Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3954
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3954, 616 aa
1>>>pF1KE3954 616 - 616 aa - 616 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8358+/-0.00107; mu= 16.1675+/- 0.063
mean_var=80.1652+/-16.921, 0's: 0 Z-trim(103.9): 174 B-trim: 18 in 1/46
Lambda= 0.143246
statistics sampled from 7470 (7651) to 7470 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 3.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 4197 877.7 0
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 2469 520.6 2.2e-147
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 1483 316.8 5.2e-86
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 1462 312.5 1e-84
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 1462 312.5 1.1e-84
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 1462 312.5 1.1e-84
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 1462 312.5 1.1e-84
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 1320 283.2 7.1e-76
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 1159 249.9 7.4e-66
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 1097 237.1 5.4e-62
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 1089 235.4 1.7e-61
CCDS69154.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 584) 898 195.9 1.2e-49
CCDS69155.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 551) 845 185.0 2.3e-46
CCDS32813.1 KLHL14 gene_id:57565|Hs108|chr18 ( 628) 813 178.4 2.5e-44
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 787 173.0 9.9e-43
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 787 173.0 1e-42
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 742 163.7 6.2e-40
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 735 162.2 1.6e-39
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 717 158.5 2e-38
CCDS35217.1 KLHL15 gene_id:80311|Hs108|chrX ( 604) 713 157.7 4e-38
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 710 157.1 6.1e-38
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 699 154.8 2.9e-37
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 694 153.8 6e-37
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 691 153.2 9.5e-37
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 671 149.0 1.4e-35
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 670 148.8 1.6e-35
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 654 145.5 1.9e-34
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 623 139.1 1.5e-32
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 622 138.9 2e-32
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 605 135.4 2.1e-31
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 592 132.6 1e-30
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 592 132.7 1.3e-30
CCDS53882.1 KLHL33 gene_id:123103|Hs108|chr14 ( 533) 585 131.2 3.3e-30
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 576 129.4 1.4e-29
CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX ( 644) 559 125.9 1.6e-28
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 556 125.3 2.3e-28
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 546 123.3 1.4e-27
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 540 122.0 2.3e-27
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 527 119.3 1.5e-26
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 483 110.2 8.2e-24
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 482 110.0 9e-24
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 482 110.0 1.1e-23
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 482 110.0 1.1e-23
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 469 107.3 6.2e-23
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 467 106.9 7.9e-23
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 465 106.5 1.1e-22
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 460 105.4 2.2e-22
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 442 101.7 3.4e-21
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 442 101.7 3.4e-21
CCDS33848.2 KBTBD12 gene_id:166348|Hs108|chr3 ( 623) 437 100.7 6.1e-21
>>CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 (616 aa)
initn: 4197 init1: 4197 opt: 4197 Z-score: 4688.9 bits: 877.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4197; 100.0% identity (100.0% similar) in 616 aa overlap (1-616:1-616)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLVADEQRVPAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLVADEQRVPAH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDGGNIDYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDGGNIDYVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNHFGTLSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNHFGTLSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLENIHFPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLENIHFPLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTNQERLLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTNQERLLFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGSFSRDNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGSFSRDNGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSSVETYSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSSVETYSPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 TDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGGHDYQIGPYRKNLLCYDHRTDVWEERRPMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGGHDYQIGPYRKNLLCYDHRTDVWEERRPMT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 TARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAPLLHANSESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAPLLHANSESG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 VAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSACVCALEPRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSACVCALEPRPE
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE3 DKKKKGKGKRHQDRGQ
::::::::::::::::
CCDS10 DKKKKGKGKRHQDRGQ
610
>>CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 (553 aa)
initn: 2580 init1: 2469 opt: 2469 Z-score: 2759.7 bits: 520.6 E(32554): 2.2e-147
Smith-Waterman score: 3634; 89.8% identity (89.8% similar) in 616 aa overlap (1-616:1-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLVADEQRVPAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLVADEQRVPAH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDGGNIDYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDGGNIDYVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNHFGTLSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNHFGTLSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLENIHFPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLENIHFPLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTNQERLLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTNQERLLFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGSFSRDNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGSFSRDNGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSSVETYSPK
:::::::::
CCDS76 DAASNLLYR---------------------------------------------------
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 TDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGGHDYQIGPYRKNLLCYDHRTDVWEERRPMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ------------FTYGHAGTIYKDFVYISGGHDYQIGPYRKNLLCYDHRTDVWEERRPMT
370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 TARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAPLLHANSESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAPLLHANSESG
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 VAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSACVCALEPRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSACVCALEPRPE
480 490 500 510 520 530
610
pF1KE3 DKKKKGKGKRHQDRGQ
::::::::::::::::
CCDS76 DKKKKGKGKRHQDRGQ
540 550
>>CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 (617 aa)
initn: 1417 init1: 411 opt: 1483 Z-score: 1657.7 bits: 316.8 E(32554): 5.2e-86
Smith-Waterman score: 1483; 38.6% identity (71.5% similar) in 594 aa overlap (12-601:17-599)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLV-ADE
.: : . ... . :::.::: ... :..::.:::.:: .:
CCDS65 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAG-TTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QRV-PAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDG
... :.:: ..: ::::..::: ::.: ..: :.. .::: ..::.: ..: :.
CCDS65 DEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 GNIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILN
:.. .::.: .::: :.::: .: . :: :: . . ..:. :.: ..: ....:::.
CCDS65 DNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HFGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLE
.: .: : .::. . ...: :::. ... : .:..:: .:: . : .: ....
CCDS65 NFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NIHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTN
::.:::. .::.. :. . ... . .: ... :: :. :::::. :::.:..
CCDS65 NIRFPLMTPQDLINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 QERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGS
. .:. .:: : .. : .: . . : ....: . .:. : : .: .::.:.:....::.
CCDS65 STHLVTLGG-VLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 FSRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSS
. :. : .: . ..:.::: ..:..:::.:..:. :.:.... : :.:::. : :..
CCDS65 SNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELAT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VETYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGG--HDYQIGPYRKNLLCYDHRTD
:: :.:. . ::::: . . ::::::.: ..::::: :: ....:.:.: ::
CCDS65 VECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHD----TFQNELMCFDPDTD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 VWEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAP
: .. ::::.:: : ::..::..: :::. : . :::. : ::: .::: .:
CCDS65 KWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTS-DYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 LLHANSESGVAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSAC
.:...:. ::::.:..::..:::::.: . . :: :: : :.: . :::....: ::
CCDS65 MLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRAC
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KE3 VCALEPRPEDKKKKGKGKRHQDRGQ
. .. : ::.
CCDS65 TLTVFP-PEENPGSPSRESPLSAPSDHS
600 610
>>CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (613 aa)
initn: 1387 init1: 417 opt: 1462 Z-score: 1634.3 bits: 312.5 E(32554): 1e-84
Smith-Waterman score: 1462; 38.1% identity (70.8% similar) in 586 aa overlap (20-601:24-599)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLVADE--
.... :::.::: ... ::.::.:::.:. .
CCDS55 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QRVPAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDGG
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pF1KE3 NIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNH
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: :.:.:. :.::: . . ::::::.: .::::: :: ..:.:.:.: ::
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: : .:: :.:.:. :.::: . . ::::::.: .::::: :: ..:.:.:
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CCDS14 GGIRACTLTVFP-PEETTPSPSRESPLSAP
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CCDS55 VEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVT
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CCDS55 LMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTA
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pF1KE3 ELVLDGGNIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFI
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CCDS55 KLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYV
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pF1KE3 DGFILNHFGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAH
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CCDS55 NSFVLKNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDF
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 ARQVLENIHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKR
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CCDS55 AAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDR
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CCDS55 TAIRSDTTHLVTLGG-VLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFL
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CCDS55 YVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNA
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CCDS55 AGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHD----TFQKELMC
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CCDS55 FDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTS-DYDDVLSCEYYSPILDQ
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pF1KE3 AGGSACVCALEPRPEDKKKKGKGKRHQDRGQ
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CCDS55 GGIRACTLTVFP-PEETTPSPSRESPLSAP
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CCDS12 GAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQGQLLDVVLTINREAF
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CCDS12 PAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHIIDFAYSAEVTLDLDCVQ
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CCDS12 DVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSLASLRESVDAFTFRHFLQ
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CCDS12 IAEEEDFLR-LPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHDPARRPRASHVLCHIRF
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CCDS12 PLMQSSELVDSVQ--TLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEMQSPRTAVRSDVPSL
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CCDS12 VTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVAVLDNFVYVAGGQHL
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CCDS12 QYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYATGGRNRAGSLASVE
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CCDS12 RYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISV-EDKKALHCYDPVADQWEF
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CCDS12 KAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRC--FDVLAVEYYVPETDQWTSVSPMRAG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]