Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4145
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4145, 578 aa
1>>>pF1KE4145 578 - 578 aa - 578 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6613+/-0.000415; mu= 17.0862+/- 0.025
mean_var=91.5641+/-19.862, 0's: 0 Z-trim(113.3): 318 B-trim: 550 in 1/50
Lambda= 0.134033
statistics sampled from 22205 (22612) to 22205 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 10.320
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 1199 242.7 2.6e-63
NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 1077 219.0 2.8e-56
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43
NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 848 174.8 7e-43
XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43
XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43
XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43
XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 798 165.1 5.6e-40
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 798 165.2 5.7e-40
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 787 163.0 2.3e-39
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 781 161.9 5.5e-39
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 772 160.1 1.9e-38
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 769 159.5 2.6e-38
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 766 158.9 4e-38
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 766 159.0 4.7e-38
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 766 159.0 4.9e-38
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 766 159.1 5.1e-38
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 766 159.1 5.1e-38
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 766 159.1 5.1e-38
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 766 159.1 5.1e-38
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 766 159.1 5.1e-38
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 766 159.1 5.2e-38
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 766 159.1 5.2e-38
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 766 159.1 5.2e-38
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 748 155.5 4.5e-37
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 748 155.6 5.5e-37
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 739 153.8 1.8e-36
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 739 153.8 1.8e-36
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 693 144.9 8.2e-34
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 691 144.5 1.1e-33
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 688 143.9 1.5e-33
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 686 143.5 1.9e-33
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 686 143.5 1.9e-33
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 686 143.5 1.9e-33
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 686 143.5 1.9e-33
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 686 143.5 1.9e-33
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 673 140.9 8.9e-33
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 673 140.9 9.7e-33
XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 663 139.0 3.7e-32
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 663 139.0 4e-32
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 662 138.8 4.5e-32
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 662 138.9 4.7e-32
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 662 138.9 4.8e-32
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 649 136.4 2.8e-31
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 649 136.4 2.8e-31
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 649 136.4 2.8e-31
>>NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 isoform (597 aa)
initn: 1165 init1: 388 opt: 1199 Z-score: 1257.7 bits: 242.7 E(85289): 2.6e-63
Smith-Waterman score: 1241; 38.4% identity (63.9% similar) in 571 aa overlap (8-562:10-559)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTL-LVGGRELPCHRSLLALSSPY
: : :.:: ..: ::..::.. :. :::: .:::..: ::..:: .:::
NP_055 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 FHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNVEALTRTAARLHFPS
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NP_055 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VQKVCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENFEAVAREDEFLQLPRE
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NP_055 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAE-QLERLPLA
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180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RLVTCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAVHLPELLSLVHLDAVPRPCVQQLLA
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NP_055 RLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE4 SEPLIQESEAC----------RAALSQGHDGAPLALQQK-----LEEVLVVVGGQALEEE
.:::. . : .:: . :: .: .. : :.::.::: . .
NP_055 AEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNNIYVTGGSRGTKTDTW
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NP_055 E--------LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRL---
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pF1KE4 STTQAWCFPLKEASWKPVAPMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGTTLDVVEVESYDPYTDSW
.: . . : :::::: : :.:..:.: .::... . .: :: ::::
NP_055 -YDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADS-----TERYDHTTDSW
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 TPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGSSACKYNALALQCYNPVTDAWSVIASPFLPKYLS
..: ..: :...:::::: .:: : : .....:::.: :: ::.. :: .
NP_055 EALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGK-ETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSF
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 SPRCAALHGELYLIGDNTKKVYVYDPGANLWQKVQSQHSLHENGALVPLGDALYVTGGRW
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NP_055 APKTATLNGLMYFVRDDSAEVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGYD
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530 540 550 560 570
pF1KE4 QGMEGDYHVEMEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYHGASTVFLDVSKWTQPSGPTQEH
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NP_055 NTFELSDVV--EAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGS
530 540 550 560 570
NP_055 DDMDPGRPRPPRDPDELH
580 590
>>NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 isof (500 aa)
initn: 1064 init1: 388 opt: 1077 Z-score: 1131.2 bits: 219.0 E(85289): 2.8e-56
Smith-Waterman score: 1119; 38.5% identity (63.9% similar) in 509 aa overlap (8-500:10-499)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTL-LVGGRELPCHRSLLALSSPY
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NP_001 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
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pF1KE4 FHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNVEALTRTAARLHFPS
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pF1KE4 VQKVCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENFEAVAREDEFLQLPRE
:...:: .:::::: :::: . .:.: . :.:. : :. .. .. : .. .::
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pF1KE4 RLVTCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAVHLPELLSLVHLDAVPRPCVQQLLA
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pF1KE4 SEPLIQESEAC----------RAALSQGHDGAPLALQQK-----LEEVLVVVGGQALEEE
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pF1KE4 EAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNNIYVTGGSRGTKTDTW
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NP_001 E--------LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRL---
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pF1KE4 STTQAWCFPLKEASWKPVAPMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGTTLDVVEVESYDPYTDSW
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NP_001 -YDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADS-----TERYDHTTDSW
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pF1KE4 TPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGSSACKYNALALQCYNPVTDAWSVIASPFLPKYLS
..: ..: :...:::::: .:: : : .....:::.: :: ::.. :: .
NP_001 EALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGK-ETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSF
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pF1KE4 SPRCAALHGELYLIGDNTKKVYVYDPGANLWQKVQSQHSLHENGALVPLGDALYVTGGRW
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NP_001 APKTATLNGLMYFVRDDSAEVDVYNPTRNEWDKIPSMNQ
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pF1KE4 QGMEGDYHVEMEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYHGASTVFLDVSKWTQPSGPTQEH
>>XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like prot (600 aa)
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Smith-Waterman score: 867; 30.5% identity (59.5% similar) in 568 aa overlap (14-561:47-590)
10 20 30 40
pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTLLVGGRE
:::...:. ....:.. ..:: . : :.:
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pF1KE4 LPCHRSLLALSSPYFHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNV
.::::..:. : ::.::: .: :: ::. . .. ....::::.. :: ::
XP_016 FPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKITTENV
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. : .:.. ... .. .:...:..::: ::::: .:.. ..: . .: : ..::
XP_016 QYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFALQTFE
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pF1KE4 AVAREDEFLQLPRERLVTCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAVHLPELLSLVH
:....:::.: ...:. . .: : . :. .::.:::: . . : : :::. :.
XP_016 DVSQHEEFLELDKDELIDYICSDELVIGKEEMVFEAVMRWVYRAVDLRRPLLHELLTHVR
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270
pF1KE4 LDAVPRPCVQQLLASEPLIQESEACRAALSQ-------GHDG-APLALQQK---LEEVLV
: . : . . :::.: : : . :.. .: . .. ::.:
XP_016 LPLLHPNYFVQTVEVDQLIQNSPECYQLLHEARRYHILGNEMMSPRTRPRRSTGYSEVIV
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 VVGGQALEEEEAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNNIYVTG
:::: :..: : :. . .: .: .:.. : ... :: :.: :.:
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: ... ..: . . : :: . : : : :.: :..::.:: . .
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pF1KE4 EVESYDPYTDSWTPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGS----SACKYNALALQCYNPVT
:: :: ... :: :.: . ::. ....: :.:...:. ..:. . .: :.: :
XP_016 SVECYDSFSNRWTEVAPLKEAVSSPAVTSCVGKLFVIGGGPDDNTCSDK---VQSYDPET
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..: . :. . : :: ..:.. .:. : :: .: ::: . :..::. : .
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pF1KE4 ENGALVPLGDALYVTGGRWQGMEGDYHVEMEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYHGASTVFL
:: .. . .:. ::: .. :. . :: . . : .:.:: ::: :.
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570
pF1KE4 DVSKWTQPSGPTQEH
XP_016 YNEKCFKL
600
>>XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like prot (600 aa)
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Smith-Waterman score: 867; 30.5% identity (59.5% similar) in 568 aa overlap (14-561:47-590)
10 20 30 40
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Smith-Waterman score: 867; 30.5% identity (59.5% similar) in 568 aa overlap (14-561:47-590)
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