Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3874
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3874, 699 aa
1>>>pF1KE3874 699 - 699 aa - 699 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4576+/-0.000875; mu= 14.6649+/- 0.053
mean_var=98.7770+/-19.826, 0's: 0 Z-trim(108.6): 18 B-trim: 28 in 1/49
Lambda= 0.129047
statistics sampled from 10455 (10463) to 10455 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 1.930
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS55171.1 ZC3HAV1 gene_id:56829|Hs109|chr7 ( 699) 4796 903.7 0
CCDS5851.1 ZC3HAV1 gene_id:56829|Hs109|chr7 ( 902) 4792 903.0 0
CCDS5850.1 ZC3HAV1L gene_id:92092|Hs109|chr7 ( 300) 469 97.9 2.3e-20
CCDS5857.1 PARP12 gene_id:64761|Hs109|chr7 ( 701) 457 95.9 2.2e-19
>>CCDS55171.1 ZC3HAV1 gene_id:56829|Hs109|chr7 (699 aa)
initn: 4796 init1: 4796 opt: 4796 Z-score: 4827.3 bits: 903.7 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4796; 100.0% identity (100.0% similar) in 699 aa overlap (1-699:1-699)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDALLQEIALSEPQLCEVLQVAGPDRFVVLETGGEAGI
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CCDS55 MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDALLQEIALSEPQLCEVLQVAGPDRFVVLETGGEAGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TRSVVATTRARVCRRKYCQRPCDNLHLCKLNLLGRCNYSQSERNLCKYSHEVLSEENFKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TRSVVATTRARVCRRKYCQRPCDNLHLCKLNLLGRCNYSQSERNLCKYSHEVLSEENFKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LKNHELSGLNKEELAVLLLQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICNQQPPCSRLHICDHFTRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKNHELSGLNKEELAVLLLQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICNQQPPCSRLHICDHFTRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NCRFPNCLRSHNLMDRKVLAIMREHGLNPDVVQNIQDICNSKHMQKNPPGPRAPSSHRRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCRFPNCLRSHNLMDRKVLAIMREHGLNPDVVQNIQDICNSKHMQKNPPGPRAPSSHRRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 MAYRARSKSRDRFFQGSQEFLASASASAERSCTPSPDQISHRASLEDAPVDDLTRKFTYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAYRARSKSRDRFFQGSQEFLASASASAERSCTPSPDQISHRASLEDAPVDDLTRKFTYL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GSQDRARPPSGSSKATDLGGTSQAGTSQRFLENGSQEDLLHGNPGSTYLASNSTSAPNWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GSQDRARPPSGSSKATDLGGTSQAGTSQRFLENGSQEDLLHGNPGSTYLASNSTSAPNWK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SLTSWTNDQGARRKTVFSPTLPAARSSLGSLQTPEAVTTRKGTGLLSSDYRIINGKSGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLTSWTNDQGARRKTVFSPTLPAARSSLGSLQTPEAVTTRKGTGLLSSDYRIINGKSGTQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 DIQPGPLFNNNADGVATDITSTRSLNYKSTSSGHREISSPRIQDAGPASRDVQATGRIAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DIQPGPLFNNNADGVATDITSTRSLNYKSTSSGHREISSPRIQDAGPASRDVQATGRIAD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 DADPRVALVNDSLSDVTSTTSSRVDDHDSEEICLDHLCKGCPLNGSCSKVHFHLPYRWQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DADPRVALVNDSLSDVTSTTSSRVDDHDSEEICLDHLCKGCPLNGSCSKVHFHLPYRWQM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LIGKTWTDFEHMETIEKGYCNPGIHLCSVGSYTINFRVMSCDSFPIRRLSTPSSVTKPAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LIGKTWTDFEHMETIEKGYCNPGIHLCSVGSYTINFRVMSCDSFPIRRLSTPSSVTKPAN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SVFTTKWIWYWKNESGTWIQYGEEKDKRKNSNVDSSYLESLYQSCPRGVVPFQAGSRNYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SVFTTKWIWYWKNESGTWIQYGEEKDKRKNSNVDSSYLESLYQSCPRGVVPFQAGSRNYE
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE3 LSFQGMIQTNIASKTQKDVIRRPTFVPQWYVQQMKRGPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSFQGMIQTNIASKTQKDVIRRPTFVPQWYVQQMKRGPE
670 680 690
>>CCDS5851.1 ZC3HAV1 gene_id:56829|Hs109|chr7 (902 aa)
initn: 4848 init1: 4792 opt: 4792 Z-score: 4821.7 bits: 903.0 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4792; 99.9% identity (100.0% similar) in 699 aa overlap (1-699:1-699)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDALLQEIALSEPQLCEVLQVAGPDRFVVLETGGEAGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDALLQEIALSEPQLCEVLQVAGPDRFVVLETGGEAGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TRSVVATTRARVCRRKYCQRPCDNLHLCKLNLLGRCNYSQSERNLCKYSHEVLSEENFKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TRSVVATTRARVCRRKYCQRPCDNLHLCKLNLLGRCNYSQSERNLCKYSHEVLSEENFKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LKNHELSGLNKEELAVLLLQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICNQQPPCSRLHICDHFTRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKNHELSGLNKEELAVLLLQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICNQQPPCSRLHICDHFTRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NCRFPNCLRSHNLMDRKVLAIMREHGLNPDVVQNIQDICNSKHMQKNPPGPRAPSSHRRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NCRFPNCLRSHNLMDRKVLAIMREHGLNPDVVQNIQDICNSKHMQKNPPGPRAPSSHRRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 MAYRARSKSRDRFFQGSQEFLASASASAERSCTPSPDQISHRASLEDAPVDDLTRKFTYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAYRARSKSRDRFFQGSQEFLASASASAERSCTPSPDQISHRASLEDAPVDDLTRKFTYL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GSQDRARPPSGSSKATDLGGTSQAGTSQRFLENGSQEDLLHGNPGSTYLASNSTSAPNWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSQDRARPPSGSSKATDLGGTSQAGTSQRFLENGSQEDLLHGNPGSTYLASNSTSAPNWK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SLTSWTNDQGARRKTVFSPTLPAARSSLGSLQTPEAVTTRKGTGLLSSDYRIINGKSGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLTSWTNDQGARRKTVFSPTLPAARSSLGSLQTPEAVTTRKGTGLLSSDYRIINGKSGTQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 DIQPGPLFNNNADGVATDITSTRSLNYKSTSSGHREISSPRIQDAGPASRDVQATGRIAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DIQPGPLFNNNADGVATDITSTRSLNYKSTSSGHREISSPRIQDAGPASRDVQATGRIAD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 DADPRVALVNDSLSDVTSTTSSRVDDHDSEEICLDHLCKGCPLNGSCSKVHFHLPYRWQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DADPRVALVNDSLSDVTSTTSSRVDDHDSEEICLDHLCKGCPLNGSCSKVHFHLPYRWQM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LIGKTWTDFEHMETIEKGYCNPGIHLCSVGSYTINFRVMSCDSFPIRRLSTPSSVTKPAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LIGKTWTDFEHMETIEKGYCNPGIHLCSVGSYTINFRVMSCDSFPIRRLSTPSSVTKPAN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SVFTTKWIWYWKNESGTWIQYGEEKDKRKNSNVDSSYLESLYQSCPRGVVPFQAGSRNYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SVFTTKWIWYWKNESGTWIQYGEEKDKRKNSNVDSSYLESLYQSCPRGVVPFQAGSRNYE
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE3 LSFQGMIQTNIASKTQKDVIRRPTFVPQWYVQQMKRGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 LSFQGMIQTNIASKTQKDVIRRPTFVPQWYVQQMKRGPDHQPAKTSSVSLTATFRPQEDF
670 680 690 700 710 720
CCDS58 CFLSSKKYKLSEIHHLHPEYVRVSEHFKASMKNFKIEKIKKIENSELLDKFTWKKSQMKE
730 740 750 760 770 780
>>CCDS5850.1 ZC3HAV1L gene_id:92092|Hs109|chr7 (300 aa)
initn: 614 init1: 225 opt: 469 Z-score: 479.1 bits: 97.9 E(33420): 2.3e-20
Smith-Waterman score: 632; 35.6% identity (61.1% similar) in 303 aa overlap (1-276:1-295)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDALLQEIALSEPQLCEVLQVAGPDRFVVLET------
::.: :: :.::.:::::::: : : .. ::: .: .::: :::.::.. :.
CCDS58 MAEPTVCSFLTKVLCAHGGRMFLKDLRGHVELSEARLRDVLQRAGPERFLLQEVETQEGL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KE3 ------------GGEAGITRSVVATTRARVC---RRKYCQRPCDNLHLCKLNLLGRCNYS
:: . . :::.. .:.: .: :: ::.::.:. ..::.: .
CCDS58 GDAEAEAAAGAVGGGGTSAWRVVAVSSVRLCARYQRGECQ-ACDQLHFCRRHMLGKCP-N
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 QSERNLCKYSHEVLSEENFKVLKNHELSGLNKEELAVLLLQSDPFFMPEICKSY-KGEGR
.. . : ::.. . :..:::.: : :::...: .::::.:: ..::.: : :::.
CCDS58 RDCWSTCTLSHDIHTPVNMQVLKSHGLFGLNENQLRILLLQNDPCLLPEVCLLYNKGEAL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 QQICNQQPPCSRLHICDHFTRGNCRFPNCLRSHNLMDRKVLAIMREHGLNPDVVQNIQDI
:: . :...:.: :..:.:.. .: :::.:. : .....::: : :.: :
CCDS58 YGYCNLKDKCNKFHVCKSFVKGECKLQTCKRSHQLIHAASLKLLQDQGLNIPSVVNFQII
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 CNSKHMQ-----KNPPGPRAPSSHRRNMAYRARSKSRDRFFQGSQEFLASASASAERSCT
. :::. .: . . : ... .. . :. : ::. :. .
CCDS58 STYKHMKLHKMLENTDNSSPSTEHSQGLEKQGVHAA------GAAEAGPLASVPAQSAKK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 PSPDQISHRASLEDAPVDDLTRKFTYLGSQDRARPPSGSSKATDLGGTSQAGTSQRFLEN
: :
CCDS58 PCPVSCEK
300
>>CCDS5857.1 PARP12 gene_id:64761|Hs109|chr7 (701 aa)
initn: 884 init1: 245 opt: 457 Z-score: 461.5 bits: 95.9 E(33420): 2.2e-19
Smith-Waterman score: 605; 25.8% identity (45.4% similar) in 720 aa overlap (1-695:1-472)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDALLQEI--ALSEPQLCEVLQVAGPDRFVV-LETGGE
::. : .:..::: :: . : : ... .:: : ..:. : :::: ...::
CCDS58 MAQAGVVGEVTQVLCAAGGALELPELRRRLRMGLSADALERLLRQRG--RFVVAVRAGGA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 AGIT-RSVVATTRARVCRRKYCQRP-----CDNLHLCKLNLLGRCNYSQSERNLCKYSHE
:. : :.:.. :.:: . ..: : .::::.. . : :.. .. .: :. ::
CCDS58 AAAPERVVLAASPLRLCRAHQGSKPGCVGLCAQLHLCRFMVYGACKFLRAGKN-CRNSHS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 VLSEENFKVLKNHELSGLNKEELAVLLLQSDPFFMPEICKSY-KGEGRQQICNQQPPCSR
. .:.:..::..: .. :. .:: ::.:.::...::::. : ::.: . : : : .
CCDS58 LTTEHNLSVLRTHGVDHLSYNELCQLLFQNDPWLLPEICQHYNKGDGPHGSCAFQKQCIK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE3 LHICDHFTRGNCRF-PNCLRSHNLMDRKVLAIMREHGLNPDVVQNIQDICNSKHMQKNPP
::::..: .:.:.: .: :::.. . . : ... :.. :.:.
CCDS58 LHICQYFLQGECKFGTSCKRSHDFSNSENLEKLEKLGMSSDLVS----------------
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 GPRAPSSHRRNMAYRARSKSRDRFFQGSQEFLASASASAERSCTPSPDQISHRASLEDAP
: :. .:
CCDS58 --RLPTIYR---------------------------------------------------
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 VDDLTRKFTYLGSQDRARPPSGSSKATDLGGTSQAGTSQRFLENGSQEDLLHGNPGSTYL
.: :.
CCDS58 ------------------------NAHDI-------------------------------
230
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 ASNSTSAPNWKSLTSWTNDQGARRKTVFSPTLPAARSSLGSLQTPEAVTTRKGTGLLSSD
.:..::: : . : .:.... :: .
CCDS58 -KNKSSAP----------------------------SRVPPLFVPQGTSERKDS------
240 250
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 YRIINGKSGTQDIQPGPLFNNNADGVATDITSTRSLNYKSTSSGHREISSPRIQDAGPAS
::. ..:. : ....:
CCDS58 -------SGS--VSPNTLSQEEGD------------------------------------
260 270
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 RDVQATGRIADDADPRVALVNDSLSDVTSTTSSRVDDHDSEEICLDHLCKGCPLNGSCSK
.::: :. :.: .. .: .
CCDS58 -----------------------------------------QICLYHIRKSCSFQDKCHR
280 290
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 VHFHLPYRWQMLIGKTWTDFEHMETIEKGYCNPGIH--LCSVG-----SYTINFRVMSCD
::::::::::.: : :...:: ::..:::: :. ::: . :. .:: .:.
CCDS58 VHFHLPYRWQFLDRGKWEDLDNMELIEEAYCNPKIERILCSESASTFHSHCLNFNAMTYG
300 310 320 330 340 350
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 SFPIRRLSTPSSVTKPANSVFTTKWIWYWKNESGTWIQYGEEKDKRKNSNVDSSYLESLY
. ::::: :::::: . ..:: :::::..: :.: .::.. . ..:.:: .:. :
CCDS58 ATQARRLSTASSVTKPPHFILTTDWIWYWSDEFGSWQEYGRQGTVHPVTTVSSSDVEKAY
360 370 380 390 400 410
650 660 670 680 690
pF1KE3 QS-CPRG------VVPFQAGSRNYELSFQGMIQTNIASKTQKDVIRRPTFVPQWYVQQMK
. : : .. ::::..::::.:....: :.. : : : ::: .: : :.
CCDS58 LAYCTPGSDGQAATLKFQAGKHNYELDFKAFVQKNLVYGTTKKVCRRPKYVSPQDVTTMQ
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 RGPE
CCDS58 TCNTKFPGPKSIPDYWDSSALPDPGFQKITLSSSSEEYQKVWNLFNRTLPFYFVQKIERV
480 490 500 510 520 530
699 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Aug 4 20:34:35 2021 done: Wed Aug 4 20:34:36 2021
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]