Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3958
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3958, 446 aa
1>>>pF1KE3958 446 - 446 aa - 446 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9978+/-0.0012; mu= 11.3847+/- 0.071
mean_var=194.1387+/-41.151, 0's: 0 Z-trim(108.8): 140 B-trim: 399 in 1/52
Lambda= 0.092049
statistics sampled from 10316 (10467) to 10316 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 3119 427.1 1.8e-119
CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 1599 225.2 1e-58
CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 1582 223.0 4.9e-58
CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 1576 222.2 8.5e-58
CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 1521 214.9 1.4e-55
CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 1473 208.5 1.1e-53
CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 1457 206.4 4.9e-53
CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 1446 204.9 1.3e-52
CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 1416 200.9 2.1e-51
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 900 132.4 9.2e-31
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 871 128.6 1.3e-29
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 787 117.4 3.1e-26
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 781 116.7 5.4e-26
CCDS7947.2 TRIM48 gene_id:79097|Hs108|chr11 ( 224) 729 109.3 3.9e-24
CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 623 95.7 1.1e-19
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 593 91.7 1.8e-18
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 549 85.8 1e-16
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 537 84.2 3.1e-16
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 537 84.3 3.1e-16
CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 534 83.7 3.2e-16
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 516 81.5 2.2e-15
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 497 79.0 1.3e-14
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 481 76.8 5.2e-14
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 480 76.7 5.9e-14
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 480 76.7 6.1e-14
CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 478 76.7 1e-13
CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 463 74.2 2.2e-13
CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 463 74.2 2.2e-13
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 463 74.4 2.8e-13
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 463 74.4 2.8e-13
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 462 74.3 3e-13
CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 431 70.1 4.6e-12
CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 431 70.2 5.3e-12
CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 427 69.7 8.2e-12
CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 425 69.3 8.5e-12
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 422 69.0 1.2e-11
CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 409 67.3 4.1e-11
CCDS5679.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 500) 406 66.9 5.4e-11
CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4 ( 437) 401 66.1 7.8e-11
>>CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 (446 aa)
initn: 3119 init1: 3119 opt: 3119 Z-score: 2258.5 bits: 427.1 E(32554): 1.8e-119
Smith-Waterman score: 3119; 100.0% identity (100.0% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP
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CCDS20 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 RLFEDVRSWMFRRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNNSWIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RLFEDVRSWMFRRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNNSWIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSVSFLNVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSVSFLNVT
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE3 KSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR
::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR
430 440
>>CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 1600 init1: 1220 opt: 1599 Z-score: 1167.6 bits: 225.2 E(32554): 1e-58
Smith-Waterman score: 1599; 52.3% identity (77.6% similar) in 451 aa overlap (1-445:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP
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CCDS55 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDSPFLVQCSECTKSTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE
....:::: .:.....:::.::: :::::.:.:::::.::::::..:.::::::::.:::
CCDS55 QINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSLLCLLCSSSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR
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CCDS55 HRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP
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CCDS55 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMYEELNEMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI
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CCDS55 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANSDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 RLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNN
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CCDS55 FLCEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 SWIRKNSTM-VNSED-IFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSV
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CCDS55 YWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTTSPLLLQYIPRPTSRVGLFLDCEAKTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KE3 SFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR
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CCDS55 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF
430 440 450
>>CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 1588 init1: 1227 opt: 1582 Z-score: 1155.4 bits: 223.0 E(32554): 4.9e-58
Smith-Waterman score: 1582; 52.1% identity (77.2% similar) in 451 aa overlap (1-445:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP
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CCDS53 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE
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CCDS53 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR
: :.:.::: ::::::::::..:. ::.: ::.::: : . :. : :: . ::
CCDS53 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP
::.:. :.:::..:: :.:. .:::..:. : .:: .. . :. ::.:: ::::::
CCDS53 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI
:::::: .:::. ::::::::::::.::::.::::::: :::.:::.:..: : .: .:
CCDS53 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANSDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 RLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNN
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CCDS53 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 SWIRKNST--MVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSV
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CCDS53 YRKEKNQNEKIDGKEGLFLLGCIKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KE3 SFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR
::..:..::::.. : :.. :.::.: :
CCDS53 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF
430 440 450
>>CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 1589 init1: 1229 opt: 1576 Z-score: 1151.1 bits: 222.2 E(32554): 8.5e-58
Smith-Waterman score: 1576; 51.9% identity (77.2% similar) in 451 aa overlap (1-445:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP
:.: . ..:: :: : .:.::..::::: :::::::::. :.:.. ..: : . .
CCDS82 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE
....:::: ::.....:::.::: :::::.:.:::::.:::.::..:.::::::::.:::
CCDS82 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR
: :.:.::: ::::::::::..:. ::.: ::.::: : . :. : :: . ::
CCDS82 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP
::.:. :.:::..:: :.:. .:::..:. : .:: .. . :. ::.:: ::::::
CCDS82 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI
:::::: .:::. ::::::::::::.::::.::::::: :::.:::.:..: : .:..:
CCDS82 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANNDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 RLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNN
:.: .:: . . : . : :::...:. ::.:::. : .: .::.::::
CCDS82 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 SWIRKNST--MVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSV
.::.. . .. .::: :.: : . .:.::::.. .:: :: .:::.::: :. .:
CCDS82 YRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KE3 SFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR
::..:..::::.. : :.. :.::.: :
CCDS82 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF
430 440 450
>>CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 1475 init1: 1176 opt: 1521 Z-score: 1111.6 bits: 214.9 E(32554): 1.4e-55
Smith-Waterman score: 1521; 51.1% identity (75.2% similar) in 452 aa overlap (1-445:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP
:.: .:..::.:::: :::::..::::: :::::::::. :.:.. ..: : . .
CCDS60 MNSGISQVFQRELTCPICLNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPILTQCFECLKTTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE
. ..:::: ::.... ::::::: :::::.:.:::::.:::.::..:.::::::::.: :
CCDS60 QRNLKTNIRLKKMASRARKASLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR
: :.: : : :::::::::::.:. ::.:. :::::: : :. : .: . ::
CCDS60 HRYHRHCPAEWAAEEHREKLLKKMQSLWEKVCENQRNLNVETTRISHWKDYVNVRLEAIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP
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CCDS60 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGTYAELMKMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISF-HFEVTNHN
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CCDS60 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNLELRAGPITGLRDRLNQFRVDITLPHNEANSHI
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300 310 320 330 340 350
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CCDS60 FRR-GDLRSICIGCDRQNAPHITATPTSFLAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCN
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pF1KE3 NSW--IRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGS
. : .:... . : .: : :.: : . .:.::::. .:. .: ..::.::: :. .
CCDS60 KYWKGTNQNGNIHGEEGLFSLGCVKNDIQCSLFTTSPLTLQYVPRPTNHVGLFLDCEART
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:::..:..:: : . : :.. :.::.: :
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10 20 30 40 50 60
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: : ... .:::: :: .::.::::::::: :: ::::: ::.. .: ::.::: :
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CCDS60 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
70 80 90 100 110 120
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CCDS60 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
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CCDS60 L-LFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCR
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..: ..:. ..:: ::::::::::.::.:..:::..:::: .: : .:::::.: : ::
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10 20 30 40 50 60
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CCDS73 FDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT
420 430 440
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CCDS53 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRP-QNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE
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CCDS53 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT
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pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP
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CCDS53 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP
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pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI
:: ::::. .. ::.. . .. :::::::::. :::.. :: :::. .. :. :
CCDS53 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI
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pF1KE3 RLFEDVRSWMFR----RGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNN
: :::: .: .: . . : ::.:::..:. ::::::.:: : .: :::: .
CCDS53 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD
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CCDS53 SRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSVSF
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CCDS53 FDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT
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CCDS73 HMAHSHSPIGWAAEECRVQKLIKEMDYLWKINQETQNNLNQETSKFCSLVDYVSLRKVII
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CCDS73 TIQYQKMHIFLDEEEQRHLQALEREAKELFQQLQDSQVRMTQHLEGMKDMYRELWETYHM
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pF1KE3 PDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHN
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CCDS73 PDVELLQDVGNISARTDLAQMPKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDNALSTEMTPCY
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 IRLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCN
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CCDS73 ISLSEDVRRVIFGDDHRSAPMDPQGVESFAVWCAQAFTSGKHYWEVDVTHSSNWILGVCR
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CCDS73 DSRTADTNIVIDSDKTFFSISSKTSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGWVGVFLDYDNGSVS
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CCDS73 FFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT
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CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
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CCDS31 LGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRCQL
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CCDS31 PALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANP
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CCDS31 ELILSEDRRS--VQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWAL
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pF1KE3 GVCNNSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFES
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CCDS31 GVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYNS-SERALAP--LRDPPRRVGIFLDYEA
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pF1KE3 GSVSFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR
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CCDS31 GHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 08:34:40 2016 done: Sun Nov 6 08:34:41 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]