Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4095
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4095, 468 aa
1>>>pF1KE4095 468 - 468 aa - 468 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0904+/-0.000483; mu= 0.2786+/- 0.030
mean_var=245.6112+/-51.231, 0's: 0 Z-trim(116.9): 212 B-trim: 1339 in 1/53
Lambda= 0.081837
statistics sampled from 28161 (28401) to 28161 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 10.050
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 1112 144.8 4.8e-34
XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 1102 143.6 1.1e-33
NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 1027 134.8 5e-31
XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 811 109.3 2.4e-23
XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 811 109.3 2.4e-23
NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 811 109.3 2.4e-23
NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 811 109.3 2.4e-23
XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 811 109.3 2.4e-23
NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452) 779 105.5 3.2e-22
NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 768 104.2 8.3e-22
NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein liga ( 485) 742 101.1 6.9e-21
XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450) 705 96.8 1.3e-19
NP_001291425 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein l ( 262) 694 95.3 2.2e-19
XP_011542587 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 391) 663 91.7 3.8e-18
XP_011538872 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 475) 581 82.1 3.6e-15
NP_061008 (OMIM: 111620,111750,609017) erythroid m ( 475) 581 82.1 3.6e-15
XP_006710376 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 475) 581 82.1 3.6e-15
NP_001017922 (OMIM: 111620,111750,609017) erythroi ( 475) 581 82.1 3.6e-15
XP_011538873 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 468) 575 81.4 5.8e-15
NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 558 79.4 2.5e-14
NP_006501 (OMIM: 602165) zinc finger protein RFP [ ( 513) 556 79.2 2.9e-14
NP_001229732 (OMIM: 613595) butyrophilin subfamily ( 374) 539 77.1 9.3e-14
NP_932078 (OMIM: 613595) butyrophilin subfamily 3 ( 535) 539 77.2 1.2e-13
NP_008925 (OMIM: 613595) butyrophilin subfamily 3 ( 584) 539 77.2 1.3e-13
NP_001723 (OMIM: 601610) butyrophilin subfamily 1 ( 526) 537 77.0 1.4e-13
XP_005249397 (OMIM: 601610) PREDICTED: butyrophili ( 626) 537 77.0 1.6e-13
NP_001288074 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein l ( 279) 528 75.7 1.8e-13
XP_016878725 (OMIM: 134610,249100,608107) PREDICTE ( 780) 532 76.5 2.9e-13
NP_000234 (OMIM: 134610,249100,608107) pyrin isofo ( 781) 532 76.5 2.9e-13
XP_011512533 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 313) 521 74.9 3.6e-13
NP_001184168 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily ( 313) 521 74.9 3.6e-13
XP_005248855 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 407) 521 75.0 4.3e-13
XP_016865656 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 407) 521 75.0 4.3e-13
NP_853509 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily 2 ( 407) 521 75.0 4.3e-13
XP_006715046 (OMIM: 613593) PREDICTED: butyrophili ( 419) 521 75.0 4.4e-13
NP_001138480 (OMIM: 613593) butyrophilin subfamily ( 461) 521 75.0 4.8e-13
XP_016865655 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 461) 521 75.0 4.8e-13
XP_011512531 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 461) 521 75.0 4.8e-13
XP_005248890 (OMIM: 613593) PREDICTED: butyrophili ( 506) 521 75.1 5.1e-13
NP_008979 (OMIM: 613593) butyrophilin subfamily 3 ( 513) 521 75.1 5.1e-13
NP_008926 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily 2 ( 523) 521 75.1 5.2e-13
XP_005248854 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 523) 521 75.1 5.2e-13
XP_006715016 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 523) 521 75.1 5.2e-13
NP_001184166 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily ( 523) 521 75.1 5.2e-13
XP_011512530 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 523) 521 75.1 5.2e-13
NP_892030 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 500) 516 74.5 7.6e-13
NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488) 511 73.9 1.1e-12
NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488) 511 73.9 1.1e-12
NP_542783 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 341) 504 72.9 1.5e-12
NP_001184162 (OMIM: 613590) butyrophilin subfamily ( 466) 504 73.0 1.9e-12
>>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T (468 aa)
initn: 1066 init1: 483 opt: 1112 Z-score: 732.3 bits: 144.8 E(85289): 4.8e-34
Smith-Waterman score: 1112; 40.3% identity (66.6% similar) in 467 aa overlap (1-462:1-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL
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NP_660 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQG--SYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQ
... :. :...: .::.:. : :: : : .: .:. . : .
NP_660 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHP---PSPVPQGVCPAHREPLAA-FCGDELRLLCAACER
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 S--HGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCKQ
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NP_660 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSS
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NP_660 NVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATA
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NP_660 QLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEV
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NP_660 NPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWAL
300 310 320 330 340 350
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pF1KE4 GICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDYES
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NP_660 GVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYN---SSERALAPLRDPPRRVGIFLDYEA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE4 GHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV
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NP_660 GHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ
420 430 440 450 460
>>XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (467 aa)
initn: 804 init1: 618 opt: 1102 Z-score: 725.9 bits: 143.6 E(85289): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 1102; 40.1% identity (66.3% similar) in 469 aa overlap (1-462:1-454)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL
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XP_016 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQG--SYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQ
... :. :...: .::.:. : :: : : .: .:. . : .
XP_016 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHP---PSPVPQGVCPAHREPLAA-FCGDELRLLCAACER
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 S--HGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLC--QEETKTC
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XP_016 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLR---KQMQDALLFQAQADETCVLWQMVESQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 KQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIES
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XP_016 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPA
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XP_016 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD
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pF1KE4 TANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEW
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XP_016 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSW
300 310 320 330 340 350
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pF1KE4 EVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDY
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XP_016 ALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYN---SSERALAPLRDPPRRVGIFLDY
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pF1KE4 ESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV
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XP_016 EAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPTPMTICRPKGGSGDTLA
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XP_016 PQ
>>NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein ligase T (475 aa)
initn: 744 init1: 463 opt: 1027 Z-score: 678.0 bits: 134.8 E(85289): 5e-31
Smith-Waterman score: 1027; 39.6% identity (66.7% similar) in 475 aa overlap (1-465:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL
:..: . . ::.:: :::: : ::. ::::::: :. : .. :: : . .
NP_003 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECI--SQVGKGGGSVCPVCRQRF
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pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYG-RMPTTAKALSD-DEQGGSAFV--
... :..:. ... ... :: : ..:. : : . .. : :. :.:.
NP_003 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEI-SQ----EAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWV
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pF1KE4 -AQSHGANRVHLS---SEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETK
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NP_003 CAQSR-KHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE4 TCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQI
: :. . .:......:: :::: ::: ::..:.:..: : ..: ::.:: ..:...:...
NP_003 TQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISEL
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pF1KE4 ESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLD
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NP_003 DRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLD
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 PATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKT
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NP_003 PDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKE
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pF1KE4 EWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFL
:..:.:.::: :::.. . : : : . : . : :.. : :.::.::
NP_003 AWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAG-TYPQTPLHLQVPPCQVGIFL
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 DYESGHIAFYNGTDE-SLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV
:::.: ..::: ::. :::::: . .: :::.::: . . : :: :::.: ::
NP_003 DYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQG
420 430 440 450 460 470
NP_003 STDY
>>XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa)
initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 540.1 bits: 109.3 E(85289): 2.4e-23
Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL
: ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. .
XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
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pF1KE4 SCPECWRTLEGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQG
:::: . .. :. : ..: .:.: ::..: . . : : . . .:.
XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ--HPGLQKQDLCQEH-HEPL--KLFCQKDQS
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pF1KE4 GSAFV---AQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQ
: .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . :
XP_011 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM
..: .. .: :. ::. .: :::: :: :: ::.:. .::.. : .: .:: .
XP_011 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 IAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEAT--TTELSLCRITGMKEMLRKFST
. :.: : .. .. :.... : :.. . .::::.. : ..::. :. :.:: :
XP_011 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPD--NPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWE
... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.:::::::
XP_011 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE
300 310 320 330 340 350
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pF1KE4 V--EVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVRE
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XP_011 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME
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pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT
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XP_011 PPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTV
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pF1KE4 ICSLNSHV
XP_011 TMWVKG
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10 20 30 40 50
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: ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. .
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:::: . .. :. : ..: .:.: ::..: . . : : . . .:.
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: .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . :
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... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.:::::::
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: ..:.:::.:.:...::. .: : .... ::.: :.:.: :: :. :
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pF1KE4 ICSLNSHV
XP_011 TMWVKG
>>NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligase T (477 aa)
initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 540.1 bits: 109.3 E(85289): 2.4e-23
Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL
: ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. .
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:::: . .. :. : ..: .:.: ::..: . . : : . . .:.
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pF1KE4 GSAFV---AQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQ
: .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . :
NP_057 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ
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pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM
..: .. .: :. ::. .: :::: :: :: ::.:. .::.. : .: .:: .
NP_057 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL
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NP_057 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE
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NP_057 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT
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420 430 440 450 460 470
pF1KE4 ICSLNSHV
NP_057 TMWVKG
>>NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligas (477 aa)
initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 540.1 bits: 109.3 E(85289): 2.4e-23
Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL
: ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. .
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NP_001 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ--HPGLQKQDLCQEH-HEPL--KLFCQKDQS
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pF1KE4 GSAFV---AQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQ
: .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . :
NP_001 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ
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pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM
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NP_001 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL
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pF1KE4 IAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEAT--TTELSLCRITGMKEMLRKFST
. :.: : .. .. :.... : :.. . .::::.. : ..::. :. :.:: :
NP_001 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE
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pF1KE4 EITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPD--NPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWE
... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.:::::::
NP_001 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE
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pF1KE4 V--EVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVRE
: .. . . : .:.:.:.:::: .:: : . : .. :. : : : . : : . :
NP_001 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT
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NP_001 PPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTV
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 ICSLNSHV
NP_001 TMWVKG
>>XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa)
initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 540.1 bits: 109.3 E(85289): 2.4e-23
Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL
: ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. .
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: .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . :
XP_006 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ
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pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM
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XP_006 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL
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. :.: : .. .. :.... : :.. . .::::.. : ..::. :. :.:: :
XP_006 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE
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pF1KE4 EITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPD--NPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWE
... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.:::::::
XP_006 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE
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pF1KE4 V--EVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVRE
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XP_006 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT
: ..:.:::.:.:...::. .: : .... ::.: :.:.: :: :. :
XP_006 PPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTV
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 ICSLNSHV
XP_006 TMWVKG
>>NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containing p (452 aa)
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Smith-Waterman score: 779; 32.0% identity (62.9% similar) in 453 aa overlap (6-449:5-450)
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pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL
... .. :: : .:..:: .::: .:::::: :. .:.. ..: :: ..
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pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQSH
: ....: .: ..::.::.. .. : .:: : : : . . ... .. .:
NP_065 EQINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMC-GTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSS
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pF1KE4 GANRVHLSSEAE---EHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCK-Q
.: : : :.::::: . .. : . : . :. : :.. : .. . . .
NP_065 QEHRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTR-CWKDYVNLRLE
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pF1KE4 VVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSS
.. .::.:: : .:::. .:..:... :: ...:. .. :...... : : ...
NP_065 AIRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMC
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pF1KE4 QSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTELSLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATAN
.. : :. :.::: .::. :. . ::: :::... : .: ..::: ::
NP_065 HKPDVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEAN
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 AYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLP---DNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEW
. : : :.:. : ..:..: .:. : . :.: ::::..::::.::.. .:
NP_065 NDIFLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSF----LAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNW
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pF1KE4 EVGICKDSVSRKGNLPKPPGD--LFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFL
:.:. ..:.. : : :: : .: . ::...::: :.. .:. .::.::
NP_065 AFGVCNMYRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFL
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pF1KE4 DYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV
: :. ..: . .. ::::..:. ::. ::::: :.
NP_065 DCEAKTVSFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFC-CIHF
420 430 440 450
>>NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T (488 aa)
initn: 827 init1: 274 opt: 768 Z-score: 512.5 bits: 104.2 E(85289): 8.3e-22
Smith-Waterman score: 1009; 36.8% identity (67.2% similar) in 476 aa overlap (2-461:15-481)
10 20 30 40
pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEH
::: .:::. : .: .::.:.. :: ::::.:: .:. : ::.
NP_742 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 NTPLSCPECWRTLEGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALS-
. . :: : .: . .. :..:: .. ::.::.. . .::. : .:::
NP_742 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLC----PQHHEALSL
70 80 90 100 110
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pF1KE4 ---DDEQGGSAFVAQSHGANRVHLS---SEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHE
.:... . : :: ..:.: ..: ....::::. :. :. . .: . :
NP_742 FCYEDQEAVCLICAISH-THRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 KERVKLCQEETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQ
... .. ... .: .. :. ..:. : ::.:. :. ::.::.. ...::.: .: .
NP_742 EKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGD
180 190 200 210 220 230
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pF1KE4 QIRSLSKMIAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTELSLCR-------
. :.:... :..:.. .:.:: :..:...::. : . . :.:.. . : .
NP_742 KRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKV--KTMEVTSVSIELEKNFSNFPR
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 -ITGMKEMLRKFSTEITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSR-QQLPDNPERFDQSATVL
.....:... ...:::: ::. :::::: ::::. .: ..:::.:.:: ::
NP_742 QYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVL
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 GTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWV
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NP_742 ATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAA-T
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460
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NP_742 GRKNAAPLTIRPPTDWE
480
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