Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3934
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3934, 545 aa
1>>>pF1KE3934 545 - 545 aa - 545 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8027+/-0.000881; mu= 5.2199+/- 0.054
mean_var=203.0177+/-40.813, 0's: 0 Z-trim(114.2): 23 B-trim: 15 in 1/50
Lambda= 0.090013
statistics sampled from 14727 (14750) to 14727 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.453), width: 16
Scan time: 3.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12172.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19 ( 545) 3628 483.4 2.9e-136
CCDS74272.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19 ( 593) 3310 442.1 8.4e-124
CCDS74271.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19 ( 601) 2193 297.1 3.9e-80
CCDS60192.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1 ( 547) 2030 275.9 8.6e-74
CCDS53344.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1 ( 551) 2030 275.9 8.6e-74
CCDS48040.1 FNBP1 gene_id:23048|Hs108|chr9 ( 617) 1322 184.0 4.5e-46
CCDS53343.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1 ( 605) 1262 176.2 9.8e-44
>>CCDS12172.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19 (545 aa)
initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628 Z-score: 2559.8 bits: 483.4 E(32554): 2.9e-136
Smith-Waterman score: 3628; 100.0% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GTPSDGRPELRGPGRSRTKRWPFGKKNKTVVTEDFSHLPPEQQRKRLQQQLEERSRELQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GTPSDGRPELRGPGRSRTKRWPFGKKNKTVVTEDFSHLPPEQQRKRLQQQLEERSRELQK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EVDQREALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLAEAESRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EVDQREALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLAEAESRVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 SNRGDSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESSEEPPSEESQDTPIYTEFDEDFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SNRGDSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESSEEPPSEESQDTPIYTEFDEDFEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EPTSPIGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEGGEGYVPTSYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EPTSPIGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEGGEGYVPTSYL
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 RVTLN
:::::
CCDS12 RVTLN
>>CCDS74272.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19 (593 aa)
initn: 3306 init1: 3306 opt: 3310 Z-score: 2336.1 bits: 442.1 E(32554): 8.4e-124
Smith-Waterman score: 3310; 94.2% identity (96.1% similar) in 536 aa overlap (1-533:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GTPSDGRPELRGPGRSRTKRWPFGKKNKTVVTEDFSHLPPEQQRKRLQQQLEERSRELQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GTPSDGRPELRGPGRSRTKRWPFGKKNKTVVTEDFSHLPPEQQRKRLQQQLEERSRELQK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EVDQREALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLAEAESRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EVDQREALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLAEAESRVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 SNRGDSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESSEEPPSEESQDTPIYTEFDEDFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SNRGDSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESSEEPPSEESQDTPIYTEFDEDFEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE3 EPTSPIGHCVAIYHFEG-SSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDG-WTRVRRKEG-GEGYVPT
:::::::::::::::: . :.. .. ::: . : . : ... : : :
CCDS74 EPTSPIGHCVAIYHFEDLGPPPPPSQGPARALSLWPRVKTSVLWKKTKGTAGPGSGGKRE
490 500 510 520 530 540
540
pF1KE3 SYLRVTLN
CCDS74 ARATCPPPTSESRSIEPCQRREEGGCRLLLLGHGEPQDLCTLFLTPWLRLRPV
550 560 570 580 590
>>CCDS74271.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19 (601 aa)
initn: 3614 init1: 2193 opt: 2193 Z-score: 1552.1 bits: 297.1 E(32554): 3.9e-80
Smith-Waterman score: 3343; 90.3% identity (90.3% similar) in 577 aa overlap (1-521:1-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE3 GTPSDGRPELRGPGRSRTKRWPFGKKNK--------------------------------
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GTPSDGRPELRGPGRSRTKRWPFGKKNKPRPPPLSPLGGPVPSALPNGPPSPRSGRDPLA
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360
pF1KE3 ------------------------TVVTEDFSHLPPEQQRKRLQQQLEERSRELQKEVDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ILSEISKSVKPRLASFRSLRGSRGTVVTEDFSHLPPEQQRKRLQQQLEERSRELQKEVDQ
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 REALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLAEAESRVLSNRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 REALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLAEAESRVLSNRG
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 DSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESSEEPPSEESQDTPIYTEFDEDFEEEPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESSEEPPSEESQDTPIYTEFDEDFEEEPTS
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PIGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEGGEGYVPTSYLRVTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PIGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEGGEGYVPTSYLRVTL
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 N
CCDS74 N
>>CCDS60192.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1 (547 aa)
initn: 1938 init1: 885 opt: 2030 Z-score: 1438.3 bits: 275.9 E(32554): 8.6e-74
Smith-Waterman score: 2030; 54.9% identity (81.9% similar) in 548 aa overlap (1-544:1-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
:.:::::::::. :..:::::.:.:.::.:::::: :.:: ::::::.::::: ::: .:
CCDS60 MSWGTELWDQFDSLDKHTQWGIDFLERYAKFVKERIEIEQNYAKQLRNLVKKYCPKRSSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
:. : .:.. .: .::.:.::.:::::.:::... :: :: .:....: :::::.:::
CCDS60 DE-EPRFTSCVAFFNILNELNDYAGQREVVAEEMAHRVYGELMRYAHDLKTERKMHLQEG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
:.::: :. .::..:::.::::.::::::: :. ::::.: ::::::::::::: .::.
CCDS60 RKAQQYLDMCWKQMDNSKKKFERECREAEKAQQSYERLDNDTNATKADVEKAKQQLNLRT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
:::.:.::::::::: :: .: . .. .:::. .::.:::::. .:. : ....: .
CCDS60 HMADENKNEYAAQLQNFNGEQHKHFYVVIPQIYKQLQEMDERRTIKLSECYRGFADSERK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
:.:::.:::::: .::..:: . ::..... :::: ::: :::.:: . :. ::...
CCDS60 VIPIISKCLEGMILAAKSVDERRDSQMVVDSFKSGFEPPGDFPFEDYSQHIYRTISDGTI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE3 GTPSD--GRPELRGP-GRSRTKRWPFGKKNKTVVTEDFSHLPPEQQRKRLQQQLEERSRE
.. .. :. . . :... : : :::: : . ::::::::::.::.:::...: .::
CCDS60 SASKQESGKMDAKTTVGKAKGKLWLFGKKPKGPALEDFSHLPPEQRRKKLQQRIDELNRE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 LQKEVDQREALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLAEAES
:::: ::..::.::::::::.::::::.::.:..:::..::.::..:..: ::::.:.:.
CCDS60 LQKESDQKDALNKMKDVYEKNPQMGDPGSLQPKLAETMNNIDRLRMEIHKNEAWLSEVEG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 RVLSNRGDSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESSEEPPSEESQDTPIYTEFDED
.. ..::: ::. . .. .: .: ..:... . ::..... ..:::..
CCDS60 KT-GGRGD--RRHSSDINHLVTQGRESPEGSYTDDANQEVRGPPQQHGH----HNEFDDE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 FEEE-PTSPIGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEGGEGYVP
::.. : :::: ::: :.: .:::..: ::: : ..::::::::::.::..: :::::
CCDS60 FEDDDPLPAIGHCKAIYPFDGHNEGTLAMKEGEVLYIIEEDKGDGWTRARRQNGEEGYVP
480 490 500 510 520 530
540
pF1KE3 TSYLRVTLN
:::. :::
CCDS60 TSYIDVTLEKNSKGS
540
>>CCDS53344.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1 (551 aa)
initn: 1938 init1: 885 opt: 2030 Z-score: 1438.2 bits: 275.9 E(32554): 8.6e-74
Smith-Waterman score: 2030; 54.9% identity (81.9% similar) in 548 aa overlap (1-544:1-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
:.:::::::::. :..:::::.:.:.::.:::::: :.:: ::::::.::::: ::: .:
CCDS53 MSWGTELWDQFDSLDKHTQWGIDFLERYAKFVKERIEIEQNYAKQLRNLVKKYCPKRSSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
:. : .:.. .: .::.:.::.:::::.:::... :: :: .:....: :::::.:::
CCDS53 DE-EPRFTSCVAFFNILNELNDYAGQREVVAEEMAHRVYGELMRYAHDLKTERKMHLQEG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
:.::: :. .::..:::.::::.::::::: :. ::::.: ::::::::::::: .::.
CCDS53 RKAQQYLDMCWKQMDNSKKKFERECREAEKAQQSYERLDNDTNATKADVEKAKQQLNLRT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
:::.:.::::::::: :: .: . .. .:::. .::.:::::. .:. : ....: .
CCDS53 HMADENKNEYAAQLQNFNGEQHKHFYVVIPQIYKQLQEMDERRTIKLSECYRGFADSERK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
:.:::.:::::: .::..:: . ::..... :::: ::: :::.:: . :. ::...
CCDS53 VIPIISKCLEGMILAAKSVDERRDSQMVVDSFKSGFEPPGDFPFEDYSQHIYRTISDGTI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE3 GTPSD--GRPELRGP-GRSRTKRWPFGKKNKTVVTEDFSHLPPEQQRKRLQQQLEERSRE
.. .. :. . . :... : : :::: : . ::::::::::.::.:::...: .::
CCDS53 SASKQESGKMDAKTTVGKAKGKLWLFGKKPKGPALEDFSHLPPEQRRKKLQQRIDELNRE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 LQKEVDQREALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLAEAES
:::: ::..::.::::::::.::::::.::.:..:::..::.::..:..: ::::.:.:.
CCDS53 LQKESDQKDALNKMKDVYEKNPQMGDPGSLQPKLAETMNNIDRLRMEIHKNEAWLSEVEG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 RVLSNRGDSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESSEEPPSEESQDTPIYTEFDED
.. ..::: ::. . .. .: .: ..:... . ::..... ..:::..
CCDS53 KT-GGRGD--RRHSSDINHLVTQGRESPEGSYTDDANQEVRGPPQQHGH----HNEFDDE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 FEEE-PTSPIGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEGGEGYVP
::.. : :::: ::: :.: .:::..: ::: : ..::::::::::.::..: :::::
CCDS53 FEDDDPLPAIGHCKAIYPFDGHNEGTLAMKEGEVLYIIEEDKGDGWTRARRQNGEEGYVP
480 490 500 510 520 530
540
pF1KE3 TSYLRVTLN
:::. :::
CCDS53 TSYIDVTLEKNSKGAVTYI
540 550
>>CCDS48040.1 FNBP1 gene_id:23048|Hs108|chr9 (617 aa)
initn: 1891 init1: 1217 opt: 1322 Z-score: 940.6 bits: 184.0 E(32554): 4.5e-46
Smith-Waterman score: 1738; 46.4% identity (74.8% similar) in 580 aa overlap (1-511:1-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
:.:::::::::. ::.:::::.:.:..:.::::::::.: .::::::.: ::: ::. .:
CCDS48 MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
.. : :... ..:.. :.:.::.:::.:...::.. .. ..:..: ::.::::: .:..:
CCDS48 EEEEYKYTSCKAFISNLNEMNDYAGQHEVISENMASQIIVDLARYVQELKQERKSNFHDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
:.:::..:. .::::.:::.:::::.::..: : :..: :::.::::::::.:::..:
CCDS48 RKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
.:::.:: .:.. ::.::..: ..: ...:.::.:.:.:.::: .:.: .. .:.. .
CCDS48 QMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRMGESMKTYAEVDRQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
:.:::.:::.:. ::...: ::::...:: .:::: :::.::::..:::.:. ::.::
CCDS48 VIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKNDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYTQPMKRTVSDNSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE3 GTP-SDGRPELRGPGRSRTKRWPFGKKNK--TVVT-------------------------
.. ..:.:.:. :.:. : ::: :::: ...:
CCDS48 SNSRGEGKPDLKFGGKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQSP
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KE3 ---------------------------------------EDFSHLPPEQQRKRLQQQLEE
::::.:::::.::.:::...:
CCDS48 KQQKEPLSHRFNEFMTSKPKIHCFRSLKRGLSLKLGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKVDE
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 RSRELQKEVDQREALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLA
..:.:::.:::.:. :::::: :.:::::::::. ..::. .:::.:..:.::.:::::
CCDS48 LNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLAEVSQNIEKLRVETQKFEAWLA
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 EAESRVLSNRGDSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESS-EEPPSEESQDTPIYT
:.:.: : :... :.. : .. :: .. . .... ..: : :.::. . :
CCDS48 EVEGR-LPARSEQARRQSGLYD--SQNPPTVNNCAQDRESPDGSYTEEQSQESEMKVLAT
490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 EFDEDFE-EEPTSPIGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEGG
.::..:. ::: :: : :.: :::..:::::..::: :
CCDS48 DFDDEFDDEEPLPAIGTCKALYTFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRRNEDE
540 550 560 570 580 590
540
pF1KE3 EGYVPTSYLRVTLN
CCDS48 EGYVPTSYVEVCLDKNAKDS
600 610
>>CCDS53343.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1 (605 aa)
initn: 1904 init1: 877 opt: 1262 Z-score: 898.6 bits: 176.2 E(32554): 9.8e-44
Smith-Waterman score: 1804; 49.0% identity (73.8% similar) in 584 aa overlap (1-522:1-576)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
:.:::::::::. :..:::::.:.:.::.:::::: :.:: ::::::.::::: ::: .:
CCDS53 MSWGTELWDQFDSLDKHTQWGIDFLERYAKFVKERIEIEQNYAKQLRNLVKKYCPKRSSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
:. : .:.. .: .::.:.::.:::::.:::... :: :: .:....: :::::.:::
CCDS53 DE-EPRFTSCVAFFNILNELNDYAGQREVVAEEMAHRVYGELMRYAHDLKTERKMHLQEG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
:.::: :. .::..:::.::::.::::::: :. ::::.: ::::::::::::: .::.
CCDS53 RKAQQYLDMCWKQMDNSKKKFERECREAEKAQQSYERLDNDTNATKADVEKAKQQLNLRT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
:::.:.::::::::: :: .: . .. .:::. .::.:::::. .:. : ....: .
CCDS53 HMADENKNEYAAQLQNFNGEQHKHFYVVIPQIYKQLQEMDERRTIKLSECYRGFADSERK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
:.:::.:::::: .::..:: . ::..... :::: ::: :::.:: . :. ::...
CCDS53 VIPIISKCLEGMILAAKSVDERRDSQMVVDSFKSGFEPPGDFPFEDYSQHIYRTISDGTI
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE3 GTPSD--GRPELRGP-GRSRTKRWPFGKKNK---------TVVT----------------
.. .. :. . . :... : : :::: : .. :
CCDS53 SASKQESGKMDAKTTVGKAKGKLWLFGKKPKPQSPPLTPTSLFTSSTPNGSQFLTFSIEP
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KE3 ---------------------------------EDFSHLPPEQQRKRLQQQLEERSRELQ
::::::::::.::.:::...: .::::
CCDS53 VHYCMNEIKTGKPRIPSFRSLKRGWSVKMGPALEDFSHLPPEQRRKKLQQRIDELNRELQ
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 KEVDQREALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWLAEAESRV
:: ::..::.::::::::.::::::.::.:..:::..::.::..:..: ::::.:.:...
CCDS53 KESDQKDALNKMKDVYEKNPQMGDPGSLQPKLAETMNNIDRLRMEIHKNEAWLSEVEGKT
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 LSNRGDSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESSEEPPSEESQDTPIYTEFDEDFE
..::: ::. . .. .: .: ..:... . ::..... ..:::..::
CCDS53 -GGRGD--RRHSSDINHLVTQGRESPEGSYTDDANQEVRGPPQQHGH----HNEFDDEFE
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 EE-PTSPIGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEGGEGYVPTS
.. : :::: ::: :.: .:::..: ::: : ..::::::::
CCDS53 DDDPLPAIGHCKAIYPFDGHNEGTLAMKEGEVLYIIEEDKGDGWTRARRQNGEEGYVPTS
540 550 560 570 580 590
540
pF1KE3 YLRVTLN
CCDS53 YIDVTLEKNSKGS
600
545 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 08:48:44 2016 done: Sun Nov 6 08:48:45 2016
Total Scan time: 3.930 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]