Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4109
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4109, 479 aa
1>>>pF1KE4109 479 - 479 aa - 479 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9126+/-0.000396; mu= -6.3324+/- 0.025
mean_var=343.8696+/-70.353, 0's: 0 Z-trim(122.6): 45 B-trim: 0 in 0/62
Lambda= 0.069164
statistics sampled from 41024 (41070) to 41024 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.771), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16
Scan time: 8.910
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_699181 (OMIM: 609082) F-box/LRR-repeat protein ( 479) 3246 337.5 4.9e-92
NP_116264 (OMIM: 609086) F-box/LRR-repeat protein ( 436) 445 58.0 6.3e-08
XP_005257803 (OMIM: 609086) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 473) 445 58.0 6.7e-08
NP_001171835 (OMIM: 609086) F-box/LRR-repeat prote ( 404) 413 54.8 5.4e-07
XP_005257804 (OMIM: 609086) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 441) 413 54.8 5.8e-07
XP_016861583 (OMIM: 605652) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 318) 362 49.6 1.5e-05
XP_005265074 (OMIM: 605652) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 318) 362 49.6 1.5e-05
XP_016874365 (OMIM: 609081) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 387) 357 49.2 2.5e-05
XP_016874364 (OMIM: 609081) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 404) 357 49.2 2.6e-05
NP_689654 (OMIM: 609081) F-box/LRR-repeat protein ( 418) 357 49.2 2.7e-05
NP_036289 (OMIM: 605652) F-box/LRR-repeat protein ( 423) 349 48.4 4.7e-05
XP_005265071 (OMIM: 605652) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 454) 349 48.4 5e-05
NP_001165184 (OMIM: 605652) F-box/LRR-repeat prote ( 355) 321 45.5 0.00029
XP_006715961 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 584) 317 45.3 0.00055
XP_005250266 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 735) 317 45.4 0.00065
XP_016867342 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 735) 317 45.4 0.00065
XP_011514232 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 735) 317 45.4 0.00065
NP_659469 (OMIM: 609080) F-box/LRR-repeat protein ( 735) 317 45.4 0.00065
XP_016867341 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 780) 317 45.4 0.00068
XP_005250264 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 792) 317 45.4 0.00069
XP_016867339 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 822) 317 45.4 0.00071
XP_005250262 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 825) 317 45.4 0.00071
XP_016867340 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 809) 310 44.7 0.0011
XP_011514231 (OMIM: 609080) PREDICTED: F-box/LRR-r ( 783) 303 44.0 0.0018
>>NP_699181 (OMIM: 609082) F-box/LRR-repeat protein 16 [ (479 aa)
initn: 3246 init1: 3246 opt: 3246 Z-score: 1773.3 bits: 337.5 E(85289): 4.9e-92
Smith-Waterman score: 3246; 100.0% identity (100.0% similar) in 479 aa overlap (1-479:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSSPGIDGDPKPPCLPRNGLVKLPGQPNGLGAASITKGTPATKNRPCQPPPPPTLPPPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 MSSPGIDGDPKPPCLPRNGLVKLPGQPNGLGAASITKGTPATKNRPCQPPPPPTLPPPSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AAPLSRAALAGGPCTPAGGPASALAPGHPAERPPLATDEKILNGLFWYFSACEKCVLAQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 AAPLSRAALAGGPCTPAGGPASALAPGHPAERPPLATDEKILNGLFWYFSACEKCVLAQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 CKAWRRVLYQPKFWAGLTPVLHAKELYNVLPGGEKEFVNLQGFAARGFEGFCLVGVSDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 CKAWRRVLYQPKFWAGLTPVLHAKELYNVLPGGEKEFVNLQGFAARGFEGFCLVGVSDLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ICEFIDNYALSKKGVKAMSLKRSTITDAGLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAGLWSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 ICEFIDNYALSKKGVKAMSLKRSTITDAGLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAGLWSSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SARITSLSVSDCINVADDAIAAISQLLPNLAELSLQAYHVTDTALAYFTARQGHSTHTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 SARITSLSVSDCINVADDAIAAISQLLPNLAELSLQAYHVTDTALAYFTARQGHSTHTLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LLSCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAENLRKLRSLDLSWCPRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 LLSCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAENLRKLRSLDLSWCPRIT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 DMALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYLSTMSSLRSLYLRWCCQVQDFGLKHLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 DMALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYLSTMSSLRSLYLRWCCQVQDFGLKHLLA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 LGSLRLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCLVIE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 LGSLRLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCLVIE
430 440 450 460 470
>>NP_116264 (OMIM: 609086) F-box/LRR-repeat protein 20 i (436 aa)
initn: 410 init1: 227 opt: 445 Z-score: 263.3 bits: 58.0 E(85289): 6.3e-08
Smith-Waterman score: 445; 28.4% identity (60.7% similar) in 387 aa overlap (99-473:30-405)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LAGGPCTPAGGPASALAPGHPAERPPLATDEKILNGLFWYFSACEKCVLAQVCKAWRRVL
...: .: .... : ::: .:: .
NP_116 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLA
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YQPKFWAGLTPVLHAKELYN-VLPGGEKEFVN-LQGFAARGFEGFCLVGVSDLDICEFID
. . : . ... . :. . :. . :. .. :: :: ::.: . : .
NP_116 LDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRG----CL-GVGDNALRTFAQ
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NYALSKKGVKAMSLKRSTITDAGLEVMLEQMQGVVR-LELSGCNDFTEAGLWSSLSAR--
: .......:. : : . . : .. . .: :.:..:...:. .: ..::
NP_116 N----CRNIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSL-KALSEGCP
120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 -ITSLSVSDCINVADDAIAAISQLLPNLAELSLQA-YHVTDTALAYFTARQGHSTHTLRL
. .:..: : .:. :.: :. . .: : :.. .. : :: :. :. . . :: :
NP_116 LLEQLNISWCDQVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELV-TLNL
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LSCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAENLRKLRSLDLSWCPRITD
.: .::..:.... .. .: .: ::::..:: .. ...: .:: :... : ..::
NP_116 QTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTD
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410
pF1KE4 MALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYLSTMSS-LRSLYLRWCCQVQDFGLKHL--
... .: . :.::.. :..::.:::. : :: :. : : : . : :..::
NP_116 VGFTTLARNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGN
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 --LALGSLRLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCL
: .:... : .:::.: ..: : . . ::..:: .: : .: . :::
NP_116 GACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIK
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 VIE
NP_116 VHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
410 420 430
>>XP_005257803 (OMIM: 609086) PREDICTED: F-box/LRR-repea (473 aa)
initn: 410 init1: 227 opt: 445 Z-score: 262.8 bits: 58.0 E(85289): 6.7e-08
Smith-Waterman score: 445; 28.4% identity (60.7% similar) in 387 aa overlap (99-473:67-442)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LAGGPCTPAGGPASALAPGHPAERPPLATDEKILNGLFWYFSACEKCVLAQVCKAWRRVL
...: .: .... : ::: .:: .
XP_005 APSRDRLLHFGFKATMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YQPKFWAGLTPVLHAKELYN-VLPGGEKEFVN-LQGFAARGFEGFCLVGVSDLDICEFID
. . : . ... . :. . :. . :. .. :: :: ::.: . : .
XP_005 LDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRG----CL-GVGDNALRTFAQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NYALSKKGVKAMSLKRSTITDAGLEVMLEQMQGVVR-LELSGCNDFTEAGLWSSLSAR--
: .......:. : : . . : .. . .: :.:..:...:. .: ..::
XP_005 N----CRNIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSL-KALSEGCP
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 -ITSLSVSDCINVADDAIAAISQLLPNLAELSLQA-YHVTDTALAYFTARQGHSTHTLRL
. .:..: : .:. :.: :. . .: : :.. .. : :: :. :. . . :: :
XP_005 LLEQLNISWCDQVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELV-TLNL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LSCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAENLRKLRSLDLSWCPRITD
.: .::..:.... .. .: .: ::::..:: .. ...: .:: :... : ..::
XP_005 QTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTD
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KE4 MALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYLSTMSS-LRSLYLRWCCQVQDFGLKHL--
... .: . :.::.. :..::.:::. : :: :. : : : . : :..::
XP_005 VGFTTLARNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGN
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 --LALGSLRLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCL
: .:... : .:::.: ..: : . . ::..:: .: : .: . :::
XP_005 GACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIK
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VIE
XP_005 VHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
450 460 470
>>NP_001171835 (OMIM: 609086) F-box/LRR-repeat protein 2 (404 aa)
initn: 382 init1: 227 opt: 413 Z-score: 246.5 bits: 54.8 E(85289): 5.4e-07
Smith-Waterman score: 413; 30.4% identity (62.6% similar) in 286 aa overlap (195-473:93-373)
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ARGFEGFCLVGVSDLDICEFIDNYALSKKGVKAMSLKRST-ITDAGLEVMLEQMQGVVRL
.. .::. . : .:... .. ... :
NP_001 SNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIEVL
70 80 90 100 110 120
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 ELSGCNDFTEAGLWSSLSARITSLSVSDCINVADDAIAAISQLLPNLAELSLQA-YHVTD
.:.::. :.: . .:..: : .:. :.: :. . .: : :.. .. :
NP_001 NLNGCTKTTDA----EGCPLLEQLNISWCDQVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLED
130 140 150 160 170
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 TALAYFTARQGHSTHTLRLLSCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVA
:: :. :. . . :: : .: .::..:.... .. .: .: ::::..:: .. ..
NP_001 EALKYIGAHCPELV-TLNLQTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALG
180 190 200 210 220 230
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ENLRKLRSLDLSWCPRITDMALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYLSTMSS-LRS
.: .:: :... : ..::... .: . :.::.. :..::.:::. : :: :.
NP_001 QNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQV
240 250 260 270 280 290
410 420 430 440 450
pF1KE4 LYLRWCCQVQDFGLKHL----LALGSLRLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNC
: : : . : :..:: : .:... : .:::.: ..: : . . ::..:: .:
NP_001 LSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDC
300 310 320 330 340 350
460 470
pF1KE4 PGATPELFKYFSQHLPRCLVIE
: .: . :::
NP_001 QQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
360 370 380 390 400
>>XP_005257804 (OMIM: 609086) PREDICTED: F-box/LRR-repea (441 aa)
initn: 382 init1: 227 opt: 413 Z-score: 246.0 bits: 54.8 E(85289): 5.8e-07
Smith-Waterman score: 418; 27.3% identity (57.5% similar) in 421 aa overlap (71-473:10-410)
50 60 70 80 90
pF1KE4 ATKNRPCQPPPPPTLPPPSLAAPLSRAALAGGPCTPAGGPASALAPG--HPAERPPLA-T
:: :: :.: : : .: .: .
XP_005 MHWGGGGGGGGGGGNRGGAAAAALPQSRHIQKRRKMAPS
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 DEKILNGLFW--YFSACEKCVLAQVCKAWRRVLYQPKFWAGLTPVLHAKEL---YNVLP-
...:. : .:: .. :. . : ...: . . .. . . .. .:::
XP_005 RDRLLHFGFKATMFSNSDEAVINK--KLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200
pF1KE4 -GGEKEFVNLQGFAARGFEGFCLVGVSDLDICEFIDNYALSKKG-VKAMSLKRST-ITDA
:.. . ..: : : .:: . ..: . : .. .::. . :
XP_005 DGSNWQRIDLFDFQ-RDIEG------------RVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDN
100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 GLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAGLWSSLSARITSLSVSDCINVADDAIAAISQLLP
.:... .. ... :.:.::. :.: . .:..: : .:. :.: :. .
XP_005 ALRTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTDA----EGCPLLEQLNISWCDQVTKDGIQALVRGCG
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 NLAELSLQA-YHVTDTALAYFTARQGHSTHTLRLLSCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSL
.: : :.. .. : :: :. :. . . :: : .: .::..:.... .. .: .:
XP_005 GLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELV-TLNLQTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCA
210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 SGCSKVTDDGVELVAENLRKLRSLDLSWCPRITDMALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITD
::::..:: .. ...: .:: :... : ..::... .: . :.::.. :..::.:::
XP_005 SGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHELEKMDLEECVQITD
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 TGLSYLSTMSS-LRSLYLRWCCQVQDFGLKHL----LALGSLRLLSLAGCPLLTTTGLSG
. : :: :. : : : . : :..:: : .:... : .:::.: ..:
XP_005 STLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEH
320 330 340 350 360 370
450 460 470
pF1KE4 LVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCLVIE
: . . ::..:: .: : .: . :::
XP_005 LKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCI
380 390 400 410 420 430
XP_005 IL
440
>>XP_016861583 (OMIM: 605652) PREDICTED: F-box/LRR-repea (318 aa)
initn: 341 init1: 217 opt: 362 Z-score: 220.4 bits: 49.6 E(85289): 1.5e-05
Smith-Waterman score: 362; 32.7% identity (62.0% similar) in 263 aa overlap (223-477:30-291)
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 KGVKAMSLKRSTITDAGLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAGLWS-SLSAR-ITSLSVS
:.:..: ..:...: . : . : . :..:
XP_016 MDAQKSLTVRLLFFSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLS
10 20 30 40 50
260 270 280 290 300
pF1KE4 DCINVADDAIAAISQLLPNLAELSLQA-YHVTDTALAYFTARQGHSTHTLRLLSCWEITN
: ... :.: :. . .: : :.. .. : :: .. : .: : :: .::.
XP_016 WCDQITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYC-HELVSLNLQSCSRITD
60 70 80 90 100 110
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAENLRKLRSLDLSWCPRITDMALEYVAC
.:::.. .. : :: :::::..:: .. .. : .:. :. . : ..:: .. .:
XP_016 EGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLAR
120 130 140 150 160 170
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 DLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYLSTMS-SLRSLYLRWCCQVQDFGLKHLL--ALGS--L
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XP_016 NCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERL
180 190 200 210 220 230
430 440 450 460 470
pF1KE4 RLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCLVIE
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XP_016 RVLELDNCLLITDVALEHLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPV
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300 310
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pF1KE4 KGVKAMSLKRSTITDAGLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAGLWS-SLSAR-ITSLSVS
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XP_005 MDAQKSLTVRLLFFSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLS
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pF1KE4 DCINVADDAIAAISQLLPNLAELSLQA-YHVTDTALAYFTARQGHSTHTLRLLSCWEITN
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XP_005 EGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLAR
120 130 140 150 160 170
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 DLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYLSTMS-SLRSLYLRWCCQVQDFGLKHLL--ALGS--L
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XP_005 NCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE4 RLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCLVIE
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XP_005 RVLELDNCLLITDVALEHLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPV
240 250 260 270 280 290
XP_005 TPPTAVAGSGQRLCRCCVIL
300 310
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130 140 150 160 170 180
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pF1KE4 YALSKKGV-----------KAMSLKR-STITDAGLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAG
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240 250 260 270 280
pF1KE4 L----WSSLSARITSLSVSDCINVADDAIAAISQLLPNLAE-------LSLQ-AYHVTDT
: :. :. ::.. .: ...: .:. .. . . :: :.:: ..::
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pF1KE4 ALAYFTARQGHSTHTLRLLSCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAE
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XP_016 SLKHIS-RGLTGLRLLNLSFCGGISDAGLLHLSH-MGSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAM
220 230 240 250 260 270
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pF1KE4 NLRKLRSLDLSWCPRITDMALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYL-STMSSLRSL
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pF1KE4 TPELFKYFSQHLPRCLVIE
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pF1KE4 AGGPCTPAGGPASALAPGHPAERPPLATDEKILNGLFWYFSACEKCVLAQVCKAWRRVLY
..: .: :... .: :::: ::: . :
XP_016 METHISCLFPELLAMIFGYLDVRDKGRAAQVCTAWRDAAY
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
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XP_016 HKSVWRGVEAKLHLRRANPSLFPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGC
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pF1KE4 YALSKKGV-----------KAMSLKR-STITDAGLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAG
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XP_016 YNLTDNGLGHAFVQEIGSLRALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGCSNITNTG
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: :. :. ::.. .: ...: .:. .. . . :: :.:: ..::
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XP_016 GSLRLSGLDVSFCDKVGDQSLAYIAQGLDGLKSLSLCSC-HISDDGINRMVRQMHGLRTL
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 TPELFKYFSQHLPRCLVIE
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400
>>NP_689654 (OMIM: 609081) F-box/LRR-repeat protein 14 [ (418 aa)
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NP_689 METHISCLFPELLAMIFGYLDVRDKGRAAQVCTAWRDAAY
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QPKFWAGLTPVLHAKELY-NVLPGGEKEFVN-LQGFAARGFEGFCLVGVSDLDICEFIDN
. . : :. :: .. ...:. . . . .: .. : .. . :..... ..
NP_689 HKSVWRGVEAKLHLRRANPSLFPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGC
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230
pF1KE4 YALSKKGV-----------KAMSLKR-STITDAGLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAG
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NP_689 YNLTDNGLGHAFVQEIGSLRALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGCSNITNTG
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280
pF1KE4 L----WSSLSARITSLSVSDCINVADDAIAAISQLLPNLAE-------LSLQ-AYHVTDT
: :. :. ::.. .: ...: .:. .. . . :: :.:: ..::
NP_689 LLLIAWGL--QRLKSLNLRSCRHLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQKLTDL
170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 ALAYFTARQGHSTHTLRLLSCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAE
.: ... : . . : : : :.. :.... : . .: .:.: .:....: :. .:
NP_689 SLKHIS-RGLTGLRLLNLSFCGGISDAGLLHLSH-MGSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAM
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 NLRKLRSLDLSWCPRITDMALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYL-STMSSLRSL
. .: .::.:.: .. :..: :.: : :. : : : .:.: :.. . : .::.:
NP_689 GSLRLSGLDVSFCDKVGDQSLAYIAQGLDGLKSLSLCSC-HISDDGINRMVRQMHGLRTL
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 YLRWCCQVQDFGLKHLLA--LGSLRLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGA
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NP_689 NIGQCVRITDKGLE-LIAEHLSQLTGIDLYGCTRITKRGLERITQLPCLKVLNLGLWQMT
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479 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 02:29:42 2016 done: Sun Nov 6 02:29:43 2016
Total Scan time: 8.910 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]