Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3979
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3979, 436 aa
1>>>pF1KE3979 436 - 436 aa - 436 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1933+/-0.000933; mu= 17.7391+/- 0.056
mean_var=70.6758+/-13.778, 0's: 0 Z-trim(105.0): 88 B-trim: 41 in 1/47
Lambda= 0.152559
statistics sampled from 8120 (8211) to 8120 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 2.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 2928 653.9 8.6e-188
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 1435 325.3 7e-89
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 1116 255.2 1.1e-67
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 921 212.3 9.3e-55
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 878 202.8 6.6e-52
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 812 188.3 1.5e-47
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 806 187.0 4e-47
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 796 184.7 1.7e-46
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 733 170.9 2.4e-42
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 685 160.3 3.9e-39
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 661 155.1 1.7e-37
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 646 151.9 2.3e-36
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 643 151.2 3.8e-36
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 623 146.7 5.1e-35
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 611 144.0 3.1e-34
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 590 139.4 7.8e-33
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 590 139.5 8.7e-33
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 583 137.9 2.7e-32
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 583 137.9 2.7e-32
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 578 136.8 5.2e-32
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 578 136.8 5.4e-32
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 578 136.8 5.6e-32
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 578 136.8 5.7e-32
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 578 136.8 5.8e-32
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 578 136.8 5.8e-32
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 571 135.3 1.7e-31
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 541 128.6 1.3e-29
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 537 127.8 2.6e-29
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 534 127.1 3.9e-29
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 535 127.4 4e-29
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 526 125.3 1.3e-28
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 493 118.2 2.9e-26
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 398 97.2 5e-20
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 395 96.6 7.7e-20
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 393 96.1 1.1e-19
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 393 96.1 1.1e-19
>>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa)
initn: 2928 init1: 2928 opt: 2928 Z-score: 3485.0 bits: 653.9 E(32554): 8.6e-188
Smith-Waterman score: 2928; 100.0% identity (100.0% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVCDDYDRERNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVCDDYDRERNE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCCQRRLDDRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 YFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCCQRRLDDRM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGREPSGIIEAICIGWFTAECIVRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGREPSGIIEAICIGWFTAECIVRF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 IVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELK
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE3 FRSARYSRSLSTEFLN
::::::::::::::::
CCDS18 FRSARYSRSLSTEFLN
430
>>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (425 aa)
initn: 1435 init1: 1435 opt: 1435 Z-score: 1709.2 bits: 325.3 E(32554): 7e-89
Smith-Waterman score: 2816; 97.5% identity (97.5% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVCDDYDRERNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVCDDYDRERNE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCCQRRLDDRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCCQRRLDDRM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGREPSGIIEAICIGWFTAECIVRF
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS42 VIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSR-----------IIEAICIGWFTAECIVRF
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 IVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSI
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELK
350 360 370 380 390 400
430
pF1KE3 FRSARYSRSLSTEFLN
::::::::::::::::
CCDS42 FRSARYSRSLSTEFLN
410 420
>>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa)
initn: 939 init1: 318 opt: 1116 Z-score: 1328.6 bits: 255.2 E(32554): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 1116; 41.8% identity (71.1% similar) in 426 aa overlap (11-425:65-476)
10 20 30 40
pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG
...:::: .::: : .::: :...:..
CCDS13 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY
: . :.:.:::::: ::.::::. ::: :: ..:. ::::. .:: ::: .:..:
CCDS13 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRA-GKLRLLREMCALSFQEELLY
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150
pF1KE3 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYS-ADEPGVL---GRDEARPGGAEAAPSRRWLER
::. ::. ::.:: ... . . .: .: ::: :. .:. .: ..:
CCDS13 WGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRC-MRR
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 MRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGP
.: :.: :.: ....: .::.:: :. : : .::::. : ... . .
CCDS13 LRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLR---------EEEEQGHCSQ
220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 GREPSGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMT-VFT
. :.:..:.:::. : ..:.: . .: :.. ::..:::.:: ::::..:. . .
CCDS13 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KE3 GE------NSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVF
:. :: :...:..::::: .::..:..:::: .:::::::: .:: ::. .::.:
CCDS13 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 ICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRIL
.:::.:.:. : ..:. . ... .:::::: ::..:.::::::::: : ..::...
CCDS13 LCVAIALFAPLLYVIENEM---ADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVV
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430
pF1KE3 GGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
. ..:::.:.:.:.: :.:.: . : ::: .. :
CCDS13 ALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDI
450 460 470 480 490 500
CCDS13 LFGSASSDTRDNN
510
>>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa)
initn: 940 init1: 291 opt: 921 Z-score: 1096.5 bits: 212.3 E(32554): 9.3e-55
Smith-Waterman score: 1144; 43.4% identity (70.3% similar) in 424 aa overlap (11-420:61-465)
10 20 30 40
pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG
...:::: :: : : ::: :.:.:.
CCDS10 METPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRL
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY
::: ......:::::.. .:.:::: ::: :. .. . ::: . .:: ::: .:. :
CCDS10 CRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAA-GKLVLLQEMCALSFQEELAY
100 110 120 130 140
110 120 130 140 150
pF1KE3 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVL--GRDEARPGGAEAAPSRRW---LE
::.: :::: :: :.: .. . . . . :: :. :: :. : :: ..
CCDS10 WGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRP----ASHSSRWGLCMN
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAG
:.:. :.: :.: ....: .:..:: .. : ::.::.:: : : .... .:. :
CCDS10 RLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLR--AEEDQGECSRKCYYIF
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 PGREPSGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFT
:.:.::..::. : .::. ...::.: . ::::::.:::.:::.:. ..
CCDS10 -------IVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEP
270 280 290 300 310
280 290 300 310 320
pF1KE3 GEN-------SQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLV
:. : :...:..::::: .::..:..:::: .::::::::..:: ::. .::.
CCDS10 PEDGERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLL
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 FICVAMAIFSALSQLLEH--GLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPG
:. ::...:: : . :. : :: ::::::. ::.:::::::::::: : .:::
CCDS10 FLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLE-----FTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRSVPG
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KE3 RILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
.... ..:::...:.: : :.:.: . : :::
CCDS10 QMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLD
440 450 460 470 480 490
CCDS10 PHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
500 510
>>CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 (526 aa)
initn: 751 init1: 239 opt: 878 Z-score: 1045.3 bits: 202.8 E(32554): 6.6e-52
Smith-Waterman score: 878; 35.5% identity (65.0% similar) in 454 aa overlap (5-434:46-482)
10 20 30
pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRR
: . .. .::::.: .:: . : :: :
CCDS13 SKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTR
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VSRLHGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSF
..::.. ::... ..:::::. :..:::: .: . ::. :.:. ..: ..:
CCDS13 LGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHP-GFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAF
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KE3 YNEMIYWGLEGAHLEYCC-----QRRLD-----DRMSDTYTFYSA--DEPGVLGRDEARP
.: :::: : :: .::: :. ::: . . :: . . :. ::
CCDS13 GQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARY
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 GGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDW--RNAA
:.:. . :: :. :.:.: :: ..... ::. :..:....: .::.. :.::
CCDS13 GAARCGRLRR---RLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAA
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250
pF1KE3 ADNRSLDDRSRYSAGPGREPSGI--------IEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKR
: . ... :: : :. .: .::.::. : :.... . .: .
CCDS13 A--------AVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCH
260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 PLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENS--QLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQ
:::.::.... :.:...: : :... .. . : ...:.:.:::: :.::::: ::.
CCDS13 PLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLR
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 TLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIIS
.:: :::. :::. .::... :....::... :. :. :..::: :: .:
CCDS13 SLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDV-----GFNTIPACWWWGTVS
370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 MTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSL
::::::::. :.:: :.. .. :...::...:::::.:...: . :.. : : :
CCDS13 MTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSN
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 STEFLN
::
CCDS13 HQEFEDLLSSIDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
480 490 500 510 520
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10 20 30 40 50
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CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELCD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 DYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCC
::: . :..:::. : : ..: . . :::. ..: .:: .:. :::.. .. ::
CCDS62 DYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHT-GKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KE3 ------------QRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRR--WLERMR
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CCDS62 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWL----
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGR
....: :. ..... .:.. :. :....: ..:::.. :... .::.
CCDS62 -ALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQ--IPDSQG---------NPGE
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 EPS-GIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGE
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CCDS62 DPRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVES
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 NSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIF
. : : . .:::.:::: ..::::: ::..:: ::: :.:. .::... :...::
CCDS62 TPTLANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIF
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340 350 360 370 380 390
pF1KE3 SALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSG
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CCDS62 SVVAYTIE-----KEENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAG
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pF1KE3 IVLLALPITFIYHSFVQCYHELK-FRSARYSRSLSTEFLN
:....::::.:...: . :.. : ..:: :
CCDS62 ILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMAS
400 410 420 430 440 450
CCDS62 LTNMSRSSPSELSLNDSLR
460 470
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10 20 30
pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRL
... .:::: :.:. : :: :..::
CCDS64 WKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRL
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:. : .::::... .:::::: .: .. . . : : .: : .:.
CCDS64 ATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLS-GVLLVLDGLCPRRFLEEL
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140
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:::.. . :: .:: :..:.. . . . ..: : :: :
CCDS64 GYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFYG-----
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150 160 170 180 190 200
pF1KE3 PSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDD
:.:: :. .:.: ::.::. .. .: .::.::.:.: .:. . .. ......
CCDS64 PQRR---RLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEG---
250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 RSRYSAGPGREPS-GIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYI
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CCDS64 ------GPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYL
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pF1KE3 SVLMTVFTGENSQ-------LQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCY
..:. ::::. : . ..: .:::.:.:::: ..::::: ::...:.::..::
CCDS64 QLLLECFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCY
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 REMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMY
... ::.:: ... ::: .:: :. ..: ::.:: . ::. .:..::::::::
CCDS64 QQVGCLLLFIAMGIFTFSAAVYSVEH--DVPSTN--FTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMY
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430
pF1KE3 PITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
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CCDS64 PETHLGRFFAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRA
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CCDS64 RKKIAECLLGSNPQLTPRQEN
530 540
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10 20 30 40 50
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. .::.:::. : ..: . :::. ..: .:: .:. :::.. .. ::.
CCDS16 SVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYT-GKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCCSN
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: :.. :. : : .: ... .. . . . :. :. ::
CCDS16 RYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWI-RM---
120 130 140 150 160 170
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CCDS16 -ENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQN---EDGEVDD-------PVLE-
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:. : ::.:::.: ::. .. . .: : ::::::...: :.: .. . . :. .
CCDS16 -GV-EIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESED
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.. : ....::.:::: ..::::: .::..:: ::.. :.:. .::.:. :...:::.:
CCDS16 IENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVL
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.:. : .::. .:::: ::. :::::::::: .:.:. :......:.. ::..
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.:::::.:...: . :.. :
CCDS16 VALPITIIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSS
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CCDS12 DYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRA-GKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCC
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pF1KE3 QRRLDDRMSDTYTFYSAD-EPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQ
::: : .. .. : :. : . :: : .. .: .:.: . ..: :.::..
CCDS12 LRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQG-SPARALGPRGR-LQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGK
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..: ::: :: :. : :: ::.:: : .. : .: . ..:..:..:
CCDS12 LFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRA---------EEERGECSPKCRSLFVLETVCVAW
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pF1KE3 FTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQ--LQRAGVTLR
:. : ..: . ...:: :.. ::::::.::. :.:.:.:. . .: .. :.:::..::
CCDS12 FSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGLVLR
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.:: .:...:..:::: .::..::::..:: ::. .::.:.:::::.:. : .: :. :
CCDS12 LLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELG
290 300 310 320 330 340
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pF1KE3 LETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIY
. .::.:.::. ::..::::::::::: : ..::.... ..:::.:.:.:.: :.
CCDS12 ---ARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIF
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:.: . : ::: .. :
CCDS12 HTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAG
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::.:..: :. . . : .:: . : :
CCDS85 VDEASAAPGHPQDGSYPRQADHDDHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFP----NTLLG
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..: .: ::::::::. .: :: : .. :.:: : :....: :
CCDS85 NPKKR-----MRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLR-RPVNVPLDMFSEEIK
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. : .. : . :: : . ..: :: . . ::
CCDS85 FYELG-----------EEAMEK----FREDE-GFI-KEEERPLPEKEYQRQVWL-----L
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:: : :: :...: :::. ...:.:..: ::: : .. .. . .:. . :...
CCDS85 FEYPESSGPARVIAIVSVMVILISIVIFCLETLPELKDDKDFTGTVHRIDNTTVIYNSNI
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CCDS85 FTDPFFIVETLCIIWFSFELVVRFFACPSKTDFFKNIMNFIDIVAIIPYFITLGTEIAEQ
220 230 240 250 260 270
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CCDS85 VILFSSAVYFAEA----EEAESHFSSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMYPVTIGGKIVGSLC
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CCDS85 AIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQLLHVSSPNLASDSDLSRRSSSTMSKS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]