Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4120
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4120, 503 aa
1>>>pF1KE4120 503 - 503 aa - 503 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9801+/-0.00051; mu= 8.4057+/- 0.031
mean_var=526.9698+/-127.001, 0's: 0 Z-trim(118.1): 1114 B-trim: 1748 in 1/57
Lambda= 0.055870
statistics sampled from 28868 (30632) to 28868 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16
Scan time: 9.500
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001092740 (OMIM: 611692) zinc finger and BTB do ( 500) 1254 116.7 1.6e-25
XP_011517001 (OMIM: 611692) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1254 116.7 1.6e-25
XP_005252046 (OMIM: 611692) PREDICTED: zinc finger ( 514) 1254 116.7 1.7e-25
NP_001304919 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB do ( 584) 429 50.3 1.8e-05
XP_005259628 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 584) 429 50.3 1.8e-05
NP_056982 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB domai ( 584) 429 50.3 1.8e-05
XP_005259627 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 634) 429 50.3 1.9e-05
NP_005444 (OMIM: 611439) zinc finger and BTB domai ( 634) 413 49.1 4.7e-05
NP_001138810 (OMIM: 611439) zinc finger and BTB do ( 634) 413 49.1 4.7e-05
NP_653254 (OMIM: 615786) nucleus accumbens-associa ( 587) 374 45.8 0.0004
XP_011516523 (OMIM: 615786) PREDICTED: nucleus acc ( 587) 374 45.8 0.0004
NP_443108 (OMIM: 610672) nucleus accumbens-associa ( 527) 369 45.4 0.0005
XP_005259778 (OMIM: 610672) PREDICTED: nucleus acc ( 527) 369 45.4 0.0005
XP_016862354 (OMIM: 606042) PREDICTED: myoneurin i ( 468) 327 41.9 0.005
XP_016862355 (OMIM: 606042) PREDICTED: myoneurin i ( 468) 327 41.9 0.005
XP_005247681 (OMIM: 606042) PREDICTED: myoneurin i ( 496) 327 41.9 0.0051
XP_005247679 (OMIM: 606042) PREDICTED: myoneurin i ( 528) 327 42.0 0.0052
XP_005248008 (OMIM: 616238) PREDICTED: zinc finger ( 466) 326 41.8 0.0052
XP_005271715 (OMIM: 176797,612447) PREDICTED: zinc ( 485) 326 41.8 0.0053
NP_001172048 (OMIM: 606042) myoneurin isoform B [H ( 581) 327 42.1 0.0055
XP_005247678 (OMIM: 606042) PREDICTED: myoneurin i ( 582) 327 42.1 0.0055
NP_061127 (OMIM: 606042) myoneurin isoform A [Homo ( 610) 327 42.1 0.0056
XP_011511289 (OMIM: 606042) PREDICTED: myoneurin i ( 610) 327 42.1 0.0056
NP_001172047 (OMIM: 606042) myoneurin isoform A [H ( 610) 327 42.1 0.0056
XP_016862353 (OMIM: 606042) PREDICTED: myoneurin i ( 610) 327 42.1 0.0056
XP_005257223 (OMIM: 613907) PREDICTED: zinc finger ( 426) 317 41.0 0.0083
NP_055712 (OMIM: 613907) zinc finger protein 652 [ ( 606) 317 41.3 0.0097
NP_001138837 (OMIM: 613907) zinc finger protein 65 ( 606) 317 41.3 0.0097
>>NP_001092740 (OMIM: 611692) zinc finger and BTB domain (500 aa)
initn: 1225 init1: 648 opt: 1254 Z-score: 579.0 bits: 116.7 E(85289): 1.6e-25
Smith-Waterman score: 1292; 45.6% identity (69.7% similar) in 498 aa overlap (1-485:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEKGGNIQLEIPDFSNSVLSHLNQLRMQGRLCDIVVNVQGQAFRAHKVVLAASSPYFRDH
:.... ::...:..:..:::.::.::.::.::::.:..::: :::::.::::::::::::
NP_001 MDSSSFIQFDVPEYSSTVLSQLNELRLQGKLCDIIVHIQGQPFRAHKAVLAASSPYFRDH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 MSLNEMSTVSISVIKNPTVFEQLLSFCYTGRICLQLADIISYLTAASFLQMQHIIDKCTQ
.:. :: .::::::::.:::::::::::::. ::: :..:.:::::::::: .::::::
NP_001 SALSTMSGLSISVIKNPNVFEQLLSFCYTGRMSLQLKDVVSFLTAASFLQMQCVIDKCTQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 ILEGIHFKINVAEVEAELSQTRTKHQERPPESHRVTPNLNRSLSPRHNTPKGNRRG-QVS
:::.:: ::.:..:. . : :. :::. . . . .: . .: .: : .
NP_001 ILESIHSKISVGDVD-----SVTVGAEENPESRNGVKDSSFFANPVEISPPYCSQGRQPT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 AVLDIRELSPPEESTSPQIIEPS-SDVESREPILRINRAGQWYVETGVADRGGRSDDEVR
: :.: . : .. .. : . :: : . . . .: : ..: : .
NP_001 ASSDLRMETTPSKALRSRLQEEGHSDRGSSGSVSEY----EIQIE-GDHEQGDLLVRESQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VLGAVHIKTENLEEWLGPENQPSGEDGSSAEEVTA---MVIDTTGHGSVGQENYTLGSSG
. :..: :. .. ... :.:: .: : . ..... ..::: :. :. ....
NP_001 IT-EVKVKMEKSDRPSCSDSSSLGDDGYHTEMVDGEQVVAVNVGSYGSVLQHAYSYSQAA
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE4 AKVARPTS-SE----VDRFSPSGSVVPLTERHRARSESPGRMDEPKQPSSQVEES---AM
.. ::. :: .. ::: :.. . :::.. . .. .. :. : ::
NP_001 SQ---PTNVSEAFGSLSNSSPSRSMLSCFRGGRARQKRALSVHLHSDLQGLVQGSDSEAM
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 MGVSGYVEYLREQEVSERWFRYNPRLTCIYCAKSFNQKGSLDRHMRLHMGITPFVCRMCG
:. :: ::. . .:. :: :: ::::.::::::::::::::::::::::::..::
NP_001 MNNPGYESSPRERSARGHWYPYNERLICIYCGKSFNQKGSLDRHMRLHMGITPFVCKFCG
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 KKYTRKDQLEYHIRKHTGNKPFHCHVCGKSFPFQAILNQHFRKNHPGCIPLEGPHSISPE
:::::::::::::: :: .:::.:..::: ::::. ::::.:::::: ... . :::
NP_001 KKYTRKDQLEYHIRGHTDDKPFRCEICGKCFPFQGTLNQHLRKNHPGVAEVRS-RIESPE
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500
pF1KE4 TTVTSRGQAEEESPSQEETVAPGEAVQGSVSTTGPD
: . : :.. : :
NP_001 RTDVYVEQKLENDASASEMGLDSRMEIHTVSDAPD
470 480 490 500
>>XP_011517001 (OMIM: 611692) PREDICTED: zinc finger and (504 aa)
initn: 1225 init1: 648 opt: 1254 Z-score: 579.0 bits: 116.7 E(85289): 1.6e-25
Smith-Waterman score: 1292; 45.6% identity (69.7% similar) in 498 aa overlap (1-485:5-487)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEKGGNIQLEIPDFSNSVLSHLNQLRMQGRLCDIVVNVQGQAFRAHKVVLAASSPY
:.... ::...:..:..:::.::.::.::.::::.:..::: :::::.::::::::
XP_011 MSVEMDSSSFIQFDVPEYSSTVLSQLNELRLQGKLCDIIVHIQGQPFRAHKAVLAASSPY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 FRDHMSLNEMSTVSISVIKNPTVFEQLLSFCYTGRICLQLADIISYLTAASFLQMQHIID
:::: .:. :: .::::::::.:::::::::::::. ::: :..:.:::::::::: .::
XP_011 FRDHSALSTMSGLSISVIKNPNVFEQLLSFCYTGRMSLQLKDVVSFLTAASFLQMQCVID
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KCTQILEGIHFKINVAEVEAELSQTRTKHQERPPESHRVTPNLNRSLSPRHNTPKGNRRG
:::::::.:: ::.:..:. . : :. :::. . . . .: . .: .:
XP_011 KCTQILESIHSKISVGDVD-----SVTVGAEENPESRNGVKDSSFFANPVEISPPYCSQG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 -QVSAVLDIRELSPPEESTSPQIIEPS-SDVESREPILRINRAGQWYVETGVADRGGRSD
: .: :.: . : .. .. : . :: : . . . .: : ..:
XP_011 RQPTASSDLRMETTPSKALRSRLQEEGHSDRGSSGSVSEY----EIQIE-GDHEQGDLLV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DEVRVLGAVHIKTENLEEWLGPENQPSGEDGSSAEEVTA---MVIDTTGHGSVGQENYTL
: .. :..: :. .. ... :.:: .: : . ..... ..::: :. :.
XP_011 RESQIT-EVKVKMEKSDRPSCSDSSSLGDDGYHTEMVDGEQVVAVNVGSYGSVLQHAYSY
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE4 GSSGAKVARPTS-SE----VDRFSPSGSVVPLTERHRARSESPGRMDEPKQPSSQVEES-
...... ::. :: .. ::: :.. . :::.. . .. .. :. :
XP_011 SQAASQ---PTNVSEAFGSLSNSSPSRSMLSCFRGGRARQKRALSVHLHSDLQGLVQGSD
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 --AMMGVSGYVEYLREQEVSERWFRYNPRLTCIYCAKSFNQKGSLDRHMRLHMGITPFVC
:::. :: ::. . .:. :: :: ::::.::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEAMMNNPGYESSPRERSARGHWYPYNERLICIYCGKSFNQKGSLDRHMRLHMGITPFVC
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 RMCGKKYTRKDQLEYHIRKHTGNKPFHCHVCGKSFPFQAILNQHFRKNHPGCIPLEGPHS
..:::::::::::::::: :: .:::.:..::: ::::. ::::.:::::: ... .
XP_011 KFCGKKYTRKDQLEYHIRGHTDDKPFRCEICGKCFPFQGTLNQHLRKNHPGVAEVRS-RI
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500
pF1KE4 ISPETTVTSRGQAEEESPSQEETVAPGEAVQGSVSTTGPD
::: : . : :.. : :
XP_011 ESPERTDVYVEQKLENDASASEMGLDSRMEIHTVSDAPD
470 480 490 500
>>XP_005252046 (OMIM: 611692) PREDICTED: zinc finger and (514 aa)
initn: 1225 init1: 648 opt: 1254 Z-score: 578.9 bits: 116.7 E(85289): 1.7e-25
Smith-Waterman score: 1292; 45.6% identity (69.7% similar) in 498 aa overlap (1-485:15-497)
10 20 30 40
pF1KE4 MEKGGNIQLEIPDFSNSVLSHLNQLRMQGRLCDIVVNVQGQAFRAH
:.... ::...:..:..:::.::.::.::.::::.:..::: ::::
XP_005 MEECKSRVRFMSVEMDSSSFIQFDVPEYSSTVLSQLNELRLQGKLCDIIVHIQGQPFRAH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 KVVLAASSPYFRDHMSLNEMSTVSISVIKNPTVFEQLLSFCYTGRICLQLADIISYLTAA
:.:::::::::::: .:. :: .::::::::.:::::::::::::. ::: :..:.::::
XP_005 KAVLAASSPYFRDHSALSTMSGLSISVIKNPNVFEQLLSFCYTGRMSLQLKDVVSFLTAA
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110 120 130 140 150 160
pF1KE4 SFLQMQHIIDKCTQILEGIHFKINVAEVEAELSQTRTKHQERPPESHRVTPNLNRSLSPR
:::::: .:::::::::.:: ::.:..:. . : :. :::. . . . .:
XP_005 SFLQMQCVIDKCTQILESIHSKISVGDVD-----SVTVGAEENPESRNGVKDSSFFANPV
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170 180 190 200 210 220
pF1KE4 HNTPKGNRRG-QVSAVLDIRELSPPEESTSPQIIEPS-SDVESREPILRINRAGQWYVET
. .: .: : .: :.: . : .. .. : . :: : . . . .:
XP_005 EISPPYCSQGRQPTASSDLRMETTPSKALRSRLQEEGHSDRGSSGSVSEY----EIQIE-
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 GVADRGGRSDDEVRVLGAVHIKTENLEEWLGPENQPSGEDGSSAEEVTA---MVIDTTGH
: ..: : .. :..: :. .. ... :.:: .: : . ..... ..
XP_005 GDHEQGDLLVRESQIT-EVKVKMEKSDRPSCSDSSSLGDDGYHTEMVDGEQVVAVNVGSY
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE4 GSVGQENYTLGSSGAKVARPTS-SE----VDRFSPSGSVVPLTERHRARSESPGRMDEPK
::: :. :. ...... ::. :: .. ::: :.. . :::.. . .
XP_005 GSVLQHAYSYSQAASQ---PTNVSEAFGSLSNSSPSRSMLSCFRGGRARQKRALSVHLHS
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 QPSSQVEES---AMMGVSGYVEYLREQEVSERWFRYNPRLTCIYCAKSFNQKGSLDRHMR
. .. :. : :::. :: ::. . .:. :: :: ::::.::::::::::::::
XP_005 DLQGLVQGSDSEAMMNNPGYESSPRERSARGHWYPYNERLICIYCGKSFNQKGSLDRHMR
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pF1KE4 LHMGITPFVCRMCGKKYTRKDQLEYHIRKHTGNKPFHCHVCGKSFPFQAILNQHFRKNHP
::::::::::..:::::::::::::::: :: .:::.:..::: ::::. ::::.:::::
XP_005 LHMGITPFVCKFCGKKYTRKDQLEYHIRGHTDDKPFRCEICGKCFPFQGTLNQHLRKNHP
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460 470 480 490 500
pF1KE4 GCIPLEGPHSISPETTVTSRGQAEEESPSQEETVAPGEAVQGSVSTTGPD
: ... . ::: : . : :.. : :
XP_005 GVAEVRS-RIESPERTDVYVEQKLENDASASEMGLDSRMEIHTVSDAPD
470 480 490 500 510
>>NP_001304919 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB domain (584 aa)
initn: 531 init1: 211 opt: 429 Z-score: 219.1 bits: 50.3 E(85289): 1.8e-05
Smith-Waterman score: 432; 25.1% identity (53.0% similar) in 483 aa overlap (5-459:7-467)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEKGGNIQLEIPDFSNSVLSHLNQLRMQGRLCDIVVNVQGQAFRAHKVVLAASSPYFR
: : . .:: :...:: ::. : :: :::.:. :.:. : .:. :::: : ::.
NP_001 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILVEGREFPTHRSVLAACSQYFK
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pF1KE4 DHMS----LNEMSTVSISVIKNPTVFEQLLSFCYTGRICLQLADIISYLTAASFLQMQHI
.. ...... :. . . .. :..: ::. . .. :.. . :.:: .:.. .
NP_001 KLFTSGAVVDQQNVYEIDFV-SAEALTALMDFAYTATLTVSTANVGDILSAARLLEIPAV
70 80 90 100 110
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pF1KE4 IDKCTQILEGIHFKINVAEVEAELSQTRTKHQERPPESHRVTPNLNRSLS-PRHNTPKGN
:...:. .: .:.. :. .: : . :. :. : : .. : .
NP_001 SHVCADLLDR---QILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRAKEYLEFFQSNPMNSLPPAA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KE4 RRGQVSAVLDI-----RELSPPEESTSPQIIE-------------PSSDVESREPILRIN
. .: . .:. .:... . :. .: : : .
NP_001 AAAAASFPWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGDCNGLDFYGPGPPAE-RPPTGDGD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 RA----GQWYVETGVADRGGRSDDEVRVLGAVHIKTENLEEWLGPENQPSGEDGSSAEEV
.. : : . : :: : : :.: . : :.. .. . .. :
NP_001 EGDSNPGLWPERDEDAPTGGLFPPPV----APPAATQNGHYGRGGEEEAASLSEAAPEPG
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 -TAMVIDTTGHGSVGQENYTLGSSGAKVARPTSSEVDRFSPSGSVVPLTERHRARSESPG
. .. ...: :. . : ... . . : : : .:... .... .:... :
NP_001 DSPGFLSGAAEGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGR---AGAAAGDSDEE-SRADDKG
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 RMDEPKQPSSQVEESAMMGVSGYVEYLREQEVSERWFRYNPRLTCIYCAKSFNQKGSLDR
:: . : ... : : :.: :. .: . : : : .. :.: :
NP_001 VMDYYLKYFSGAHD-------GDVYPAWSQKV-EKKIRAKAFQKCPICEKVIQGAGKLPR
350 360 370 380 390
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pF1KE4 HMRLHMGITPFVCRMCGKKYTRKDQLEYHIRKHTGNKPFHCHVCGKSFPFQAILNQHFRK
:.: : : :. : .: ..::.:.:. :.:::::.::. :. :: .: . :..:.:
NP_001 HIRTHTGEKPYECNICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQQCGAAFAHNYDLKNHMRV
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500
pF1KE4 NHPGCIPLEGPHSISPETTVTSRGQAEEESPSQEETVAPGEAVQGSVSTTGPD
: : : .
NP_001 -HTGLRPYQCDSCCKTFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKPRVRGGAPDPSPGATATP
460 470 480 490 500 510
>>XP_005259628 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger and (584 aa)
initn: 531 init1: 211 opt: 429 Z-score: 219.1 bits: 50.3 E(85289): 1.8e-05
Smith-Waterman score: 432; 25.1% identity (53.0% similar) in 483 aa overlap (5-459:7-467)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEKGGNIQLEIPDFSNSVLSHLNQLRMQGRLCDIVVNVQGQAFRAHKVVLAASSPYFR
: : . .:: :...:: ::. : :: :::.:. :.:. : .:. :::: : ::.
XP_005 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILVEGREFPTHRSVLAACSQYFK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 DHMS----LNEMSTVSISVIKNPTVFEQLLSFCYTGRICLQLADIISYLTAASFLQMQHI
.. ...... :. . . .. :..: ::. . .. :.. . :.:: .:.. .
XP_005 KLFTSGAVVDQQNVYEIDFV-SAEALTALMDFAYTATLTVSTANVGDILSAARLLEIPAV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IDKCTQILEGIHFKINVAEVEAELSQTRTKHQERPPESHRVTPNLNRSLS-PRHNTPKGN
:...:. .: .:.. :. .: : . :. :. : : .. : .
XP_005 SHVCADLLDR---QILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRAKEYLEFFQSNPMNSLPPAA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KE4 RRGQVSAVLDI-----RELSPPEESTSPQIIE-------------PSSDVESREPILRIN
. .: . .:. .:... . :. .: : : .
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180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 RA----GQWYVETGVADRGGRSDDEVRVLGAVHIKTENLEEWLGPENQPSGEDGSSAEEV
.. : : . : :: : : :.: . : :.. .. . .. :
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240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 -TAMVIDTTGHGSVGQENYTLGSSGAKVARPTSSEVDRFSPSGSVVPLTERHRARSESPG
. .. ...: :. . : ... . . : : : .:... .... .:... :
XP_005 DSPGFLSGAAEGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGR---AGAAAGDSDEE-SRADDKG
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:: . : ... : : :.: :. .: . : : : .. :.: :
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pF1KE4 HMRLHMGITPFVCRMCGKKYTRKDQLEYHIRKHTGNKPFHCHVCGKSFPFQAILNQHFRK
:.: : : :. : .: ..::.:.:. :.:::::.::. :. :: .: . :..:.:
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: : : .
XP_005 -HTGLRPYQCDSCCKTFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKPRVRGGAPDPSPGATATP
460 470 480 490 500 510
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10 20 30 40 50
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: : . .:: :...:: ::. : :: :::.:. :.:. : .:. :::: : ::.
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.. ...... :. . . .. :..: ::. . .. :.. . :.:: .:.. .
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:...:. .: .:.. :. .: : . :. :. : : .. : .
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. .: . .:. .:... . :. .: : : .
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.. : : . : :: : : :.: . : :.. .. . .. :
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. .. ...: :. . : ... . . : : : .:... .... .:... :
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:: . : ... : : :.: :. .: . : : : .. :.: :
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:.: : : :. : .: ..::.:.:. :.:::::.::. :. :: .: . :..:.:
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: : : .
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:. :.:. : .:. :::: : ::. .. ...... :. . . .. :..: ::.
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. .. :.. . :.:: .:.. . :...:. .: .:.. :. .: :
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. :. :. : : .. : . . .: . .:. .:... .
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210 220 230 240
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:. .: : : ... : : . : :: : : :
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.: . : :.. .. . .. : . .. ...: :. . : ... . . : :
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: .:... .... .:... : :: . : ... : : :.: :.
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430 440 450 460 470 480
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::. :. :: .: . :..:.: : : : .
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:::...::..: ::: ::.::::..: :: :..: .
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: ....:.. . : :.. .:. . .:::..: .:.:::
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:.. .:. :: : : :: . ..
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. ..:.:. . : .. . ..: . : .. .: :: .. : : : :
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. : . . :.: :. .:. :. :: :: : : .
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.:: . : : . . : :: ..:.:..:. .:: : : .
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: : . : .:.:.:..:. :::. .:... :: : .:.::. : .: :.
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. ::: ::..: ::.:.: .. . .:
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... .:. ....: ::: :.::.:::. .
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:::. ::::..:::::::::.:.. :. :...:. . .: .:: .:. ::::. .
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:::...::..: ::: ::.::::..: :: :..: .
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pF1KE4 --AELSQTRTKHQERPPESHRVTPNLNRSLSPRHNTP---------------KGNRRGQ-
: ....:.. . : :.. .:. . .:::..: .:.:::
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:.. .:. :: : : :: . ..
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. ..:.:. . : .. . ..: . : .. .: :: .. : : : :
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. : . . :.: :. .:. :. :: :: : : .
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.:: . : : . . : :: ..:.:..:. .:: : : .
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NP_001 TGSGDG---NKIFLC-HCGKAFSHKSMRDRHVNMHLNLRPFDCPVCNKKFKMKHHLTEHM
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. ::: ::..: ::.:.: .. . .:
NP_001 KTHTGLKPYECGVCAKKFMWRDSFMRHRGHCERRHRLGGVGAVPGPGTPTGPSLPSKRES
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pF1KE4 MEKGGNIQLEIPDFSNSVLSHLNQLRMQGRLCDIVVNVQGQAFRAHKVVLAASSPYFRDH
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NP_653 MSQMLHIEIPNFGNTVLGCLNEQRLLGLYCDVSIVVKGQAFKAHRAVLAASSLYFRDL
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pF1KE4 MSLNEMSTVSISVIKNPTVFEQLLSFCYTGRICLQLADIISYLTAASFLQMQHIIDKCTQ
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NP_653 FSGNSKSAFELPGSVPPACFQQILSFCYTGRLTMTASEQLVVMYTAGFLQIQHIVERGTD
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.. . : ..: .: :. .. .. : . ..: . .:: : .: .
NP_653 LMFKVSSPHCDSQTAVIEDAGSEPQSPCNQLQPAAAAAAPYV---VSPSVPIPLLTRVKH
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pF1KE4 VSAVLDIRELSPPEESTSPQIIEPSSDVESREPILRINRAGQWYVETGVADRGGRSDDEV
. :: : . .:.
NP_653 -----EAMELPPAGPGLAPKRPLETGPRDGVAVAAGAAVAAGTAPLKLPRVSYYGVPSLA
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503 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]