Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4051
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4051, 294 aa
1>>>pF1KE4051 294 - 294 aa - 294 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0571+/-0.000839; mu= 11.6590+/- 0.050
mean_var=103.8080+/-20.590, 0's: 0 Z-trim(110.4): 209 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.125881
statistics sampled from 11369 (11618) to 11369 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 294) 2031 379.2 2e-105
CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 262) 1752 328.5 3.3e-90
CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 252) 1022 195.9 2.6e-50
CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 302) 986 189.4 2.7e-48
CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 323) 978 188.0 7.9e-48
CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 ( 329) 906 174.9 6.9e-44
CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 306) 828 160.7 1.2e-39
CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 ( 278) 694 136.4 2.4e-32
CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 351 74.7 5.7e-13
CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 351 74.7 5.7e-13
CCDS34003.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2352) 348 74.3 9.9e-13
CCDS68721.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2490) 348 74.3 1e-12
CCDS34004.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2603) 348 74.3 1.1e-12
CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 351 75.0 1.1e-12
CCDS74908.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 ( 899) 330 70.7 4.6e-12
CCDS11879.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 301) 319 68.3 8e-12
CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 326 70.2 1.3e-11
CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 326 70.2 1.3e-11
CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 326 70.2 1.3e-11
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 324 69.8 1.7e-11
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 324 69.8 1.7e-11
CCDS33416.1 ASB1 gene_id:51665|Hs108|chr2 ( 335) 313 67.2 1.8e-11
CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 318 68.4 1.8e-11
CCDS33355.2 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 367) 313 67.3 2e-11
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 324 70.1 3e-11
CCDS1846.1 ASB3 gene_id:51130|Hs108|chr2 ( 518) 309 66.7 4.3e-11
CCDS54361.1 ASB3 gene_id:100302652|Hs108|chr2 ( 556) 309 66.7 4.5e-11
>>CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (294 aa)
initn: 2031 init1: 2031 opt: 2031 Z-score: 2006.2 bits: 379.2 E(32554): 2e-105
Smith-Waterman score: 2031; 100.0% identity (100.0% similar) in 294 aa overlap (1-294:1-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE4 PESPLAQLFLEREGPPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PESPLAQLFLEREGPPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
250 260 270 280 290
>>CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (262 aa)
initn: 1752 init1: 1752 opt: 1752 Z-score: 1733.1 bits: 328.5 E(32554): 3.3e-90
Smith-Waterman score: 1752; 100.0% identity (100.0% similar) in 254 aa overlap (1-254:1-254)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE4 PESPLAQLFLEREGPPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
::::::::::::::
CCDS14 PESPLAQLFLEREGASLPKPKP
250 260
>>CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (252 aa)
initn: 1189 init1: 1017 opt: 1022 Z-score: 1016.8 bits: 195.9 E(32554): 2.6e-50
Smith-Waterman score: 1653; 96.1% identity (96.1% similar) in 254 aa overlap (1-254:1-244)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQR
:::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLQHGASVQPESDLASPIHEAARR----------AYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQR
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE4 PESPLAQLFLEREGPPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
::::::::::::::
CCDS55 PESPLAQLFLEREGASLPKPKP
240 250
>>CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (302 aa)
initn: 1209 init1: 984 opt: 986 Z-score: 980.4 bits: 189.4 E(32554): 2.7e-48
Smith-Waterman score: 986; 54.6% identity (78.8% similar) in 269 aa overlap (25-293:33-301)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRN
. . ..:: .: ::.:::: .:. :.:..
CCDS35 QLTGENEKNCEVSERIRRSGPWKEISFGDYICHTFQGDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LISQGWAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGS
::.:: ::..: ..:: :::::::::..:.: ::..::.:::::. ::::::: :::
CCDS35 LIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 WDCVNLLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLA
:::.::. ::..: : ::::::::..::: ::.. :.: . ::::.. .::::::.:
CCDS35 AACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 CENQQRACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKR
: :. ::::::: ::.:..:. :.::::.:: .. :. :: :.::. . .::.::
CCDS35 CTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PVELVPPESPLAQLFLEREGPPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
..:. :.: . : .: :::::.: ::::: .:::.: :. : :: ::: :..:::.
CCDS35 ALDLAAPKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
250 260 270 280 290 300
>>CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (323 aa)
initn: 1191 init1: 966 opt: 978 Z-score: 972.1 bits: 188.0 E(32554): 7.9e-48
Smith-Waterman score: 978; 55.3% identity (79.2% similar) in 264 aa overlap (30-293:59-322)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQG
..: .: ::.:::: .:. :.:..::.::
CCDS14 KVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQG
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 WAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVN
::..: ..:: :::::::::..:.: ::..::.:::::. ::::::: ::: :::
CCDS14 VNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVN
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQ
.::. ::..: : ::::::::..::: ::.. :.: . ::::.. .::::::.:: :.
CCDS14 VLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQR
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELV
::::::: ::.:..:. :.::::.:: .. :. :: :.::. . .::.:: ..:.
CCDS14 VDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLA
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PPESPLAQLFLEREGPPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
:.: . : .: :::::.: ::::: .:::.: :. : :: ::: :..:::.
CCDS14 APKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
270 280 290 300 310 320
>>CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 (329 aa)
initn: 820 init1: 820 opt: 906 Z-score: 901.4 bits: 174.9 E(32554): 6.9e-44
Smith-Waterman score: 906; 53.1% identity (79.5% similar) in 258 aa overlap (35-291:69-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 QGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGWAVNI
.: ::.:::: .:. :.::.:.:::. ::
CCDS38 SHFYIVKGNRKEAARIAAEFYGVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYNVNA
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNLLLQH
.: :::.:::::::: :..:.. ::. ::.::..: : ::::::: .:: .:..:::..
CCDS38 VTLDHVTPLHEACLGDHVACARTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELLLEY
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQRACVK
::..: :: : :: :::: .:: ::.. ::..: ..:..: :::::::.:: .:: :.
CCDS38 GAKAQLESCLPSPTHEAASKGHHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFHCIW
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVPPESP
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CCDS38 KLLYAGADVQKGKYWDTPLHAAAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATSSSM
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290
pF1KE4 LAQLFLEREGPPS-LMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
. ...:..:. :: :.::::: ::. .: . : : .: :: ::.::
CCDS38 VERILLQHEATPSSLYQLCRLCIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
280 290 300 310 320
>>CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (306 aa)
initn: 1119 init1: 826 opt: 828 Z-score: 825.2 bits: 160.7 E(32554): 1.2e-39
Smith-Waterman score: 876; 51.9% identity (74.2% similar) in 264 aa overlap (30-293:59-305)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQG
..: .: ::.:::: .:. :.:..::.:
CCDS56 KVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQ-
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 WAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVN
::::::..:.: ::..::.:::::. ::::::: ::: :::
CCDS56 ----------------ACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVN
90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQ
.::. ::..: : ::::::::..::: ::.. :.: . ::::.. .::::::.:: :.
CCDS56 VLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQR
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELV
::::::: ::.:..:. :.::::.:: .. :. :: :.::. . .::.:: ..:.
CCDS56 VDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLA
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PPESPLAQLFLEREGPPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
:.: . : .: :::::.: ::::: .:::.: :. : :: ::: :..:::.
CCDS56 APKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
260 270 280 290 300
>>CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 (278 aa)
initn: 971 init1: 577 opt: 694 Z-score: 694.3 bits: 136.4 E(32554): 2.4e-32
Smith-Waterman score: 694; 42.3% identity (70.0% similar) in 267 aa overlap (29-291:10-275)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDW---SPMHEAAIHGHQLSLRNLIS
..:: :. : .:.:::: .:..:.:..::
CCDS70 MEPRAADGCFLGD-VGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 QGWAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDC
.: :: .:.: ..::: : : :. ::..:: ::::.. . : ::: .::.::: .:
CCDS70 SGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIEC
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VNLLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACEN
:.:::..::.:.: :::.::: : ::: :: :.:.. . :.::::..::
CCDS70 VKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 QQRACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]