Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3910
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3910, 588 aa
1>>>pF1KE3910 588 - 588 aa - 588 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9549+/-0.00103; mu= 14.5898+/- 0.061
mean_var=70.3576+/-14.322, 0's: 0 Z-trim(103.1): 147 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.152904
statistics sampled from 7069 (7232) to 7069 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 3.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6599.1 CCIN gene_id:881|Hs108|chr9 ( 588) 3946 880.3 0
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CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 435 105.8 2.3e-22
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 429 104.4 4e-22
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 429 104.4 4e-22
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CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 429 104.5 5.1e-22
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CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 397 97.4 6.3e-20
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 395 96.9 7.5e-20
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 390 95.8 1.6e-19
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 379 93.4 8.9e-19
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CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 370 91.4 3.4e-18
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 361 89.5 1.7e-17
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CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 347 86.3 1e-16
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 345 85.9 1.6e-16
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CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 344 85.7 1.9e-16
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CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 344 85.7 2e-16
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 337 84.2 6.1e-16
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 336 83.9 6.3e-16
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 335 83.7 7.2e-16
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 335 83.7 7.2e-16
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 326 81.7 2.7e-15
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 326 81.7 2.8e-15
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 321 80.6 6.2e-15
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 320 80.4 7e-15
CCDS81621.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 533) 312 78.6 2.2e-14
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 309 78.0 4e-14
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 309 78.0 4e-14
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 294 74.7 3.9e-13
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 294 74.7 4e-13
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 289 73.5 7e-13
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 289 73.5 7.5e-13
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 277 70.9 4.4e-12
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 269 69.2 1.8e-11
CCDS76133.1 ZBTB8A gene_id:653121|Hs108|chr1 ( 340) 262 67.5 3e-11
CCDS30664.1 ZBTB8A gene_id:653121|Hs108|chr1 ( 441) 262 67.6 3.9e-11
>>CCDS6599.1 CCIN gene_id:881|Hs108|chr9 (588 aa)
initn: 3946 init1: 3946 opt: 3946 Z-score: 4703.4 bits: 880.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3946; 99.8% identity (100.0% similar) in 588 aa overlap (1-588:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKLEFTEKNYNSFVLQNLNRQRKRKEYWDMALSVDNHVFFAHRNVLAAVSPLVRSLISSN
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CCDS65 MKLEFTEKNYNSFVLQNLNRQRKRKEYWDMALSVDNHVFFAHRNVLAAVSPLVRSLISSN
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70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DMKTADELFITIDTSYLSPVTVDQLLDYFYSGKVVISEQNVEELLRGAQYFNTPRLRVHC
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CCDS65 DMKTADELFITIDTSYLSPVTVDQLLDYFYSGKVVISEQNVEELLRGAQYFNTPRLRVHC
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130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NDFLIKSICRANCLRYLFLAELFELKEVSDVAYSGIRDNFHYWASPEGSMHFMRCPPVIF
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CCDS65 NDFLIKSICRANCLRYLFLAELFELKEVSDVAYSGIRDNFHYWASPEGSMHFMRCPPVIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GRLLRDENLHVLNEDQALSALINWVYFRKEDREKYFKKFFNYINLNAVSNKTLVFASNKL
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CCDS65 GRLLRDENLHVLNEDQALSALINWVYFRKEDREKYFKKFFNYINLNAVSNKTLVFASNKL
190 200 210 220 230 240
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pF1KE3 VGMENTSSHTTLIESVLMDRKQERPCSLLVYQRKGALLDSVVILGGQKAHGQFNDGVFAY
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CCDS65 VGMENTSSHTTLIESVLMDRKQERPCSLLVYQRKGALLDSVVILGGQKAHGQFNDGVFAY
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pF1KE3 IIQENLWMELSDMPYRAAALSATSAGRYIYISGGTTEQISGLKTAWRYDMDDNSWTKLPD
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CCDS65 IIQENLWMKLSDMPYRAAALSATSAGRYIYISGGTTEQISGLKTAWRYDMDDNSWTKLPD
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pF1KE3 LPIGLVFHTMVTCGGTVYSVGGSIAPRRYVSNIYRYDERKEVWCLAGKMSIPMDGTAVIT
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CCDS65 LPIGLVFHTMVTCGGTVYSVGGSIAPRRYVSNIYRYDERKEVWCLAGKMSIPMDGTAVIT
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pF1KE3 KGDRHLYIVTGRCLVKGYISRVGVVDCFDTSTGDVVQCITFPIEFNHRPLLSFQQDNILC
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pF1KE3 VHSHRQSVEINLQKVKASKTTTSVPVLPNSCPLDVSHAICSIGDSKVFVCGGVTTASDVQ
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CCDS65 VHSHRQSVEINLQKVKASKTTTSVPVLPNSCPLDVSHAICSIGDSKVFVCGGVTTASDVQ
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pF1KE3 TKDYTINPNAFLLDQKTGKWKTLAPPPEALDCPACCLAKLPCKILQRI
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CCDS65 TKDYTINPNAFLLDQKTGKWKTLAPPPEALDCPACCLAKLPCKILQRI
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>>CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 (621 aa)
initn: 388 init1: 154 opt: 441 Z-score: 524.4 bits: 107.1 E(32554): 6.9e-23
Smith-Waterman score: 451; 24.6% identity (53.3% similar) in 568 aa overlap (2-550:46-583)
10 20 30
pF1KE3 MKLEFTEKNYNSFVLQN-LNRQRKRKEYWDM
:..: . . :..::: :. : .. :.
CCDS32 VEKSLEGPLAPSTDEPSQKTGDLVEILNGEKVKFDDAGL-SLILQNGLETLRMENALTDV
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 ALSVDNHVFFAHRNVLAAVSPLVRSLISSNDMKTADELFITIDTSYLSPVTVDQLLDYFY
: :: . : :: ::::.: :... ::.: : : : .. :. :::: :
CCDS32 ILCVDIQEFSCHRVVLAAASNYFRAMFC-NDLKEKYEKRIIIKG--VDAETMHTLLDYTY
80 90 100 110 120 130
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pF1KE3 SGKVVISEQNVEELLRGAQYFNTPRLRVHCNDFLIKSICRANCLRYLFLAELFELKEVSD
..:..:..:::...:..:. :. :. : .:: ... ::. : ::. : ..
CCDS32 TSKALITKQNVQRVLEAANLFQFLRMVDACASFLTEALNPENCVGILRLADTHSLDSLKK
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160 170 180 190 200 210
pF1KE3 VAYSGIRDNFHYWASPEGSMHFMRCPPVIFGRLLRDENLHVLNEDQALSALINWVYFRKE
. : : .:: .. .: .:. : . ..:....:.: .: :.. ....:: .
CCDS32 QVQSYIIQNF---VQILNSEEFLDLPVDTLHHILKSDDLYVTEEAQVFETVMSWVRHKPS
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KE3 DREKYFKKFFNYINLNAVSNKTLV--FASNKLVGMENTSSHTTLIESVLMDRKQERPCSL
.: . .. . : .. .: .. :. . : :. .. . .. :
CCDS32 ERLCLLPYVLENVRLPLLDPWYFVETVEADPLI-RQCPEVFPLLQEARMYHLSGNEIISE
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270 280 290 300 310 320
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. : . . : .:.:: .: : . .:.. .: : .
CCDS32 RTKPRMHEFQSEVFMIIGGCTKDERFVAEVTCLDPLRRSRLEVAKLPLTEHELESENKKW
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330 340 350 360 370
pF1KE3 -----TSAGRYIYISGGTTEQISGLKTAWRYDMDDNSWTKLPDLPIGLVFHTMVTCGGTV
.. .::::: : . .:.:. . :.: .. : :: : ::. :: :
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pF1KE3 YSVGGSIAPRRYVSNIYRYDERKEVWCLAGKMSIPMDGTAVITKGDRHLYIVTGRCLVKG
: .:: . .: ..:. :: .. : :. . . ... :. :. ..::.. : .:
CCDS32 YVIGGFDGLQR-INNVETYDPFHNCWSEAAPLLVHVSSFAA-TSHKKKLYVIGGG--PNG
430 440 450 460 470
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pF1KE3 YISRVGVVDCFDTSTGDVVQCITFPIEFNHRPLLSFQQDNILCVHSHRQSVEINLQKVKA
.. . ..:.: ::. ..:.: . .::. : : : . .. . :
CCDS32 KLA-TDKTQCYDPSTNKWSLKAAMPVEAKCINAVSFR-DRIYVVGG-------AMRALYA
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pF1KE3 SKTTTSVPVLPNSCPL-DVSH--AICSIG--DSKVFVCGGVTTASDVQTKDYTINPNAFL
. :. . : . ..:: : :.:. ...... :: ..: . .:.:
CCDS32 YS-----PLEDSWCLVTQLSHERASCGIAPCNNRLYITGGRDEKNEVIATVLCWDPEAQK
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560 570 580
pF1KE3 LDQKTGKWKTLAPPPEALDCPACCLAKLPCKILQRI
CCDS32 LTEECVLPRGVSHHGSVTIRKSYTHIRRIVPGAVSV
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>>CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 (589 aa)
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Smith-Waterman score: 439; 23.1% identity (55.5% similar) in 463 aa overlap (5-449:23-466)
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pF1KE3 MKLEFTEKNYNSFVLQNLNRQRKRKEYWDMALSVDNHVFFAH
: ...: . :: .:: :... . :. : . :..: :
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pF1KE3 RNVLAAVSPLVRSLISSNDMKTADELFITIDTSYLSPVTVDQLLDYFYSGKVVISEQNVE
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CCDS40 RAVLAACSRYFEAMFSGG-LKESQDSEVNFDNS-IHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAE
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::....... .: : .:: :.. .::: .:.:.. . .. .... .::.
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. : :.. : . .:: .:.:.. .: . . :::. . . : :. ....
CCDS40 IRKNE---DFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQT
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pF1KE3 INLNAVSNKTLVFASNKLVGMENTSSHTTLIESVLMDRKQERPCSLLVYQRKGALLD---
. : . :. . :.::. .. . .. . . :.: . : :.. .
CCDS40 VRLALLPAIYLM----ENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIR---CKLKILQNDGVVTSLCA
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 -------SVVILGGQKAHGQFNDGVFAYIIQENLWMELSDMPYRAAALSATSAGRYIYIS
.. .:::: . : .. . . . .:.: .:: . : .::.
CCDS40 RPRKTGHALFLLGGQTF---MCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYIT
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380
pF1KE3 GGTTEQISGLKTAWRYDMDDNSWTKLPDLPIGLVFHTMVTCGGTVYSVGGSIA-------
:: . . : .: :: . :.: . .. : . .: ::: :
CCDS40 GGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPA
350 360 370 380 390 400
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: .... .:: . : ... . ....::.. . .:. : . . . .:
CCDS40 SPSVSLKQVEHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVS-AKLKLFAFGGTSVSHDKLPKV--
410 420 430 440 450 460
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pF1KE3 VDCFDTSTGDVVQCITFPIEFNHRPLLSFQQDNILCVHSHRQSVEINLQKVKASKTTTSV
.:.:
CCDS40 -QCYDQCENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKV
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>>CCDS11411.1 KLHL11 gene_id:55175|Hs108|chr17 (708 aa)
initn: 265 init1: 104 opt: 435 Z-score: 516.3 bits: 105.8 E(32554): 1.9e-22
Smith-Waterman score: 520; 23.6% identity (53.9% similar) in 610 aa overlap (4-586:70-667)
10 20 30
pF1KE3 MKLEFTEKNYNSFVLQNLNRQRKRKEYWDMAL-
.: ... : . :.::.. . :..:
CCDS11 VRGSGTVDFGPGPGISAMEASGGDPGPEAEDFECSSHCSELSWRQNEQRRQGLFCDITLC
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40 50 60 70 80
pF1KE3 --SVDNHVFFAHRNVLAAVSPLVRSLIS---SNDMKTADELFITIDTSYLSPVTVDQLLD
.. .. : :::.::::.. :.: :.. . :. . : ::. ...
CCDS11 FGGAGGREFRAHRSVLAAATEYFTPLLSGQFSESRSGRVEMRKWSSEPGPEPDTVEAVIE
100 110 120 130 140 150
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pF1KE3 YFYSGKVVISEQNVEELLRGAQYFNTPRLRVHCNDFLIKSICRANCLRYLFLAELFELKE
:.:.:.. .: .:.:.:. :. : ::. :..:: :.. .::. ::... :..
CCDS11 YMYTGRIRVSTGSVHEVLELADRFLLIRLKEFCGEFLKKKLHLSNCVAIHSLAHMYTLSQ
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150 160 170 180 190 200
pF1KE3 VSDVAYSGIRDNFHYWASPEGSMHFMRCPPVIFGRLLRDENLHVLNEDQALSALINWVYF
.. : . :: ::: . : .:. : .. : : .. : .:. . ....::
CCDS11 LALKAADMIRRNFHKVIQDE---EFYTLPFHLIRDWLSDLEITVDSEEVLFETVLKWVQR
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250
pF1KE3 RKEDREKYFKKFFNYINLNAVSNKTL--------VFASN----KLVGMENTSSHTTLIES
:.::.::...:. . :. .. : . :.: :::. . . :. :.
CCDS11 NAEERERYFEELFKLLRLSQMKPTYLTRHVKPERLVANNEVCVKLVA-DAVERHALRAEN
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 VLMDRKQERPCSLLVYQRKGALLDSVVILGGQKAHGQFNDGVFAYIIQENLWMELSDMPY
. :. . . : : .: ....:: . :.. . .:...:. :..: .
CCDS11 IQSGTCQHPTSHVSLLPRYGQNMDVIMVIGGVSEGGDYLSECVGYFVDEDRWVNLPHIHN
340 350 360 370 380 390
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 RAAALSATSAGRYIYISGGTTEQISGLKTAWRYDMDDNSWTKLPDLPIGLVFHTMVTCGG
. . ... . :.:..:. .. ::. ::. . :.: .. .: .. :
CCDS11 HLDGHAVAVTESYVYVAGSMEPGFA--KTVERYNPNLNTWEHVCSLMTRKHSFGLTEVKG
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pF1KE3 TVYSVGGSIAPRRYVSNIYRYDERKEVW-CLAGKMSIPMDGTAVITKGDRHLYIVTGRCL
.::.:: ... :. . . : : . .: : :. . :: .::.. .
CCDS11 KLYSIGGHGNFSPGFKDVTVYNPELDKWHNLESAPKILRDVKALAIE-DRFVYIAARTPV
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. . . .:. :.:: : . . ..:. :. . .: : : .:.
CCDS11 DRDTEDGLKAVITCYDTETRQWQDVESLPLIDNYCFFQMSVVNSNFYQTASCCPKSYCLE
520 530 540 550 560 570
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 VEINLQKVKASKTTTSVPVLPNSCPLDVSHAICSIGDSKVFVCGGVTTASDVQTKDYTIN
: ..:. .. . . :: . ::: :. ::. :: ...:.. :.: .
CCDS11 NEEAVRKIASQVSDEILESLPPEVLSIEGAAICYYKDD-VFIIGGWKNSDDID-KQYRKE
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550 560 570 580
pF1KE3 PNAFLLDQKTGKWKTLAPPPEALDCPAC-CLAKLPCKILQRI
. ..: .: : : :. : : : ...: . :.
CCDS11 AYRYCAERK--RWMLLPPMPQP-RCRATACHVRIPYRYLHGTQRYPMPQNLMWQKDRIRQ
640 650 660 670 680
CCDS11 MQEIHRHALNMRRVPSSQIEC
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. :... : .:.::::. : ..:: : .: . . . . : :. ... ::..
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:.:..::. :.. ::..:. :. . : .:: :.. .::: : .:: .. .:.
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.: . . : :. : . . . . . . ...:.. :. . ..:.:.
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: .: ... . : :.:.:. :. .:. . : ... .. . ..
CCDS54 ATRTQYAAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEM
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. : : .... . .:..::.. :. . .. : :.: :. :...: :
CCDS54 QTPRTRPRL----SAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYD
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.:..::: ::.::: .. : .: : .. :: :. . . . :. .. :
CCDS54 REFFSVVSAGDNIYLSGGMESGVT-LADVWCYMSLLDN-WNLVSRMTVPRCRHNSLVYDG
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pF1KE3 TVYSVGGSIAPRRYVSNIYRYDERKEVWCLAGKMSIPMDGTAVITKGDRHLYIVTGRCLV
.:..:: .. :... ::: . : .. . . ..:. . : . .:. : :
CCDS54 KIYTLGG-LGVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGK-IYVFGG---V
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pF1KE3 KGYISRVGVVDCFDTSTGDVVQCITFPIEFNHRPLLSFQQDNILCVHSHRQSVEINLQKV
. .::.. . : : :. : . :.. :: .. . : .
CCDS54 NEAGRAAGVLQSY------VPQTNTWS--FIESPMI----DNKYAPAVTLNGFVFILGGA
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pF1KE3 KASKTTTSVPVLPN--SCP-LDVSHAICS--IGDSKVFVCGGVTTASDVQTKDYTINPNA
: :: : : . : .. :. .:: . :.:... ::.... : .:
CCDS54 YARATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALG----NMEA
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pF1KE3 FLLDQKTGKWKTLAPPPEALDCPACCLAKLPCKILQRI
. . :. : :: : . :: . . : ....
CCDS54 Y--EPTTNTW-TLLP---HMPCP---VFRHGCVVIKKYIQSG
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: :. ...... ..:. :. : . .. . ::: ::..:: .
CCDS54 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAA
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CCDS54 MFT-NDVREARQEEIKMEG--VEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQ
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pF1KE3 LRVHCNDFLIKSICRANCLRYLFLAELFELKEVSDVAYSGIRDNFHYWASPEGSMHFMRC
. : ::.:.. .::: .:. .. ::.. ..: ...:.
CCDS54 VVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIR---NQEFVLL
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pF1KE3 PPVIFGRLLRDENLHVLNEDQALSALINWVYFRKEDREKYFKKFFNYINLNAVSNKTLVF
: ...:: ...... ::. :.::..:: :.:.: ..:.. :: : .. . :.
CCDS54 PASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLAD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ASNKLVGMENTSSHTTLIESV---LMDRKQERPCSLLVYQRKGALLDSVVILGGQKAHGQ
:... .. . ..:.. :. ... : . ::... .. : ....:
CCDS54 MENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGA
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pF1KE3 FNDGVFAYIIQENLWMELSDMPYRAAALSATSAGRYIYISGGTTEQISGLKTAWRYDMDD
. . : .. :.: ...: : .... .:. :: . .. :.:. :.
CCDS54 TS--IEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGR-DGLKTLNTVECYNPKT
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pF1KE3 NSWTKLPDLPIGLVFHTM--VTCGGTVYSVGGSIAPRRYVSNIYRYDERKEVWCLAGKMS
..:. .: :.. : . .. : .:.::: :.... :.: . . : ... ::
CCDS54 KTWSVMP--PMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGH-DGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMS
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: . :.::.. .:: : :: : : . :.::: :. . : . . .
CCDS54 TPRSTVGVAVLSG---KLYAVGGR---DGS-SCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGV
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pF1KE3 PLLSFQQDNILCVHSHRQSVEINLQKVKAS-------KTTTSVPVLPNSCPLDVSHAICS
. .. ...: . . ... :: . .. :: . : : :. ..:
CCDS54 GVTTW--NGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAV-GVCL
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pF1KE3 IGDSKVFVCGGVTTASDVQTKDYTINPNAFLLDQKTGKWKTLAPPPEALDCPACCLAKLP
.:: :... :: : :. :.. :. : .:..: .::
CCDS54 LGD-KLYAVGGY----DGQAYLNTVE--AY--DPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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pF1KE3 CKILQRI
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: : .....: .:..:: :. . :... . . . ::::::. :: :
CCDS43 MDEESLDGLLFKDHDFSSDLLRQLNSLRQSRILTDVSICAGAREIPCHRNVLASSSPYFR
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pF1KE3 SLISSNDMKTADELFITIDTSYLSPVTVDQLLDYFYSGKVVISEQNVEELLRGAQYFNTP
... :. .. .: .. . ..: :.::...: :.:.. :. .:: ....:.... :
CCDS43 AMFCSS-FREKSE--AKVQLKGIDPPTLDQIVSYVYTGEAHIATDNVLPVMEAASMLQFP
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pF1KE3 RLRVHCNDFLIKSICRANCLRYLFLAELFELKEVSDVAYSGIRDNFHYWASPEGSMHFMR
.: :...: ... .::: .. :.:.. . .. : .: :. : . .
CCDS43 KLFEACSSYLQSQLAPSNCLGMIRLSEILSCETLKKKAREVALTSFPEVAA---SADLKE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE3 CPPVIFGRLLRDENLHVLNEDQALSALINWVYFRKEDREKYFKKFFNYINLNAVSNKTLV
. . : :..: .:.... ::. :. . :..:....:. . :. . .
CCDS43 LCALELRDYLGDDGL-CGEEEKVFEALMVWIKHDLQARKRYMQELFKQVRLQYIHPAFFH
180 190 200 210 220 230
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pF1KE3 -FASNKLVGMENTSSHTTLIESVLMDRKQ-------ERP-CSLLVY-QRKGALLDSVVIL
: .: . .... . ..:.. ..: : :.::.. ... : ...:
CCDS43 HFIANDAL-LQSSPACQIILETA---KRQMFSLCGTTVPDCKLLLHVPPRNSYQDFLILL
240 250 260 270 280
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pF1KE3 GGQKAHGQFNDGVFAYIIQENLWMELSDMPYRAAALSATSAGRYIYISGGTTEQISGLK-
::.: : . :. : : . :. :. .: : :: . : ::. :: . . :: .
CCDS43 GGRKDSQQTTRDVLLYSKQTGQWQSLAKLPTRLYKASAITLHRSIYVLGGMAVS-SGRSL
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pF1KE3 ---TAWRYDMDDNSWTKLPDLPIGLVFHTMVTCGGTVYSVGGSIAPRRYVSNIYRYDERK
... ... :.: . .. : .. . ..:.:: .. .... :::
CCDS43 VSHNVYIFSLKLNQWRLGEPMLVARYSHRSTAHKNFIFSIGGIGEGQELMGSMERYDSIC
350 360 370 380 390 400
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pF1KE3 EVWCLAGKMSIPMDGTAVITKGDRHLYIVTGRCLVKGYISRVGVVDCFDTSTGDVVQCIT
.:: ..: . . :: .: :..::. :. ... . : ... . : .. . :
CCDS43 NVWESMASMPVGVLHPAVAVK-DQRLYLFGGEDIMQ---NPVRLIQVYHISRNSWFKMET
410 420 430 440 450 460
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pF1KE3 FPIEFNHRPLLSFQQDNILCVHSHRQSVEINLQKVKASKTTTSVPVLPNSCPLDVSHAIC
:. : . . . .. :. . . :. : : . . . :.
CCDS43 RMIKNVCAPAVVLGERIVIVGGYTRRILAYDPQSNKFVKCA-------DMKDRRMHHGAT
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pF1KE3 SIGDSKVFVCGGVTTASDVQTKDYTINPNAFLLDQKTGKWKTLAPPPEALDCPACCLAKL
.:. :..: :: ..: . .: . . . . : .: : . . :. : ::
CCDS43 VMGN-KLYVTGGRRLTTDCNIED-SASFDCY--DPETDTWTSQGQLPHKLFDHACLTLQC
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pF1KE3 PCKILQRI
CCDS43 IPRTSGLP
580
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: :. ...... ..:. :. : .
CCDS33 ESDSSSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVA
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.. . ::: ::..:: .... ::.. : . : .. . : .. .:..: :.:..
CCDS33 GDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFT-NDVREARQEEIKMEG--VEPNSLWSLIQYAYTGRL
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..:.:.: :: : .. .. : ::.:.. .::: .:. .. ::..
CCDS33 ELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHN
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pF1KE3 GIRDNFHYWASPEGSMHFMRCPPVIFGRLLRDENLHVLNEDQALSALINWVYFRKEDREK
..: ...:. : ...:: ...... ::. :.::..:: :.:.:
CCDS33 YTMEHFMEVIR---NQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRK
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pF1KE3 YFKKFFNYINLNAVSNKTLVFASNKLVGMENTSSHTTLIESV---LMDRKQERPCSLLVY
..:.. :: : .. . :. :... .. . ..:.. :. ... : .
CCDS33 DLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTK
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pF1KE3 QRKGALLDSVVILGGQKAHGQFNDGVFAYIIQENLWMELSDMPYRAAALSATSAGRYIYI
::... .. : ....: . . : .. :.: ...: : .... .:.
CCDS33 PRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATS--IEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYV
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pF1KE3 SGGTTEQISGLKTAWRYDMDDNSWTKLPDLPIGLVFHTM--VTCGGTVYSVGGSIAPRRY
:: . .. :.:. :. ..:. .: :.. : . .. : .:.::: :
CCDS33 VGGR-DGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMP--PMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGH-DGWSY
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pF1KE3 VSNIYRYDERKEVWCLAGKMSIPMD--GTAVITKGDRHLYIVTGRCLVKGYISRVGVVDC
.... :.: . . : ... :: : . :.::.. .:: : :: : : . :.:
CCDS33 LNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSG---KLYAVGGR---DGS-SCLKSVEC
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pF1KE3 FDTSTGDVVQCITFPIEFNHRPLLSFQQDNILCVHSHRQSVEINLQKVKAS-------KT
:: :. . : . . . . .. ...: . . ... :: . .. ::
CCDS33 FDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTW--NGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKT
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pF1KE3 TTSVPVLPNSCPLDVSHAICSIGDSKVFVCGGVTTASDVQTKDYTINPNAFLLDQKTGKW
. : : :. ..: .:: :... :: : :. :.. :. : .:..:
CCDS33 DMWTAVASMSISRDAV-GVCLLGD-KLYAVGGY----DGQAYLNTVE--AY--DPQTNEW
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pF1KE3 KTLAPPPEALDCPACCLAKLPCKILQRI
.::
CCDS33 TQVAPLCLGRAGACVVTVKL
690 700
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10 20 30
pF1KE3 MKLEFTEKNYNSFVLQNLNRQRKRKEYWDMALSV
: :. ...... ..:. :. : .
CCDS33 ESDSSSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVA
170 180 190 200 210 220
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pF1KE3 DNHVFFAHRNVLAAVSPLVRSLISSNDMKTADELFITIDTSYLSPVTVDQLLDYFYSGKV
.. . ::: ::..:: .... ::.. : . : .. . : .. .:..: :.:..
CCDS33 GDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFT-NDVREARQEEIKMEG--VEPNSLWSLIQYAYTGRL
230 240 250 260 270 280
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 VISEQNVEELLRGAQYFNTPRLRVHCNDFLIKSICRANCLRYLFLAELFELKEVSDVAYS
..:.:.: :: : .. .. : ::.:.. .::: .:. .. ::..
CCDS33 ELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHN
290 300 310 320 330 340
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 GIRDNFHYWASPEGSMHFMRCPPVIFGRLLRDENLHVLNEDQALSALINWVYFRKEDREK
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