Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3950
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3950, 783 aa
1>>>pF1KE3950 783 - 783 aa - 783 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8663+/-0.000383; mu= 2.3633+/- 0.024
mean_var=322.0374+/-65.900, 0's: 0 Z-trim(123.2): 124 B-trim: 504 in 2/59
Lambda= 0.071470
statistics sampled from 42571 (42706) to 42571 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.501), width: 16
Scan time: 12.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004342 (OMIM: 610584) tripartite motif-conta ( 783) 5410 571.9 3.7e-162
XP_011542494 (OMIM: 610584) PREDICTED: tripartite ( 781) 5372 567.9 5.7e-161
XP_016856812 (OMIM: 610584) PREDICTED: tripartite ( 854) 5281 558.6 4e-158
NP_001287818 (OMIM: 610584) tripartite motif-conta ( 721) 3506 375.5 4.4e-103
XP_016876435 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 706) 2591 281.1 1.1e-74
XP_016876434 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 710) 2589 280.9 1.3e-74
NP_055978 (OMIM: 606555) E3 ubiquitin-protein liga ( 710) 2589 280.9 1.3e-74
XP_016876437 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 688) 2132 233.8 1.9e-60
XP_016876436 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 692) 2130 233.6 2.2e-60
XP_005267359 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 714) 1910 210.9 1.5e-53
NP_443210 (OMIM: 606555) E3 ubiquitin-protein liga ( 550) 1636 182.6 4e-45
XP_016876432 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 791) 1638 182.9 4.5e-45
XP_011534691 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 802) 1638 182.9 4.6e-45
XP_016876433 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 732) 1636 182.7 4.9e-45
XP_005267358 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 777) 1636 182.7 5.1e-45
XP_006720081 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 795) 1636 182.7 5.2e-45
XP_016876439 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 593) 1121 129.5 4.1e-29
XP_016876438 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 611) 1121 129.5 4.2e-29
NP_001287681 (OMIM: 609317) E3 ubiquitin-protein l ( 573) 429 58.1 1.2e-07
NP_001287688 (OMIM: 609317) E3 ubiquitin-protein l ( 716) 429 58.2 1.4e-07
NP_061170 (OMIM: 609317) E3 ubiquitin-protein liga ( 728) 429 58.2 1.4e-07
XP_016865111 (OMIM: 609317) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 733) 429 58.2 1.4e-07
XP_016865110 (OMIM: 609317) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 745) 429 58.2 1.5e-07
XP_016865112 (OMIM: 609317) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 529) 413 56.5 3.6e-07
XP_016884728 (OMIM: 300204,300928) PREDICTED: prob ( 685) 411 56.4 5e-07
NP_438112 (OMIM: 300204,300928) probable E3 ubiqui ( 705) 411 56.4 5.1e-07
XP_016885029 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 552) 394 54.5 1.4e-06
NP_000372 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiquiti ( 667) 394 54.6 1.6e-06
NP_001092094 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiqu ( 667) 394 54.6 1.6e-06
NP_001180206 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiqu ( 667) 394 54.6 1.6e-06
XP_016885025 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 667) 394 54.6 1.6e-06
NP_150632 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiquiti ( 667) 394 54.6 1.6e-06
XP_005262119 (OMIM: 300204,300928) PREDICTED: prob ( 715) 367 51.8 1.2e-05
NP_036348 (OMIM: 300204,300928) probable E3 ubiqui ( 735) 367 51.8 1.2e-05
XP_016885031 (OMIM: 189960,300000,300552) PREDICTE ( 489) 340 48.9 6.3e-05
NP_001180208 (OMIM: 189960,300000,300552) E3 ubiqu ( 489) 340 48.9 6.3e-05
NP_912730 (OMIM: 606474) tripartite motif-containi ( 358) 326 47.3 0.00014
NP_115977 (OMIM: 606131) E3 ubiquitin-protein liga ( 353) 315 46.2 0.0003
XP_016858048 (OMIM: 606131) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 379) 315 46.2 0.00031
NP_001274120 (OMIM: 609829) FSD1-like protein isof ( 508) 293 44.1 0.0018
XP_016870676 (OMIM: 609829) PREDICTED: FSD1-like p ( 317) 283 42.8 0.0027
NP_001317668 (OMIM: 609829) FSD1-like protein isof ( 509) 285 43.2 0.0033
XP_016870674 (OMIM: 609829) PREDICTED: FSD1-like p ( 362) 280 42.6 0.0037
NP_001274121 (OMIM: 609829) FSD1-like protein isof ( 497) 283 43.0 0.0037
XP_016870672 (OMIM: 609829) PREDICTED: FSD1-like p ( 498) 283 43.0 0.0037
XP_005252311 (OMIM: 609829) PREDICTED: FSD1-like p ( 541) 282 43.0 0.0042
XP_011517379 (OMIM: 609829) PREDICTED: FSD1-like p ( 547) 282 43.0 0.0043
XP_016870671 (OMIM: 609829) PREDICTED: FSD1-like p ( 529) 280 42.7 0.0048
NP_001138785 (OMIM: 609829) FSD1-like protein isof ( 530) 280 42.7 0.0048
XP_011517381 (OMIM: 609829) PREDICTED: FSD1-like p ( 542) 280 42.7 0.0049
>>NP_001004342 (OMIM: 610584) tripartite motif-containin (783 aa)
initn: 5410 init1: 5410 opt: 5410 Z-score: 3032.1 bits: 571.9 E(85289): 3.7e-162
Smith-Waterman score: 5410; 100.0% identity (100.0% similar) in 783 aa overlap (1-783:1-783)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGLQAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGLQAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSYTPSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSYTPSLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGAGATGGSTARKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGAGATGGSTARKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKAQLSQALNGVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKAQLSQALNGVSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLLTKVTKEREHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLLTKVTKEREHKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQVSQEQWVKGALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQVSQEQWVKGALE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCRVPPVPLLQLEKCCTRNNSVTLAWRMPPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCRVPPVPLLQLEKCCTRNNSVTLAWRMPPFT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFNSSGVGPYSKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFNSSGVGPYSKTV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 VLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGLEVPTNLGRPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGLEVPTNLGRPKL
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 SGN
:::
NP_001 SGN
>>XP_011542494 (OMIM: 610584) PREDICTED: tripartite moti (781 aa)
initn: 3510 init1: 3510 opt: 5372 Z-score: 3011.0 bits: 567.9 E(85289): 5.7e-161
Smith-Waterman score: 5372; 99.6% identity (99.7% similar) in 783 aa overlap (1-783:1-781)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGLQAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGLQAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSYTPSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSYTPSLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGAGATGGSTARKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGAGATGGSTARKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKAQLSQALNGVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKAQLSQALNGVSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLLTKVTKEREHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLLTKVTKEREHKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQVSQEQWVKGALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQVSQEQWVKGALE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCRVPPVPLLQLEKCCTRNNSVTLAWRMPPFT
::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMK--LPPVPLLQLEKCCTRNNSVTLAWRMPPFT
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFNSSGVGPYSKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFNSSGVGPYSKTV
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRY
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVG
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 VLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGLEVPTNLGRPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGLEVPTNLGRPKL
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 SGN
:::
XP_011 SGN
780
>>XP_016856812 (OMIM: 610584) PREDICTED: tripartite moti (854 aa)
initn: 5278 init1: 5278 opt: 5281 Z-score: 2959.8 bits: 558.6 E(85289): 4e-158
Smith-Waterman score: 5281; 99.5% identity (99.5% similar) in 768 aa overlap (1-768:1-768)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGLQAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGLQAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSYTPSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSYTPSLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGAGATGGSTARKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGAGATGGSTARKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKAQLSQALNGVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKAQLSQALNGVSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLLTKVTKEREHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLLTKVTKEREHKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQVSQEQWVKGALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQVSQEQWVKGALE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCRVPPVPLLQLEKCCTRNNSVTLAWRMPPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCRVPPVPLLQLEKCCTRNNSVTLAWRMPPFT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFNSSGVGPYSKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFNSSGVGPYSKTV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 VLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGLEVPTNLGRPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_016 VLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVHTSPGPDLVWLLPTVCH
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 SGN
XP_016 RSLQCPWAEWAIKKLTTEPSQTELINWPALDISWRRSVLTCSLGTPRGPKVAASGDADLR
790 800 810 820 830 840
>>NP_001287818 (OMIM: 610584) tripartite motif-containin (721 aa)
initn: 3877 init1: 3504 opt: 3506 Z-score: 1971.6 bits: 375.5 E(85289): 4.4e-103
Smith-Waterman score: 4833; 92.1% identity (92.1% similar) in 783 aa overlap (1-783:1-721)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGLQAG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDG-------------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSYTPSLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ---------------------GSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSYTPSLK
50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLDHRGLRGFQRNR
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVLYCSACQLKCHP
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGAGATGGSTARKF
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRGPFAKHRL----------------------GAPSGGGGCKSPGGAGAGATGGSTARKF
210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKAQLSQALNGVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKAQLSQALNGVSD
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLLTKVTKEREHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLLTKVTKEREHKL
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQVSQEQWVKGALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQVSQEQWVKGALE
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCRVPPVPLLQLEKCCTRNNSVTLAWRMPPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCRVPPVPLLQLEKCCTRNNSVTLAWRMPPFT
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFNSSGVGPYSKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFNSSGVGPYSKTV
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRY
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVG
600 610 620 630 640 650
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 VLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGLEVPTNLGRPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGLEVPTNLGRPKL
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 SGN
:::
NP_001 SGN
720
>>XP_016876435 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (706 aa)
initn: 2127 init1: 1489 opt: 2591 Z-score: 1461.8 bits: 281.1 E(85289): 1.1e-74
Smith-Waterman score: 3272; 63.8% identity (79.6% similar) in 780 aa overlap (1-772:4-696)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGL
::::::::::::..:::::::::::.: :::.: ::::..:. ::
XP_016 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESES--PQS---------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QAGAAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSY--
: :: :.: : : ::.:::::.:::::::
XP_016 -----------HRAA------GSGVSDYDYLD---------LDKMSLYSEADSGYGSYGG
50 60 70 80
120 130 140 150 160
pF1KE3 ------TPSLKSPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLD
:: ::::::::.: . ::.. . : . . .: ::::::::: ::
XP_016 FASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV-----PRNSCITCPQCHRSLILD
90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 HRGLRGFQRNRLLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVL
:::::: .::.::....:::: : :::. ::::...: : :...::::::.
XP_016 DRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ--------SKAAALK-CQLCEKAPKE-ATVMCEQCDVF
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YCSACQLKCHPSRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGA
::. :.:.::: :::.:::::: ::: :: : ::
XP_016 YCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLV-------PPA----------QGRVSRR---LSP-----
190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 GATGGSTARKFPTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKA
:: :: .::.::.:::::.:. :::: :::::.:..:::: :::::: ::.
XP_016 --------RKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKS
230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 QLSQALNGVSDKAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLL
::::::::.::.:::::::::::.:..::::::....:::::::::::.:::.:.::.::
XP_016 QLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 TKVTKEREHKLKMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQV
..:.::.:::::.: :::.:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::..
XP_016 ARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 SQEQWVKGALEPKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCRVPPVPLLQLEKCCTRNNS
...:: ::.: :.....:::.::. ::::.::::::.:.: :: .:.::::.:::.:::
XP_016 TEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVK--VPATPILQLEECCTHNNS
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 VTLAWRMPPFTHSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFN
.::.:..::.. :.:::::::::: :::::::::::::.::.:::::::::::::::::
XP_016 ATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFN
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 SSGVGPYSKTVVLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKG
..::.:::::.:::::.::::.:::.:.: :::::::: :.:::::::::::: ..::::
XP_016 KTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKG
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 VHYWELHVDRYDNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRT
.::::: :::::::::::::::: .:.::.:::::::::::::::::::::: :::::::
XP_016 IHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRT
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 EGGVCKGATVGVLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGL
:::. ::::.:::::::...:::::: .:::: ::..:.:.:.::.::::::::::::::
XP_016 EGGITKGATIGVLLDLNRKNLTFFINDEQQGPIAFDNVEGLFFPAVSLNRNVQVTLHTGL
640 650 660 670 680 690
770 780
pF1KE3 EVPTNLGRPKLSGN
::
XP_016 PVPDFYSSRASIA
700
>>XP_016876434 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (710 aa)
initn: 3234 init1: 1484 opt: 2589 Z-score: 1460.7 bits: 280.9 E(85289): 1.3e-74
Smith-Waterman score: 3270; 63.7% identity (79.4% similar) in 782 aa overlap (1-772:4-700)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGL
::::::::::::..:::::::::::.: :::.: ::::..:. ::
XP_016 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESES--PQS---------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QAGAAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSY--
: :: :.: : : ::.:::::.:::::::
XP_016 -----------HRAA------GSGVSDYDYLD---------LDKMSLYSEADSGYGSYGG
50 60 70 80
120 130 140 150 160
pF1KE3 ------TPSLKSPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLD
:: ::::::::.: . ::.. . : . . .: ::::::::: ::
XP_016 FASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV-----PRNSCITCPQCHRSLILD
90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 HRGLRGFQRNRLLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVL
:::::: .::.::....:::: : :::. ::::...: : :...::::::.
XP_016 DRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ--------SKAAALK-CQLCEKAPKE-ATVMCEQCDVF
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YCSACQLKCHPSRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGA
::. :.:.::: :::.:::::: ::: :: : ::
XP_016 YCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLV-------PPA----------QGRVSRR---LSP-----
190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 GATGGSTARKFPTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKA
:: :: .::.::.:::::.:. :::: :::::.:..:::: :::::: ::.
XP_016 --------RKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKS
230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 QLSQALNGVSDKAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLL
::::::::.::.:::::::::::.:..::::::....:::::::::::.:::.:.::.::
XP_016 QLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 TKVTKEREHKLKMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQV
..:.::.:::::.: :::.:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::..
XP_016 ARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 SQEQWVKGALEPKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCR--VPPVPLLQLEKCCTRN
...:: ::.: :.....:::.::. ::::.::::::.:.: :: .:.::::.:::.:
XP_016 TEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHN
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 NSVTLAWRMPPFTHSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKA
::.::.:..::.. :.:::::::::: :::::::::::::.::.:::::::::::::::
XP_016 NSATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKA
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 FNSSGVGPYSKTVVLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFS
::..::.:::::.:::::.::::.:::.:.: :::::::: :.:::::::::::: ..::
XP_016 FNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFS
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 KGVHYWELHVDRYDNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTN
::.::::: :::::::::::::::: .:.::.:::::::::::::::::::::: :::::
XP_016 KGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTN
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 RTEGGVCKGATVGVLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHT
:::::. ::::.:::::::...:::::: .:::: ::..:.:.:.::.::::::::::::
XP_016 RTEGGITKGATIGVLLDLNRKNLTFFINDEQQGPIAFDNVEGLFFPAVSLNRNVQVTLHT
640 650 660 670 680 690
770 780
pF1KE3 GLEVPTNLGRPKLSGN
:: ::
XP_016 GLPVPDFYSSRASIA
700 710
>>NP_055978 (OMIM: 606555) E3 ubiquitin-protein ligase T (710 aa)
initn: 3234 init1: 1484 opt: 2589 Z-score: 1460.7 bits: 280.9 E(85289): 1.3e-74
Smith-Waterman score: 3270; 63.7% identity (79.4% similar) in 782 aa overlap (1-772:4-700)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGL
::::::::::::..:::::::::::.: :::.: ::::..:. ::
NP_055 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESES--PQS---------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QAGAAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSY--
: :: :.: : : ::.:::::.:::::::
NP_055 -----------HRAA------GSGVSDYDYLD---------LDKMSLYSEADSGYGSYGG
50 60 70 80
120 130 140 150 160
pF1KE3 ------TPSLKSPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLD
:: ::::::::.: . ::.. . : . . .: ::::::::: ::
NP_055 FASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV-----PRNSCITCPQCHRSLILD
90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 HRGLRGFQRNRLLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVL
:::::: .::.::....:::: : :::. ::::...: : :...::::::.
NP_055 DRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ--------SKAAALK-CQLCEKAPKE-ATVMCEQCDVF
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YCSACQLKCHPSRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGA
::. :.:.::: :::.:::::: ::: :: : ::
NP_055 YCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLV-------PPA----------QGRVSRR---LSP-----
190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 GATGGSTARKFPTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKA
:: :: .::.::.:::::.:. :::: :::::.:..:::: :::::: ::.
NP_055 --------RKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKS
230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 QLSQALNGVSDKAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLL
::::::::.::.:::::::::::.:..::::::....:::::::::::.:::.:.::.::
NP_055 QLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 TKVTKEREHKLKMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQV
..:.::.:::::.: :::.:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::..
NP_055 ARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 SQEQWVKGALEPKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCR--VPPVPLLQLEKCCTRN
...:: ::.: :.....:::.::. ::::.::::::.:.: :: .:.::::.:::.:
NP_055 TEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHN
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 NSVTLAWRMPPFTHSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKA
::.::.:..::.. :.:::::::::: :::::::::::::.::.:::::::::::::::
NP_055 NSATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKA
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 FNSSGVGPYSKTVVLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFS
::..::.:::::.:::::.::::.:::.:.: :::::::: :.:::::::::::: ..::
NP_055 FNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFS
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 KGVHYWELHVDRYDNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTN
::.::::: :::::::::::::::: .:.::.:::::::::::::::::::::: :::::
NP_055 KGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTN
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 RTEGGVCKGATVGVLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHT
:::::. ::::.:::::::...:::::: .:::: ::..:.:.:.::.::::::::::::
NP_055 RTEGGITKGATIGVLLDLNRKNLTFFINDEQQGPIAFDNVEGLFFPAVSLNRNVQVTLHT
640 650 660 670 680 690
770 780
pF1KE3 GLEVPTNLGRPKLSGN
:: ::
NP_055 GLPVPDFYSSRASIA
700 710
>>XP_016876437 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (688 aa)
initn: 3083 init1: 1120 opt: 2132 Z-score: 1206.2 bits: 233.8 E(85289): 1.9e-60
Smith-Waterman score: 3095; 61.5% identity (77.4% similar) in 780 aa overlap (1-772:4-678)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGL
::::::::::::..:::::::::::.: :::.: ::::..:. ::
XP_016 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESES--PQS---------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QAGAAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSY--
: :: :.: : : ::.:::::.:::::::
XP_016 -----------HRAA------GSGVSDYDYLD---------LDKMSLYSEADSGYGSYGG
50 60 70 80
120 130 140 150 160
pF1KE3 ------TPSLKSPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLD
:: ::::::::.: . ::.. . : . . .: ::::::::: ::
XP_016 FASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV-----PRNSCITCPQCHRSLILD
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170 180 190 200 210 220
pF1KE3 HRGLRGFQRNRLLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVL
:::::: .::.::....:::: : :::. ::::...: : :...::::::.
XP_016 DRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ--------SKAAALK-CQLCEKAPKE-ATVMCEQCDVF
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YCSACQLKCHPSRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGA
::. :.:.::: :::.:::::: ::: :: : ::
XP_016 YCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLV-------PPA----------QGRVSRR---LSP-----
190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 GATGGSTARKFPTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKA
:: :: .::.::.:::::.:. :::: :::::.:..:::: :::::: ::.
XP_016 --------RKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKS
230 240 250 260 270
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pF1KE3 QLSQALNGVSDKAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLL
::::::::.::.:::::::::::.:..::::::....:::::::::::.:::.:.::.::
XP_016 QLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 TKVTKEREHKLKMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQV
..:.::.:::::.: :::.:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::..
XP_016 ARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 SQEQWVKGALEPKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCRVPPVPLLQLEKCCTRNNS
...:: ::.: :.....:::.::. ::::.::::::.:.: :: .:.::::.:::.:::
XP_016 TEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVK--VPATPILQLEECCTHNNS
400 410 420 430 440 450
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pF1KE3 VTLAWRMPPFTHSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKAFN
.::.:..::.. :.:::::::::: :::::::::::::.::.:::::::::::::::::
XP_016 ATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFN
460 470 480 490 500 510
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pF1KE3 SSGVGPYSKTVVLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKG
..::.:::::.:::::.::::.:::.:.: :::::::: :.:::::::::::: ..::::
XP_016 KTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKG
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 VHYWELHVDRYDNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRT
.::::: :::::::::::::::: .:.::.::::::::::. :
XP_016 IHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAI------------------T
580 590 600 610
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 EGGVCKGATVGVLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGL
:::. ::::.:::::::...:::::: .:::: ::..:.:.:.::.::::::::::::::
XP_016 EGGITKGATIGVLLDLNRKNLTFFINDEQQGPIAFDNVEGLFFPAVSLNRNVQVTLHTGL
620 630 640 650 660 670
770 780
pF1KE3 EVPTNLGRPKLSGN
::
XP_016 PVPDFYSSRASIA
680
>>XP_016876436 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (692 aa)
initn: 3089 init1: 1126 opt: 2130 Z-score: 1205.1 bits: 233.6 E(85289): 2.2e-60
Smith-Waterman score: 3093; 61.4% identity (77.2% similar) in 782 aa overlap (1-772:4-682)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGL
::::::::::::..:::::::::::.: :::.: ::::..:. ::
XP_016 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESES--PQS---------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QAGAAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSY--
: :: :.: : : ::.:::::.:::::::
XP_016 -----------HRAA------GSGVSDYDYLD---------LDKMSLYSEADSGYGSYGG
50 60 70 80
120 130 140 150 160
pF1KE3 ------TPSLKSPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLD
:: ::::::::.: . ::.. . : . . .: ::::::::: ::
XP_016 FASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV-----PRNSCITCPQCHRSLILD
90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 HRGLRGFQRNRLLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVL
:::::: .::.::....:::: : :::. ::::...: : :...::::::.
XP_016 DRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ--------SKAAALK-CQLCEKAPKE-ATVMCEQCDVF
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YCSACQLKCHPSRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGA
::. :.:.::: :::.:::::: ::: :: : ::
XP_016 YCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLV-------PPA----------QGRVSRR---LSP-----
190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 GATGGSTARKFPTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKA
:: :: .::.::.:::::.:. :::: :::::.:..:::: :::::: ::.
XP_016 --------RKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKS
230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 QLSQALNGVSDKAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLL
::::::::.::.:::::::::::.:..::::::....:::::::::::.:::.:.::.::
XP_016 QLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 TKVTKEREHKLKMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQV
..:.::.:::::.: :::.:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::..
XP_016 ARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 SQEQWVKGALEPKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCR--VPPVPLLQLEKCCTRN
...:: ::.: :.....:::.::. ::::.::::::.:.: :: .:.::::.:::.:
XP_016 TEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHN
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 NSVTLAWRMPPFTHSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKA
::.::.:..::.. :.:::::::::: :::::::::::::.::.:::::::::::::::
XP_016 NSATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKA
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 FNSSGVGPYSKTVVLQTSDVAWFTFDPNSGHRDIILSNDNQTATCSSYDDRVVLGTAAFS
::..::.:::::.:::::.::::.:::.:.: :::::::: :.:::::::::::: ..::
XP_016 FNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDPGSAHSDIILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFS
520 530 540 550 560 570
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pF1KE3 KGVHYWELHVDRYDNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTN
::.::::: :::::::::::::::: .:.::.::::::::::.
XP_016 KGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAI-----------------
580 590 600 610
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pF1KE3 RTEGGVCKGATVGVLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFSHVDGVFMPALSLNRNVQVTLHT
::::. ::::.:::::::...:::::: .:::: ::..:.:.:.::.::::::::::::
XP_016 -TEGGITKGATIGVLLDLNRKNLTFFINDEQQGPIAFDNVEGLFFPAVSLNRNVQVTLHT
620 630 640 650 660 670
770 780
pF1KE3 GLEVPTNLGRPKLSGN
:: ::
XP_016 GLPVPDFYSSRASIA
680 690
>>XP_005267359 (OMIM: 606555) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (714 aa)
initn: 3075 init1: 1126 opt: 1910 Z-score: 1082.3 bits: 210.9 E(85289): 1.5e-53
Smith-Waterman score: 3039; 59.7% identity (75.1% similar) in 804 aa overlap (1-772:4-704)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEEELKCPVCGSLFREPIILPCSHNVCLPCARTIAVQTPDGEQHLPQPLLLSRGSGL
::::::::::::..:::::::::::.: :::.: ::::..:. ::
XP_005 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESES--PQS---------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QAGAAAAASLEHDAAAGPACGGAGGSAAGGLGGGAGGGGDHADKLSLYSETDSGYGSY--
: :: :.: : : ::.:::::.:::::::
XP_005 -----------HRAA------GSGVSDYDYLD---------LDKMSLYSEADSGYGSYGG
50 60 70 80
120 130 140 150 160
pF1KE3 ------TPSLKSPNGVRVLPMVPAPPGSSAAAARGAACSSLSSSSSSITCPQCHRSASLD
:: ::::::::.: . ::.. . : . . .: ::::::::: ::
XP_005 FASAPTTPCQKSPNGVRVFPPAMPPPATHLSPALAPV-----PRNSCITCPQCHRSLILD
90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 HRGLRGFQRNRLLEAIVQRYQQGRGAVPGTSAAAAVAICQLCDRTPPEPAATLCEQCDVL
:::::: .::.::....:::: : :::. ::::...: : :...::::::.
XP_005 DRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ--------SKAAALK-CQLCEKAPKE-ATVMCEQCDVF
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YCSACQLKCHPSRGPFAKHRLVQPPPPPPPPAEAASGPTGTAQGAPSGGGGCKSPGGAGA
::. :.:.::: :::.:::::: ::: :: : ::
XP_005 YCDPCRLRCHPPRGPLAKHRLV-------PPA----------QGRVSRR---LSP-----
190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 GATGGSTARKFPTCPEHEMENYSMYCVSCRTPVCYLCLEEGRHAKHEVKPLGAMWKQHKA
:: :: .::.::.:::::.:. :::: :::::.:..:::: :::::: ::.
XP_005 --------RKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKS
230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 QLSQALNGVSDKAKEAKEFLVQLKNILQQIQENGLDYEACLVAQCDALVDALTRQKAKLL
::::::::.::.:::::::::::.:..::::::....:::::::::::.:::.:.::.::
XP_005 QLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLL
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pF1KE3 TKVTKEREHKLKMVWDQINHCTLKLRQSTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIKRVQV
..:.::.:::::.: :::.:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::..
XP_005 ARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 SQEQWVKGALEPKVSAEFDLTLDSEPLLQAIHQLDFIQMKCR--VPPVPLLQLEKCCTRN
...:: ::.: :.....:::.::. ::::.::::::.:.: :: .:.::::.:::.:
XP_005 TEDQWGKGTLTPRMTTDFDLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEECCTHN
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 NSVTLAWRMPPFTHSPVDGYILELDDGAGGQFREVYVGKETLCTIDGLHFNSTYNARVKA
::.::.:..::.. :.:::::::::: :::::::::::::.::.:::::::::::::::
XP_005 NSATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNSTYNARVKA
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620
pF1KE3 FNSSGVGPYSKTVVLQTSD----------------------VAWFTFDPNSGHRDIILSN
::..::.:::::.:::::. ::::.:::.:.: ::::::
XP_005 FNKTGVSPYSKTLVLQTSEGCNFETQSAPYSQLVDIKKLLAVAWFAFDPGSAHSDIILSN
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pF1KE3 DNQTATCSSYDDRVVLGTAAFSKGVHYWELHVDRYDNHPDPAFGVARASVVKDMMLGKDD
:: :.:::::::::::: ..::::.::::: :::::::::::::::: .:.::.::::::
XP_005 DNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDD
580 590 600 610 620 630
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pF1KE3 KAWAMYVDNNRSWFMHCNSHTNRTEGGVCKGATVGVLLDLNKHTLTFFINGQQQGPTAFS
::::. ::::. ::::.:::::::...:::::: .:::: ::.
XP_005 KAWAI------------------TEGGITKGATIGVLLDLNRKNLTFFINDEQQGPIAFD
640 650 660 670
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pF1KE3 HVDGVFMPALSLNRNVQVTLHTGLEVPTNLGRPKLSGN
.:.:.:.::.:::::::::::::: ::
XP_005 NVEGLFFPAVSLNRNVQVTLHTGLPVPDFYSSRASIA
680 690 700 710
783 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 08:40:07 2016 done: Sun Nov 6 08:40:09 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]