Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4141
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4141, 558 aa
1>>>pF1KE4141 558 - 558 aa - 558 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4555+/-0.0005; mu= 18.0011+/- 0.031
mean_var=100.2355+/-22.312, 0's: 0 Z-trim(109.4): 307 B-trim: 326 in 1/50
Lambda= 0.128104
statistics sampled from 17199 (17610) to 17199 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.549), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16
Scan time: 8.710
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 659 133.5 1.9e-30
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 659 133.5 1.9e-30
XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 659 133.5 1.9e-30
XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 659 133.5 1.9e-30
XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 659 133.5 1.9e-30
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 659 133.5 1.9e-30
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 659 133.5 1.9e-30
NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 659 133.5 1.9e-30
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 659 133.5 1.9e-30
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 609 124.1 9.6e-28
NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 610 124.4 1e-27
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 609 124.2 1e-27
NP_115894 (OMIM: 616607) kelch repeat and BTB doma ( 601) 561 115.4 5.3e-25
XP_016862151 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 319) 512 106.0 1.8e-22
XP_016862152 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 319) 512 106.0 1.8e-22
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 510 105.9 3.6e-22
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 510 105.9 3.6e-22
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 510 105.9 3.6e-22
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 510 105.9 3.6e-22
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 510 105.9 3.6e-22
XP_016862139 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 502 104.5 1.1e-21
XP_016862146 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 502 104.5 1.1e-21
XP_016862147 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 502 104.5 1.1e-21
XP_016862145 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 502 104.5 1.1e-21
XP_016862142 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 502 104.5 1.1e-21
XP_016862144 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 502 104.5 1.1e-21
XP_016862141 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 502 104.5 1.1e-21
XP_016862140 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 502 104.5 1.1e-21
XP_016862143 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 502 104.5 1.1e-21
XP_011511576 (OMIM: 614214) PREDICTED: kelch-like ( 327) 496 103.1 1.4e-21
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 496 103.4 2.3e-21
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 494 103.0 2.9e-21
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 494 103.0 2.9e-21
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 494 103.0 2.9e-21
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 494 103.0 2.9e-21
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 494 103.0 2.9e-21
NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 490 102.2 4.2e-21
NP_689606 (OMIM: 615340,615348) kelch-like protein ( 621) 487 101.7 7.2e-21
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 481 100.6 1.5e-20
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 480 100.4 1.6e-20
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 476 99.6 2.4e-20
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 476 99.6 2.6e-20
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 476 99.6 2.7e-20
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 476 99.7 2.9e-20
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 476 99.7 2.9e-20
NP_061334 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like ( 538) 469 98.3 6.5e-20
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 469 98.3 6.7e-20
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 469 98.4 6.9e-20
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 469 98.4 7.3e-20
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 466 97.8 1e-19
>>XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like prot (600 aa)
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Smith-Waterman score: 987; 31.8% identity (61.2% similar) in 575 aa overlap (2-556:33-591)
10 20 30
pF1KE4 MALKGQEDYIYLFKDSTHPVDFLDAFRTFYL
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40 50 60 70 80 90
pF1KE4 DGLFTDITLQCPSGIIFHCHRAVLAACSNYFKAMFTADMKEKFKNKIKLSGIHHDILEGL
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100 110 120 130 140 150
pF1KE4 VNYAYTSQIEITKRNVQSLLEAADLLQFLSVKKACERFLVRHLDIDNCIGMHSFAEFHVC
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160 170 180 190 200 210
pF1KE4 PELEKESRRILCSKFKEVWQQEEFLEISLEKFLFILSRKNLSVWKEEAIIEPVIKWTAHD
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pF1KE4 TYDKVQSYNSDINEWSLITSSPHPEYGLCSVPFENKLYLVGGQTTITECYDPEQNEWREI
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pF1KE4 CVCVYNV
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pF1KE4 MALKGQEDYIYLFKDSTHPVDFLDAFRTFYL
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pF1KE4 DGLFTDITLQCPSGIIFHCHRAVLAACSNYFKAMFTADMKEKFKNKIKLSGIHHDILEGL
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pF1KE4 PMHKEISQRSTA---TMYIIGGY-----YWHPLSEVHIWDPLTNVWIQGAEIPDYTRESY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]