Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3929
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3929, 500 aa
1>>>pF1KE3929 500 - 500 aa - 500 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0158+/-0.000425; mu= 20.1090+/- 0.026
mean_var=86.9791+/-16.913, 0's: 0 Z-trim(111.6): 228 B-trim: 227 in 1/50
Lambda= 0.137520
statistics sampled from 19948 (20220) to 19948 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 9.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated c ( 500) 3285 662.4 8.4e-190
NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated c ( 911) 1304 269.6 2.6e-71
XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 1276 264.1 1.2e-69
XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 1276 264.1 1.2e-69
NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage- ( 858) 1276 264.1 1.2e-69
NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated c ( 494) 918 192.8 1.9e-48
NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated c ( 466) 847 178.7 3.2e-44
XP_011524222 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 847 178.7 3.2e-44
XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 847 178.7 3.2e-44
XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 847 178.7 3.2e-44
XP_016881193 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 509) 847 178.7 3.4e-44
XP_016859548 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 812 171.8 4.1e-42
NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gate ( 491) 812 171.8 4.1e-42
XP_011531127 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 812 171.8 4.1e-42
NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated c ( 491) 812 171.8 4.1e-42
NP_598004 (OMIM: 607604,610356) potassium voltage- ( 545) 750 159.5 2.2e-38
XP_016869471 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666) 741 157.8 8.9e-38
XP_016869470 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666) 741 157.8 8.9e-38
NP_002242 (OMIM: 602905) potassium voltage-gated c ( 526) 686 146.8 1.5e-34
NP_001309728 (OMIM: 602905) potassium voltage-gate ( 526) 686 146.8 1.5e-34
XP_016883335 (OMIM: 602905) PREDICTED: potassium v ( 527) 686 146.8 1.5e-34
XP_011542212 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 647) 672 144.1 1.1e-33
NP_004970 (OMIM: 300281) potassium voltage-gated c ( 647) 672 144.1 1.1e-33
NP_000208 (OMIM: 160120,176260) potassium voltage- ( 495) 661 141.8 4.3e-33
NP_036413 (OMIM: 605410) potassium voltage-gated c ( 630) 659 141.5 6.7e-33
XP_006710694 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 510) 647 139.0 3e-32
NP_751948 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 636) 647 139.1 3.5e-32
XP_006710693 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 636) 647 139.1 3.5e-32
XP_005270908 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655) 647 139.2 3.6e-32
NP_004971 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 655) 647 139.2 3.6e-32
XP_006710692 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655) 647 139.2 3.6e-32
XP_016856733 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655) 647 139.2 3.6e-32
NP_005540 (OMIM: 602420) potassium voltage-gated c ( 511) 627 135.1 4.8e-31
XP_011539701 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 621 133.9 1.1e-30
XP_011539700 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 621 133.9 1.1e-30
XP_011539702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 621 133.9 1.1e-30
XP_011539698 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 621 133.9 1.1e-30
XP_016856702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 621 133.9 1.1e-30
XP_011539699 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 621 133.9 1.1e-30
NP_004965 (OMIM: 176262,616366) potassium voltage- ( 499) 621 133.9 1.1e-30
NP_758847 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 425) 620 133.6 1.1e-30
XP_016884998 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 558) 620 133.7 1.3e-30
XP_016884997 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 558) 620 133.7 1.3e-30
NP_002223 (OMIM: 176263) potassium voltage-gated c ( 575) 616 132.9 2.3e-30
NP_579875 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 436) 611 131.8 3.8e-30
NP_002224 (OMIM: 176266) potassium voltage-gated c ( 653) 594 128.6 5.3e-29
NP_002225 (OMIM: 176267,612240) potassium voltage- ( 613) 567 123.3 2.1e-27
NP_114092 (OMIM: 176268) potassium voltage-gated c ( 456) 553 120.3 1.2e-26
XP_016884999 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 405) 532 116.1 1.9e-25
XP_011514467 (OMIM: 605410) PREDICTED: potassium v ( 380) 513 112.3 2.5e-24
>>NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated chann (500 aa)
initn: 3285 init1: 3285 opt: 3285 Z-score: 3528.6 bits: 662.4 E(85289): 8.4e-190
Smith-Waterman score: 3285; 99.8% identity (99.8% similar) in 500 aa overlap (1-500:1-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EQDFSQGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSAELSWLDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EQDFSQGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSAELSWLDLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 STVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 STVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEML
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE3 RLKGRERASTRSSGGDDFWF
::::::::::::::::::::
NP_055 RLKGRERASTRSSGGDDFWF
490 500
>>NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated chann (911 aa)
initn: 1258 init1: 561 opt: 1304 Z-score: 1401.2 bits: 269.6 E(85289): 2.6e-71
Smith-Waterman score: 1304; 46.4% identity (74.1% similar) in 468 aa overlap (43-497:39-485)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
.:::: . ..:. .:.::::::
NP_004 LNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
. : ::.::: : .::::::: :: .:..::::.::.::..::::
NP_004 TH----------ESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
: ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : ....: .. ..:.:. :.. ::
NP_004 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--RREAETMR-EREGEE-FDNTCCPD
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--QL-----LE
:.:::..::::.::.::.:....::.:.:.: : ..: . ::. : :: :
NP_004 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTTQ
.: :::.::: :..:::: .. .:.. :.::::::::.:.:. :.:: ....
NP_004 HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSVL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 ELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFST
...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::.
NP_004 QFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLAL
. .:::.. : :::.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.::
NP_004 LVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIAL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRL
:: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.::.:..::: ::.. .
NP_004 PIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNLKDAFARS-MELIDV
420 430 440 450 460
490 500
pF1KE3 ---KGRERASTRSSGGDDFWF
:. : :.:..:. :.
NP_004 AVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNT
470 480 490 500 510 520
>>XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: potassiu (858 aa)
initn: 1227 init1: 565 opt: 1276 Z-score: 1371.5 bits: 264.1 E(85289): 1.2e-69
Smith-Waterman score: 1276; 45.9% identity (72.9% similar) in 468 aa overlap (43-497:35-481)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
.:::: . ..:. .:.::::::
XP_006 MTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
. : ::.::: . :::::::: :: .:..:::::::.::..::::
XP_006 TH----------DSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALS
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
: ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : :...: . ..:.:. :.. :
XP_006 FSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--KREAETLR-EREGEE-FDNTCCAE
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--------QLL
:.:::..::::.::.::.:...:::.:.:.: : ..: . ::. :: ::
XP_006 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT
.. : :::.::: :..:::: . .:.. : ::::::::.:.:. :.:: ....
XP_006 HV-EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS
...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::
XP_006 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA
.. .:::.. :: : :.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.:
XP_006 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KE3 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSI--MEM
::: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.:..:..:::: :..
XP_006 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
410 420 430 440 450 460
480 490 500
pF1KE3 LRLKGRERASTRSSGGDDFWF
. :. : . ... :.
XP_006 VVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQH
470 480 490 500 510 520
>>XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: potassiu (858 aa)
initn: 1227 init1: 565 opt: 1276 Z-score: 1371.5 bits: 264.1 E(85289): 1.2e-69
Smith-Waterman score: 1276; 45.9% identity (72.9% similar) in 468 aa overlap (43-497:35-481)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
.:::: . ..:. .:.::::::
XP_011 MTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
. : ::.::: . :::::::: :: .:..:::::::.::..::::
XP_011 TH----------DSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALS
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
: ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : :...: . ..:.:. :.. :
XP_011 FSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--KREAETLR-EREGEE-FDNTCCAE
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--------QLL
:.:::..::::.::.::.:...:::.:.:.: : ..: . ::. :: ::
XP_011 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT
.. : :::.::: :..:::: . .:.. : ::::::::.:.:. :.:: ....
XP_011 HV-EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS
...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::
XP_011 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA
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XP_011 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KE3 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSI--MEM
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XP_011 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
410 420 430 440 450 460
480 490 500
pF1KE3 LRLKGRERASTRSSGGDDFWF
. :. : . ... :.
XP_011 VVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQH
470 480 490 500 510 520
>>NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage-gate (858 aa)
initn: 1227 init1: 565 opt: 1276 Z-score: 1371.5 bits: 264.1 E(85289): 1.2e-69
Smith-Waterman score: 1276; 45.9% identity (72.9% similar) in 468 aa overlap (43-497:35-481)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
.:::: . ..:. .:.::::::
NP_004 MTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
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pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
. : ::.::: . :::::::: :: .:..:::::::.::..::::
NP_004 TH----------DSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALS
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
: ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : :...: . ..:.:. :.. :
NP_004 FSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--KREAETLR-EREGEE-FDNTCCAE
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pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--------QLL
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NP_004 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
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pF1KE3 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT
.. : :::.::: :..:::: . .:.. : ::::::::.:.:. :.:: ....
NP_004 HV-EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS
...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::
NP_004 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
290 300 310 320 330 340
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pF1KE3 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA
.. .:::.. :: : :.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.:
NP_004 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
350 360 370 380 390 400
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pF1KE3 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSI--MEM
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NP_004 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
410 420 430 440 450 460
480 490 500
pF1KE3 LRLKGRERASTRSSGGDDFWF
. :. : . ... :.
NP_004 VVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQH
470 480 490 500 510 520
>>NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated chann (494 aa)
initn: 914 init1: 428 opt: 918 Z-score: 990.6 bits: 192.8 E(85289): 1.9e-48
Smith-Waterman score: 918; 37.7% identity (67.2% similar) in 424 aa overlap (43-457:27-435)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
::::: : :: . :: .:.:::..: .
NP_002 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCL
10 20 30 40 50
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pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
: :. .. : :::: .: :..:::. .::. :.. : :..:. . .: .
NP_002 A-----GGYDTIFS---LCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC
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140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
: .:...: .: .:.::... .:.:: : . :. . .: . . :
NP_002 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRR--C--
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pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSA-ELSWLDLQ-------LLE
.. .:..:::: :: ::. .:.:.....:: . : . . ::. :: . ::
NP_002 -QKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLE
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pF1KE3 ILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQTTQE
.: .::.::: :..::.. .. .: . ::.:.:::::::..: . : :.. .:
NP_002 NVETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL-GARM-ME
230 240 250 260 270 280
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pF1KE3 LENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTV
: :: . ::.::..: :..::.:::.::..: ... . ..:.::::..:.::: .::..
NP_002 LTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSAL
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pF1KE3 EYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALP
: ::: :.: : :.: ..::: .::::::::: : :: ::. : . .: :....:::
NP_002 GYTMEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALP
350 360 370 380 390 400
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pF1KE3 IAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLK
: : . : : .. :.:.... : .:...
NP_002 IHPIINNFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEA
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490 500
pF1KE3 GRERASTRSSGGDDFWF
NP_002 PSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
470 480 490
>>NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated chann (466 aa)
initn: 907 init1: 416 opt: 847 Z-score: 914.8 bits: 178.7 E(85289): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 941; 37.7% identity (64.8% similar) in 446 aa overlap (27-460:6-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF
:: : : . . .:::: : :. ::.
NP_036 MEPWPCSPGGGGG-TRARHVIINVGGCRVRLAWAALARC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG
: .:: .: . : : :..::: . .:.::::: ::: .. :.:
NP_036 PLARLERLRAC----RGHDDL------LRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAG
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pF1KE3 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES
.:.... :::.: .:. :::::: .. :: : ::.: :. . . .. .:
NP_036 KLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREE--EAAEARAGPTERGAQGSP
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KE3 EQDFS-QGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMAL-----MSAEL
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NP_036 ARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEE
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pF1KE3 SWLDL----QLLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL
. . : .:: ::..::. ::.:: : ....: ::: ::::.::.::::..:
NP_036 ERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSL
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pF1KE3 LVESLSGSQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLL
:. .: :. :: .: ....:: ::.: ...:.::: ::::::.:. .: .: ::::
NP_036 LLGLAAGPGGTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLL
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pF1KE3 LFLSVGISIFSTVEYFAEQSI-PDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVA
::: :....:. . ..::. . :.::: ..:::. :::::::::. : . :..::
NP_036 LFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVA
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pF1KE3 FMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEA-AVRQREALKKLTKNIATDSYISVNL
. ::::::..:.:.. : :: : :: .. :. . ::.. . . ::
NP_036 LSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQG
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pF1KE3 RDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF
NP_036 PDSAGLADDSADALWVRAGR
450 460
>>XP_011524222 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta (466 aa)
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Smith-Waterman score: 941; 37.7% identity (64.8% similar) in 446 aa overlap (27-460:6-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF
:: : : . . .:::: : :. ::.
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pF1KE3 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG
: .:: .: . : : :..::: . .:.::::: ::: .. :.:
XP_011 PLARLERLRAC----RGHDDL------LRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAG
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pF1KE3 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES
.:.... :::.: .:. :::::: .. :: : ::.: :. . . .. .:
XP_011 KLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREE--EAAEARAGPTERGAQGSP
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pF1KE3 EQDFS-QGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMAL-----MSAEL
. .. .: :..: .....: :. :...:. .:. ::.:. ... : . ::
XP_011 ARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEE
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. . : .:: ::..::. ::.:: : ....: ::: ::::.::.::::..:
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:. .: :. :: .: ....:: ::.: ...:.::: ::::::.:. .: .: ::::
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::: :....:. . ..::. . :.::: ..:::. :::::::::. : . :..::
XP_011 LFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVA
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pF1KE3 FMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEA-AVRQREALKKLTKNIATDSYISVNL
. ::::::..:.:.. : :: : :: .. :. . ::.. . . ::
XP_011 LSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQG
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pF1KE3 RDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF
XP_011 PDSAGLADDSADALWVRAGR
450 460
>>XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta (466 aa)
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Smith-Waterman score: 941; 37.7% identity (64.8% similar) in 446 aa overlap (27-460:6-438)
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pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF
:: : : . . .:::: : :. ::.
XP_016 MEPWPCSPGGGGG-TRARHVIINVGGCRVRLAWAALARC
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: .:: .: . : : :..::: . .:.::::: ::: .. :.:
XP_016 PLARLERLRAC----RGHDDL------LRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAG
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.:.... :::.: .:. :::::: .. :: : ::.: :. . . .. .:
XP_016 KLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREE--EAAEARAGPTERGAQGSP
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. .. .: :..: .....: :. :...:. .:. ::.:. ... : . ::
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. . : .:: ::..::. ::.:: : ....: ::: ::::.::.::::..:
XP_016 ERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSL
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:. .: :. :: .: ....:: ::.: ...:.::: ::::::.:. .: .: ::::
XP_016 LLGLAAGPGGTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLL
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::: :....:. . ..::. . :.::: ..:::. :::::::::. : . :..::
XP_016 LFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVA
330 340 350 360 370 380
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pF1KE3 FMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEA-AVRQREALKKLTKNIATDSYISVNL
. ::::::..:.:.. : :: : :: .. :. . ::.. . . ::
XP_016 LSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQG
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500
pF1KE3 RDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF
XP_016 PDSAGLADDSADALWVRAGR
450 460
>>XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta (466 aa)
initn: 907 init1: 416 opt: 847 Z-score: 914.8 bits: 178.7 E(85289): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 941; 37.7% identity (64.8% similar) in 446 aa overlap (27-460:6-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF
:: : : . . .:::: : :. ::.
XP_011 MEPWPCSPGGGGG-TRARHVIINVGGCRVRLAWAALARC
10 20 30
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pF1KE3 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG
: .:: .: . : : :..::: . .:.::::: ::: .. :.:
XP_011 PLARLERLRAC----RGHDDL------LRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAG
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pF1KE3 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES
.:.... :::.: .:. :::::: .. :: : ::.: :. . . .. .:
XP_011 KLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREE--EAAEARAGPTERGAQGSP
90 100 110 120 130 140
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pF1KE3 EQDFS-QGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMAL-----MSAEL
. .. .: :..: .....: :. :...:. .:. ::.:. ... : . ::
XP_011 ARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEE
150 160 170 180 190 200
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pF1KE3 SWLDL----QLLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL
. . : .:: ::..::. ::.:: : ....: ::: ::::.::.::::..:
XP_011 ERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSL
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