Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3969
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3969, 418 aa
1>>>pF1KE3969 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7258+/-0.00111; mu= 14.6759+/- 0.066
mean_var=74.8623+/-15.594, 0's: 0 Z-trim(102.8): 67 B-trim: 425 in 1/48
Lambda= 0.148232
statistics sampled from 7058 (7119) to 7058 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 2.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8509.1 FBXL14 gene_id:144699|Hs108|chr12 ( 418) 2764 601.0 6.8e-172
CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 404) 465 109.3 6.7e-24
CCDS54886.1 FBXL17 gene_id:64839|Hs108|chr5 ( 701) 381 91.5 2.7e-18
CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 735) 362 87.4 4.7e-17
CCDS10421.1 FBXL16 gene_id:146330|Hs108|chr16 ( 479) 357 86.3 6.9e-17
CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 423) 341 82.8 6.7e-16
CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 436) 319 78.1 1.8e-14
CCDS54560.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 355) 304 74.9 1.4e-13
CCDS31273.1 FBXL15 gene_id:79176|Hs108|chr10 ( 300) 269 67.4 2.1e-11
>>CCDS8509.1 FBXL14 gene_id:144699|Hs108|chr12 (418 aa)
initn: 2764 init1: 2764 opt: 2764 Z-score: 3199.5 bits: 601.0 E(32554): 6.8e-172
Smith-Waterman score: 2764; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 METHISCLFPELLAMIFGYLDVRDKGRAAQVCTAWRDAAYHKSVWRGVEAKLHLRRANPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 METHISCLFPELLAMIFGYLDVRDKGRAAQVCTAWRDAAYHKSVWRGVEAKLHLRRANPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LFPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGCYNLTDNGLGHAFVQEIGSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LFPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGCYNLTDNGLGHAFVQEIGSLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGCSNITNTGLLLIAWGLQRLKSLNLRSCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGCSNITNTGLLLIAWGLQRLKSLNLRSCR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQKLTDLSLKHISRGLTGLRLLNLSFCGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 HLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQKLTDLSLKHISRGLTGLRLLNLSFCGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ISDAGLLHLSHMGSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAMGSLRLSGLDVSFCDKVGDQSLAYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ISDAGLLHLSHMGSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAMGSLRLSGLDVSFCDKVGDQSLAYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AQGLDGLKSLSLCSCHISDDGINRMVRQMHGLRTLNIGQCVRITDKGLELIAEHLSQLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 AQGLDGLKSLSLCSCHISDDGINRMVRQMHGLRTLNIGQCVRITDKGLELIAEHLSQLTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 IDLYGCTRITKRGLERITQLPCLKVLNLGLWQMTDSEKEARGDFSPLFTVRTRGSSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 IDLYGCTRITKRGLERITQLPCLKVLNLGLWQMTDSEKEARGDFSPLFTVRTRGSSRR
370 380 390 400 410
>>CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (404 aa)
initn: 379 init1: 183 opt: 465 Z-score: 542.6 bits: 109.3 E(32554): 6.7e-24
Smith-Waterman score: 474; 30.4% identity (58.8% similar) in 391 aa overlap (2-385:21-377)
10 20 30 40
pF1KE3 METHISCLFP-ELLAMIFGYLDVRDKGRAAQVCTAWRDAAY
:. :. .: ::: ::..::: : ::: :: :
CCDS54 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 HKSVWRGVEAKLHLRRANPSLFPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGC
: :. .. . ..: ....: .. .. .: .. ...:.: ::
CCDS54 DGSNWQRIDL-FDFQR-------DIEGRVVENIS----KRCGGF-------LRKLSLRGC
70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 YNLTDNGLGHAFVQEIGSLRALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGCSNITNTG
.. ::.: ..:.:. ....:::. : . :: :. :: :... :...:. :
CCDS54 LGVGDNAL-RTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTD------AEGCPLLEQLNISWCDQVTKDG
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LLLIAWGLQRLKSLNLRSCRHLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQKLTDLSL
. .. : ::.: :..: .: : .. .... : : :.:: : ..:: .:
CCDS54 IQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAH-------CPELVTLNLQTCLQITDEGL
160 170 180 190 200
230 240 250 260 270
pF1KE3 KHISRGLTGLRLLNLSFCGGISDAGLLHLSHM-GSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAMGSL
: :: :. : : :..:.:: : :.. :: :.. :....:.:. :: .
CCDS54 ITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCH
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 RLSGLDVSFCDKVGDQSLAYIAQGLDGLKSLSLCSCH-ISDDGINRMVRQM--HG-LRTL
.: .:. : .. :..: .. :. ::: :. :.:::: .. : :...
CCDS54 ELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVI
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 NIGQCVRITDKGLELIAEHLSQLTGIDLYGCTRITKRGLERI-TQLPCLKVLNLGLWQMT
.. .: ::: .:: . . .: :.:: : .::. :..:. :.:: .::
CCDS54 ELDNCPLITDASLEHL-KSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTP
330 340 350 360 370 380
400 410
pF1KE3 DSEKEARGDFSPLFTVRTRGSSRR
CCDS54 PPSVGGSRQRFCRCCIIL
390 400
>>CCDS54886.1 FBXL17 gene_id:64839|Hs108|chr5 (701 aa)
initn: 599 init1: 206 opt: 381 Z-score: 441.9 bits: 91.5 E(32554): 2.7e-18
Smith-Waterman score: 451; 26.1% identity (59.0% similar) in 376 aa overlap (5-379:321-666)
10 20 30
pF1KE3 METHISCLFPELLAMIFGYLDVRDKGRAAQ-VCT
:. : : .: ::. :.. .. .:. ::
CCDS54 QQHECGDADCRESPENPCDCHREPPPETPDINQLPPSILLKIFSNLSLDERCLSASLVCK
300 310 320 330 340 350
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 AWRDAAYHKSVWRGVEAKLHLRRANPSLFPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIE
::: . :. .: : : :. . . : . . ::
CCDS54 YWRDLCLDFQFWK----QLDLSS---------------RQQVTD--ELLEKIASRSQNII
360 370 380
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SLNLSGCYNLTDNGLGHAFVQEIGSLRALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGC
.:.: : ...:::. . : :: :::..:.:. .:.. :. ...:.
CCDS54 EINISDCRSMSDNGVCVLAFKCPGLLRYTAYR-CKQLSDTSIIAVASHCPLLQKVHVGNQ
390 400 410 420 430 440
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 SNITNTGLLLIAWGLQRLKSLNLRSCRHLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQ
...:. :: .. ..::.... .: ..:: :. .: .::: :... .:. .
CCDS54 DKLTDEGLKQLGSKCRELKDIHFGQCYKISDEGMIVIA-------KGCLKLQRIYMQENK
450 460 470 480 490 500
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 KLTDLSLKHISRGLTGLRLLNLSFCGGISDAGLLHLSHMGSLRSLNLRSCDNISDTGIMH
.:: :.: ... :. ... :. ... :..::... .: ::.:: .... .:.
CCDS54 LVTDQSVKAFAEHCPELQYVGFMGCS-VTSKGVIHLTKLRNLSSLDLRHITELDNETVME
510 520 530 540 550 560
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 LAMGSLRLSGLDVSFCDKVGDQSLAYIAQGLDGLKSLSLCSCHISDDGINRMVRQMHGLR
.. ::.:.. . ..:. . ::. ..:: : : ::.:.: .. . : ..
CCDS54 IVKRCKNLSSLNLCLNWIINDRCVEVIAKEGQNLKELYLVSCKITDYALIAIGRYSMTIE
570 580 590 600 610 620
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 TLNIGQCVRITDKGLELIAEHLSQLTGIDLYGCTRITKRGLERITQLPCLKVLNLGLWQM
:...: : .:::.: :::. ..: . :. : .... .:...:
CCDS54 TVDVGWCKEITDQGATLIAQSSKSLRYLGLMRCDKVNEVTVEQLVQQYPHITFSTVLQDC
630 640 650 660 670 680
400 410
pF1KE3 TDSEKEARGDFSPLFTVRTRGSSRR
CCDS54 KRTLERAYQMGWTPNMSAASS
690 700
>>CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (735 aa)
initn: 469 init1: 150 opt: 362 Z-score: 419.6 bits: 87.4 E(32554): 4.7e-17
Smith-Waterman score: 415; 31.5% identity (64.0% similar) in 292 aa overlap (92-378:402-680)
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGCYNLTDNGLGHAFV-QEIGSLR
.... . : .:: .. :. .. .:
CCDS57 VEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASF--KFIDKNYPNLS
380 390 400 410 420
130 140 150 160 170
pF1KE3 ALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGCSNITNTGL--LLIAWGLQRLKSLNLRS
. .. :: :::::: : . :: : ::.:..: : . :: .: . . .:.. ::: .
CCDS57 HIYMADCKGITDSSL-RSLSPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMRIRELNLSN
430 440 450 460 470 480
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 CRHLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQKLTDLSLKHISRGLTGLRLLNLSFC
: .:::... .:. : : .:. :.:..:..:: .. .: .. . :.....
CCDS57 CVRLSDASVMKLS-------ERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYI---VNIFSLVSIDLS
490 500 510 520 530
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 G-GISDAGLLHLSHMGSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAMGSLRLSGLDVSFCDKVGDQSL
: ::. :: ::. .:. :.. : :.: ::. . .:: : ::::.:....:. .
CCDS57 GTDISNEGLNVLSRHKKLKELSVSECYRITDDGIQAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMII
540 550 560 570 580 590
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AYIAQGLDGLKSLSLCSC-HISDDGINRMVRQMHGLRTLNIGQCVRITDKGLELIAEHLS
.: .: :::. .: .:.:.... . . : :. :.:. :: .::. :: . .
CCDS57 KALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLSAKCHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCK
600 610 620 630 640 650
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 QLTGIDLYGCTRITKRGLERITQLPCLKVLNLGLWQMTDSEKEARGDFSPLFTVRTRGSS
:: . . :: :.:.. .:..
CCDS57 QLRILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQEYNTNDPPRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGA
660 670 680 690 700 710
>>CCDS10421.1 FBXL16 gene_id:146330|Hs108|chr16 (479 aa)
initn: 510 init1: 184 opt: 357 Z-score: 416.7 bits: 86.3 E(32554): 6.9e-17
Smith-Waterman score: 445; 28.1% identity (60.7% similar) in 366 aa overlap (29-388:118-454)
10 20 30 40 50
pF1KE3 METHISCLFPELLAMIFGYLDVRDKGRAAQVCTAWRDAAYHKSVWRGVEAKLHLRRAN
:::: ::: . :. . : :. :: ..
CCDS10 HPAERPPLATDEKILNGLFWYFSACEKCVLAQVCKAWRRVLYQPKFWAGLTPVLHAKELY
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 PSLFPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGCYNLTDNGLGHAFVQEIGS
...:. . . . .: .. : .. . :..... .. : :. .:
CCDS10 -NVLPGGEKEFVN-LQGFAARGFEGFCLVGVSDLDICEFIDNYALSKKG-----------
150 160 170 180 190
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LRALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGCSNITNTGLLLIAWGL--QRLKSLNL
..:..:. . :::..: . . ..:. :::.::...:..:: :. :. ::..
CCDS10 VKAMSLKR-STITDAGLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAGL----WSSLSARITSLSV
200 210 220 230 240
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RSCRHLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQKLTDLSLKHIS-RGLTGLRLLNL
.: ...: .:. .. . . :: :.:: ..:: .: ... : . . : :
CCDS10 SDCINVADDAIAAISQLLPNLAE-------LSLQ-AYHVTDTALAYFTARQGHSTHTLRL
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SFCGGISDAGLLHLSH-MGSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAMGSLRLSGLDVSFCDKVGD
: :.. :.... : . .: .:.: .:....: :. .: . .: .::.:.: .. :
CCDS10 LSCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAENLRKLRSLDLSWCPRITD
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 QSLAYIAQGLDGLKSLSLCSC-HISDDGINRMVRQMHGLRTLNIGQCVRITDKGLE-LIA
..: :.: : :. : : : .:.: :.. . : .::.: . : .. : ::. :.:
CCDS10 MALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYL-STMSSLRSLYLRWCCQVQDFGLKHLLA
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 EHLSQLTGIDLYGCTRITKRGLERITQLPCLKVLNLGLWQMTDSEKEARGDFSPLFTVRT
:..: ..: :: .: :: ..:: :. :.:
CCDS10 --LGSLRLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCLVI
430 440 450 460 470
pF1KE3 RGSSRR
CCDS10 E
>>CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (423 aa)
initn: 408 init1: 159 opt: 341 Z-score: 399.0 bits: 82.8 E(32554): 6.7e-16
Smith-Waterman score: 522; 34.1% identity (65.3% similar) in 311 aa overlap (81-385:95-396)
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 KLHLRRANPSLFPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGCYNLTDNGLGH
::. :. ::: :::.:: ..::. .
CCDS26 EGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIEHLNLNGCTKITDSTC-Y
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 AFVQEIGSLRALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGCSNITNTGLLLIAWGLQR
.. . ..:. :.:. : .::.::: :.. ..:: :.:. :..::. :. .. : .
CCDS26 SLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLSWCDQITKDGIEALVRGCRG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 LKSLNLRSCRHLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQKLTDLSLKHISRGLTGL
::.: ::.: .: : .. :. .. : : .:.::.:...:: .. .: :: :
CCDS26 LKALLLRGCTQLEDEALKHIQNY-------CHELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE3 RLLNLSFCGGISDAGLLHLS-HMGSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAMGSLRLSGLDVSFC
. : :: :....::.: :. . :. :. :....:.:. :: . .: .:. :
CCDS26 QALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEEC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 DKVGDQSLAYIAQGLDGLKSLSLCSCH-ISDDGINRMVRQMHG---LRTLNIGQCVRITD
. :..: .. :..::: :. :.:::: .. . : ::.:.. .:. :::
CCDS26 ILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLELDNCLLITD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 KGLELIAEHLSQLTGIDLYGCTRITKRGLERI-TQLPCLKVLNLGLWQMTDSEKEARGDF
.:: . :. : ..:: : ..:. :..:. .::: .::
CCDS26 VALEHL-ENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPTAVAGSGQR
360 370 380 390 400 410
410
pF1KE3 SPLFTVRTRGSSRR
CCDS26 LCRCCVIL
420
>>CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (436 aa)
initn: 474 init1: 155 opt: 319 Z-score: 373.4 bits: 78.1 E(32554): 1.8e-14
Smith-Waterman score: 452; 32.5% identity (60.8% similar) in 311 aa overlap (81-385:108-409)
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 KLHLRRANPSLFPSLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGCYNLTDNGLGH
.: :. ::: :::.:: . :: .
CCDS32 EGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTD-ATCT
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 AFVQEIGSLRALNLSLCKQITDSSLGRIAQYLKGLEVLELGGCSNITNTGLLLIAWGLQR
.. . ..:: :.:. : .::. :: ... :: :... :...:. :. .. :
CCDS32 SLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCDQVTKDGIQALVRGCGG
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 LKSLNLRSCRHLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQKLTDLSLKHISRGLTGL
::.: :..: .: : .. .... : : :.:: : ..:: .: : :: :
CCDS32 LKALFLKGCTQLEDEALKYIGAH-------CPELVTLNLQTCLQITDEGLITICRGCHKL
200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE3 RLLNLSFCGGISDAGLLHLSHM-GSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAMGSLRLSGLDVSFC
. : : :..:.:: : :.. :: :.. :....:.:. :: . .: .:. :
CCDS32 QSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHELEKMDLEEC
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 DKVGDQSLAYIAQGLDGLKSLSLCSCH-ISDDGINRMVRQM--HG-LRTLNIGQCVRITD
.. :..: .. :. ::: :. :.:::: .. : :..... .: :::
CCDS32 VQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 KGLELIAEHLSQLTGIDLYGCTRITKRGLERI-TQLPCLKVLNLGLWQMTDSEKEARGDF
.:: . . .: :.:: : .::. :..:. :.:: .::
CCDS32 ASLEHL-KSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQR
370 380 390 400 410 420
410
pF1KE3 SPLFTVRTRGSSRR
CCDS32 FCRCCIIL
430
>>CCDS54560.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 461 init1: 159 opt: 304 Z-score: 357.4 bits: 74.9 E(32554): 1.4e-13
Smith-Waterman score: 413; 31.3% identity (59.1% similar) in 335 aa overlap (11-329:18-323)
10 20 30 40 50
pF1KE3 METHISCLFPELLAMIFGYLDVRDKGRAAQVCTAWRDAAYHKSVWRGVEAKLH
::: ::..::. : ::. :: : : :. ..
CCDS54 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILALDGSNWQRID----
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LRRANPSLFP-SLQARGIRRVQILSLRRSLSYVIQGMANIESLNLSGCYNLTDNGLGHAF
:: . ...: : :. .: .: .. ...:.: :: .. :..: ..:
CCDS54 -------LFNFQTDVEG-RVVENIS-KRCGGF-------LRKLSLRGCIGVGDSSL-KTF
60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KE3 VQEIGSLRALNLSLCKQITDS---SLGRIAQYLKGLE-------VLELGGCSNITNTGLL
.:. ... :::. : .:::: ::.:. . :: .. :.: .:: ::. :..
CCDS54 AQNCRNIEHLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVV
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LIAWGLQRLKSLNLRSCRHLSDVGIGHLAGMTRSAAEGCLGLEQLTLQDCQKLTDLSLKH
: : .::..: : .: .:.:... : :. .: :. : :..::: ..
CCDS54 QICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTAL-GL------NCPRLQILEAARCSHLTDAGFTL
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KE3 ISRGLTGLRLLNLSFCGGISDAGLLHLS-HMGSLRSLNLRSCDNISDTGIMHLAM---GS
..:. :. ..: : :.:. :..:: : .:..:.: :. :.: ::.::. :
CCDS54 LARNCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGH
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 LRLSGLDVSFCDKVGDQSLAYIAQGLDGLKSLSLCSCH-ISDDGINRMVRQMHGLRTLNI
:: :... : . : .: .. .. ::. : : .:. .. ::.:: :.
CCDS54 ERLRVLELDNCLLITDVALEHL-ENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAY
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 GQCVRITDKGLELIAEHLSQLTGIDLYGCTRITKRGLERITQLPCLKVLNLGLWQMTDSE
CCDS54 FAPVTPPTAVAGSGQRLCRCCVIL
340 350
>>CCDS31273.1 FBXL15 gene_id:79176|Hs108|chr10 (300 aa)
initn: 188 init1: 117 opt: 269 Z-score: 318.0 bits: 67.4 E(32554): 2.1e-11
Smith-Waterman score: 269; 26.8% identity (64.7% similar) in 224 aa overlap (111-328:53-269)
90 100 110 120 130
pF1KE3 SLSYVIQGMANIESLNLSGCYNLTDNGLGHAFVQ-EIGSLRALNLS-LCKQITDSSLGRI
..:: ....:: .. . . :: ..:.:.
CCDS31 PWEDVLLPHVLNRVPLRQLLRLQRVSRAFRSLVQLHLAGLRRFDAAQVGPQIPRAALARL
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 AQYLKGLEVLELGGCSN-ITNTGLLLIAWGLQRLKSLNLRSCRHLSDVGIGHLAGMTRSA
. .::. : :. : . ... :. . .:.:. : .: .:: ..: ::
CCDS31 LRDAEGLQELALAPCHEWLSDEDLVPVLARNPQLRSVALGGCGQLSRRALGALA------
90 100 110 120 130
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 AEGCLGLEQLTLQDCQKLTDLSLKHISRGLTGLRLLNLSFCGGISDAGLLHLSHM--GSL
::: :..:.: :. . :.:. .. .:. :.:. : ..: ....:.. ..:
CCDS31 -EGCPRLQRLSLAHCDWVDGLALRGLADRCPALEELDLTACRQLKDEAIVYLAQRRGAGL
140 150 160 170 180 190
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 RSLNLRSCDNISDTGIMHLAMGSLRLSGLDVSFCDKVGDQSLAYIAQGLDGLKSLSLCSC
:::.: :..:.....:: . .: ::.. : .::.... .:. :.:: . :
CCDS31 RSLSLAVNANVGDAAVQELARNCPELHHLDLTGCLRVGSDGVRTLAEYCPVLRSLRVRHC
200 210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 H-ISDDGINRMVRQMHGLRTLNIGQCVRITDKGLELIAEHLSQLTGIDLYGCTRITKRGL
: .......:. ..
CCDS31 HHVAESSLSRLRKRGVDIDVEPPLHQALVLLQDMAGFAPFVNLQV
260 270 280 290 300
418 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 08:28:19 2016 done: Sun Nov 6 08:28:20 2016
Total Scan time: 2.490 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]