Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4118
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4118, 496 aa
1>>>pF1KE4118 496 - 496 aa - 496 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3213+/-0.000353; mu= 12.9203+/- 0.022
mean_var=328.2370+/-68.606, 0's: 0 Z-trim(123.7): 1704 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.070791
statistics sampled from 42017 (44096) to 42017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.799), E-opt: 0.2 (0.517), width: 16
Scan time: 12.010
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_116225 (OMIM: 609133) flt3-interacting zinc fin ( 496) 3588 380.2 7.5e-105
XP_005259409 (OMIM: 609133) PREDICTED: flt3-intera ( 496) 3588 380.2 7.5e-105
XP_011525728 (OMIM: 609133) PREDICTED: flt3-intera ( 505) 2854 305.2 2.8e-82
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 657 81.1 1.2e-14
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 657 81.1 1.2e-14
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 657 81.1 1.2e-14
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 657 81.2 1.3e-14
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 657 81.2 1.3e-14
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 620 77.6 2e-13
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 620 77.6 2e-13
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 620 77.6 2e-13
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 620 77.6 2e-13
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 620 77.6 2e-13
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 616 76.8 2e-13
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 599 75.5 8.9e-13
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 599 75.5 8.9e-13
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 599 75.5 9e-13
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 599 75.5 9.1e-13
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 599 75.5 9.1e-13
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 599 75.5 9.2e-13
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 599 75.5 9.3e-13
NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [ ( 671) 584 73.6 2e-12
XP_011525924 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 639) 574 72.5 4e-12
XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 673) 574 72.6 4.1e-12
XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 685) 574 72.6 4.1e-12
XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 718) 574 72.6 4.2e-12
XP_006716717 (OMIM: 194531) PREDICTED: zinc finger ( 590) 554 70.4 1.6e-11
NP_001269726 (OMIM: 194531) zinc finger protein 7 ( 590) 554 70.4 1.6e-11
XP_006716719 (OMIM: 194531) PREDICTED: zinc finger ( 590) 554 70.4 1.6e-11
XP_011515599 (OMIM: 194531) PREDICTED: zinc finger ( 590) 554 70.4 1.6e-11
XP_011515598 (OMIM: 194531) PREDICTED: zinc finger ( 685) 554 70.5 1.7e-11
XP_011515597 (OMIM: 194531) PREDICTED: zinc finger ( 685) 554 70.5 1.7e-11
XP_011515596 (OMIM: 194531) PREDICTED: zinc finger ( 686) 554 70.5 1.7e-11
NP_003407 (OMIM: 194531) zinc finger protein 7 iso ( 686) 554 70.5 1.7e-11
XP_011515595 (OMIM: 194531) PREDICTED: zinc finger ( 686) 554 70.5 1.7e-11
NP_001269724 (OMIM: 194531) zinc finger protein 7 ( 697) 554 70.5 1.7e-11
XP_011515594 (OMIM: 194531) PREDICTED: zinc finger ( 697) 554 70.5 1.7e-11
XP_016869302 (OMIM: 194531) PREDICTED: zinc finger ( 702) 554 70.6 1.7e-11
>>NP_116225 (OMIM: 609133) flt3-interacting zinc finger (496 aa)
initn: 3588 init1: 3588 opt: 3588 Z-score: 2003.4 bits: 380.2 E(85289): 7.5e-105
Smith-Waterman score: 3588; 99.8% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPHACPRCGKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPHACPRCGKGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCELRFSSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 KHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCELRFSSRS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGGEGPEGAGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 SLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGGEGPEGAGAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 LGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 ALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 GVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCDCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 GVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCDCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEEAAAAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECE
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 GHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEEAATAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 KLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFI
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 TLSNLSRHLKLHRGMD
::::::::::::::::
NP_116 TLSNLSRHLKLHRGMD
490
>>XP_005259409 (OMIM: 609133) PREDICTED: flt3-interactin (496 aa)
initn: 3588 init1: 3588 opt: 3588 Z-score: 2003.4 bits: 380.2 E(85289): 7.5e-105
Smith-Waterman score: 3588; 99.8% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPHACPRCGKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPHACPRCGKGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCELRFSSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCELRFSSRS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGGEGPEGAGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGGEGPEGAGAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 GVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCDCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCDCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEEAAAAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECE
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEEAATAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFI
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 TLSNLSRHLKLHRGMD
::::::::::::::::
XP_005 TLSNLSRHLKLHRGMD
490
>>XP_011525728 (OMIM: 609133) PREDICTED: flt3-interactin (505 aa)
initn: 2854 init1: 2854 opt: 2854 Z-score: 1598.1 bits: 305.2 E(85289): 2.8e-82
Smith-Waterman score: 2854; 99.7% identity (100.0% similar) in 398 aa overlap (99-496:108-505)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCELRFSSRSSLGRHLKR
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WRKANVTGAWRSRKCGSGEVWRVPDPGNTAVVHTGEKPYCCLVCELRFSSRSSLGRHLKR
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGGEGPEGAGAGLGSWGLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGGEGPEGAGAGLGSWGLAE
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAPALLERHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAPALLERHKL
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 THDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGGGVPKLGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGGGVPKLGGL
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCDCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGCGHCGALYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCDCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGCGHCGALYA
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 ALAALEEHRRVSHGEGGGEEAAAAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECEKLFRSPRD
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALAALEEHRRVSHGEGGGEEAATAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECEKLFRSPRD
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRH
440 450 460 470 480 490
490
pF1KE4 LKLHRGMD
::::::::
XP_011 LKLHRGMD
500
>>NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
initn: 728 init1: 372 opt: 657 Z-score: 383.7 bits: 81.1 E(85289): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 820; 30.4% identity (50.9% similar) in 503 aa overlap (25-494:251-749)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPHACP
::::::.: ::.: : . ::. ::. :
NP_001 YKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCH
230 240 250 260 270 280
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCEL
.::: :.:. ::.: : ::::.::.:. : :.:: ..: ::..::::::. : :
NP_001 ECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGK
290 300 310 320 330 340
120 130 140 150 160
pF1KE4 RFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQP-GPGLP---ALSAPCSVCCNVGP--CSVCG----
:.. : : : : : : : . : .. .:. .. . : :. ::
NP_001 LFTQNSHLISHW-RIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFR
350 360 370 380 390
170 180 190 200 210
pF1KE4 -GSGAG------GGEGPEGAGAGLGSWGLAEAAAAAAA---SLPPFACGACARRFDHGRE
.: : :: : . .... :. . . :: :. :.. : .. .
NP_001 YNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQ
400 410 420 430 440 450
220 230 240 250 260
pF1KE4 LAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAPALLERHKLTHDLQGP------GAPPAQA------
:: : :: ::.:: .: . :.. . : :. :. . : : .:
NP_001 LANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSH
460 470 480 490 500 510
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 WAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAA
. : : .: . : . :: :. : : . . ..
NP_001 RGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSD---RSSLTFHQ
520 530 540 550 560 570
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 AEPSEDTLYQC-DCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSH
: . . :.: .:: : . ::.: . :.: : :..:: .. . : :. .
NP_001 AIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHT
580 590 600 610 620 630
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 GEGGGEEAAAAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHTGEKP
:: . . . . . . :.: . :.:: : : .: : .:::.::
NP_001 GEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKP
640 650 660 670 680 690
450 460 470 480 490
pF1KE4 FPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD
. : :::: : .. .: :: .: :.:. : :::.: . :.:. :. .: :
NP_001 YKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCN
700 710 720 730 740 750
NP_001 ECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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