : . .. :: : ... : . .:. ::: :..:
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