Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4150
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4150, 585 aa
1>>>pF1KE4150 585 - 585 aa - 585 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1898+/-0.000474; mu= 19.4722+/- 0.029
mean_var=79.5472+/-17.080, 0's: 0 Z-trim(109.1): 439 B-trim: 113 in 1/48
Lambda= 0.143801
statistics sampled from 16769 (17259) to 16769 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.546), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 9.630
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 1342 289.0 2.9e-77
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 1334 287.4 8.7e-77
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 1322 284.9 5e-76
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 1322 284.9 5.1e-76
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 1322 284.9 5.2e-76
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 1322 284.9 5.2e-76
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 1322 284.9 5.3e-76
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 1314 283.2 1.5e-75
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 1296 279.5 2.3e-74
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 1213 262.3 3.4e-69
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 1213 262.3 3.4e-69
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 1169 253.1 1.6e-66
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 1155 250.2 1.2e-65
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 1155 250.2 1.2e-65
NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 1105 239.9 1.9e-62
NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 1105 239.9 1.9e-62
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 1103 239.4 2.1e-62
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 1103 239.4 2.1e-62
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 1051 228.6 3.6e-59
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 1051 228.6 3.9e-59
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 995 216.9 1e-55
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 993 216.6 1.8e-55
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 994 216.9 1.9e-55
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 994 216.9 1.9e-55
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 994 216.9 1.9e-55
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 993 216.7 2.1e-55
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 993 216.7 2.2e-55
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 993 216.7 2.2e-55
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 993 216.7 2.2e-55
NP_001278935 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 544) 990 216.0 2.6e-55
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 989 215.9 4e-55
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 989 215.9 4e-55
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 989 215.9 4e-55
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 987 215.4 4.2e-55
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 987 215.5 5.1e-55
NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 964 210.6 1.2e-53
NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 964 210.6 1.2e-53
XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 964 210.6 1.2e-53
NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 964 210.6 1.2e-53
NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 964 210.7 1.3e-53
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 964 210.7 1.3e-53
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 964 210.7 1.3e-53
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 964 210.7 1.3e-53
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 964 210.7 1.3e-53
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 964 210.7 1.3e-53
NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 963 210.4 1.4e-53
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 951 208.0 8.8e-53
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 947 207.2 1.6e-52
NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein ( 582) 927 202.9 2.4e-51
NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584) 924 202.3 3.6e-51
>>NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein 3 i (587 aa)
initn: 1719 init1: 710 opt: 1342 Z-score: 1508.2 bits: 289.0 E(85289): 2.9e-77
Smith-Waterman score: 1342; 38.7% identity (67.3% similar) in 569 aa overlap (6-567:7-564)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVK
: : .: : . ... : . .. .: ::... :::... . ::.
NP_059 MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 IHAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTV
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NP_059 IEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 ESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFE
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NP_059 QVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 AVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVR
: :::. :. .. ..:.: :.:..:: :: :. :::.:. . : ...:.:.. ::
NP_059 EVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMP-EHRLSHQTVLMTRPRCA---
:::: .:.. : . ::... ::: .: ::.:::..: ..:: .. :.::
NP_059 LPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNP-RTKPRTPVSL
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 PKVLCAVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIAT
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NP_059 PKVMIVVGGQAP--KAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NVRPGVTIRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQ
..: .: .:. .. . :::. :.: :::::..:: :::.::.::.. :
NP_059 SLR----VR----TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLA
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SVEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAH---MNSVERYDPSKDS
::: : : .: ::::.: :: ...:..: .::.::: : ...::.:.:. .
NP_059 SVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 WEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTG
: .::.:. .: ::::. : ....:::.: .:.: ::: : : :. : .
NP_059 WIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRN
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KE4 VGAAVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL
.:. .... :::::: .:: : .:. :.:..: :
NP_059 AGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
530 540 550 560 570 580
>>NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein (555 aa)
initn: 1719 init1: 710 opt: 1334 Z-score: 1499.6 bits: 287.4 E(85289): 8.7e-77
Smith-Waterman score: 1334; 40.1% identity (69.0% similar) in 536 aa overlap (39-567:8-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 YPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKIHAHKVVLA
.: ::... :::... . ::.:.::.::::
NP_001 MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVESLLPAANL
. :::: :::::..::.. ...:.. .: .:. ...: ::. . .....:. :::::.:
NP_001 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAASL
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pF1KE4 LQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFEAVCQTEEFF
::. : ..:: ::.::: : ::.:: ::... : :: :. : :.: : :::.
NP_001 LQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRLPLLSVKFL
:. .. ..:.: :.:..:: :: :. :::.:. . : ...:.:.. :::::: .:
NP_001 SLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDYL
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pF1KE4 TRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMP-EHRLSHQTVLMTRPRCA---PKVLCAVGG
.. : . ::... ::: .: ::.:::..: ..:: .. :.:: :::. .:::
NP_001 VQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNP-RTKPRTPVSLPKVMIVVGG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 KSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIATNVRPGVTIR
.. . ::: : ..: : .: : : . :. . .::..::. ..: .:
NP_001 QAP--KAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLR----VR
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 KHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKYIPKI
.:. .. . :::. :.: :::::..:: :::.::.::.. : ::: : :
NP_001 ----TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKT
340 350 360 370 380
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pF1KE4 RKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAH---MNSVERYDPSKDSWEMVASMAD
.: ::::.: :: ...:..: .::.::: : ...::.:.:. . : .::.:.
NP_001 NEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMST
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pF1KE4 KRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDNY
.: ::::. : ....:::.: .:.: ::: : : :. : ..:. ....
NP_001 RRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGL
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pF1KE4 LYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL
:::::: .:: : .:. :.:..: :
NP_001 LYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
510 520 530 540 550
>>NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 isoform (568 aa)
initn: 1695 init1: 798 opt: 1322 Z-score: 1486.0 bits: 284.9 E(85289): 5e-76
Smith-Waterman score: 1322; 39.0% identity (68.4% similar) in 564 aa overlap (27-585:11-565)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKI
.:. :....:...: ::. . :::. ::: . .
NP_067 MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDF
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVE
::..:::. : :: ::::..:::: . :..: . .... .....:: :: .. ..:.
NP_067 PAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQ
50 60 70 80 90 100
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pF1KE4 SLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFEA
::::: :::.: : . :: ::::::::.::.:: ::::..: ::. :: . ..:
NP_067 ELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRL
: : :::. :.......... : ..: .:: :: :. .:.:. .::.. : .::. ::.
NP_067 VVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRM
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE4 PLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRC-APKVL
:::. ...: . .:. .:: . :. :..:: :.:. :: : . : :: : : .::
NP_067 PLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGP-RTRARLGANEVL
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 CAVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIATNVRP
.::: .. . .: :: : :... : : .. : . : ...:::::
NP_067 LVVGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGG-----YD
290 300 310 320 330
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pF1KE4 GVTIRKHENSVEC--WNPDTN-TWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQS
: :.. .:::: .. : . .: :. :: :. :...:. .:. ::.::. :
NP_067 G---RSRLSSVECLDYTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTS
340 350 360 370 380 390
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pF1KE4 VEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGY-GPAHMNSVERYDPSKDSWEM
.:.: :.: .:. .. : :.: . .: .:.:: .::: : .::::.::: :
NP_067 MERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTN
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pF1KE4 VASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGA
:. :: :: ::... :.:::: .:..::::.: :. . ..::. : :: :::
NP_067 VTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCYVGA
460 470 480 490 500 510
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pF1KE4 AVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL
.:. . ::...:..:.: :.... :::: :.: ..: ::. :. .:
NP_067 TVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLREK
520 530 540 550 560
>>NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isoform (593 aa)
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Smith-Waterman score: 1322; 37.9% identity (68.3% similar) in 562 aa overlap (31-585:38-589)
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: .. .. .: ::... :::. . . :..:
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::.::::. ::::.:::::..::.. ..:... .: .:. ...:.::. . .....:.
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70 80 90 100 110 120
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:::::.:::.. : : :: :::::: : ::.:: ::. ..: :: :. : :.:
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: .:::..: .. ..:.: :....:: :: :. .:...: . ::...:.:.. :::
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::: ..:.. : . :.... .:: : ::.:::..: :.:. ..: . : ::
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.. .:::.. . ::: : ... : .: : : . :. . :...::. ..
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: .: .:. ..: . :::. : . :::::..:: : :::.::.::.. :.::
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. .... :::::: .:: : .:. :.: .: : . :. : : :.:..
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10 20 30 40 50 60
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: .. .. .: ::... :::. . . :..:
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::.::::. ::::.:::::..::.. ..:... .: .:. ...:.::. . .....:.
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:::::.:::.. : : :: :::::: : ::.:: ::. ..: :: :. : :.:
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.. .:::.. . ::: : ... : .: : : . :. . :...::. ..
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. .... :::::: .:: : .:. :.: .: : . :. : : :.:..
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.:: .::: .. . .: :: : :... : : .. : . : ...:::::
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: :. :: :: ::... :.:::: .:..::::.: :. . ..::. : ::
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:::.:. . ::...:..:.: :.... :::: :.: ..: ::. :. .:
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..:. ::::: :::.: : . :: ::::::::.::.:: ::::..: ::. :: . .
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::.:::. ...: . .:. .:: . :. :..:: :.:. :: : . : :: : :
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.:: .::: .. . .: :: : :... : : .. : . : ...:::::
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: :. :: :: ::... :.:::: .:..::::.: :. . ..::. : ::
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initn: 1493 init1: 680 opt: 1296 Z-score: 1456.2 bits: 279.5 E(85289): 2.3e-74
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start: Sun Nov 6 01:34:11 2016 done: Sun Nov 6 01:34:13 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]