FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4174, 634 aa
1>>>pF1KE4174 634 - 634 aa - 634 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6196+/-0.0011; mu= 17.3320+/- 0.066
mean_var=75.3683+/-15.387, 0's: 0 Z-trim(102.8): 159 B-trim: 4 in 1/50
Lambda= 0.147734
statistics sampled from 6949 (7118) to 6949 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 3.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 4230 911.8 0
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CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 1315 290.5 4.8e-78
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CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 774 175.2 2.8e-43
CCDS69155.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 551) 758 171.7 2.3e-42
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CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 753 170.7 5.9e-42
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 739 167.7 4.5e-41
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 732 166.3 1.3e-40
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CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 677 154.5 3.8e-37
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 658 150.5 6.5e-36
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CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 586 135.1 2.7e-31
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CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX ( 644) 509 118.7 2.4e-26
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CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 486 113.8 6.3e-25
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 477 111.9 2.6e-24
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CCDS6599.1 CCIN gene_id:881|Hs108|chr9 ( 588) 418 99.3 1.6e-20
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 409 97.3 5.3e-20
CCDS81621.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 533) 395 94.4 4.3e-19
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 394 94.2 5.4e-19
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 394 94.2 5.4e-19
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 385 92.3 2e-18
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 369 88.8 2.1e-17
CCDS11411.1 KLHL11 gene_id:55175|Hs108|chr17 ( 708) 369 88.9 2.5e-17
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 366 88.2 3.6e-17
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 359 86.7 9.8e-17
CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1 ( 642) 354 85.7 2.1e-16
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 353 85.5 2.4e-16
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 349 84.6 4.1e-16
CCDS2234.1 KLHL41 gene_id:10324|Hs108|chr2 ( 606) 331 80.8 6.1e-15
>>CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 (634 aa)
initn: 4230 init1: 4230 opt: 4230 Z-score: 4872.6 bits: 911.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4230; 99.8% identity (100.0% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPKKKIVKKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAPKKKIVKKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EGLSKMRQENFLCDLVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILKKDPSIQRVDLNDISPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EGLSKMRQENFLCDLVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILKKDPSIQRVDLNDISPLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLIKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLVKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGRPGLTEKSLSRDILYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGRPGLTEKSLSRDILYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 RSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE4 PEATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PEATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
610 620 630
>>CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 (617 aa)
initn: 1332 init1: 614 opt: 1325 Z-score: 1526.5 bits: 292.6 E(32554): 1e-78
Smith-Waterman score: 1325; 35.6% identity (68.5% similar) in 593 aa overlap (50-628:27-614)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 IIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLLEGLSKMRQENFLCD--LVI
.:. ... .:.:....: :..::: ::
CCDS65 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVP
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 GTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILK---KDPSIQRVDLNDISPLGLATVIAYAYTGKLT
: . : ::...::: :.:: .. :. ... . :. .. .:: .: . ::.::.
CCDS65 GDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLS
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 LSLYTIGSIISAAVYLQIHTLIKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAETYSLKNAKAAAQKF
:.. .. . . :: .::: .. .:. ::: .:..::. : ::.::.: .. ...:
CCDS65 LNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNF
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 IRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKWLEFDQKRVKYAADL
: :: . . .:.:: ::.. .: ...:. .:. :. : .::.... :. ::: :
CCDS65 ILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKL
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 LSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYHQNTLQSRRTRIRGG
..:::: .. :::.::::.: : : : ::..: ::...:: : ..:: :: ::.
CCDS65 MKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 CRVLVTVGG--RPGLTEKSLSRDI-LYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCVAVMDGFLYVAG
:::.:: : :. .:... .: . . : .:. : : ... .::. .::::.:
CCDS65 STHLVTLGGVLRQQLV---VSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVG
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 GEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGLVYAAGGRNAEG
:... :... : ::.. :.:::.: :...::.:.::: : ::...: .::.:::.: :
CCDS65 GQSNYDTKG--KTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAG
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 SLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYSRSVCAYDPASD
::..::: : :.:. . . . ::..: : . ..:: .... . .:: .:
CCDS65 ELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPDTD
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 SWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSPATGQWSYAAPL
.:.. ..: :: :: :..:..::.::... .. :::. : :::. ::. : .
CCDS65 KWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAM
480 490 500 510 520 530
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 QVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDELPEATVGVSCCT
: : .::...... :.:::.. ... . . .: ..:: .:: . .:::. :. ::
CCDS65 LRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRACT
540 550 560 570 580 590
620 630
pF1KE4 LSM------PNNVTRESRASSVSSVPVSI
:.. :.. .::: :. :
CCDS65 LTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS
600 610
>>CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (613 aa)
initn: 1430 init1: 615 opt: 1315 Z-score: 1515.1 bits: 290.5 E(32554): 4.5e-78
Smith-Waterman score: 1316; 34.4% identity (67.9% similar) in 613 aa overlap (39-629:6-612)
10 20 30 40 50
pF1KE4 KKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPN----------
::. .. .::.: ... ::.
CCDS55 MKLSLGGSEMG-LSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSS
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 -LLEGLSKMRQENFLCDLVI--GTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILK---KDPSIQRVD
.:.:....: :..:::... : .: ::. .::: :.:: .. :. ... .
CCDS55 VVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIK
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LNDISPLGLATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLIKMCSDFLIREMSVENC
:. .: .:: .: . ::.::.:.. .. . . :: .::: .. .:. ::: ....::
CCDS55 LHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNC
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 MYVVNIAETYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIV
. : ::.::.: .. ...:. :: . . .:.:: ::.. .: ...:. .:.
CCDS55 VEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELE
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 AFQIAMKWLEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAM
:. . .::.... :. .:: :..:::: .. :.:.::::.: : : : ::..:
CCDS55 LFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEAS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE4 NYHLLPYHQNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGG--RPGLTEKSLSRDI-LYRDPENGWSKLT
::...:: : ..:: :: ::. :::.:: : :. .:... .: . . :..:.
CCDS55 NYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLV---VSKELRMYDEKAHEWKSLA
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 EMPAKSFNQCVAVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKR
: : ... .::. .::::.::... :.. .: ::.. :.:::.: :...::.:.::
CCDS55 PMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTK--GKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKR
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 THFSLSVFNGLVYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVL
: : ::...: .::.::::: : : ..::: : ::.: . . . ::..: : .
CCDS55 TFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMY
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 VTGGYIANAYSRSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGER
..:: ..... . .:: .:.: . ..: :: :: :...:.::.::... ..
CCDS55 ISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDY
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 VDVLTVECYSPATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSP
:::. : ::: ::. : . : : .::...... :.:::.. ... . . .: ..:
CCDS55 DDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDP
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630
pF1KE4 ELNEWTEDDELPEATVGVSCCTLSM--PNNVT-RESRASSVSSVPVSI
. .:: . .:::. :. :::.. :...: :: : .:.
CCDS55 DKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
570 580 590 600 610
>>CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (639 aa)
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CCDS12 RDLHFPESFAGIACAPVLLPRAGTRR
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CCDS10 RVPAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDGGN
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CCDS10 IDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNHF
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CCDS10 GTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLENI
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CCDS10 HFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTNQE
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CCDS10 SFSRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALS
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CCDS32 NK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]