Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3939
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3939, 518 aa
1>>>pF1KE3939 518 - 518 aa - 518 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9456+/-0.00144; mu= 8.9351+/- 0.084
mean_var=130.4906+/-27.387, 0's: 0 Z-trim(102.1): 248 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.112275
statistics sampled from 6521 (6804) to 6521 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 2.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1846.1 ASB3 gene_id:51130|Hs108|chr2 ( 518) 3478 576.0 3.5e-164
CCDS54361.1 ASB3 gene_id:100302652|Hs108|chr2 ( 556) 3478 576.0 3.7e-164
CCDS1847.1 ASB3 gene_id:51130|Hs108|chr2 ( 445) 2997 498.0 8.9e-141
CCDS9915.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 ( 587) 638 116.0 1.2e-25
CCDS55940.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 ( 635) 638 116.1 1.2e-25
CCDS34742.1 ASB15 gene_id:142685|Hs108|chr7 ( 588) 596 109.2 1.3e-23
CCDS46856.2 ASB14 gene_id:142686|Hs108|chr3 ( 587) 544 100.8 4.5e-21
CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 548 101.8 7.1e-21
CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 548 101.8 7.1e-21
CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 548 101.8 7.1e-21
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 484 91.5 9.3e-18
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 484 91.5 9.3e-18
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 484 91.7 1.7e-17
CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 457 86.9 1.2e-16
CCDS74908.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 ( 899) 445 84.9 4.2e-16
CCDS74619.1 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 993) 445 84.9 4.5e-16
CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 ( 784) 417 80.3 8.7e-15
CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250) 418 80.6 1.1e-14
CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429) 418 80.7 1.2e-14
CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 409 79.0 2.1e-14
CCDS33355.2 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 367) 383 74.6 2.2e-13
CCDS44920.1 ANKRD52 gene_id:283373|Hs108|chr12 (1076) 388 75.7 2.9e-13
CCDS11879.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 301) 378 73.7 3.3e-13
CCDS75319.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 581) 370 72.6 1.4e-12
CCDS43372.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 616) 370 72.6 1.4e-12
CCDS43371.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 627) 370 72.6 1.4e-12
CCDS6746.1 INVS gene_id:27130|Hs108|chr9 (1065) 369 72.6 2.4e-12
CCDS4225.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 (2542) 370 73.1 4.3e-12
CCDS4224.1 EIF4EBP3 gene_id:404734|Hs108|chr5 (2617) 370 73.1 4.4e-12
CCDS11871.1 MIB1 gene_id:57534|Hs108|chr18 (1006) 363 71.7 4.6e-12
CCDS77164.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 268) 348 68.8 8.8e-12
CCDS34003.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2352) 363 71.9 8.8e-12
CCDS68721.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2490) 363 71.9 9.2e-12
CCDS34004.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2603) 363 72.0 9.6e-12
CCDS55872.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 (1248) 342 68.3 5.7e-11
CCDS42650.1 KIDINS220 gene_id:57498|Hs108|chr2 (1771) 344 68.8 6e-11
>>CCDS1846.1 ASB3 gene_id:51130|Hs108|chr2 (518 aa)
initn: 3478 init1: 3478 opt: 3478 Z-score: 3061.1 bits: 576.0 E(32554): 3.5e-164
Smith-Waterman score: 3478; 100.0% identity (100.0% similar) in 518 aa overlap (1-518:1-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDFTEAYADTCSTVGLAAREGNVKVLRKLLKKGRSVDVADNRGWMPIHEAAYHNSVECLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MDFTEAYADTCSTVGLAAREGNVKVLRKLLKKGRSVDVADNRGWMPIHEAAYHNSVECLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 MLINADSSENYIKMKTFEGFCALHLAASQGHWKIVQILLEAGADPNATTLEETTPLFLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MLINADSSENYIKMKTFEGFCALHLAASQGHWKIVQILLEAGADPNATTLEETTPLFLAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ENGQIDVLRLLLQHGANVNGSHSMCGWNSLHQASFQENAEIIKLLLRKGANKECQDDFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ENGQIDVLRLLLQHGANVNGSHSMCGWNSLHQASFQENAEIIKLLLRKGANKECQDDFGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TPLFVAAQYGKLESLSILISSGANVNCQALDKATPLFIAAQEGHTKCVELLLSSGADPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TPLFVAAQYGKLESLSILISSGANVNCQALDKATPLFIAAQEGHTKCVELLLSSGADPDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 YCNEDSWQLPIHAAAQMGHTKILDLLIPLTNRACDTGLNKVSPVYSAVFGGHEDCLEILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 YCNEDSWQLPIHAAAQMGHTKILDLLIPLTNRACDTGLNKVSPVYSAVFGGHEDCLEILL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 RNGYSPDAQACLVFGFSSPVCMAFQKDCEFFGIVNILLKYGAQINELHLAYCLKYEKFSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RNGYSPDAQACLVFGFSSPVCMAFQKDCEFFGIVNILLKYGAQINELHLAYCLKYEKFSI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 FRYFLRKGCSLGPWNHIYEFVNHAIKAQAKYKEWLPHLLVAGFDPLILLCNSWIDSVSID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 FRYFLRKGCSLGPWNHIYEFVNHAIKAQAKYKEWLPHLLVAGFDPLILLCNSWIDSVSID
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 TLIFTLEFTNWKTLAPAVERMLSARASNAWILQQHIATVPSLTHLCRLEIRSSLKSERLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TLIFTLEFTNWKTLAPAVERMLSARASNAWILQQHIATVPSLTHLCRLEIRSSLKSERLR
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE3 SDSYISQLPLPRSLHNYLLYEDVLRMYEVPELAAIQDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SDSYISQLPLPRSLHNYLLYEDVLRMYEVPELAAIQDG
490 500 510
>>CCDS54361.1 ASB3 gene_id:100302652|Hs108|chr2 (556 aa)
initn: 3478 init1: 3478 opt: 3478 Z-score: 3060.6 bits: 576.0 E(32554): 3.7e-164
Smith-Waterman score: 3478; 100.0% identity (100.0% similar) in 518 aa overlap (1-518:39-556)
10 20 30
pF1KE3 MDFTEAYADTCSTVGLAAREGNVKVLRKLL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HHPERQAELGSGLRDGGGAALRPPGRLVKQMDFTEAYADTCSTVGLAAREGNVKVLRKLL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 KKGRSVDVADNRGWMPIHEAAYHNSVECLQMLINADSSENYIKMKTFEGFCALHLAASQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKGRSVDVADNRGWMPIHEAAYHNSVECLQMLINADSSENYIKMKTFEGFCALHLAASQG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 HWKIVQILLEAGADPNATTLEETTPLFLAVENGQIDVLRLLLQHGANVNGSHSMCGWNSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HWKIVQILLEAGADPNATTLEETTPLFLAVENGQIDVLRLLLQHGANVNGSHSMCGWNSL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 HQASFQENAEIIKLLLRKGANKECQDDFGITPLFVAAQYGKLESLSILISSGANVNCQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQASFQENAEIIKLLLRKGANKECQDDFGITPLFVAAQYGKLESLSILISSGANVNCQAL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 DKATPLFIAAQEGHTKCVELLLSSGADPDLYCNEDSWQLPIHAAAQMGHTKILDLLIPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DKATPLFIAAQEGHTKCVELLLSSGADPDLYCNEDSWQLPIHAAAQMGHTKILDLLIPLT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 NRACDTGLNKVSPVYSAVFGGHEDCLEILLRNGYSPDAQACLVFGFSSPVCMAFQKDCEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NRACDTGLNKVSPVYSAVFGGHEDCLEILLRNGYSPDAQACLVFGFSSPVCMAFQKDCEF
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 FGIVNILLKYGAQINELHLAYCLKYEKFSIFRYFLRKGCSLGPWNHIYEFVNHAIKAQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FGIVNILLKYGAQINELHLAYCLKYEKFSIFRYFLRKGCSLGPWNHIYEFVNHAIKAQAK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 YKEWLPHLLVAGFDPLILLCNSWIDSVSIDTLIFTLEFTNWKTLAPAVERMLSARASNAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YKEWLPHLLVAGFDPLILLCNSWIDSVSIDTLIFTLEFTNWKTLAPAVERMLSARASNAW
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 ILQQHIATVPSLTHLCRLEIRSSLKSERLRSDSYISQLPLPRSLHNYLLYEDVLRMYEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILQQHIATVPSLTHLCRLEIRSSLKSERLRSDSYISQLPLPRSLHNYLLYEDVLRMYEVP
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 ELAAIQDG
::::::::
CCDS54 ELAAIQDG
550
>>CCDS1847.1 ASB3 gene_id:51130|Hs108|chr2 (445 aa)
initn: 2997 init1: 2997 opt: 2997 Z-score: 2640.9 bits: 498.0 E(32554): 8.9e-141
Smith-Waterman score: 2997; 100.0% identity (100.0% similar) in 445 aa overlap (74-518:1-445)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 WMPIHEAAYHNSVECLQMLINADSSENYIKMKTFEGFCALHLAASQGHWKIVQILLEAGA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MKTFEGFCALHLAASQGHWKIVQILLEAGA
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 DPNATTLEETTPLFLAVENGQIDVLRLLLQHGANVNGSHSMCGWNSLHQASFQENAEIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 DPNATTLEETTPLFLAVENGQIDVLRLLLQHGANVNGSHSMCGWNSLHQASFQENAEIIK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LLLRKGANKECQDDFGITPLFVAAQYGKLESLSILISSGANVNCQALDKATPLFIAAQEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LLLRKGANKECQDDFGITPLFVAAQYGKLESLSILISSGANVNCQALDKATPLFIAAQEG
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 HTKCVELLLSSGADPDLYCNEDSWQLPIHAAAQMGHTKILDLLIPLTNRACDTGLNKVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 HTKCVELLLSSGADPDLYCNEDSWQLPIHAAAQMGHTKILDLLIPLTNRACDTGLNKVSP
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 VYSAVFGGHEDCLEILLRNGYSPDAQACLVFGFSSPVCMAFQKDCEFFGIVNILLKYGAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VYSAVFGGHEDCLEILLRNGYSPDAQACLVFGFSSPVCMAFQKDCEFFGIVNILLKYGAQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 INELHLAYCLKYEKFSIFRYFLRKGCSLGPWNHIYEFVNHAIKAQAKYKEWLPHLLVAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 INELHLAYCLKYEKFSIFRYFLRKGCSLGPWNHIYEFVNHAIKAQAKYKEWLPHLLVAGF
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 DPLILLCNSWIDSVSIDTLIFTLEFTNWKTLAPAVERMLSARASNAWILQQHIATVPSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 DPLILLCNSWIDSVSIDTLIFTLEFTNWKTLAPAVERMLSARASNAWILQQHIATVPSLT
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510
pF1KE3 HLCRLEIRSSLKSERLRSDSYISQLPLPRSLHNYLLYEDVLRMYEVPELAAIQDG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 HLCRLEIRSSLKSERLRSDSYISQLPLPRSLHNYLLYEDVLRMYEVPELAAIQDG
400 410 420 430 440
>>CCDS9915.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 (587 aa)
initn: 525 init1: 281 opt: 638 Z-score: 574.1 bits: 116.0 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 684; 28.9% identity (60.2% similar) in 543 aa overlap (17-502:64-585)
10 20 30 40
pF1KE3 MDFTEAYADTCSTVGLAAREGNVKVLRKLLKKGRSVDVADNRGWMP
: ..:. ..:. ..:.:... ...::.:
CCDS99 PMGLFQGVMQKYSSSLFKTSQLAPADPLIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEGWLP
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 IHEAAYHNSVECLQMLINADSSENYIKMKTFEGFCALHLAASQGHWKIVQILLEAGADPN
.:::::...: ::..: : . : ..:.. :..::. .:: . ::.:::.:.
CCDS99 LHEAAYYGQVGCLKVLQRA--YPGTIDQRTLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAEPD
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 ATTLEETTPLFLAVENGQIDVLRLLLQHGANVNGSHSMC--GWNSLHQASFQENAEIIKL
.. . :::. : : . .....:.::.:..: : : ::..::.. ... :....
CCDS99 ISNKSRETPLYKACERKNAEAVKILVQHNADTN--HR-CNRGWTALHESVSRNDLEVMQI
160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LLRKGANKECQDDFGITPLFVAAQYGKLESLSILISSGANVNCQALDKATPLFIAAQEGH
:. ::. : .. .:::::::::: :.::.: .: . ::..: :: :.:. :. : .. :
CCDS99 LVSGGAKVESKNAYGITPLFVAAQSGQLEALRFLAKYGADINTQASDNASALYEACKNEH
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 TKCVELLLSSGADPDLYCNEDSWQLPIHAAAQMGHTKILDLLIPLTNRACDTGLNKVSPV
. ::.:::.::: . :.:. ::.: :.. :. .:...:.:.:.:. . :::.
CCDS99 EEVVEFLLSQGADAN-KTNKDGL-LPLHIASKKGNYRIVQMLLPVTSRT-RIRRSGVSPL
270 280 290 300 310 320
290 300 310
pF1KE3 YSAVFGGHEDCLEILLRNGY---SPDA-----------QACLVFGFS-------------
. :. .:.. :: :: . .: : .. : :.
CCDS99 HLAAERNHDEVLEALLSARFDVNTPLAPERARLYEDRRSSALYFAVVNNNVYATELLLQH
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360
pF1KE3 ---------SPVCMAFQKDCEFFGIVNILLKYGAQINEL---H-LAY----CLKYEKFSI
::. .:... : . ...:: .::.:. : :. . .. .:.
CCDS99 GADPNRDVISPLLVAIRHGC--LRTMQLLLDHGANIDAYIATHPTAFPATIMFAMKCLSL
390 400 410 420 430 440
370 380 390 400 410
pF1KE3 FRYFLRKGCSLGP-WNHIYEFVNHAIKAQAKYKEWLPHLLVAGFDP-LILLC--------
..... ::. : .. .: : : . . . .: .: .. .:
CCDS99 LKFLMDLGCDGEPCFSCLYGNGPHPPAPQPSSR--FNDAPAADKEPSVVQFCEFVSAPEV
450 460 470 480 490 500
420 430 440 450 460
pF1KE3 NSWIDSVSIDTLIFTLEFTNWKTLAPAVERMLSARASNAWILQQHIATVPS-LTHLCRLE
. : . ::.: :.... : ... ... . : . .. : : :.:::::.
CCDS99 SRWAGPI-IDVL---LDYVGNVQLCSRLKEHIDSFED--WAVIKEKAEPPRPLAHLCRLR
510 520 530 540 550
470 480 490 500 510
pF1KE3 IRSSLKSERLRSDSYISQLPLPRSLHNYLLYEDVLRMYEVPELAAIQDG
.:... . :.. .. :::: : :: ::.
CCDS99 VRKAIGKYRIK---LLDTLPLPGRLIRYLKYENTQ
560 570 580
>>CCDS55940.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 (635 aa)
initn: 525 init1: 281 opt: 638 Z-score: 573.7 bits: 116.1 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 684; 28.9% identity (60.2% similar) in 543 aa overlap (17-502:112-633)
10 20 30 40
pF1KE3 MDFTEAYADTCSTVGLAAREGNVKVLRKLLKKGRSVDVADNRGWMP
: ..:. ..:. ..:.:... ...::.:
CCDS55 PMGLFQGVMQKYSSSLFKTSQLAPADPLIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEGWLP
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 IHEAAYHNSVECLQMLINADSSENYIKMKTFEGFCALHLAASQGHWKIVQILLEAGADPN
.:::::...: ::..: : . : ..:.. :..::. .:: . ::.:::.:.
CCDS55 LHEAAYYGQVGCLKVLQRA--YPGTIDQRTLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAEPD
150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 ATTLEETTPLFLAVENGQIDVLRLLLQHGANVNGSHSMC--GWNSLHQASFQENAEIIKL
.. . :::. : : . .....:.::.:..: : : ::..::.. ... :....
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. ::.:::.::: . :.:. ::.: :.. :. .:...:.:.:.:. . :::.
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. :. .:.. :: :: . .: : .. : :.
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320 330 340 350 360
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::. .:... : . ...:: .::.:. : :. . .. .:.
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..... ::. : .. .: : : . . . .: .: .. .:
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440 450 460 470
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CCDS34 MGLQKLCQPASVEKLPLPPAIQRYILFKEYDLYGQELKLT
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CCDS47 LPIVKNLLQRGASPNVSNVKVETPLHMAARAGHTEVAKYLLQNKAKVNAKAKDDQTPLHC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]