Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4178
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4178, 642 aa
1>>>pF1KE4178 642 - 642 aa - 642 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8202+/-0.00105; mu= 2.3441+/- 0.064
mean_var=307.5554+/-62.069, 0's: 0 Z-trim(114.1): 136 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.073133
statistics sampled from 14550 (14687) to 14550 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.451), width: 16
Scan time: 3.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 4322 469.7 5.4e-132
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 1828 206.5 8.5e-53
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 1795 203.0 9.4e-52
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 1785 202.0 2e-51
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 1753 198.6 2e-50
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 1746 197.8 3.2e-50
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 1611 183.6 6.3e-46
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 1611 183.7 7.4e-46
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 1611 183.7 7.8e-46
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 1600 182.5 1.4e-45
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 1583 180.6 4.5e-45
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 1571 179.3 1.1e-44
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 1547 176.9 7.9e-44
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 1527 174.9 3.6e-43
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 1524 174.5 4.3e-43
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 1520 174.1 5.8e-43
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 1486 170.4 5.4e-42
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 1473 169.1 1.5e-41
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 1446 166.2 1.1e-40
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 1446 166.2 1.1e-40
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 1354 156.5 9.8e-38
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 1287 149.3 1e-35
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 1279 148.6 2.4e-35
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 1191 139.3 1.5e-32
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 1086 128.2 2.9e-29
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 1053 124.8 3.4e-28
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 1013 120.7 8.5e-27
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 994 118.5 2.4e-26
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 991 118.2 3.2e-26
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 900 108.6 2.5e-23
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 883 106.8 8.9e-23
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 883 106.9 9.1e-23
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 883 106.9 9.3e-23
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 883 106.9 9.3e-23
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 882 106.7 9.6e-23
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 881 106.6 1e-22
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 862 104.6 4e-22
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 437) 850 103.2 7.8e-22
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 851 103.5 9.3e-22
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 782 96.1 1.3e-19
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 768 94.7 3.8e-19
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 767 94.6 4.1e-19
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 721 89.8 1.3e-17
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 710 88.6 2.7e-17
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 700 87.5 5.5e-17
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 681 85.6 2.5e-16
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 678 85.2 2.9e-16
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 636 80.7 5.8e-15
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 630 80.1 9.5e-15
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 622 79.3 1.7e-14
>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 (642 aa)
initn: 4322 init1: 4322 opt: 4322 Z-score: 2483.1 bits: 469.7 E(32554): 5.4e-132
Smith-Waterman score: 4322; 100.0% identity (100.0% similar) in 642 aa overlap (1-642:1-642)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MQPRSERPAGRTQSPEHGSPGPGPEAPPPPPPQPPAPEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MQPRSERPAGRTQSPEHGSPGPGPEAPPPPPPQPPAPEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 CCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIHGDCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIHGDCE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGGNDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGGNDG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 TSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE4 TNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
610 620 630 640
>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
initn: 2900 init1: 1203 opt: 1828 Z-score: 1061.3 bits: 206.5 E(32554): 8.5e-53
Smith-Waterman score: 1828; 49.9% identity (77.3% similar) in 555 aa overlap (71-624:47-601)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 RTRPRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAA
: .: .... ... .:.. :::.:: :.:
CCDS13 TGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGA
20 30 40 50 60 70
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 KEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEG
:.: ::.:.:..:::::.::::.:..:::::.:...::: .:.. :..::::..:.: ::
CCDS13 KKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEG
80 90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 NVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQH
::::::::: :::: ...:::.:: :::::::::::.:::.::: .::. : ... ..
CCDS13 NVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHN
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 FVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKC
: .: ..::::::: .:.....::: ::: :::.:. ::..:::.... :: ..:....
CCDS13 FQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQH
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 VRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGA
::::::: ::.: : .. :.. .:.::. :: .. :::..: .. :::::.
CCDS13 VRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRC
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 GPVLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGT
: ::::::: .. : :: .:..:..::::: :: :::... . ::::::.::.
CCDS13 GEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGS
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450
pF1KE4 SDLATVESYDPVTNTWQPEVS-MGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPL
: : .:: ::: :: :. .:. .: :. .:::.: :.::..:: ::.:::: .:::::
CCDS13 SYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPK
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 TGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLSR
. :: ::.::::: : ::.: : :::::: :..: : :::.:.:: : : .: : .:
CCDS13 ENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTR
440 450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 RSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWL
:. : :: . .:..:: : :. :.:.:::.:... : :. :. ::: :....: :
CCDS13 RKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQL
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 YAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSS
.:::: ::.. :..:: ..: .: : . : :: . ::.:...
CCDS13 MAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
560 570 580 590 600
640
pF1KE4 TSL
>>CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (593 aa)
initn: 2434 init1: 1364 opt: 1795 Z-score: 1042.6 bits: 203.0 E(32554): 9.4e-52
Smith-Waterman score: 1797; 47.7% identity (74.9% similar) in 597 aa overlap (31-623:4-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MQPRSERPAGRTQSPEHGSPGPGPEAPPPPPPQPPAPEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLL
:: ::: :. . .: .
CCDS34 METPPLPPAC----TKQGHQKPLDSKDD-----
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAM
. : : . . :.. :: .:...:...::::... . :: ::.::::.::::::::
CCDS34 NTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAM
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDA
::.:::::: .: ....: .: .:....::::: : : :::.:::::.::::. :. .
CCDS34 FTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKT
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 CCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLE
::.:: ::: : ::::::.::: :.:.:::. :. :. :::.::. .:::. : ..::
CCDS34 CCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCS
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESL
:.:::.:.. :::.:..::..::.:: :.:.. . :::. :::::: :..:. .:. :.:
CCDS34 LISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEAL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE4 VRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIHGDC
:.. ::: ::::.:.:::: ::: .. . ::: : . .. .::: . ::..
CCDS34 VKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRS-V
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 EAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPE
: :: . .::: :: . .:: :.:.. ... ..::::..:. . ::.::::: . :
CCDS34 ECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSV
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 VSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVA
..: ::: ::.:.:.::::..::.::.. :.:.: :. .. : :: :.::: : :.
CCDS34 ANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVG
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 TLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGG
.. : ::::::::..:. :.::: :. .: :. .: : .:::.:::.::.. ::..::
CCDS34 VVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGG
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 NDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKY
.:: .::: :.: ..::..:: ::. : . . :..: ::.:::.::: .: :.: :
CCDS34 HDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYY
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640
pF1KE4 NPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
:: :.:: :..::: : :: .::.:..
CCDS34 NPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
570 580 590
>>CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (597 aa)
initn: 2434 init1: 1364 opt: 1785 Z-score: 1036.9 bits: 202.0 E(32554): 2e-51
Smith-Waterman score: 1785; 49.2% identity (77.0% similar) in 565 aa overlap (63-623:31-594)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 QPPAPEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLC
: : . . :.. :: .:...:...:::
CCDS54 MVWLEARPQILFVCTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLC
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 DIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYT
:... . :: ::.::::.::::::::::.:::::: .: ....: .: .:....::
CCDS54 DVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYT
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 AEIVVGEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKA
::: : : :::.:::::.::::. :. .::.:: ::: : ::::::.::: :.:.:::.
CCDS54 AEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNK
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 AHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQ
:. :. :::.::. .:::. : ..:: :.:::.:.. :::.:..::..::.:: :.:..
CCDS54 ANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQE
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 HVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSR
. :::. :::::: :..:. .:. :.::.. ::: ::::.:.:::: ::: .. . :
CCDS54 FMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVR
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 TRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRL
:: : . .. .::: . ::.. : :: . .::: :: . .:: :.:.. ... .
CCDS54 TRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRS-VECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLV
310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 YAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLN
.::::..:. . ::.::::: . : ..: ::: ::.:.:.::::..::.::.. :.
CCDS54 FAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLS
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500
pF1KE4 SAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNV
:.: :. .. : :: :.::: : :... : ::::::::..:. :.::: :. .:
CCDS54 SVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNE
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 WSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRST
:. .: : .:::.:::.::.. ::..::.:: .::: :.: ..::..:: ::. : .
CCDS54 WTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRN
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 HDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFP
. :..: ::.:::.::: .: :.: ::: :.:: :..::: : :: .::.:..
CCDS54 AGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
540 550 560 570 580 590
630 640
pF1KE4 PPSSPTLSVSSTSL
>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (587 aa)
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Smith-Waterman score: 1753; 49.5% identity (76.7% similar) in 553 aa overlap (74-622:32-583)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 PRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEI
:. :: .:...:.. ::::... . ::
CCDS41 EGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEI
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 RAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQ
.::.::::.::::: ::::..::::. .. ..:.: :.:..:... ::::: : : :::
CCDS41 EAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQ
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
.:::::::::: ::. :: :: ::: :.::::::.:::.:.:.:::. :. :. ::: .
CCDS41 VLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPE
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
: :::. : : :: :.:::.:.: :::.:..::.::.... ..: .:. .::. :::
CCDS41 VMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRL
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 PLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGP
::: ::.:. :. :.:.... :::.::::.:.:::: .:: .. . ::.:: .
CCDS41 PLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPK
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 VLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSD
:...::: . ::.. : :: . ::: .: . .:: :.::. .....:::::..:.
CCDS41 VMIVVGGQAPKAIRS-VECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLR
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 LATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGT
. ::. :: : . : .:: ::: ::.:.:. :::..::.::.. : :.: :. :.
CCDS41 VRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNE
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 WTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRR
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CCDS41 WFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRR
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 SSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLY
:.:::.:: : ::..::.:: .::: :.: ...:..:: ::. : . . :..: ::
CCDS41 SGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLY
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630
pF1KE4 AVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSS
.:::.::: .: :.: ::: :.:: . . : : :: .::::.
CCDS41 VVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
550 560 570 580
640
pF1KE4 TSL
>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (555 aa)
initn: 1682 init1: 1323 opt: 1746 Z-score: 1015.1 bits: 197.8 E(32554): 3.2e-50
Smith-Waterman score: 1746; 49.7% identity (76.9% similar) in 549 aa overlap (78-622:4-551)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 RPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHK
:: .:...:.. ::::... . ::.::.
CCDS58 MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHR
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLP
::::.::::: ::::..::::. .. ..:.: :.:..:... ::::: : : :::.:::
CCDS58 VVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLP
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 AASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKT
::::::: ::. :: :: ::: :.::::::.:::.:.:.:::. :. :. ::: .:
CCDS58 AASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLG
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLS
:::. : : :: :.:::.:.: :::.:..::.::.... ..: .:. .::. ::::::
CCDS58 EEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLP
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 RDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFA
::.:. :. :.:.... :::.::::.:.:::: .:: .. . ::.:: . :...
CCDS58 RDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIV
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 VGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATV
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CCDS58 VGGQAPKAIRS-VECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTV
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 ESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSV
. :: : . : .:: ::: ::.:.:. :::..::.::.. : :.: :. :. : :
CCDS58 DVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWFFV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 AAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAG
: :.::: : :....:.::::::::..:. :.:::.:.: .: : ::.: .:::.::
CCDS58 APMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAG
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 VAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGG
:.:: : ::..::.:: .::: :.: ...:..:: ::. : . . :..: ::.:::
CCDS58 VGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGG
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 NDGSSSLNSIEKYNPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
.::: .: :.: ::: :.:: . . : : :: .::::.
CCDS58 DDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
520 530 540 550
>>CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (568 aa)
initn: 2161 init1: 717 opt: 1611 Z-score: 938.0 bits: 183.6 E(32554): 6.3e-46
Smith-Waterman score: 1611; 44.5% identity (75.4% similar) in 557 aa overlap (74-624:15-568)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 PRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEI
: ...: : . .. :::..: .. ..:
CCDS54 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRI
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 RAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQ
::..::.: : :: :::::.. :.:: .. .. ..:..: .:.:.:::... . : :..
CCDS54 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIE
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
:: .: ::::. : .::::::..:: ::::::::.::::..:.:: :.:: :...::..
CCDS54 CLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFME
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
: ...::.::: ... .:..::..:.:.:: . :.:.::.::.. ::. . .:. .::
CCDS54 VIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRL
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 PLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPV
:::. .:: . .. . : : .:. :..::.:.:::::.: .: . ::.::. .: .
CCDS54 PLLAPQFL-ADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKST-VG-T
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDL
:::::: . . : :: ::. : ::.:. :: . :::.. ..::.::: :: . :
CCDS54 LFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTL
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 ATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTW
::: :.: :.::. :.:.: ::::.:.: .:..::.:: : ::..::.:: . :
CCDS54 NTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQW
350 360 370 380 390 400
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pF1KE4 TSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSA
. ::.::: : : ::.:.:.:::::: :.:: : .:: ..:..: :. :.: .::...
CCDS54 NFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGV
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570
pF1KE4 GVAVLEGALYVAGGNDG-TSCLNS-----VERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDG
::.. .: ::. ::.:. .: :.: ::::.::. : .:: :.: :.. . .
CCDS54 GVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGD
470 480 490 500 510 520
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pF1KE4 WLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSV
:::::: ::.. ::..: :.:.::.:. .. . :... :....:
CCDS54 KLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
530 540 550 560
640
pF1KE4 SSTSL
>>CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (709 aa)
initn: 2001 init1: 717 opt: 1611 Z-score: 936.7 bits: 183.7 E(32554): 7.4e-46
Smith-Waterman score: 1611; 44.5% identity (75.4% similar) in 557 aa overlap (74-624:156-709)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 PRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEI
: ...: : . .. :::..: .. ..:
CCDS33 SCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRI
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 RAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQ
::..::.: : :: :::::.. :.:: .. .. ..:..: .:.:.:::... . : :..
CCDS33 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIE
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
:: .: ::::. : .::::::..:: ::::::::.::::..:.:: :.:: :...::..
CCDS33 CLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFME
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
: ...::.::: ... .:..::..:.:.:: . :.:.::.::.. ::. . .:. .::
CCDS33 VIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRL
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 PLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPV
:::. .:: . .. . : : .:. :..::.:.:::::.: .: . ::.::. .: .
CCDS33 PLLAPQFL-ADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKST-VG-T
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 LFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDL
:::::: . . : :: ::. : ::.:. :: . :::.. ..::.::: :: . :
CCDS33 LFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTL
430 440 450 460 470 480
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pF1KE4 ATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTW
::: :.: :.::. :.:.: ::::.:.: .:..::.:: : ::..::.:: . :
CCDS33 NTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQW
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pF1KE4 TSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSA
. ::.::: : : ::.:.:.:::::: :.:: : .:: ..:..: :. :.: .::...
CCDS33 NFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGV
550 560 570 580 590 600
530 540 550 560 570
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::.. .: ::. ::.:. .: :.: ::::.::. : .:: :.: :.. . .
CCDS33 GVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGD
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CCDS33 KLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
670 680 690 700
640
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50 60 70 80 90 100
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110 120 130 140 150 160
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CCDS33 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIE
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230 240 250 260 270 280
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350 360 370 380 390 400
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530 540 550 560 570
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:::::: ::.. ::..: :.:.::.:. .. . :... :....:
CCDS33 KLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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640
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CCDS33 MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYG----VME
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pF1KE4 RMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQAL
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CCDS33 EIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSAL
30 40 50 60 70 80
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CCDS33 EALINFAYNGNLAIDQQNVQSLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAET
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CCDS33 MMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWV
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CCDS33 RYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMPER
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CCDS33 SRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEAYNPETDTWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIY
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CCDS33 GCIPLLTI
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642 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 01:32:15 2016 done: Sun Nov 6 01:32:15 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]