Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4175
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4175, 635 aa
1>>>pF1KE4175 635 - 635 aa - 635 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3016+/-0.000831; mu= 15.8466+/- 0.050
mean_var=119.0312+/-23.648, 0's: 0 Z-trim(111.2): 92 B-trim: 66 in 1/49
Lambda= 0.117556
statistics sampled from 12107 (12220) to 12107 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.375), width: 16
Scan time: 4.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 4316 743.3 2.4e-214
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 4110 708.3 7.7e-204
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 2648 460.3 3.2e-129
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 2503 435.7 7.3e-122
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 2359 411.3 1.8e-114
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 2346 409.1 8.1e-114
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 2340 408.1 1.8e-113
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 2340 408.1 1.8e-113
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 2340 408.1 1.8e-113
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 2340 408.1 1.8e-113
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 1732 305.1 2.3e-82
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 650 121.4 2.9e-27
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 642 120.2 9e-27
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 640 119.7 9.5e-27
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 620 116.3 9.8e-26
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 611 114.8 2.6e-25
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 606 114.0 5.6e-25
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 583 110.0 6.9e-24
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 537 102.5 2.5e-21
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 530 101.3 6e-21
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 506 97.0 6.2e-20
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 502 96.4 1.1e-19
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 491 94.4 3.4e-19
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 492 94.7 3.9e-19
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 469 90.7 5e-18
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 422 82.8 1.3e-15
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 418 82.1 2e-15
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 417 81.9 2.4e-15
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 398 78.7 2.2e-14
CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 356) 324 66.0 9.9e-11
>>CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 (635 aa)
initn: 4316 init1: 4316 opt: 4316 Z-score: 3961.8 bits: 743.3 E(32554): 2.4e-214
Smith-Waterman score: 4316; 99.8% identity (99.8% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-635)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MISSVCVSSYRGRKSGNKPPSKTCLKEEMAKGEASEKIIINVGGTRHETYRSTLRTLPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MISSVCVSSYRGRKSGNKPPSKTCLKEEMAKGEASEKIIINVGGTRHETYRSTLRTLPGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RLAWLADPDGGGRPETDGGGVGSSGSSGGGGCEFFFDRHPGVFAYVLNYYRTGKLHCPAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RLAWLADPDGGGRPETDGGGVGSSGSSGGGGCEFFFDRHPGVFAYVLNYYRTGKLHCPAD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VCGPLFEEELTFWGIDETDVEPCCWMTYRQHRDAEEALDIFESPDGGGSGAGPSDEAGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VCGPLFEEELTFWGIDETDVEPCCWMTYRQHRDAEEALDIFESPDGGGSGAGPSDEAGDD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ERELALQRLGPHEGGAGHGAGSGGCRGWQPRMWALFEDPYSSRAARVVAFASLFFILVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ERELALQRLGPHEGGAGHGAGSGGCRGWQPRMWALFEDPYSSRAARVVAFASLFFILVSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TTFCLETHEAFNIDRNVTEILRVGNITSVHFRREVETEPILTYIEGVCVLWFTLEFLVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TTFCLETHEAFNIDRNVTEILRVGNITSVHFRREVETEPILTYIEGVCVLWFTLEFLVRI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VCCPDTLDFVKNLLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSSKAARDVLGFLRVVRFVRILRIFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VCCPDTLDFVKNLLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSSKAARDVLGFLRVVRFVRILRIFKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGARPSDPRGNDHTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGARPSDPRGNDHTDF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KNIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPKTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNNFGMYYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KNIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPKTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNNFGMYYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LAMAKQKLPKKRKKHVPRPAQLESPMYCKSEETSPRDSTYSDTSPPAREEGMIERKRADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS82 LAMAKQKLPKKRKKHVPRPAQLESPMYCKSEETSPRDSTCSDTSPPAREEGMIERKRADS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 KQNGDANAVLSDEEGAGLTQPLASSPTPEERRALRRSTTRDRNKKAAACFLLSTGDYACA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KQNGDANAVLSDEEGAGLTQPLASSPTPEERRALRRSTTRDRNKKAAACFLLSTGDYACA
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE4 DGSVRKGTFVLRDLPLQHSPEAACPPTAGTLFLPH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DGSVRKGTFVLRDLPLQHSPEAACPPTAGTLFLPH
610 620 630
>>CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 (626 aa)
initn: 4204 init1: 4110 opt: 4110 Z-score: 3773.1 bits: 708.3 E(32554): 7.7e-204
Smith-Waterman score: 4110; 99.7% identity (99.7% similar) in 608 aa overlap (1-608:1-608)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MISSVCVSSYRGRKSGNKPPSKTCLKEEMAKGEASEKIIINVGGTRHETYRSTLRTLPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MISSVCVSSYRGRKSGNKPPSKTCLKEEMAKGEASEKIIINVGGTRHETYRSTLRTLPGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RLAWLADPDGGGRPETDGGGVGSSGSSGGGGCEFFFDRHPGVFAYVLNYYRTGKLHCPAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLAWLADPDGGGRPETDGGGVGSSGSSGGGGCEFFFDRHPGVFAYVLNYYRTGKLHCPAD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VCGPLFEEELTFWGIDETDVEPCCWMTYRQHRDAEEALDIFESPDGGGSGAGPSDEAGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VCGPLFEEELTFWGIDETDVEPCCWMTYRQHRDAEEALDIFESPDGGGSGAGPSDEAGDD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ERELALQRLGPHEGGAGHGAGSGGCRGWQPRMWALFEDPYSSRAARVVAFASLFFILVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERELALQRLGPHEGGAGHGAGSGGCRGWQPRMWALFEDPYSSRAARVVAFASLFFILVSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TTFCLETHEAFNIDRNVTEILRVGNITSVHFRREVETEPILTYIEGVCVLWFTLEFLVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TTFCLETHEAFNIDRNVTEILRVGNITSVHFRREVETEPILTYIEGVCVLWFTLEFLVRI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VCCPDTLDFVKNLLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSSKAARDVLGFLRVVRFVRILRIFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VCCPDTLDFVKNLLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSSKAARDVLGFLRVVRFVRILRIFKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGARPSDPRGNDHTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGARPSDPRGNDHTDF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KNIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPKTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNNFGMYYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KNIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPKTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNNFGMYYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LAMAKQKLPKKRKKHVPRPAQLESPMYCKSEETSPRDSTYSDTSPPAREEGMIERKRADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS44 LAMAKQKLPKKRKKHVPRPAQLESPMYCKSEETSPRDSTCSDTSPPAREEGMIERKRADS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 KQNGDANAVLSDEEGAGLTQPLASSPTPEERRALRRSTTRDRNKKAAACFLLSTGDYACA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KQNGDANAVLSDEEGAGLTQPLASSPTPEERRALRRSTTRDRNKKAAACFLLSTGDYACA
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE4 DGSVRKGTFVLRDLPLQHSPEAACPPTAGTLFLPH
:::::: :
CCDS44 DGSVRKETCQDALSSNYAQAEVLTLS
610 620
>>CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 (585 aa)
initn: 2654 init1: 1787 opt: 2648 Z-score: 2433.4 bits: 460.3 E(32554): 3.2e-129
Smith-Waterman score: 2648; 71.3% identity (84.0% similar) in 586 aa overlap (29-606:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MISSVCVSSYRGRKSGNKPPSKTCLKEEMAKGEASEKIIINVGGTRHETYRSTLRTLPGT
:..:. ::.:.::::::::.::::::::::::
CCDS44 MGQGDESERIVINVGGTRHQTYRSTLRTLPGT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RLAWLADPDGGGRPETDGGGVGSSGSSGGGGCEFFFDRHPGVFAYVLNYYRTGKLHCPAD
::::::.::. .. . : . ::::::::::::..::::::::::::::
CCDS44 RLAWLAEPDAHSHFDYDPRAD-----------EFFFDRHPGVFAHILNYYRTGKLHCPAD
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KE4 VCGPLFEEELTFWGIDETDVEPCCWMTYRQHRDAEEALDIFE-SP-DGGGSGA---GPSD
:::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::: : .: :.... : ::.:
CCDS44 VCGPLYEEELAFWGIDETDVEPCCWMTYRQHRDAEEALDSFGGAPLDNSADDADADGPGD
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EAGDDERELAL-QRLGPHEGGAGHGAGSGGCRGWQPRMWALFEDPYSSRAARVVAFASLF
.:: : :: . .::. .. :. .: : ::::.::::::::::: :: :::::::
CCDS44 -SGDGEDELEMTKRLALSDSPDGRPGGFW--RRWQPRIWALFEDPYSSRYARYVAFASLF
150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FILVSITTFCLETHEAFNIDRNVTEILRVGNITSVHFRREVETEPILTYIEGVCVLWFTL
::::::::::::::: :: : ::: : : :.:.. ::.::: .:::::::::.:::.
CCDS44 FILVSITTFCLETHERFNPIVNKTEIENVRNGTQVRYYREAETEAFLTYIEGVCVVWFTF
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 EFLVRIVCCPDTLDFVKNLLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSSKAARDVLGFLRVVRFVRI
:::.:.. ::. ..:.:: ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS44 EFLMRVIFCPNKVEFIKNSLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSSKAAKDVLGFLRVVRFVRI
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGARPSDPRG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: .
CCDS44 LRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGAQPNDPSA
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 NDHTDFKNIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPKTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNN
..:: :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SEHTHFKNIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPQTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNN
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 FGMYYSLAMAKQKLPKKRKKHVPRPAQLESPMYCKSEETSPRDSTYSDTSPPAREEGMIE
:::::::::::::::::.:::.::: :: :: :::: .::. :: ::: : :.:: ..:
CCDS44 FGMYYSLAMAKQKLPKKKKKHIPRPPQLGSPNYCKSVVNSPHHSTQSDTCPLAQEE-ILE
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 RKRADSKQNGD-ANAVLSDEEGAGLTQPLASSPTPEERRALRRSTTRDRNKKAAACFLLS
.::::: ::. :.:.:..:. . : : ::.: . :: ::.: . :::::
CCDS44 INRADSKLNGEVAKAALANEDCPHIDQAL----TPDEGLPFTRSGTRERY---GPCFLLS
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630
pF1KE4 TGDYACADGS-VRKGTFVLRDLPLQHSPEAACPPTAGTLFLPH
::.::: :. .::
CCDS44 TGEYACPPGGGMRKDLCKESPVIAKYMPTEAVRVT
560 570 580
>>CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 (511 aa)
initn: 2490 init1: 1787 opt: 2503 Z-score: 2301.3 bits: 435.7 E(32554): 7.3e-122
Smith-Waterman score: 2503; 74.6% identity (86.1% similar) in 519 aa overlap (29-541:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MISSVCVSSYRGRKSGNKPPSKTCLKEEMAKGEASEKIIINVGGTRHETYRSTLRTLPGT
:..:. ::.:.::::::::.::::::::::::
CCDS78 MGQGDESERIVINVGGTRHQTYRSTLRTLPGT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RLAWLADPDGGGRPETDGGGVGSSGSSGGGGCEFFFDRHPGVFAYVLNYYRTGKLHCPAD
::::::.::. .. . : . ::::::::::::..::::::::::::::
CCDS78 RLAWLAEPDAHSHFDYDPRAD-----------EFFFDRHPGVFAHILNYYRTGKLHCPAD
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KE4 VCGPLFEEELTFWGIDETDVEPCCWMTYRQHRDAEEALDIFE-SP-DGGGSGA---GPSD
:::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::: : .: :.... : ::.:
CCDS78 VCGPLYEEELAFWGIDETDVEPCCWMTYRQHRDAEEALDSFGGAPLDNSADDADADGPGD
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EAGDDERELAL-QRLGPHEGGAGHGAGSGGCRGWQPRMWALFEDPYSSRAARVVAFASLF
.:: : :: . .::. .. :. .: : ::::.::::::::::: :: :::::::
CCDS78 -SGDGEDELEMTKRLALSDSPDGRPGGFW--RRWQPRIWALFEDPYSSRYARYVAFASLF
150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FILVSITTFCLETHEAFNIDRNVTEILRVGNITSVHFRREVETEPILTYIEGVCVLWFTL
::::::::::::::: :: : ::: : : :.:.. ::.::: .:::::::::.:::.
CCDS78 FILVSITTFCLETHERFNPIVNKTEIENVRNGTQVRYYREAETEAFLTYIEGVCVVWFTF
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 EFLVRIVCCPDTLDFVKNLLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSSKAARDVLGFLRVVRFVRI
:::.:.. ::. ..:.:: ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS78 EFLMRVIFCPNKVEFIKNSLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSSKAAKDVLGFLRVVRFVRI
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGARPSDPRG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: .
CCDS78 LRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGAQPNDPSA
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 NDHTDFKNIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPKTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNN
..:: :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SEHTHFKNIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPQTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNN
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 FGMYYSLAMAKQKLPKKRKKHVPRPAQLESPMYCKSEETSPRDSTYSDTSPPAREEGMIE
:::::::::::::::::.:::.::: :: :: :::: .::. :: ::: : :.:: ..:
CCDS78 FGMYYSLAMAKQKLPKKKKKHIPRPPQLGSPNYCKSVVNSPHHSTQSDTCPLAQEE-ILE
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 RKRADSKQNGDANAVLSDEEGAGLTQPLASSPTPEERRALRRSTTRDRNKKAAACFLLST
.:: :
CCDS78 INRAGRKPLRGMSI
500 510
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:.: : .:..:.::::::::::::::.:::::
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: :::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::: .: ::
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::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::.::.:.:: ...::.::::::::::::::::::::::
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:: .::.: . .:: ::: .... ..:..:. ... . : . . .: .:
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..: :: : :::: .
CCDS58 VTSPYNSPCP-----LRRSRSPIPSIL
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:.: : .:..:.::::::::::::::.:::::
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: :::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::: .: ::
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: : ::: .. :.::.: :::.:::::.:::.::::::: :. :.:.:::::::::::
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::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::.::.:.:: ...::.::::::::::::::::::::::
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:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.: :
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:: .::.: . .:: ::: .... ..:..:.:.
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610
>>CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 (618 aa)
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CCDS58 MGKIENNERVILNVGGTRHETYRSTLKTLPGT
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>>CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 (629 aa)
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CCDS58 MGKIENNERVILNVGGTRHETYRSTLKTLPGT
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CCDS58 SDHPGGGREFFFDRHPGVFAYVLNYYRTGKLHCPADVCGPLFEEELAFWGIDETDVEPCC
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CCDS58 WMTYRQHRDAEEALDIFETPDLIGG------DPGDDE-DLAAKRLGI-EDAAGLGGPDGK
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CCDS58 SGRWRRLQPRMWALFEDPYSSRAARFIAFASLFFILVSITTFCLETHEAFNIVKNKTEP-
210 220 230 240 250 260
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pF1KE4 RVGNITSVHFRREVETEPILTYIEGVCVLWFTLEFLVRIVCCPDTLDFVKNLLNIIDFVA
: : ::: .. :.::.: :::.:::::.:::.::::::: :. :.:.:::::::::::
CCDS58 -VINGTSVVLQYEIETDPALTYVEGVCVVWFTFEFLVRIVFSPNKLEFIKNLLNIIDFVA
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CCDS58 LLLIIFLALGVLIFATMIYYAERVGAQPNDPSASEHTQFKNIPIGFWWAVVTMTTLGYGD
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CCDS58 MYPQTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNNFGMYYSLAMAKQKLPRKRKKHIPPAPQ
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pF1KE4 LESPMYCKSEETSPRDSTYSDTSPPAREEGMIERKRADSKQNGDANAVLSDEEGAGLTQP
:: .::.: . .:: ::: .... ..:..:. ::: ....: :
CCDS58 ASSPTFCKTELNMACNSTQSDTCL-GKDNRLLEHNRS----------VLSGDDSTGSEPP
510 520 530 540 550
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pF1KE4 LASSPTPEERRALRRSTTRDRNKKAAACFLLSTGDYACA-DGSVRKGTFVLRDLPLQHSP
: .: :: .:::.:::.:... .::::.::::.:: ::..::
CCDS58 L----SPPERLPIRRSSTRDKNRRGETCFLLTTGDYTCASDGGIRKVLYRIYHGLLTAEK
560 570 580 590 600
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pF1KE4 EAACPPTAGTLFLPH
CCDS58 GTVEFSHTKDYTGNRLLLLNVP
610 620
>>CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 (638 aa)
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: :::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::: .: ::
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: : ::: .. :.::.: :::.:::::.:::.::::::: :. :.:.:::::::::::
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::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::.::.:.:: ...::.::::::::::::::::::::::
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: .: :: .:::.:::.:... .::::.::::.:: ::..::: :.:
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630
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610 620 630
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]