Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4113
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4113, 485 aa
1>>>pF1KE4113 485 - 485 aa - 485 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0109+/-0.00097; mu= 4.6336+/- 0.060
mean_var=243.3142+/-49.409, 0's: 0 Z-trim(113.9): 66 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.082222
statistics sampled from 14447 (14512) to 14447 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.446), width: 16
Scan time: 3.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 ( 485) 3231 395.9 4.9e-110
CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 461) 2324 288.3 1.2e-77
CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 522) 2324 288.4 1.3e-77
CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 ( 525) 1357 173.7 4.3e-43
CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 482) 1305 167.5 2.9e-41
CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 385) 998 131.0 2.3e-30
>>CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 (485 aa)
initn: 3231 init1: 3231 opt: 3231 Z-score: 2089.0 bits: 395.9 E(32554): 4.9e-110
Smith-Waterman score: 3231; 100.0% identity (100.0% similar) in 485 aa overlap (1-485:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LIFYA
:::::
CCDS10 LIFYA
>>CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 (461 aa)
initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 1507.8 bits: 288.3 E(32554): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 2324; 75.8% identity (89.9% similar) in 455 aa overlap (31-485:7-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
::. :. . . .:: .:
CCDS13 MAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL
.:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.:
CCDS13 NWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGEL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
:: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::
CCDS13 AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.
CCDS13 TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
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CCDS13 LNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
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CCDS13 GVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
:::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.
CCDS13 QFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEY
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
:::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
CCDS13 PVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LIFYA
:::::
CCDS13 LIFYA
460
>>CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 (522 aa)
initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 1507.1 bits: 288.4 E(32554): 1.3e-77
Smith-Waterman score: 2324; 75.8% identity (89.9% similar) in 455 aa overlap (31-485:68-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
::. :. . . .:: .:
CCDS13 SSSNSSKLPPVCYEIITLKTKKKKMAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL
.:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.:
CCDS13 NWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGEL
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
:: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::
CCDS13 AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.
CCDS13 TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
::.:: :::::.:::::.::.:: : .. .:::.:::.::::.:::::.:..::::::::
CCDS13 LNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQS
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
.:::.::..:::::::..::.:.: ::::.::::::::: ::::::::::::::::
CCDS13 GVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSI
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
:::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.
CCDS13 QFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEY
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
:::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
CCDS13 PVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 LIFYA
:::::
CCDS13 LIFYA
520
>>CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 (525 aa)
initn: 1264 init1: 978 opt: 1357 Z-score: 887.1 bits: 173.7 E(32554): 4.3e-43
Smith-Waterman score: 1372; 45.1% identity (72.3% similar) in 501 aa overlap (8-484:28-524)
10 20 30 40
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAP
:.. ::: : .::.::.. :. . :. :
CCDS12 MAAGGSGGRASCPPGVGVGPGTGGSPGPSANAAATPAPGNAAAAAAAAAAAAAAPGPTPP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KE4 APPPPAPAPPTLGNNHQE---SPG-----------WRCCRPTLRERNALMFNNELMADVH
::: :. . : .. : .:: :. .::..:: :..::::.. :::
CCDS12 APPGPGTDAQAAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVH
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 FVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYS
:.:: ... .:::..::::::.:: ::: : .: ...::..::::::::: :::..::
CCDS12 FLVGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYS
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 DEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQR
::... .::..:::.:::: :::: ::.::. .:.: :: .::.:.:::.::.:..
CCDS12 DEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASL
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 CWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLP
: : :: .. :. .::: .:: .:: .. :..:. .:. .:.::. :.::::.:: :
CCDS12 CLENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQ
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFP
.::.:.:.:::.:: :.:.: ::.:::: : ::: ::. .:. :.:: .:.. :::..:
CCDS12 VTPENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFI
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 LTKRKGLAPQRC--HRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAE
: : ..: .:::. : : : : : :.:.:..:.:..:.::::: : ..
CCDS12 DRPRCCLRGKECSINRFQQVESR---WGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTD
370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 YSVKIELKRL--GVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELS
:.:.:.. . ..::.:: : : :::..:: : :..::.: .. ::: :.: : . :
CCDS12 YQVNIQIIHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPD-S
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480
pF1KE4 YFGQEGMTEVQC------GKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
..: .:. .: .:. : : .. ..:::.:. :::::.:::
CCDS12 HYGTKGLRKVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
480 490 500 510 520
>>CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (482 aa)
initn: 1274 init1: 790 opt: 1305 Z-score: 854.3 bits: 167.5 E(32554): 2.9e-41
Smith-Waterman score: 1312; 44.7% identity (72.6% similar) in 481 aa overlap (23-484:7-481)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGN--NHQE
::.:..:. . . :.:: ::: :.: .:: :.
CCDS10 MASLGPAAAGEQAS--GAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 SP--GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGP------PGATRTVPAHKYVLAVGSS
: .:. . .:.:: :..::.::..::.::.: :. . .:::..:::.::.
CCDS10 EPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPA
:: ::: : .: ...::..::::::::: ::...::::... .::..:::.:::: :::
CCDS10 VFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQ
: ::.:: :.: :: .::.:.:::.::.:.. : ..:: .. :. .::: .:: .
CCDS10 LEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDID
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTL
:: .. :..:. .:. .: ::. ::::::.:: ::.: ::..:::.:: :.:.: ::.
CCDS10 TLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE4 EEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRC--HRFQSSAYRS
:::: : ::: ::. .:. ..:: .:.. :::... : : ..: .:::. :
CCDS10 EEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESR-
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 NQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRL--GVVLAQNLTKFM
: : : : :.:.:.::. :.:.::::: : ..:.:.:.. . .:.:: : :
CCDS10 --WGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFS
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 SDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEV-----QCGKVAFQF
::..::: : :..:... .. ::: :.: : . :..: .:. .: .:..: :
CCDS10 CDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACATLKGPD-SHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFF
400 410 420 430 440 450
470 480
pF1KE4 QCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
: ..:::... :::::.:::
CCDS10 FSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
460 470 480
>>CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (385 aa)
initn: 1053 init1: 790 opt: 998 Z-score: 658.7 bits: 131.0 E(32554): 2.3e-30
Smith-Waterman score: 1005; 46.2% identity (73.2% similar) in 351 aa overlap (23-361:7-352)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGN--NHQE
::.:..:. . . :.:: ::: :.: .:: :.
CCDS32 MASLGPAAAGEQAS--GAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 SP--GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGP------PGATRTVPAHKYVLAVGSS
: .:. . .:.:: :..::.::..::.::.: :. . .:::..:::.::.
CCDS32 EPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPA
:: ::: : .: ...::..::::::::: ::...::::... .::..:::.:::: :::
CCDS32 VFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQ
: ::.:: :.: :: .::.:.:::.::.:.. : ..:: .. :. .::: .:: .
CCDS32 LEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDID
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTL
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