Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4179
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4179, 644 aa
1>>>pF1KE4179 644 - 644 aa - 644 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8558+/-0.000378; mu= 12.4782+/- 0.023
mean_var=136.7976+/-28.264, 0's: 0 Z-trim(116.6): 324 B-trim: 1450 in 1/51
Lambda= 0.109657
statistics sampled from 27525 (27936) to 27525 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16
Scan time: 11.930
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 677 119.2 4.4e-26
NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 633 112.2 5.5e-24
XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 633 112.3 5.7e-24
NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 633 112.3 5.7e-24
NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 633 112.3 5.7e-24
NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 633 112.3 5.7e-24
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 633 112.3 5.8e-24
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 633 112.3 5.8e-24
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 633 112.3 5.8e-24
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 633 112.3 5.8e-24
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 633 112.3 5.8e-24
NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 508 92.5 5.1e-18
XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 508 92.5 5.1e-18
XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 508 92.5 5.1e-18
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 502 91.5 9.2e-18
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 502 91.5 9.2e-18
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 502 91.5 9.2e-18
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 502 91.5 9.2e-18
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 502 91.5 9.2e-18
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 488 89.3 4.3e-17
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 488 89.3 4.5e-17
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 476 87.4 1.5e-16
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 470 86.4 3e-16
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 470 86.4 3.1e-16
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 470 86.4 3.1e-16
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 464 85.5 5.8e-16
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 464 85.5 6.1e-16
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 464 85.5 6.2e-16
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 458 84.6 1.2e-15
XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 457 84.4 1.3e-15
NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 457 84.4 1.3e-15
NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584) 442 82.0 6.6e-15
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 420 78.4 6.3e-14
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 420 78.5 6.8e-14
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 421 78.7 6.9e-14
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 421 78.7 6.9e-14
NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 410 76.9 2e-13
NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 410 77.0 2.2e-13
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 407 76.5 3.1e-13
NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 406 76.3 3.5e-13
NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 406 76.3 3.5e-13
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 406 76.4 4e-13
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 406 76.4 4e-13
NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein ( 582) 404 76.0 4.3e-13
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 400 75.4 6.5e-13
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 400 75.4 7.6e-13
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 400 75.5 8e-13
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 400 75.5 8.3e-13
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 400 75.5 8.3e-13
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 400 75.5 8.3e-13
>>NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Homo sa (617 aa)
initn: 821 init1: 313 opt: 677 Z-score: 589.2 bits: 119.2 E(85289): 4.4e-26
Smith-Waterman score: 964; 30.7% identity (58.1% similar) in 652 aa overlap (3-640:26-615)
10 20 30
pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTL-ETE
.: : ..:....: :.. :: ::.:::::: .
NP_061 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTS--NTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGD
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 GSE-FPAHRSLLACSSDYFRALFKSHTQESRARVIHLHVPSAAGLQRLLDFIYTAWLSLS
:.: ::.::...: .::::.:.: . .:. :.:: . .::....:::::: :::.
NP_061 GDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 MDTVEDTLEAASYLQVTEALGLCGRYLERQLAPENCCFAANVAARFGLAHTLDAAERCIV
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NP_061 MDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFIL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 SHLQELLARGAGPAGLLELNPTSLRAVLGAPDVARVPEARLLGLALAWLRQEPTTERLAH
... ::. : .:.: : ::.. .. . : .:. : ::: : :. .
NP_061 KNFPALLSTGE----FLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDP--RMDY
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 CTELLERVRFGLV-PADVLRRVYSGSGLVLPARVKGLIIQALNYHTTPSRQPLMQGEQTS
..:.. .:: :. : :.. : . . . .:...: ::. : ::.::...:.
NP_061 AAKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 IRSPQTRILLVGGRRAREVVIEEVAAPQRAARGQVAAPEPEEEEEELEEEEEEEEWELTQ
::: .:... .:: ...:. . : .. .:. .:
NP_061 IRSDSTHLVTLGGVLRQQLVVSK--------------------ELRMYDERAQE------
300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 NVVAFDVYNHRWRSLTQLPTPLLGHSVCTAGNFLFVLGGESPSGSASSPLADDSRVVTAQ
::::. . .: :.. . ::::.:.::.: . .. .:
NP_061 -----------WRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDT-------
330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 VHRYDPRFHAWTEVPAMREARAHFWCGAVGERLLAVGGLGAGGEVLASVEMYDLRRDRWT
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NP_061 VFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGE-LATVECYNPRMNEWS
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 AAGALPRALHGHAGAVGDRGVVYISGGKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGT
.. . . .::::.: :..::::: . . .:. . :. . : .:::: :
NP_061 YVAKMSEPHYGHAGTVYG-GLMYISGGITHD-----TFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMTT
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560
pF1KE4 AR-------FGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSEIERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLA
.: : .. :. : : . :. : :.: :::: . . . :.:
NP_061 VRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGVA
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 VVEETALLLGGLKWRDSRQVPTRNVVGYDLDLDRWEDIGCALPWAWSGLRCAVLQL----
: :. ..:: .: . .: : :: . :.:. . :: . .:.: .: .
NP_061 VFENKIYVVGGYSWNNRCMVEI--VQKYDPEKDEWHKV-FDLPESLGGIRACTLTVFPPE
550 560 570 580 590
630 640
pF1KE4 AEGGDDEREGEVGEALDLVLG
. :. ::. .. :
NP_061 ENPGSPSRESPLSAPSDHS
600 610
>>NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (613 aa)
initn: 848 init1: 312 opt: 633 Z-score: 551.6 bits: 112.2 E(85289): 5.5e-24
Smith-Waterman score: 953; 30.7% identity (58.0% similar) in 622 aa overlap (11-621:32-592)
10 20 30
pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTLETEGSE-
:....: :.. :: ::.:::::: ..
NP_001 KLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 -FPAHRSLLACSSDYFRALFKSHTQESRARVIHLHVPSAAGLQRLLDFIYTAWLSLSMDT
::.:: ..: .::::.:.: . .:. :.:: : .::....:::::: :::.::.
NP_001 AFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDN
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100 110 120 130 140 150
pF1KE4 VEDTLEAASYLQVTEALGLCGRYLERQLAPENCCFAANVAARFGLAHTLDAAERCIVSHL
..:::::::.::. .: .: .: .. .:: .. .: ..:... .. .....
NP_001 LQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNF
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160 170 180 190 200 210
pF1KE4 QELLARGAGPAGLLELNPTSLRAVLGAPDVARVPEARLLGLALAWLR-QEPTTERLAHCT
::. : .:.: : ::.. .. . : .:. . ::: .:: :. .
NP_001 PALLSTGE----FLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEP---RMDFAA
190 200 210 220 230
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pF1KE4 ELLERVRFGLV-PADVLRRVYSGSGLVLPARVKGLIIQALNYHTTPSRQPLMQGEQTSIR
.:.. .:: :. : ... : . . . .:...: ::. : ::.::...:.::
NP_001 KLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIR
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280 290 300 310 320 330
pF1KE4 SPQTRILLVGGRRAREVVIEEVAAPQRAARGQVAAPEPEEEEEELEEEEEEEEWELTQNV
: :... .:: ...:. ....
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pF1KE4 VAFDVYNHRWRSLTQLPTPLLGHSVCTAGNFLFVLGGESPSGSASSPLADDSRVVTAQVH
.: :.:.::. . .: :.. . ::::.:.::.: . .. .: :
NP_001 RMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDT-------VF
320 330 340 350 360 370
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pF1KE4 RYDPRFHAWTEVPAMREARAHFWCGAVGERLLAVGGLGAGGEVLASVEMYDLRRDRWTAA
:.:::.. : .: .. : :. : .:. : :::: .:.:: : .:: :. : ..:: .
NP_001 RFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGE-LPTVECYNPRTNEWTYV
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pF1KE4 GALPRALHGHAGAVGDRGVVYISGGKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGTAR
. . . .::::.: ::.::::: . . ..:. . :. . : .:::: :.:
NP_001 AKMSEPHYGHAGTVYG-GVMYISGGITHD-----TFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVR
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pF1KE4 -------FGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSEIERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLAVV
:... :. : : . :. : :.: :::: . . . :.::
NP_001 GLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVF
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 EETALLLGGLKWRDSRQVPTRNVVGYDLDLDRWEDIGCALPWAWSGLRCAVLQLAEGGDD
:. ..:: .: . .: : :: : :.:. . :: . .:.: .:
NP_001 ENKIYVVGGYSWNNRCMVEI--VQKYDPDKDEWHKV-FDLPESLGGIRACTLTVFPPEET
550 560 570 580 590 600
630 640
pF1KE4 EREGEVGEALDLVLG
NP_001 TPSPSRESPLSAP
610
>>XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like prot (639 aa)
initn: 848 init1: 312 opt: 633 Z-score: 551.4 bits: 112.3 E(85289): 5.7e-24
Smith-Waterman score: 953; 30.7% identity (58.0% similar) in 622 aa overlap (11-621:58-618)
10 20 30
pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTLETEGSE-
:....: :.. :: ::.:::::: ..
XP_016 KLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDD
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 -FPAHRSLLACSSDYFRALFKSHTQESRARVIHLHVPSAAGLQRLLDFIYTAWLSLSMDT
::.:: ..: .::::.:.: . .:. :.:: : .::....:::::: :::.::.
XP_016 AFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDN
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 VEDTLEAASYLQVTEALGLCGRYLERQLAPENCCFAANVAARFGLAHTLDAAERCIVSHL
..:::::::.::. .: .: .: .. .:: .. .: ..:... .. .....
XP_016 LQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 QELLARGAGPAGLLELNPTSLRAVLGAPDVARVPEARLLGLALAWLR-QEPTTERLAHCT
::. : .:.: : ::.. .. . : .:. . ::: .:: :. .
XP_016 PALLSTGE----FLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEP---RMDFAA
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 ELLERVRFGLV-PADVLRRVYSGSGLVLPARVKGLIIQALNYHTTPSRQPLMQGEQTSIR
.:.. .:: :. : ... : . . . .:...: ::. : ::.::...:.::
XP_016 KLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIR
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 SPQTRILLVGGRRAREVVIEEVAAPQRAARGQVAAPEPEEEEEELEEEEEEEEWELTQNV
: :... .:: ...:. ....
XP_016 SDTTHLVTLGGVLRQQLVV-------------------------------------SKEL
330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 VAFDVYNHRWRSLTQLPTPLLGHSVCTAGNFLFVLGGESPSGSASSPLADDSRVVTAQVH
.: :.:.::. . .: :.. . ::::.:.::.: . .. .: :
XP_016 RMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDT-------VF
350 360 370 380 390
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pF1KE4 RYDPRFHAWTEVPAMREARAHFWCGAVGERLLAVGGLGAGGEVLASVEMYDLRRDRWTAA
:.:::.. : .: .. : :. : .:. : :::: .:.:: : .:: :. : ..:: .
XP_016 RFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGE-LPTVECYNPRTNEWTYV
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 GALPRALHGHAGAVGDRGVVYISGGKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGTAR
. . . .::::.: ::.::::: . . ..:. . :. . : .:::: :.:
XP_016 AKMSEPHYGHAGTVYG-GVMYISGGITHD-----TFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVR
460 470 480 490 500
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pF1KE4 -------FGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSEIERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLAVV
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pF1KE4 EREGEVGEALDLVLG
XP_011 TPSPSRESPLSAP
650
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NP_277 KLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIR
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NP_277 SDTTHLVTLGGVLRQQLVV-------------------------------------SKEL
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.: :.:.::. . .: :.. . ::::.:.::.: . .. .: :
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:.:::.. : .: .. : :. : .:. : :::: .:.:: : .:: :. : ..:: .
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:... :. : : . :. : :.: :::: . . . :.::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]