Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4165
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4165, 615 aa
1>>>pF1KE4165 615 - 615 aa - 615 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2757+/-0.000981; mu= 9.6243+/- 0.059
mean_var=114.5907+/-23.435, 0's: 0 Z-trim(108.1): 176 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.119812
statistics sampled from 9795 (9981) to 9795 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 3.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 4183 734.4 1.1e-211
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 1630 293.1 7.3e-79
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 1630 293.1 7.6e-79
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 1630 293.1 7.8e-79
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 1630 293.1 7.8e-79
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 1611 289.8 7.2e-78
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 1320 239.5 9.9e-63
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 1290 234.3 3.7e-61
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 1127 206.1 1.1e-52
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 953 176.1 1.2e-43
CCDS32813.1 KLHL14 gene_id:57565|Hs108|chr18 ( 628) 905 167.8 4e-41
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 860 160.0 8.5e-39
CCDS35217.1 KLHL15 gene_id:80311|Hs108|chrX ( 604) 838 156.2 1.2e-37
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 812 151.7 2.5e-36
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 812 151.7 2.6e-36
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 804 150.3 6.8e-36
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 804 150.3 6.8e-36
CCDS69154.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 584) 788 147.5 4.6e-35
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 787 147.3 5.1e-35
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 779 146.0 1.3e-34
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 765 143.5 6.9e-34
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 749 140.8 5.1e-33
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 748 140.6 5.5e-33
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 727 137.0 6.8e-32
CCDS69155.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 551) 725 136.6 8.2e-32
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 720 135.8 1.5e-31
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 710 134.1 5.4e-31
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 708 133.7 6.5e-31
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 678 128.5 2.6e-29
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 638 121.6 2.6e-27
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 631 120.4 5.9e-27
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 627 119.7 1.1e-26
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 626 119.5 1.2e-26
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 617 118.0 3.5e-26
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 617 118.0 4.3e-26
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 617 118.0 4.5e-26
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 610 116.8 8.8e-26
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 609 116.6 9.5e-26
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 611 117.0 1.1e-25
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 609 116.6 1.2e-25
CCDS53882.1 KLHL33 gene_id:123103|Hs108|chr14 ( 533) 599 114.8 2.9e-25
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 593 113.9 7.6e-25
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 593 113.9 7.7e-25
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 585 112.4 1.7e-24
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 582 111.9 2.1e-24
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 574 110.5 4.7e-24
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 550 106.4 1.3e-22
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 545 105.5 1.9e-22
CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX ( 644) 543 105.2 2.8e-22
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 535 103.8 6.8e-22
>>CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 (615 aa)
initn: 4183 init1: 4183 opt: 4183 Z-score: 3914.2 bits: 734.4 E(32554): 1.1e-211
Smith-Waterman score: 4183; 100.0% identity (100.0% similar) in 615 aa overlap (1-615:1-615)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAESGGSSGGAGGGGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAESGGSSGGAGGGGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 QLLDVVLTINREAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHIIDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QLLDVVLTINREAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHIIDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AYSAEVTLDLDCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSLASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AYSAEVTLDLDCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSLASL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 RESVDAFTFRHFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHDPAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RESVDAFTFRHFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHDPAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 RPRASHVLCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEMQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RPRASHVLCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEMQSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RTAVRSDVPSLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVAVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RTAVRSDVPSLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVAVLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 NFVYVAGGQHLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYATGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NFVYVAGGQHLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYATGG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 RNRAGSLASVERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKALHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RNRAGSLASVERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKALHC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 YDPVADQWEFKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFDVLAVEYYVPETDQWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YDPVADQWEFKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFDVLAVEYYVPETDQWT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 SVSPMRAGQSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEWERDLHFPESFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVSPMRAGQSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEWERDLHFPESFAG
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE4 IACAPVLLPRAGTRR
:::::::::::::::
CCDS12 IACAPVLLPRAGTRR
610
>>CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (613 aa)
initn: 1443 init1: 805 opt: 1630 Z-score: 1529.3 bits: 293.1 E(32554): 7.3e-79
Smith-Waterman score: 1630; 43.0% identity (72.9% similar) in 584 aa overlap (30-609:18-596)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAESGGSSGGAGGGGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQG
..: : . :.. .::. .:::. :: .:
CCDS55 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTR-IFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE4 QLLDVVLTINR--EAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHII
: ::.: . .:::.:.:..:. ::::.:::::::.: . :.:.::: :::.::
CCDS55 LLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKII
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DFAYSAEVTLDLDCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSLA
:: :.:...:..: .::.: :: :::.:::...:. :: .......:...:..:.:..:.
CCDS55 DFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SLRESVDAFTFRHFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHDP
. . :..:....: . .::.::.:::.: :.:: :. :.:..::.:. :::. .
CCDS55 EVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ARRPRASHVLCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEMQ
: :.... .:::::: .::.. :::.:.: : : . :::: :::..:. : ::
CCDS55 PRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SPRTAVRSDVPSLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVAV
: :::.:::. :::.::. .. : :: .. . :.... :. :.. . .::
CCDS55 SDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR---QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LDNFVYVAGGQHLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYAT
. ::.::.::: .:. :::. .:.::. :.:... ...:.: :.:..: :..::.
CCDS55 IGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GGRNRAGSLASVERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKAL
:::: :: : .:: : :: ::: :. .... .::::.. :: .::::: .. .: :
CCDS55 GGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTF-QKEL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 HCYDPVADQWEFKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFD-VLAVEYYVPETD
:.:: .:.: ::::. : :: : .: :.:..:: . .: ::. ::: : :
CCDS55 MCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 QWTSVSPMRAGQSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEWERDLHFPES
::: .. : :::..: ..: :::.::::.: .. ::: :. : :::.. . .:::
CCDS55 QWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPES
530 540 550 560 570 580
600 610
pF1KE4 FAGI-ACAPVLLPRAGTRR
..:: ::. ...:
CCDS55 LGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
590 600 610
>>CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (639 aa)
initn: 1443 init1: 805 opt: 1630 Z-score: 1529.0 bits: 293.1 E(32554): 7.6e-79
Smith-Waterman score: 1630; 43.0% identity (72.9% similar) in 584 aa overlap (30-609:44-622)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAESGGSSGGAGGGGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQ
..: : . :.. .::. .:::. :: .
CCDS55 LRNRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTR-IFTSNTHSSVVLQGFDQLRLE
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GQLLDVVLTINR--EAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHI
: : ::.: . .:::.:.:..:. ::::.:::::::.: . :.:.::: :::.:
CCDS55 GLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKI
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IDFAYSAEVTLDLDCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSL
::: :.:...:..: .::.: :: :::.:::...:. :: .......:...:..:.:..:
CCDS55 IDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ASLRESVDAFTFRHFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHD
. . . :..:....: . .::.::.:::.: :.:: :. :.:..::.:. :::. .
CCDS55 TEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PARRPRASHVLCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEM
: :.... .:::::: .::.. :::.:.: : : . :::: :::..:. : :
CCDS55 EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVM
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QSPRTAVRSDVPSLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVA
:: :::.:::. :::.::. .. : :: .. . :.... :. :.. . .:
CCDS55 QSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR---QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIA
320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 VLDNFVYVAGGQHLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYA
:. ::.::.::: .:. :::. .:.::. :.:... ...:.: :.:..: :..::
CCDS55 VIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 TGGRNRAGSLASVERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKA
.:::: :: : .:: : :: ::: :. .... .::::.. :: .::::: .. .:
CCDS55 VGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTF-QKE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 LHCYDPVADQWEFKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFD-VLAVEYYVPET
: :.:: .:.: ::::. : :: : .: :.:..:: . .: ::. ::: :
CCDS55 LMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPIL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 DQWTSVSPMRAGQSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEWERDLHFPE
:::: .. : :::..: ..: :::.::::.: .. ::: :. : :::.. . .::
CCDS55 DQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPE
550 560 570 580 590 600
600 610
pF1KE4 SFAGI-ACAPVLLPRAGTRR
:..:: ::. ...:
CCDS55 SLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
610 620 630
>>CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (655 aa)
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10 20 30 40 50
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240 250 260 270 280 290
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630 640 650
>>CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (658 aa)
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10 20 30 40 50
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..: : . :.. .::. .:::. :: .
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240 250 260 270 280 290
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: :.... .:::::: .::.. :::.:.: : : . :::: :::..:. : :
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.:::: :: : .:: : :: ::: :. .... .::::.. :: .::::: .. .:
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:..:: ::. ...:
CCDS55 SLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
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CCDS65 LCDVTLVPGDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIID
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CCDS65 FIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIE
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CCDS65 VDKYVNNFILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDP
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CCDS65 RMDYAAKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQS
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CCDS65 DRTAIRSDSTHLVTLGGV---LRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVI
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CCDS65 GNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVG
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CCDS65 GRSAAGELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTF-QNELM
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CCDS65 CFDPDTDKWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQ
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CCDS65 WTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESL
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CCDS65 GGIRACTLTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS
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>>CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 (616 aa)
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CCDS10 YVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNHFGT
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CCDS10 LSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLENIHF
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CCDS10 LFVGGE-VSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKE-TPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGSFS
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CCDS10 RDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSSVE
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CCDS10 TYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGGHDYQIGPYRKNLLCYDHRTDVWEE
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CCDS10 RRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAPLLHA
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CCDS10 NSESGVAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSACVCAL
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:: ..
CCDS10 EPRPEDKKKKGKGKRHQDRGQ
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CCDS34 KKKIVKKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLLEGL
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pF1KE4 ATLRAQGQLLDVVLTINREAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARG
. .: .. : :.:. . ..: .:: :.:.::.:: .. .. : . ..:. .: :
CCDS34 SKMRQENFLCDLVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILK---KDPSIQRVDLNDISPLG
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CCDS34 LATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLVKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAE
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CCDS34 TYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKW
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CCDS34 QNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGRPGL-TEKSLSRDILYRDPENG---WSKLTEMPAKSF
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CCDS34 NQCVAVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSV
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CCDS34 FNGLVYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGY-I
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: : : : ::. ..:...: : :: :. . :.:::.: .. .: .. . .::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]