FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4102, 471 aa
1>>>pF1KE4102 471 - 471 aa - 471 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9160+/-0.000534; mu= 11.9037+/- 0.033
mean_var=202.0236+/-44.617, 0's: 0 Z-trim(114.2): 274 B-trim: 1085 in 2/52
Lambda= 0.090235
statistics sampled from 23627 (23982) to 23627 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 8.450
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 1325 185.8 2.2e-46
NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 976 140.4 1e-32
NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 937 135.3 3.5e-31
NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein liga ( 485) 866 126.1 2.2e-28
XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 863 125.7 2.8e-28
NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 863 125.7 2.8e-28
XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 863 125.7 2.8e-28
XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 863 125.7 2.8e-28
NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 863 125.7 2.8e-28
XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450) 763 112.6 2.2e-24
XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 749 110.8 8.1e-24
NP_477514 (OMIM: 607564) tripartite motif-containi ( 488) 680 101.9 4.2e-21
NP_001003818 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 516) 680 101.9 4.4e-21
NP_892030 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 500) 677 101.5 5.6e-21
NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488) 664 99.8 1.8e-20
NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488) 664 99.8 1.8e-20
NP_291027 (OMIM: 610530) E3 ubiquitin-protein liga ( 630) 652 98.4 6.2e-20
NP_060677 (OMIM: 616755) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 648 97.7 7.4e-20
XP_016857118 (OMIM: 616755) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 555) 647 97.6 9e-20
XP_006714995 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 520) 637 96.3 2.1e-19
XP_006714992 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 543) 637 96.3 2.2e-19
NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452) 632 95.6 3.1e-19
NP_963921 (OMIM: 610530) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 613 93.2 1.8e-18
XP_006714993 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 541) 613 93.2 1.9e-18
XP_011514091 (OMIM: 612548) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 486) 612 93.0 1.9e-18
NP_001268379 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 486) 612 93.0 1.9e-18
NP_001268380 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 487) 612 93.0 1.9e-18
NP_835226 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein liga ( 487) 612 93.0 1.9e-18
NP_006065 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein liga ( 498) 608 92.5 2.8e-18
NP_001008275 (OMIM: 613288) tripartite motif-conta ( 477) 606 92.2 3.3e-18
XP_006714994 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 525) 602 91.8 5e-18
NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 599 91.4 6.5e-18
NP_001186502 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein l ( 494) 597 91.1 7.6e-18
NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 343) 547 84.4 5.5e-16
NP_741983 (OMIM: 617007) tripartite motif-containi ( 493) 541 83.8 1.2e-15
XP_016856908 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 528 81.7 2.6e-15
XP_016856907 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 528 81.7 2.6e-15
NP_439893 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 395) 529 82.1 3.1e-15
NP_006769 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 481) 529 82.2 3.5e-15
XP_016866752 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 462) 527 81.9 4e-15
XP_011513161 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 462) 527 81.9 4e-15
NP_001723 (OMIM: 601610) butyrophilin subfamily 1 ( 526) 509 79.7 2.2e-14
XP_005249397 (OMIM: 601610) PREDICTED: butyrophili ( 626) 509 79.7 2.5e-14
NP_569074 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 270) 499 78.0 3.6e-14
NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 493) 503 78.8 3.7e-14
XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 493) 503 78.8 3.7e-14
NP_000234 (OMIM: 134610,249100,608107) pyrin isofo ( 781) 506 79.5 3.7e-14
XP_016878725 (OMIM: 134610,249100,608107) PREDICTE ( 780) 501 78.8 5.8e-14
XP_005249435 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 491 77.3 1.1e-13
NP_003440 (OMIM: 600830) tripartite motif-containi ( 539) 491 77.3 1.1e-13
>>NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T (488 aa)
initn: 1195 init1: 651 opt: 1325 Z-score: 953.6 bits: 185.8 E(85289): 2.2e-46
Smith-Waterman score: 1325; 43.1% identity (70.6% similar) in 473 aa overlap (6-470:19-488)
10 20 30 40
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDL
:: ::: :.:: .::::::.:: :.::::::..:.. :.::
NP_742 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 DDTFPCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLF
. ::::::: :.:.: : :: ...::::::: . ... .....: .:.. :.::
NP_742 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQ---AVKRKIRDESLCPQHHEALSLF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 CVKDLEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGS
: .: : .: :..: :. : . :. :.. ..: :. ::::....... . . .
NP_742 CYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 KSVELKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYV
: :::. :: .:..: :::... :..::...: ....::..:: .: :: ..:.:
NP_742 KPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 STLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPEL--FSFRLTKYGFSLPPQYSG
: :: ::::: .::..:.: ..:: .: ...: :. :..: : ..: :: .
NP_742 RDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY-ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQR
: .:.: . .:: :: .::::.:..:::::.:.. : . :.. :::: : ::...
NP_742 LRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 FSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
:.:::::::::::.: .: .:::.: . :. . : :.: . . . :.:. :
NP_742 FTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFYTGT-----DSE
: :::...::::::: : :::::..::: .:::.: ::: .:: :: : ..
NP_742 PLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA
420 430 440 450 460 470
460 470
pF1KE4 PLKICSVSDSER
:: : .: :
NP_742 PLTIRPPTDWE
480
>>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T (468 aa)
initn: 918 init1: 322 opt: 976 Z-score: 708.3 bits: 140.4 E(85289): 1e-32
Smith-Waterman score: 976; 35.6% identity (63.5% similar) in 463 aa overlap (9-464:9-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCF
:::::..: :::.:. ::: .::::::: :. : . . . :: ::
NP_660 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCS
: ...: : : ...:.: :: . ...: : . :. :: .:..::. :
NP_660 PQRNLRPNRPLAKMAEMA-----RRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKR
: .: : . :.. :: . :: ::: ::.... . : .: :: .:
NP_660 RSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGK
... .:::..: .: .:....:.....::...: .: :. ..:.. . : .:. :.::.
NP_660 QNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE4 SVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKC--PELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQVDVI
: :: . :. .. :..: ::. ..: . .: :: . .. :. ::
NP_660 CQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVETLRRFRGDVT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVEVGN
:: .::.:.:..::::..:. .. . .:.:: : :::..::.:::::::::::.
NP_660 LDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 KPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAI---GRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKI
. .: ::::.. . :. . . :. .::: . : :..:. : .: : : ..
NP_660 RTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRD---P---PRRV
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTDSE-PLKICSVSDSER
::::::: : ::::. .: :.:. : . :. .. : : ..: :. ::
NP_660 GIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDT
410 420 430 440 450 460
NP_660 LAPQ
>>NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein ligase T (475 aa)
initn: 870 init1: 406 opt: 937 Z-score: 680.8 bits: 135.3 E(85289): 3.5e-31
Smith-Waterman score: 937; 35.7% identity (64.5% similar) in 476 aa overlap (1-467:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCF
: .. :. . :: .:::::. . .::.:.:::.::. :.: : .. ::::: :
NP_003 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKGGGSV--CPVCRQRF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCS
:..: : :: :... :... ..... : : : :.. : ::: :: . :: :.
NP_003 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEIS-QEAREGTQGER--CAVHGERLHLFCEKDGKALCWVCA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKR
: ::. : . :...::. ..: :. .: :: . : .::. . . : .. :: :: ..
NP_003 QSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGK
.:..:: : . :: .:.. :.... .: . : :.:. ..:.. ..:..:. :.. .
NP_003 SRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDRR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE4 SVQSNLELLTQAKSMHHKYQ--NLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQVDVI
.: :::: .. . .. . ::: .. : .: . .: :: .... : .
NP_003 CHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSV-CHVP----GLKKMLRTCAVHIT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVEVGN
:: .::.: :..::::. :: ...: . .:: : :::.:.: ::.:::::.: .
NP_003 LDPDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 KPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKIGIF
: : ::::.: . :. . : .:::.: . :. : :. : : : : ..:::
NP_003 KEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHLQVPPCQVGIF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LDYELGDLSFYNMNDR-SILYTFNDC-FTEAVWPYFYTG-----TDSEPLKICSVSDSER
:::: : .::::..:. :..:.:..: :: . :.: : .. :: .: ..
NP_003 LDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQ
420 430 440 450 460 470
NP_003 GSTDY
>>NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein ligase T (485 aa)
initn: 845 init1: 402 opt: 866 Z-score: 630.7 bits: 126.1 E(85289): 2.2e-28
Smith-Waterman score: 872; 34.6% identity (62.7% similar) in 491 aa overlap (5-470:4-484)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEFVTALVN-LQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDT----FPCPV
::::. . :: .::::. .:..:..:.:::.::.:::: :. .. . ::.
NP_060 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 CRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEIL
:: ...: : :: :..: .. :... . . . .::.:.. : .:: .:. :.
NP_060 CRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLK---GDLCERHGEKLKMFCKEDVLIM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 CTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKK
: :: : .:. : . :.. .: .. :. .:: :... :.. :. . . .... : .
NP_060 CEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE4 VEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQE----------MILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSD
:: ... : :::. . .:...: : ..: : . . ::. : :: .
NP_060 VETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 YVSTLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSM--HHKYQNLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQY
..: ... :.. .: . .: . . . . : .:. :: .:..: :
NP_060 QSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVL----
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 SGLDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQ
:: .:.: . .:: :: .::. .:.:::::: :.: .... .:.::: :::::
NP_060 -GLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 RFSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKT
.::::::::::::.. .: ::::.. . :. : :::.: : :.. .:
NP_060 CISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVI-RLRKGNEYRAGTDE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE4 TQLLPV-VKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMND-RSILYTFNDC-FTEAVWPYF---YT-GT
.: . : : ..:::.::: :.::::..: : ..:: : . ::: :. ::
NP_060 YPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGT
420 430 440 450 460 470
460 470
pF1KE4 D-SEPLKICSVSDSER
. . :: :::. :.:
NP_060 NNTAPLAICSL-DGED
480
>>XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa)
initn: 734 init1: 294 opt: 863 Z-score: 628.7 bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
:: : .::::..: :::.:. ::: .:::::::.:...:: . .:
XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
::: :: : ... : : ...:.:.: . ::.. .:..:.. : ::: ::
XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
.:. : : .:. : . : ..:.. .. :: ..: ::..: :. .. . .. .:
XP_011 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
. ::. .::.: :::.. :.: .:.. .:. .. :: . ..: :... :. .:.
XP_011 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
:: ..: .:.:. :..: . : . .:. .:::. . .: : ..
XP_011 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
.. : ::. : ..:.: ::. :.:. :: . ..: . :: . : ..:. ::
XP_011 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
:::::::: .. . : ::::.: . :. . .:::.. . :... :
XP_011 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
.. . ::..:::::.: :..:::...: : :.:... : . :.: :. : .
XP_011 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE4 ICSVSDSER
: .:.
XP_011 ISTVTMWVKG
470
>>NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligas (477 aa)
initn: 734 init1: 294 opt: 863 Z-score: 628.7 bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
:: : .::::..: :::.:. ::: .:::::::.:...:: . .:
NP_001 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
::: :: : ... : : ...:.:.: . ::.. .:..:.. : ::: ::
NP_001 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
.:. : : .:. : . : ..:.. .. :: ..: ::..: :. .. . .. .:
NP_001 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
. ::. .::.: :::.. :.: .:.. .:. .. :: . ..: :... :. .:.
NP_001 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
:: ..: .:.:. :..: . : . .:. .:::. . .: : ..
NP_001 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
.. : ::. : ..:.: ::. :.:. :: . ..: . :: . : ..:. ::
NP_001 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
:::::::: .. . : ::::.: . :. . .:::.. . :... :
NP_001 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
.. . ::..:::::.: :..:::...: : :.:... : . :.: :. : .
NP_001 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE4 ICSVSDSER
: .:.
NP_001 ISTVTMWVKG
470
>>XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa)
initn: 734 init1: 294 opt: 863 Z-score: 628.7 bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
:: : .::::..: :::.:. ::: .:::::::.:...:: . .:
XP_006 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
::: :: : ... : : ...:.:.: . ::.. .:..:.. : ::: ::
XP_006 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
.:. : : .:. : . : ..:.. .. :: ..: ::..: :. .. . .. .:
XP_006 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
. ::. .::.: :::.. :.: .:.. .:. .. :: . ..: :... :. .:.
XP_006 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
:: ..: .:.:. :..: . : . .:. .:::. . .: : ..
XP_006 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
.. : ::. : ..:.: ::. :.:. :: . ..: . :: . : ..:. ::
XP_006 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
:::::::: .. . : ::::.: . :. . .:::.. . :... :
XP_006 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
.. . ::..:::::.: :..:::...: : :.:... : . :.: :. : .
XP_006 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE4 ICSVSDSER
: .:.
XP_006 ISTVTMWVKG
470
>>XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa)
initn: 734 init1: 294 opt: 863 Z-score: 628.7 bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
:: : .::::..: :::.:. ::: .:::::::.:...:: . .:
XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
::: :: : ... : : ...:.:.: . ::.. .:..:.. : ::: ::
XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
.:. : : .:. : . : ..:.. .. :: ..: ::..: :. .. . .. .:
XP_011 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
. ::. .::.: :::.. :.: .:.. .:. .. :: . ..: :... :. .:.
XP_011 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
:: ..: .:.:. :..: . : . .:. .:::. . .: : ..
XP_011 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
.. : ::. : ..:.: ::. :.:. :: . ..: . :: . : ..:. ::
XP_011 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
:::::::: .. . : ::::.: . :. . .:::.. . :... :
XP_011 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
.. . ::..:::::.: :..:::...: : :.:... : . :.: :. : .
XP_011 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE4 ICSVSDSER
: .:.
XP_011 ISTVTMWVKG
470
>>NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligase T (477 aa)
initn: 734 init1: 294 opt: 863 Z-score: 628.7 bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
:: : .::::..: :::.:. ::: .:::::::.:...:: . .:
NP_057 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
::: :: : ... : : ...:.:.: . ::.. .:..:.. : ::: ::
NP_057 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
.:. : : .:. : . : ..:.. .. :: ..: ::..: :. .. . .. .:
NP_057 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
. ::. .::.: :::.. :.: .:.. .:. .. :: . ..: :... :. .:.
NP_057 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
:: ..: .:.:. :..: . : . .:. .:::. . .: : ..
NP_057 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
.. : ::. : ..:.: ::. :.:. :: . ..: . :: . : ..:. ::
NP_057 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
:::::::: .. . : ::::.: . :. . .:::.. . :... :
NP_057 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
.. . ::..:::::.: :..:::...: : :.:... : . :.: :. : .
NP_057 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE4 ICSVSDSER
: .:.
NP_057 ISTVTMWVKG
470
>>XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (450 aa)
initn: 634 init1: 294 opt: 763 Z-score: 558.6 bits: 112.6 E(85289): 2.2e-24
Smith-Waterman score: 763; 31.0% identity (60.9% similar) in 455 aa overlap (31-467:4-445)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
:::::::.:...:: . .:
XP_011 MTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
::: :: : ... : : ...:.:.: . ::.. .:..:.. : ::: ::
XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
.:. : : .:. : . : ..:.. .. :: ..: ::..: :. .. . .. .:
XP_011 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
. ::. .::.: :::.. :.: .:.. .:. .. :: . ..: :... :. .:.
XP_011 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
:: ..: .:.:. :..: . : . .:. .:::. . .: : ..
XP_011 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
.. : ::. : ..:.: ::. :.:. :: . ..: . :: . : ..:. ::
XP_011 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
:::::::: .. . : ::::.: . :. . .:::.. . :... :
XP_011 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
.. . ::..:::::.: :..:::...: : :.:... : . :.: :. : .
XP_011 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
390 400 410 420 430 440
470
pF1KE4 ICSVSDSER
: .:.
XP_011 ISTVTMWVKG
450
471 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 04:05:13 2016 done: Sun Nov 6 04:05:14 2016
Total Scan time: 8.450 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]