Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4110
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4110, 481 aa
1>>>pF1KE4110 481 - 481 aa - 481 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6855+/-0.00113; mu= 7.6685+/- 0.067
mean_var=183.0241+/-39.131, 0's: 0 Z-trim(109.3): 150 B-trim: 410 in 1/51
Lambda= 0.094803
statistics sampled from 10598 (10762) to 10598 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 3287 462.3 5.2e-130
CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 2536 359.5 3.8e-99
CCDS4677.1 TRIM15 gene_id:89870|Hs108|chr6 ( 465) 1190 175.5 1.1e-43
CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 905 136.5 6.7e-32
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 808 123.2 6.1e-28
CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 511) 754 115.9 1.1e-25
CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 748 115.0 1.8e-25
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 746 114.8 2.3e-25
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 704 109.0 1.2e-23
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 704 109.0 1.2e-23
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 692 107.4 3.7e-23
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 692 107.4 3.8e-23
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 630 98.9 1.3e-20
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 618 97.3 4.3e-20
CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 619 97.5 4.5e-20
CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 518) 613 96.6 6.9e-20
CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 600 94.7 2e-19
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 579 91.9 1.7e-18
CCDS43414.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 329) 572 90.8 2.4e-18
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 572 90.9 3.2e-18
CCDS4463.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 303) 561 89.3 6.4e-18
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 541 86.7 6.1e-17
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 540 86.6 6.4e-17
CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 534 85.6 8.8e-17
CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 534 85.6 9.2e-17
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 536 86.0 9.4e-17
CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 536 86.0 9.5e-17
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 534 85.7 1.2e-16
CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 536 86.2 1.4e-16
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 529 85.1 1.8e-16
CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 460 75.6 1.3e-13
CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 446 73.6 3.8e-13
CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 448 74.0 4.1e-13
CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 341) 444 73.3 4.6e-13
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 446 73.7 4.8e-13
CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 431 71.6 1.9e-12
CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 296) 424 70.5 2.8e-12
CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 411 68.9 1.3e-11
CCDS5679.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 500) 404 68.0 2.7e-11
CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 401 67.5 3.3e-11
>>CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 (481 aa)
initn: 3287 init1: 3287 opt: 3287 Z-score: 2447.5 bits: 462.3 E(32554): 5.2e-130
Smith-Waterman score: 3287; 100.0% identity (100.0% similar) in 481 aa overlap (1-481:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 CREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEELE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLEK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDRATCVLAHTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDRATCVLAHTGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRLAWGFVSALGSFPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRLAWGFVSALGSFPT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 RLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTASFTRKVIPFFGLWGRGSSFSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTASFTRKVIPFFGLWGRGSSFSLS
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 S
:
CCDS34 S
>>CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 (395 aa)
initn: 2534 init1: 2534 opt: 2536 Z-score: 1893.5 bits: 359.5 E(32554): 3.8e-99
Smith-Waterman score: 2536; 97.4% identity (98.2% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 CREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEELE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLEK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDRATCVLAHTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDRATCVLAHTGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRLAWGFVSALGSFPT
:::::::: . ..:
CCDS46 TGGRHTWVWMARVPGDSGCCQFCSPPSVLGTEVAA
370 380 390
>>CCDS4677.1 TRIM15 gene_id:89870|Hs108|chr6 (465 aa)
initn: 1376 init1: 1190 opt: 1190 Z-score: 897.7 bits: 175.5 E(32554): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 1308; 43.1% identity (69.4% similar) in 480 aa overlap (1-479:1-463)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC
: .. :. . . : .: : :.. ::: :::.::: :: .. . . . ::::
CCDS46 MPATPSLKVVHELPACTLCAGPLEDAVTIPCGHTFCRLCLPALSQMGAQSSGKILLCPLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLG-LGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCV
.: :. : . :: ::: :.:::::::::::.: :::
CCDS46 QEE----------------EQAETPMAPVPLGPLGET-YCEEHGEKIYFFCENDAEFLCV
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVS
:::. : .::. ::..: :::..... :. : ::.::.... .:....::::::.
CCDS46 FCREGPTHQAHTVGFLDEAIQPYRDRLRSRLEALSTERDEIEDVKCQEDQKLQVLLTQIE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 TKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEEL
.:..:: . : .:.. ::.:. .:::.:. . .: ..:::. :. :. :..: ..::
CCDS46 SKKHQVETAFERLQQELEQQRCLLLARLRELEQQIWKERDEYITKVSEEVTRLGAQVKEL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 EEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLE
::: ..:: ::: :.: . ::: . .: :.::.: ..:::: .. : : . :.:: :
CCDS46 EEKCQQPASELLQDVRVNQSRCEMKTFVSPEAISPDLVKKIRDFHRKILTLPEMMRMFSE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 KLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDRATCVLAHTG
.: .:. . . :.:::::. .:.::::.. .... . .. ::.: ::: ::. :
CCDS46 NLAHHLEIDSGVITLDPQTASRSLVLSEDRKSVRYTRQKKSLPDSPLRFDGLPAVLGFPG
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 ITGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRLAWGFVSALGSFP
...::: : :...:. ::.:::::..: :.::::. : :.::::: .. : :
CCDS46 FSSGRHRWQVDLQLGDGGGCTVGVAGEGVRRKGEMGLSAEDGVWAVIISHQQCWASTSPG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 TRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTASFTRKVIPFFGLWGRGSSFSL
: : :.: :: :::.::::.: ::. :: :.:::.::::::. ::.:::..: .:: ..:
CCDS46 TDLPLSEIPRGVRVALDYEAGQVTLHNAQTQEPIFTFTASFSGKVFPFFAVWKKGSCLTL
410 420 430 440 450 460
480
pF1KE4 SS
CCDS46 KG
>>CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 (539 aa)
initn: 1225 init1: 549 opt: 905 Z-score: 686.2 bits: 136.5 E(32554): 6.7e-32
Smith-Waterman score: 1044; 37.0% identity (60.5% similar) in 522 aa overlap (1-458:1-516)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC
::..: . :: .::.: :: ::.:::::::: :::.: : : : :.::::
CCDS46 MATSAPLRSLEEEVTCSICLDYLRDPVTIDCGHVFCRSCTTDVRPISGS----RPVCPLC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE4 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGE-----ED--VCQEHGEKIYFFCEDD
:.::. ..:: ::::..:::::::.. . :: .: .:..: ::....::::
CCDS46 KKPFKKENIRPVWQLASLVENIERLKVDKGRQPGEVTREQQDAKLCERHREKLHYYCEDD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 EMQLCVVCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQV
:::.:::. :: :: ..: :: :.::.: . :. ::..:..:: .:.. . . .
CCDS46 GKLLCVMCRESREHRPHTAVLMEKAAQPHREKILNHLSTLRRDRDKIQGFQAKGEADILA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LLTQVSTKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFS
: ... .:: ...:: . ..::.:.. :: :: . . .. . :..: .::. :..
CCDS46 ALKKLQDQRQYIVAEFEQGHQFLREREEHLLEQLAKLEQELTEGREKFKSRGVGELARLA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRK--CRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQ
.: ::: : ..:: ::. : :. : : .: ::.: . .. .: .. : ::
CCDS46 LVISELEGKAQQPAAELMQDTRDFLNRYPRKKFWVGKPIARV--VKKKTGEFSDKLLSLQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 REMKMFLEKLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDRA
: .. : :: .:.:. . ..::::.. : :::: . . .. .... .::.::
CCDS46 RGLREFQGKLLRDLEYKTVSVTLDPQSASGYLQLSEDWKCVTYTSLYKSAYLHPQQFDCE
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KE4 TCVLAHTGITGGRHTWVVSI-------DLAHGG---------------------------
::. :.: :. : : . : .:
CCDS46 PGVLGSKGFTWGKVYWEVEVEREGWSEDEEEGDEEEEGEEEEEEEEAGYGDGYDDWETDE
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410
pF1KE4 ---------------------SCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRLAWGFVSALG
:: :::. ..:.:::.: ::::.::::.::. . . :
CCDS46 DEESLGDEEEEEEEEEEEVLESCMVGVARDSVKRKGDLSLRPEDGVWALRLSSSGIWANT
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTASFTRKVIPFFGLWGRGSS
: ..: .::.: ..:::: : :::::: ..: ::::::
CCDS46 SPEAELFPALRPRRVGIALDYEGGTVTFTNAESQELIYTFTATFTRRLVPFLWLKWPGTR
480 490 500 510 520 530
480
pF1KE4 FSLSS
CCDS46 LLLRP
>>CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 (485 aa)
initn: 918 init1: 358 opt: 808 Z-score: 615.1 bits: 123.2 E(32554): 6.1e-28
Smith-Waterman score: 978; 34.6% identity (65.0% similar) in 486 aa overlap (1-468:1-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC
: .: : ....:: ::::. ::::..:::::.::..::. :::: . . . :::::
CCDS31 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVV
. : .: ..:::::::::::... :.: .:: . :.:..::::. .::..: . .: .
CCDS31 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGL-KGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEA
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 CREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVST
: .. :: .:.. .::.: :. ..:. :. :.::.:: ... : :: . :: :
CCDS31 CSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVET
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE4 KRQQVISEFAHLRKFLEEQQ----------SILLAQLESQDGDILRQRDEFD---LLVAG
..:... :: . ...::..: . ::.:. . .. . :. :.. :. .
CCDS31 RKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETM-QKLELNHSELIQQS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EICRFSALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQA
.. . .: ::.:...::.: .: ::. .: : .. . ..: .: :: : .
CCDS31 QV--LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCR-----V
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LPLQREMKMFLEKLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQR
: :.. .: . : . :::.:.. .:..:::..:.... :. ::::.:
CCDS31 LGLREILKTY-----------AADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPER
300 310 320 330 340
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: : . ::. :..::: : : . : .. : .:: ...:.:: . : :. : :..:
CCDS31 FYRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWG---LGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIR
350 360 370 380 390
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pF1KE4 LAWG--FVSALGSFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVT-REPIYTFTA-SFTR
: : . .. .: :.: ::.: . .:::. ..: :.. :.:: :
CCDS31 LRKGNEYRAGTDEYPI-LSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPG
400 410 420 430 440 450
470 480
pF1KE4 KVIPFFGLWGRGSSFSLSS
...:.:
CCDS31 RLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED
460 470 480
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10 20 30 40
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: .. : :..: :: .::::...:::.:::::. : : :
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10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
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: ..: :: :.:: ::...::: ::: :. ..:..: .. . ::.
CCDS44 GAGSVGAATRAPPFPLPCPQCREPARPSQLRPNRQLAAVATLLRRFSLPAA-APGEHGSQ
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100 110 120 130 140
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: .::: . ..:.:: .:::: .: :: :.. :..:. .: ...
CCDS44 AAAARAAAARCGQHGEPFKLYCQDDGRAICVVCDRAREHREHAVLPLDEAVQEAKELLES
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVSTKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLE
:. :.:: :. . ..: :.:. . :: :.......: .:: :: :: ::.. ::..::
CCDS44 RLRVLKKELEDCEVFRSTEKKESKELLKQMAAEQEKVGAEFQALRAFLVEQEGRLLGRLE
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
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. .. ....: .. :: ..: : ...: ..: ..: ...::: :: . :
CCDS44 ELSREVAQKQNENLAQLGVEITQLSKLSSQIQETAQKPDLDFLQEFKSTLSRCSNVPGPK
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270 280 290 300 310 320
pF1KE4 PVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLEKLCFELDYEP-AHISLDPQTSHPKLLLSE
:..:: :. ... . ... :. .: : : : ::. : ....:::.:..:.:.::
CCDS44 PTTVSSEMKNKVWNVSLKTFVLKGMLKKFKEDLRGELEKEEKVELTLDPDTANPRLILSL
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330 340 350 360 370 380
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: . .... . :. :..: ::: : ::: :...::: : : . : . ::. :.
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390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VQRKGELRLRPEEGVWAVRLAWGFVSALGSFPTRLTLKE-QPRQVRVSLDYEVGWVTFTN
:.::: . :::::::..: : :. : : : :. . .:::.:: ::: :.:
CCDS44 VRRKGLTPFTPEEGVWALQLNGGQYWAVTS-PERSPLSCGHLSRVRVALDLEVGAVSFYA
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450 460 470 480
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. . .::: ..: ..:.:.:.. . :.
CCDS44 VEDMRHLYTFRVNFQERVFPLFSVCSTGTYLRIWP
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10 20 30 40 50
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. .:..:::: ...::.:.:::::::.:: : . :: : ::
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10 20 30 40 50
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::::. :: ::.: ...: :::.. : . : . ......:. : : ...
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..:... .::..:..:: :.....: .:.... . .. .: : . : .. :: :.
CCDS56 SQRMRISTEFSKLHNFLVEEEDLFLQRLNKEEEETKKKLNENTLKLNQTIASLKKLILEV
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::.. :. ::: . . .: : : . : : : . ... : .::..:: :.
CCDS56 GEKSQAPTLELLQNPKEVLTRSEI----QDVNYSLE-AVKVKTVCQ--IPLMKEM---LK
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. :.. ..: .:.::::..:.. . .. :: :. :::
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::.. :::... .:.:.: : .. . .::: :::. . .. :.
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: . .. ::: :
CCDS56 SSVSRLRPFFWLSPLASLVIPPVTDRK
450 460 470
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:: .. :: :.. ::.:. ..:::.. : :.. .. .. ... .. ::. ..
CCDS46 VCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQ
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.:.... :: .: . :.:.. :::.:: : : . . . .: ..:.:: .:
CCDS46 MEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSSLIAQL
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:::...:.:::: :: .:: : : . .: . :.: ..:. : :. : : . .:.: :
CCDS46 EEKQQQPTRELLQDIGDTLSRAERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTE
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CCDS46 KMQSDMEKIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLPDNPERFNL
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:::. . .::: : .... .. :.:: ..: ::: . :..: ::: :
CCDS46 FPCVLGSPCFIAGRHYW--EVEVGDKAKWTIGVCEDSVCRKGGVTSAPQNGFWAVSLWYG
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pF1KE4 --AWGFVSALGSFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFT-ASFTRKV
:...: . ..: : :. .: . :::..: :.: :.. : .::. :.: :
CCDS46 KEYWALTSPMTALPLRTPLQ----RVGIFLDYDAGEVSFYNVTERCHTFTFSHATFCGPV
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 IPFFGLWGRGSSFSLSS
:.:.:
CCDS46 RPYFSLSYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSP
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.:: .:. .:..: . : .::. :.::. :.:...:::. :... .:: . .: :
CCDS34 LFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSE
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.:. : : ..:::.. :: .:.. :.:.:..::..:: .. ::: :: . . :
CCDS34 EKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDIL-QRLRENAAHLG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EICR-FSALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQ
. : .. : :.: : . . :.: :..::: .:: : . ..:: :: . . .::.:
CCDS34 DKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQ
240 250 260 270 280 290
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. :.. .:... : ..:::.:.::.:.::::.. ..: . .. ::.:
CCDS34 YFALRKILKQLI-----------ADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTP
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.:: :::: :.:.::: : : . : .: . ::: ..:.::::: :: : :
CCDS34 RRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWA---VGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWR
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pF1KE4 VRLAWGFVSALGSFP-TRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTASFTRK
::: : : . : : : .: .:..: . ::::.: ..: :.. : ::::: .::.:
CCDS34 VRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEK
410 420 430 440 450 460
470 480
pF1KE4 VIPFFGLWGRGSSFSLSS
. :.:
CCDS34 LWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
470 480
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pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIP
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CCDS78 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWE--
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.:: .:. .:..: . : .::. :.::. :.:...:::. :... .:: . .: :
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CCDS78 EKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDIL-QRLRENAAHLG
180 190 200 210 220 230
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pF1KE4 EICR-FSALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQ
. : .. : :.: : . . :.: :..::: .:: : . ..:: :: . . .::.:
CCDS78 DKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQ
240 250 260 270 280 290
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. :.. .:... : ..:::.:.::.:.::::.. ..: . .. ::.:
CCDS78 YFALRKILKQLI-----------ADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTP
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pF1KE4 QRFDRATCVLAHTGITGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAV
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CCDS78 RRFTFYPCVLATEGFTSGRHYW--EVEAAH---C---VLAQDPENQALARFYCYTERTIA
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pF1KE4 RLAWGFVSALGSFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTASFTRKVI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]