Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4058
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4058, 323 aa
1>>>pF1KE4058 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1955+/-0.00114; mu= 11.0336+/- 0.067
mean_var=114.0050+/-22.955, 0's: 0 Z-trim(106.1): 202 B-trim: 22 in 1/47
Lambda= 0.120119
statistics sampled from 8544 (8783) to 8544 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 2.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 323) 2159 385.4 3.2e-107
CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 302) 1771 318.2 5.3e-87
CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 306) 1492 269.8 1.9e-72
CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 ( 329) 1183 216.3 2.7e-56
CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 294) 978 180.7 1.2e-45
CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 262) 823 153.8 1.4e-37
CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 ( 278) 674 128.0 8.4e-30
CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 252) 455 90.0 2.1e-18
CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 356 73.6 1.4e-12
CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 356 73.6 1.4e-12
CCDS75319.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 581) 333 69.2 9e-12
CCDS43372.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 616) 333 69.2 9.4e-12
CCDS43371.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 627) 333 69.2 9.5e-12
CCDS34003.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2352) 339 70.8 1.2e-11
CCDS68721.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2490) 339 70.8 1.3e-11
CCDS34004.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2603) 339 70.8 1.3e-11
CCDS74908.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 ( 899) 332 69.2 1.4e-11
CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 332 69.2 1.6e-11
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 321 67.6 9.1e-11
>>CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (323 aa)
initn: 2159 init1: 2159 opt: 2159 Z-score: 2038.4 bits: 385.4 E(32554): 3.2e-107
Smith-Waterman score: 2159; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEDGPVFYGFKNIFITMFATFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEDGPVFYGFKNIFITMFATFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECME
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 VEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLG
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
:::::::::::::::::::::::
CCDS14 RACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
310 320
>>CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (302 aa)
initn: 1771 init1: 1771 opt: 1771 Z-score: 1675.4 bits: 318.2 E(32554): 5.3e-87
Smith-Waterman score: 1771; 100.0% identity (100.0% similar) in 263 aa overlap (61-323:40-302)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 FLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQGVN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KNCEVSERIRRSGPWKEISFGDYICHTFQGDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQGVN
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 VNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVNVL
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 LEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQRVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQRVD
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 CVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLAAP
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320
pF1KE4 KSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
250 260 270 280 290 300
>>CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (306 aa)
initn: 1489 init1: 1489 opt: 1492 Z-score: 1414.0 bits: 269.8 E(32554): 1.9e-72
Smith-Waterman score: 2013; 94.7% identity (94.7% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEDGPVFYGFKNIFITMFATFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MEDGPVFYGFKNIFITMFATFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLEN
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS56 DCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQ-----------------ACLGGHVACAKALLEN
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECME
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 VEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLG
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE4 RACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
:::::::::::::::::::::::
CCDS56 RACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
290 300
>>CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 (329 aa)
initn: 1522 init1: 902 opt: 1183 Z-score: 1124.2 bits: 216.3 E(32554): 2.7e-56
Smith-Waterman score: 1183; 53.8% identity (81.8% similar) in 325 aa overlap (2-323:6-329)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEDGPVFYGFKNIFITMFATFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIY
:. : ..:...:.. ..: :::..:. ::.:.:::::::::::::::: :.:
CCDS38 MSVLEENRPFAQQLSNVYFTIL-SLFCFKLFVKISLAILSHFYIVKGNRKEAARIAAEFY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GGISD--CWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACA
: . :::::::::::.:::::::.::..:: ::: ::...:. ::::::: :::::
CCDS38 GVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYNVNAVTLDHVTPLHEACLGDHVACA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRG
..::: ::.::..:. :.::::::: .:: .:...:::.::::::: : :: :::...:
CCDS38 RTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELLLEYGAKAQLESCLPSPTHEAASKG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 HRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHA
:.::..::.. ....:.:.:.::::::::: :. :. ::: ::.:..:.. ::::::
CCDS38 HHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFHCIWKLLYAGADVQKGKYWDTPLHA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 AARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPPA-LSQLCRL
::.::..:...:: ..::... .:.. .:.:. .: ::. :: .:. :. : :::::
CCDS38 AAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATSSSMVERILLQHEATPSSLYQLCRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE4 CVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
:.:. .:. . : .:.:: :. :: :.
CCDS38 CIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
300 310 320
>>CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (294 aa)
initn: 1191 init1: 966 opt: 978 Z-score: 932.9 bits: 180.7 E(32554): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 978; 55.3% identity (79.2% similar) in 264 aa overlap (59-322:30-293)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 KVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQG
..: .: ::.:::: .:. :.:..::.::
CCDS35 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQG
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 VNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVN
::..: ..:: :::::::::..:.: ::..::.:::::. ::::::: ::: :::
CCDS35 WAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVN
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 VLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQR
.::. ::..: : ::::::::..::: ::.. :.: . ::::.. .::::::.:: :.
CCDS35 LLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQ
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 VDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLA
::::::: ::.:..:. :.::::.:: .. :. :: :.::. . .::.:: ..:.
CCDS35 RACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELV
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 APKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
:.: . : .: :::::.: ::::: .:::.: :. : :: ::: :..:::.
CCDS35 PPESPLAQLFLEREGPPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
240 250 260 270 280 290
>>CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (262 aa)
initn: 823 init1: 823 opt: 823 Z-score: 788.4 bits: 153.8 E(32554): 1.4e-37
Smith-Waterman score: 823; 54.7% identity (79.6% similar) in 225 aa overlap (59-283:30-254)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 KVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQG
..: .: ::.:::: .:. :.:..::.::
CCDS14 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQG
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 VNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVN
::..: ..:: :::::::::..:.: ::..::.:::::. ::::::: ::: :::
CCDS14 WAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVN
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 VLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQR
.::. ::..: : ::::::::..::: ::.. :.: . ::::.. .::::::.:: :.
CCDS14 LLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQ
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 VDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLA
::::::: ::.:..:. :.::::.:: .. :. :: :.::. . .::.:: ..:.
CCDS14 RACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELV
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 APKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
:.: . : .: :::
CCDS14 PPESPLAQLFLEREGASLPKPKP
240 250 260
>>CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 (278 aa)
initn: 785 init1: 548 opt: 674 Z-score: 648.5 bits: 128.0 E(32554): 8.4e-30
Smith-Waterman score: 674; 39.4% identity (69.0% similar) in 274 aa overlap (50-322:4-277)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 TFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLL
: :. . : :..:.:.:::: .:. :
CCDS70 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 ALKTLIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNAC
:. :: .:. :: ::.. .. :: : : :.. :.. :: ::.:.. .. :.::: .::
CCDS70 QLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDAC
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 CSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTP
::: ::..:: .:::.. .. :::.::: : ::...:. ..:.. . ..:::
CCDS70 ASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTP
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 LYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNA
:.:::. ...:::: ::. ::.:. .. .: :: ::. .::..:..: ..:.:. :.
CCDS70 LHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDN
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 QGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPP-ALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLER
.::. : . .:. . . : : .::::::. .:: : . : ::..: :
CCDS70 RGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLID
220 230 240 250 260 270
320
pF1KE4 FLLYQ
.: :
CCDS70 YLSYN
>>CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (252 aa)
initn: 894 init1: 443 opt: 455 Z-score: 443.9 bits: 90.0 E(32554): 2.1e-18
Smith-Waterman score: 754; 52.4% identity (76.0% similar) in 225 aa overlap (59-283:30-244)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 KVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQG
..: .: ::.:::: .:. :.:..::.::
CCDS55 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQG
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 VNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVN
::..: ..:: :::::::::..:.: ::..::.:::::. ::::::: ::: :::
CCDS55 WAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVN
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 VLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQR
.::. ::..: : ::::::::..: : . ::::.. .::::::.:: :.
CCDS55 LLLQHGASVQPESDLASPIHEAARR----------AYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQ
120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 VDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLA
::::::: ::.:..:. :.::::.:: .. :. :: :.::. . .::.:: ..:.
CCDS55 RACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELV
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]