Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3929
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3929, 500 aa
1>>>pF1KE3929 500 - 500 aa - 500 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7560+/-0.000951; mu= 15.5381+/- 0.057
mean_var=78.4473+/-15.740, 0's: 0 Z-trim(105.0): 98 B-trim: 45 in 1/49
Lambda= 0.144806
statistics sampled from 8098 (8209) to 8098 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 3.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 3285 696.3 2e-200
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 1304 282.6 1.3e-75
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 1276 276.7 6.9e-74
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 918 201.8 1.4e-51
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 847 187.0 4e-47
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 812 179.7 6.6e-45
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 750 166.7 5.7e-41
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 686 153.4 5.9e-37
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 672 150.5 5.3e-36
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 661 148.1 2.1e-35
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 659 147.8 3.4e-35
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 647 145.3 1.9e-34
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 647 145.3 2e-34
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 627 141.0 2.9e-33
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 621 139.8 6.9e-33
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 620 139.5 6.9e-33
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 616 138.8 1.6e-32
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 611 137.6 2.6e-32
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 594 134.2 4.3e-31
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 567 128.5 2e-29
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 553 125.5 1.2e-28
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 435 100.9 3.6e-21
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 357 84.6 2.8e-16
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 347 82.5 1.1e-15
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 307 74.2 4e-13
CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11 ( 676) 302 73.2 1e-12
CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs108|chr1 ( 695) 293 71.3 3.8e-12
CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 822) 285 69.7 1.4e-11
CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 923) 285 69.7 1.5e-11
CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 932) 285 69.7 1.6e-11
CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 951) 285 69.7 1.6e-11
>>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 (500 aa)
initn: 3285 init1: 3285 opt: 3285 Z-score: 3711.7 bits: 696.3 E(32554): 2e-200
Smith-Waterman score: 3285; 99.8% identity (99.8% similar) in 500 aa overlap (1-500:1-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EQDFSQGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSAELSWLDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 EQDFSQGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSAELSWLDLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 STVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 STVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEML
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE3 RLKGRERASTRSSGGDDFWF
::::::::::::::::::::
CCDS63 RLKGRERASTRSSGGDDFWF
490 500
>>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa)
initn: 1258 init1: 561 opt: 1304 Z-score: 1471.2 bits: 282.6 E(32554): 1.3e-75
Smith-Waterman score: 1304; 46.4% identity (74.1% similar) in 468 aa overlap (43-497:39-485)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
.:::: . ..:. .:.::::::
CCDS62 LNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
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CCDS62 TH----------ESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
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CCDS62 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--RREAETMR-EREGEE-FDNTCCPD
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--QL-----LE
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CCDS62 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTTQ
.: :::.::: :..:::: .. .:.. :.::::::::.:.:. :.:: ....
CCDS62 HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSVL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 ELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFST
...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::.
CCDS62 QFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLAL
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CCDS62 LVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIAL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRL
:: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.::.:..::: ::.. .
CCDS62 PIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNLKDAFARS-MELIDV
420 430 440 450 460
490 500
pF1KE3 ---KGRERASTRSSGGDDFWF
:. : :.:..:. :.
CCDS62 AVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNT
470 480 490 500 510 520
>>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 (858 aa)
initn: 1227 init1: 565 opt: 1276 Z-score: 1440.0 bits: 276.7 E(32554): 6.9e-74
Smith-Waterman score: 1276; 45.9% identity (72.9% similar) in 468 aa overlap (43-497:35-481)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
.:::: . ..:. .:.::::::
CCDS13 MTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
. : ::.::: . :::::::: :: .:..:::::::.::..::::
CCDS13 TH----------DSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALS
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
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CCDS13 FSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--KREAETLR-EREGEE-FDNTCCAE
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--------QLL
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CCDS13 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT
.. : :::.::: :..:::: . .:.. : ::::::::.:.:. :.:: ....
CCDS13 HV-EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS
...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::
CCDS13 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA
.. .:::.. :: : :.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.:
CCDS13 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KE3 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSI--MEM
::: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.:..:..:::: :..
CCDS13 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
410 420 430 440 450 460
480 490 500
pF1KE3 LRLKGRERASTRSSGGDDFWF
. :. : . ... :.
CCDS13 VVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQH
470 480 490 500 510 520
>>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 (494 aa)
initn: 914 init1: 428 opt: 918 Z-score: 1039.4 bits: 201.8 E(32554): 1.4e-51
Smith-Waterman score: 918; 37.7% identity (67.2% similar) in 424 aa overlap (43-457:27-435)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
::::: : :: . :: .:.:::..: .
CCDS16 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCL
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
: :. .. : :::: .: :..:::. .::. :.. : :..:. . .: .
CCDS16 A-----GGYDTIFS---LCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC
60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
: .:...: .: .:.::... .:.:: : . :. . .: . . :
CCDS16 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRR--C--
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240
pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSA-ELSWLDLQ-------LLE
.. .:..:::: :: ::. .:.:.....:: . : . . ::. :: . ::
CCDS16 -QKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQTTQE
.: .::.::: :..::.. .. .: . ::.:.:::::::..: . : :.. .:
CCDS16 NVETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL-GARM-ME
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTV
: :: . ::.::..: :..::.:::.::..: ... . ..:.::::..:.::: .::..
CCDS16 LTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSAL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALP
: ::: :.: : :.: ..::: .::::::::: : :: ::. : . .: :....:::
CCDS16 GYTMEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALP
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 IAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLK
: : . : : .. :.:.... : .:...
CCDS16 IHPIINNFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEA
410 420 430 440 450 460
490 500
pF1KE3 GRERASTRSSGGDDFWF
CCDS16 PSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
470 480 490
>>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa)
initn: 907 init1: 416 opt: 847 Z-score: 959.6 bits: 187.0 E(32554): 4e-47
Smith-Waterman score: 941; 37.7% identity (64.8% similar) in 446 aa overlap (27-460:6-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF
:: : : . . .:::: : :. ::.
CCDS12 MEPWPCSPGGGGG-TRARHVIINVGGCRVRLAWAALARC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG
: .:: .: . : : :..::: . .:.::::: ::: .. :.:
CCDS12 PLARLERLRAC----RGHDDL------LRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAG
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES
.:.... :::.: .:. :::::: .. :: : ::.: :. . . .. .:
CCDS12 KLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREE--EAAEARAGPTERGAQGSP
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KE3 EQDFS-QGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMAL-----MSAEL
. .. .: :..: .....: :. :...:. .:. ::.:. ... : . ::
CCDS12 ARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEE
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SWLDL----QLLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL
. . : .:: ::..::. ::.:: : ....: ::: ::::.::.::::..:
CCDS12 ERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LVESLSGSQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLL
:. .: :. :: .: ....:: ::.: ...:.::: ::::::.:. .: .: ::::
CCDS12 LLGLAAGPGGTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE3 LFLSVGISIFSTVEYFAEQSI-PDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVA
::: :....:. . ..::. . :.::: ..:::. :::::::::. : . :..::
CCDS12 LFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVA
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 FMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEA-AVRQREALKKLTKNIATDSYISVNL
. ::::::..:.:.. : :: : :: .. :. . ::.. . . ::
CCDS12 LSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQG
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500
pF1KE3 RDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF
CCDS12 PDSAGLADDSADALWVRAGR
450 460
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10 20 30 40 50 60
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: :. : :. ..:::: . ..:..: :
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10 20 30
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:::::::: . . :. :::::: . .:.::.:::. . :::::..: ::
CCDS16 PHTRLGKLLTCHSE-------EAI---LELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTG
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pF1KE3 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTED-------
.:::::.::..:: :::.::::.:: ::::: .:: .::: .. :. . ..:
CCDS16 KLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE3 -QESQHESE-QDFSQGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS
. : :.: . :. .:.:.: .:.:. .:..... :. :..::. : . :
CCDS16 EESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHS
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280
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: . .: .:: .: .::.:::::...:. . . .: .. ::::...:.::
CCDS16 MSEFQNEDGEVDDPVLEGVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPF
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 YITLLVESLSGSQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEV
: :: :. . . ....::.:..::.:::.: .:.:::.:::.:::::: :. . :.::
CCDS16 YATLAVD--TKEEESEDIENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEV
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:::::::::::::::.. : .:.. ...::.: ::::: ::::::::: .: : .::
CCDS16 GLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGK
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 IVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQ--REALKKLTKNIATDSYI
..: ::. ::::.::::.:: ..:: : : :. : : ..: .:
CCDS16 LIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYY--QKQKDIDVDQCSEDAPEK------CHELP
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pF1KE3 SVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF
:.::.::. .
CCDS16 YFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK
440 450 460 470 480 490
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10 20 30 40 50
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:: ..: :: . ..::::: . :. :.
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60 70 80 90 100 110
pF1KE3 CFPHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYR
::.::::.::. .. :. : :::: . .::::::. .:. : ..:
CCDS64 GFPKTRLGRLATSTSRSRQ----------LSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYL
120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 TGRLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQ
.: : :.. :: ::.:. :::. ::: . :: :::: : .... . : .
CCDS64 SGVLLVLDGLCPRRFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQV
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
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.:.:. : . :: :..:::..::: ::.::. .:: : ::.::.. .:: ..:
CCDS64 EEAEELFRDMRFYGP---QRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVE
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280
pF1KE3 LSWL---------DLQ-LLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAI
::. .:: .:..:...:: :..::. . : :: :.. :..::.::
CCDS64 EMQQHSGQGEGGPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAI
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330
pF1KE3 LPFYITLLVESLSG-----SQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMT
::.:. ::.: ..: .::. . .::....:.::.: .:.:::.:::::::..:.:
CCDS64 LPLYLQLLLECFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFT
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340 350 360 370 380 390
pF1KE3 ITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDI
. :::..:: ::::...:: ::.. : .:...:.:.::..: .::::..:..::::::.
CCDS64 LRQCYQQVGCLLLFIAMGIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDM
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 RPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNI
:.: :.. ::.:: ::.. ..::.:. ..:: : :: : .. .::
CCDS64 YPETHLGRFFAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQR
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500
pF1KE3 ATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF
CCDS64 ARKKIAECLLGSNPQLTPRQEN
530 540
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10 20 30 40
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pF1KE3 VGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFD
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CCDS13 VGGVRRQLSARALARFPGTRLGRLQ----------AAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFD
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pF1KE3 RSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSET
: : .::.::::.:::...::...: :: .:::. : .. .::: ::..:. :..
CCDS13 RHPGFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERR-LTQP
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. .:.. :. :. . : .. . : .:..:: .:.:: : ...:.
CCDS13 HAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSC
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250
pF1KE3 ISIIFVVVSIINMALMS----------AELSWL----------DLQLLEILEYVCISWFT
.:: :..:: : . : : .. . : .:. ::: ::.::.
CCDS13 VSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAAAAVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFS
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: :.: . . :. . :.::....::::.:::. :.: .:. ..:..:::.
CCDS13 FEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVF
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::.: .:.:::.:::::::::: :. . :.:::.:::.:.::.:.:: : : ::. :.
CCDS13 RLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKE-EDV
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380 390 400 410 420 430
pF1KE3 TFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSAC
:...: :::.:.:::::::::. : :..::..: :::.::::.::::.:: ..::
CCDS13 GFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHF
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440 450 460 470 480 490
pF1KE3 YFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSG
: : :::::
CCDS13 YRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSIDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHP
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CCDS14 S------------------SEKEFFYDAD--SGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPR
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: : .: .:. ..:. . .:: ..: :.:: .: : .::.:. :. :
CCDS14 QECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERL-----AEDEEA--EQAGDGP
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: ..::.:: .:.: .:::: .: .. .:..::.: .. ::. : .
CCDS14 ALPAGSSLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSRE
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: . .. .:. ::::..::.. . .::::::.: ..::..::::.:: ::
CCDS14 QPCGERFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLL
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: . ..:. .::..:..:..:..::: ::: ::.:. .: :.:.::.
CCDS14 VP---------KNDDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLF
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:...: ::.:: ..::.. :.:::.: :.:.. ..:::.::::. :.: .::: . .
CCDS14 SLTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSI
340 350 360 370 380 390
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pF1KE3 CILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKL---KEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNL
: :::.::.:::. .: . :: : . ..: . : : .:.:. .:....
CCDS14 CSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQ
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pF1KE3 RDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF
CCDS14 NGGLEDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGR
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pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
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CCDS85 EASAAPGHPQDGSYPRQADHDDHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFPNTLLG------
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pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG-RLHVMEQLCAL
.: . .:. :::::::. .: .:.::..: ::. ..
CCDS85 -------------NPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLD
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pF1KE3 SFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
: .::... . : .... .:. : ..: .. ..: :
CCDS85 MFSEEIKFYELGEEAMEKFREDEGFIKEE-------ERPLPEKEYQ--------------
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pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AEL----------------
:: .: ..: : :: ::.....:.. ...::. . : . ::
CCDS85 -RQ-VWLLFEYPESSGPARVIAIVSVMVILISIVIFCLETLPELKDDKDFTGTVHRIDNT
160 170 180 190 200
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pF1KE3 -----SWLDLQLLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYIT
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CCDS85 TVIYNSNIFTDPFFIVETLCIIWFSFELVVRFFACPSKTDFFKNIMNFIDIVAIIPYFIT
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CCDS85 LGTEIAEQEGNQKGEQATSLA-ILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELG
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CCDS85 LLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAEEAESHFSSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMYPVTIGGKI
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pF1KE3 VAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVN
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CCDS85 VGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFN--YFYHRETEGE-EQAQLLHVSSPNLASDSDLSRR
390 400 410 420 430 440
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pF1KE3 LRDVYARS-IMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF
.....: ::.
CCDS85 SSSTMSKSEYMEIEEDMNNSIAHYRQVNIRTANCTTANQNCVNKSKLLTDV
450 460 470 480 490
500 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 08:50:54 2016 done: Sun Nov 6 08:50:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]