Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4092
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4092, 466 aa
1>>>pF1KE4092 466 - 466 aa - 466 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2473+/-0.000316; mu= 13.7576+/- 0.020
mean_var=80.4376+/-16.527, 0's: 0 Z-trim(116.9): 199 B-trim: 1760 in 1/54
Lambda= 0.143003
statistics sampled from 28147 (28375) to 28147 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 10.000
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001287664 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-contain ( 472) 2099 442.4 1.2e-123
XP_016863302 (OMIM: 614532) PREDICTED: ras-GEF dom ( 473) 2087 440.0 6.8e-123
NP_689758 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-containing ( 473) 2087 440.0 6.8e-123
NP_001287665 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-contain ( 431) 1786 377.8 3.1e-104
XP_016863301 (OMIM: 614532) PREDICTED: ras-GEF dom ( 432) 1774 375.4 1.7e-103
NP_660356 (OMIM: 614531) ras-GEF domain-containing ( 481) 1653 350.4 6.2e-96
NP_001269791 (OMIM: 614531) ras-GEF domain-contain ( 489) 1653 350.4 6.3e-96
XP_011537802 (OMIM: 614531) PREDICTED: ras-GEF dom ( 401) 1472 313.1 9.2e-85
XP_005271866 (OMIM: 614531) PREDICTED: ras-GEF dom ( 401) 1472 313.1 9.2e-85
NP_055062 (OMIM: 609530) rap guanine nucleotide ex (1499) 350 81.8 1.4e-14
XP_016864348 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1524) 350 81.8 1.5e-14
XP_011530729 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1540) 350 81.8 1.5e-14
XP_016864346 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1544) 350 81.8 1.5e-14
XP_016864347 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1544) 350 81.8 1.5e-14
XP_006714485 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1585) 350 81.8 1.5e-14
XP_011530728 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1585) 350 81.8 1.5e-14
XP_011530727 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1589) 350 81.8 1.5e-14
XP_016864345 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1652) 350 81.8 1.6e-14
XP_005263418 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1654) 350 81.8 1.6e-14
XP_005263417 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1660) 350 81.8 1.6e-14
XP_006714484 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1685) 350 81.8 1.6e-14
XP_005263416 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1693) 350 81.8 1.6e-14
XP_006714483 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1695) 350 81.8 1.6e-14
XP_005263415 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1701) 350 81.8 1.6e-14
NP_001157861 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1391) 318 75.2 1.3e-12
NP_001157860 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1504) 318 75.2 1.4e-12
NP_001157859 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1509) 318 75.2 1.4e-12
NP_057424 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide ex (1601) 318 75.2 1.5e-12
NP_001157858 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1609) 318 75.2 1.5e-12
NP_722522 (OMIM: 606600) ras-specific guanine nucl ( 489) 307 72.7 2.5e-12
NP_001139120 (OMIM: 606600) ras-specific guanine n (1257) 307 72.9 5.7e-12
XP_016877945 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specifi (1260) 307 72.9 5.8e-12
XP_016877944 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specifi (1270) 307 72.9 5.8e-12
NP_002882 (OMIM: 606600) ras-specific guanine nucl (1273) 307 72.9 5.8e-12
XP_016865171 (OMIM: 606614) PREDICTED: ras-specifi (1142) 293 70.0 3.9e-11
NP_008840 (OMIM: 606614) ras-specific guanine nucl (1237) 293 70.0 4.2e-11
NP_001269830 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ( 791) 282 67.7 1.4e-10
NP_001269829 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ( 840) 282 67.7 1.4e-10
XP_006712268 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 840) 282 67.7 1.4e-10
XP_016858686 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 849) 282 67.7 1.4e-10
NP_001269828 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ( 858) 282 67.7 1.5e-10
NP_001093867 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ( 867) 282 67.7 1.5e-10
XP_011508807 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 881) 282 67.7 1.5e-10
XP_016858685 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 960) 282 67.7 1.6e-10
XP_005246303 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 993) 282 67.7 1.7e-10
NP_008954 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ex (1011) 282 67.7 1.7e-10
XP_011507644 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 620) 267 64.5 9.3e-10
XP_016856245 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 683) 267 64.5 1e-09
XP_011507643 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 718) 267 64.5 1.1e-09
NP_001284601 (OMIM: 605667) ral guanine nucleotide ( 739) 267 64.5 1.1e-09
>>NP_001287664 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-containing (472 aa)
initn: 2103 init1: 1278 opt: 2099 Z-score: 2340.7 bits: 442.4 E(85289): 1.2e-123
Smith-Waterman score: 2099; 68.0% identity (85.4% similar) in 472 aa overlap (1-465:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
:::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::..
NP_001 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
.::::::::::::..: ::.:.:::::.:.:.:. : :: ..::..::.::::.:::::
NP_001 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----G
:: ::..: . .:::.. ::: .:.::: ..:..: : .::::: : : :. .
NP_001 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLA
.:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.::::
NP_001 TDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLD
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 STKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG
. : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.::::::::::::
NP_001 NDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSL
:::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.:::
NP_001 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVEC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::
NP_001 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVEC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE4 PFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
:::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::.
NP_001 PFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
420 430 440 450 460 470
>>XP_016863302 (OMIM: 614532) PREDICTED: ras-GEF domain- (473 aa)
initn: 2027 init1: 1278 opt: 2087 Z-score: 2327.3 bits: 440.0 E(85289): 6.8e-123
Smith-Waterman score: 2087; 67.9% identity (85.2% similar) in 473 aa overlap (1-465:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
:::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::..
XP_016 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
.::::::::::::..: ::.:.:::::.:.:.:. : :: ..::..::.::::.:::::
XP_016 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE-AYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----
:: ::..: . .:::.. ::: .: .::: ..:..: : .::::: : : :.
XP_016 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEEQTYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISST
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPL
..:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.::::
XP_016 STDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNI
. : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.:::::::::::
XP_016 DNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRS
::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.::
XP_016 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.::::::
XP_016 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE4 CPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
::::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::.
XP_016 CPFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
420 430 440 450 460 470
>>NP_689758 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-containing fam (473 aa)
initn: 2027 init1: 1278 opt: 2087 Z-score: 2327.3 bits: 440.0 E(85289): 6.8e-123
Smith-Waterman score: 2087; 67.9% identity (85.2% similar) in 473 aa overlap (1-465:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
:::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::..
NP_689 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
.::::::::::::..: ::.:.:::::.:.:.:. : :: ..::..::.::::.:::::
NP_689 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE-AYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----
:: ::..: . .:::.. ::: .: .::: ..:..: : .::::: : : :.
NP_689 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEEQTYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISST
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPL
..:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.::::
NP_689 STDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNI
. : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.:::::::::::
NP_689 DNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRS
::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.::
NP_689 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.::::::
NP_689 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE4 CPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
::::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::.
NP_689 CPFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
420 430 440 450 460 470
>>NP_001287665 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-containing (431 aa)
initn: 1894 init1: 1278 opt: 1786 Z-score: 1992.4 bits: 377.8 E(85289): 3.1e-104
Smith-Waterman score: 1812; 62.3% identity (77.8% similar) in 472 aa overlap (1-465:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
:::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::..
NP_001 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
..::..::.::::.:::::
NP_001 -----------------------------------------QMRKIAPKILQLLTEWTET
70
130 140 150 160 170
pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----G
:: ::..: . .:::.. ::: .:.::: ..:..: : .::::: : : :. .
NP_001 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLA
.:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.::::
NP_001 TDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLD
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 STKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG
. : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.::::::::::::
NP_001 NDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIG
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSL
:::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.:::
NP_001 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSL
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVEC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::
NP_001 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVEC
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460
pF1KE4 PFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
:::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::.
NP_001 PFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
380 390 400 410 420 430
>>XP_016863301 (OMIM: 614532) PREDICTED: ras-GEF domain- (432 aa)
initn: 1816 init1: 1278 opt: 1774 Z-score: 1979.0 bits: 375.4 E(85289): 1.7e-103
Smith-Waterman score: 1800; 62.2% identity (77.6% similar) in 473 aa overlap (1-465:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
:::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::..
XP_016 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
..::..::.::::.:::::
XP_016 -----------------------------------------QMRKIAPKILQLLTEWTET
70
130 140 150 160 170
pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE-AYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----
:: ::..: . .:::.. ::: .: .::: ..:..: : .::::: : : :.
XP_016 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEEQTYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISST
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPL
..:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.::::
XP_016 STDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPL
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNI
. : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.:::::::::::
XP_016 DNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNI
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRS
::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.::
XP_016 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRS
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.::::::
XP_016 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVE
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460
pF1KE4 CPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
::::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::.
XP_016 CPFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
380 390 400 410 420 430
>>NP_660356 (OMIM: 614531) ras-GEF domain-containing fam (481 aa)
initn: 1610 init1: 1043 opt: 1653 Z-score: 1843.3 bits: 350.4 E(85289): 6.2e-96
Smith-Waterman score: 1674; 53.9% identity (80.1% similar) in 482 aa overlap (1-465:1-480)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPQT-LSASDMVTP---GSLSPPPTEPTDGEQAGQPLL---DGAPSSASLETLIQHLVPT
:::: . :... : :...: : : .:. : :: :.:::.:..:::::
NP_660 MPQTSVVFSSILGPSCSGQVQPGMGERGGGAGGGSGDLIFQDGHLISGSLEALMEHLVPT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQL
.::::...::::::::::.:. :..::::: ..:.::.: . .::....:. :..::
NP_660 VDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKSFSAKIVQL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE4 LAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALHQKLAA---LR
: ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.: .::: :.
NP_660 LKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLSLAARSQLQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFV
. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:. : ::...
NP_660 ELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVSSIYPEDLM
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 QAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFI
: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::.:....::::
NP_660 QIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHRTRMLEFFI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 DVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRT
::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:::..:::::::
NP_660 DVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPSSNFCNYRT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVG
::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::.:: :...:.
NP_660 ALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFKKFWEISRQIH
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 EFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSIL
::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. ::.::...:
NP_660 EFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSWKTLRTTLL
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GKT
..
NP_660 NRA
480
>>NP_001269791 (OMIM: 614531) ras-GEF domain-containing (489 aa)
initn: 1610 init1: 1043 opt: 1653 Z-score: 1843.2 bits: 350.4 E(85289): 6.3e-96
Smith-Waterman score: 1674; 53.9% identity (80.1% similar) in 482 aa overlap (1-465:9-488)
10 20 30 40
pF1KE4 MPQT-LSASDMVTP---GSLSPPPTEPTDGEQAGQPLL---DGAPSSASLET
:::: . :... : :...: : : .:. : :: :.:::.
NP_001 MFLEPQETMPQTSVVFSSILGPSCSGQVQPGMGERGGGAGGGSGDLIFQDGHLISGSLEA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LIQHLVPTADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRK
:..:::::.::::...::::::::::.:. :..::::: ..:.::.: . .::....
NP_001 LMEHLVPTVDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 FGPKLLQLLAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALHQK
:. :..::: ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.: .
NP_001 FSAKIVQLLKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE4 LAA---LRQGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLR
::: :.. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:.
NP_001 LAARSQLQELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVS
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 HIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQR
: ::...: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::.:
NP_001 SIYPEDLMQIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 AQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPT
....::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:::.
NP_001 TRMLEFFIDVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 GNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKF
.:::::::::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::.::
NP_001 SNFCNYRTALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFKKF
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LELAKQVGEFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERW
:...:. ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. :
NP_001 WEISRQIHEFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSW
420 430 440 450 460 470
460
pF1KE4 KALRSSILGKT
:.::...:..
NP_001 KTLRTTLLNRA
480
>>XP_011537802 (OMIM: 614531) PREDICTED: ras-GEF domain- (401 aa)
initn: 1429 init1: 1043 opt: 1472 Z-score: 1642.8 bits: 313.1 E(85289): 9.2e-85
Smith-Waterman score: 1472; 55.0% identity (81.8% similar) in 402 aa overlap (74-465:1-400)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 ETLIQHLVPTADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARV
. :..::::: ..:.::.: . .::..
XP_011 MPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKL
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 RKFGPKLLQLLAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALH
..:. :..::: ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.:
XP_011 KSFSAKIVQLLKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLL
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210
pF1KE4 QKLAA---LRQGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELER
.::: :.. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:
XP_011 LSLAARSQLQELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDR
100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 LRHIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKK
. : ::...: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::
XP_011 VSSIYPEDLMQIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKK
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 QRAQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMD
.:....::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.::
XP_011 HRTRMLEFFIDVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMD
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 PTGNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFE
:..:::::::::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::.
XP_011 PSSNFCNYRTALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFK
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 KFLELAKQVGEFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKE
:: :...:. ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::.
XP_011 KFWEISRQIHEFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKD
330 340 350 360 370 380
460
pF1KE4 RWKALRSSILGKT
::.::...:..
XP_011 SWKTLRTTLLNRA
390 400
>>XP_005271866 (OMIM: 614531) PREDICTED: ras-GEF domain- (401 aa)
initn: 1429 init1: 1043 opt: 1472 Z-score: 1642.8 bits: 313.1 E(85289): 9.2e-85
Smith-Waterman score: 1472; 55.0% identity (81.8% similar) in 402 aa overlap (74-465:1-400)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 ETLIQHLVPTADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARV
. :..::::: ..:.::.: . .::..
XP_005 MPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKL
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 RKFGPKLLQLLAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALH
..:. :..::: ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.:
XP_005 KSFSAKIVQLLKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLL
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210
pF1KE4 QKLAA---LRQGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELER
.::: :.. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:
XP_005 LSLAARSQLQELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDR
100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 LRHIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKK
. : ::...: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::
XP_005 VSSIYPEDLMQIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKK
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 QRAQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMD
.:....::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.::
XP_005 HRTRMLEFFIDVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMD
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 PTGNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFE
:..:::::::::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::.
XP_005 PSSNFCNYRTALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFK
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 KFLELAKQVGEFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKE
:: :...:. ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::.
XP_005 KFWEISRQIHEFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKD
330 340 350 360 370 380
460
pF1KE4 RWKALRSSILGKT
::.::...:..
XP_005 SWKTLRTTLLNRA
390 400
>>NP_055062 (OMIM: 609530) rap guanine nucleotide exchan (1499 aa)
initn: 336 init1: 205 opt: 350 Z-score: 382.6 bits: 81.8 E(85289): 1.4e-14
Smith-Waterman score: 350; 33.2% identity (64.9% similar) in 202 aa overlap (204-402:721-904)
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VGADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDP
.: ::. ..: .:.: : :... . .
NP_055 METETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFK---
700 710 720 730 740
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LASTKPCFSDKTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG
: : : .::. . . .:. . ::.:: ... .: ..:. :: .: .: .
NP_055 LRSKTSC-----ANLKRFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECK
750 760 770 780 790 800
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKV--RTAKFFI-LEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAH
::::..:::::.:..::.::. :: :. . :.: :. .::. :. .::..: .
NP_055 NFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNS---
810 820 830 840 850
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 RSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQ
.. . .::.: .. ::. ::.:: ... .: :::::. .::..
NP_055 ------QNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKV-DGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMAS
860 870 880 890 900 910
420 430 440 450 460
pF1KE4 VECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
NP_055 VNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQ
920 930 940 950 960 970
466 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 04:11:49 2016 done: Sun Nov 6 04:11:50 2016
Total Scan time: 10.000 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]