Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4165
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4165, 615 aa
1>>>pF1KE4165 615 - 615 aa - 615 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9525+/-0.000408; mu= 11.2389+/- 0.025
mean_var=129.3511+/-27.287, 0's: 0 Z-trim(114.6): 377 B-trim: 41 in 1/50
Lambda= 0.112769
statistics sampled from 24164 (24619) to 24164 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 11.320
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 1630 277.2 1.1e-73
NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1630 277.3 1.2e-73
XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 1630 277.3 1.2e-73
NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1630 277.3 1.2e-73
NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 1630 277.3 1.2e-73
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 1630 277.3 1.2e-73
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 1630 277.3 1.2e-73
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 1630 277.3 1.2e-73
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1630 277.3 1.2e-73
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1630 277.3 1.2e-73
NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 1611 274.2 9.6e-73
NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 1290 221.9 5.1e-57
XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 1290 221.9 5.1e-57
XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 1290 221.9 5.1e-57
NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Ho ( 628) 905 159.3 3.7e-38
NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 838 148.4 6.8e-35
XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 838 148.4 6.8e-35
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 804 142.9 3.1e-33
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 804 142.9 3.1e-33
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 779 138.8 5.1e-32
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 767 136.8 1.9e-31
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 765 136.5 2.4e-31
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 754 134.7 9.1e-31
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 749 133.9 1.6e-30
NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584) 748 133.7 1.7e-30
NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein ( 582) 727 130.3 1.8e-29
NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 710 127.6 1.3e-28
NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 710 127.6 1.3e-28
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 708 127.2 1.5e-28
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 708 127.2 1.6e-28
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 708 127.3 1.6e-28
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 692 124.6 7.9e-28
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 692 124.6 8.6e-28
XP_016856699 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 531) 676 122.0 5.3e-27
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 670 120.9 8.5e-27
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 638 115.8 3.7e-25
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 631 114.7 8.1e-25
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 631 114.7 8.1e-25
NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 626 113.8 1.4e-24
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 627 114.1 1.4e-24
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 627 114.1 1.4e-24
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 627 114.1 1.4e-24
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 627 114.1 1.4e-24
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 627 114.1 1.4e-24
NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 626 113.9 1.6e-24
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 617 112.4 4.3e-24
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 617 112.5 5.1e-24
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 617 112.5 5.4e-24
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 617 112.5 5.6e-24
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 617 112.5 5.6e-24
>>NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (613 aa)
initn: 1443 init1: 805 opt: 1630 Z-score: 1443.8 bits: 277.2 E(85289): 1.1e-73
Smith-Waterman score: 1630; 43.0% identity (72.9% similar) in 584 aa overlap (30-609:18-596)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAESGGSSGGAGGGGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQG
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NP_001 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTR-IFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE4 QLLDVVLTINR--EAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHII
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NP_001 LLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKII
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DFAYSAEVTLDLDCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSLA
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NP_001 DFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SLRESVDAFTFRHFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHDP
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NP_001 EVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ARRPRASHVLCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEMQ
: :.... .:::::: .::.. :::.:.: : : . :::: :::..:. : ::
NP_001 PRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SPRTAVRSDVPSLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVAV
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NP_001 SDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR---QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LDNFVYVAGGQHLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYAT
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NP_001 IGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GGRNRAGSLASVERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKAL
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NP_001 GGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTF-QKEL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 HCYDPVADQWEFKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFD-VLAVEYYVPETD
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NP_001 MCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 QWTSVSPMRAGQSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEWERDLHFPES
::: .. : :::..: ..: :::.::::.: .. ::: :. : :::.. . .:::
NP_001 QWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPES
530 540 550 560 570 580
600 610
pF1KE4 FAGI-ACAPVLLPRAGTRR
..:: ::. ...:
NP_001 LGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
590 600 610
>>NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (639 aa)
initn: 1443 init1: 805 opt: 1630 Z-score: 1443.5 bits: 277.3 E(85289): 1.2e-73
Smith-Waterman score: 1630; 43.0% identity (72.9% similar) in 584 aa overlap (30-609:44-622)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAESGGSSGGAGGGGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQ
..: : . :.. .::. .:::. :: .
NP_001 LRNRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTR-IFTSNTHSSVVLQGFDQLRLE
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GQLLDVVLTINR--EAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHI
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NP_001 GLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKI
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120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IDFAYSAEVTLDLDCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSL
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NP_001 IDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ASLRESVDAFTFRHFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHD
. . . :..:....: . .::.::.:::.: :.:: :. :.:..::.:. :::. .
NP_001 TEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PARRPRASHVLCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEM
: :.... .:::::: .::.. :::.:.: : : . :::: :::..:. : :
NP_001 EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVM
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QSPRTAVRSDVPSLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVA
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NP_001 QSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR---QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIA
320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 VLDNFVYVAGGQHLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYA
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NP_001 VIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYA
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 TGGRNRAGSLASVERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKA
.:::: :: : .:: : :: ::: :. .... .::::.. :: .::::: .. .:
NP_001 VGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTF-QKE
430 440 450 460 470 480
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pF1KE4 LHCYDPVADQWEFKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFD-VLAVEYYVPET
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NP_001 LMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPIL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 DQWTSVSPMRAGQSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEWERDLHFPE
:::: .. : :::..: ..: :::.::::.: .. ::: :. : :::.. . .::
NP_001 DQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPE
550 560 570 580 590 600
600 610
pF1KE4 SFAGI-ACAPVLLPRAGTRR
:..:: ::. ...:
NP_001 SLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
610 620 630
>>XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like prot (639 aa)
initn: 1443 init1: 805 opt: 1630 Z-score: 1443.5 bits: 277.3 E(85289): 1.2e-73
Smith-Waterman score: 1630; 43.0% identity (72.9% similar) in 584 aa overlap (30-609:44-622)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAESGGSSGGAGGGGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQ
..: : . :.. .::. .:::. :: .
XP_016 LRNRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTR-IFTSNTHSSVVLQGFDQLRLE
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GQLLDVVLTINR--EAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHI
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XP_016 GLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKI
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IDFAYSAEVTLDLDCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSL
::: :.:...:..: .::.: :: :::.:::...:. :: .......:...:..:.:..:
XP_016 IDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNL
140 150 160 170 180 190
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pF1KE4 ASLRESVDAFTFRHFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHD
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XP_016 TEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PARRPRASHVLCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEM
: :.... .:::::: .::.. :::.:.: : : . :::: :::..:. : :
XP_016 EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVM
260 270 280 290 300 310
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pF1KE4 QSPRTAVRSDVPSLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVA
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XP_016 QSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR---QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIA
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360 370 380 390 400 410
pF1KE4 VLDNFVYVAGGQHLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYA
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XP_016 VIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYA
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 TGGRNRAGSLASVERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKA
.:::: :: : .:: : :: ::: :. .... .::::.. :: .::::: .. .:
XP_016 VGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTF-QKE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 LHCYDPVADQWEFKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFD-VLAVEYYVPET
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XP_016 LMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPIL
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pF1KE4 SFAGI-ACAPVLLPRAGTRR
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XP_011 SLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
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pF1KE4 DQWTSVSPMRAGQSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEWERDLHFPE
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600 610
pF1KE4 SFAGI-ACAPVLLPRAGTRR
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NP_277 SLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
630 640 650
>>NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (658 aa)
initn: 1443 init1: 805 opt: 1630 Z-score: 1443.3 bits: 277.3 E(85289): 1.2e-73
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NP_001 EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]